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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24721 | 2024-09-11 |
Inference of single-cell network using mutual information for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05895-3
PMID:39237886
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研究论文 | 本文介绍了一种基于互信息的单细胞网络构建方法SINUM,用于分析scRNA-seq数据 | SINUM通过估计基因间的互信息来确定基因在特定细胞中的依赖性或独立性,相比现有方法在细胞类型识别上表现更优 | NA | 构建单细胞网络以揭示生物系统的动态变化和细胞间的异质性 | scRNA-seq数据中的基因表达网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 互信息 | 基因表达数据 | 涉及不同细胞数量的多个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 24722 | 2024-09-11 |
Enhanced osteogenic differentiation in 3D hydrogel scaffold via macrophage mitochondrial transfer
2024-Sep-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02757-1
PMID:39237942
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研究论文 | 评估一种新型3D生物仿生水凝胶支架在促进骨折愈合中的效果 | 通过巨噬细胞线粒体转移增强3D水凝胶支架的成骨分化能力 | NA | 评估新型3D生物仿生水凝胶支架在促进骨折愈合中的效果 | 3D生物仿生水凝胶支架、巨噬细胞、骨髓间充质干细胞、骨折愈合 | 生物医学工程 | 骨折 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 体外实验使用骨髓间充质干细胞,体内实验使用骨折小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 24723 | 2024-09-11 |
Loss of Annexin A1 in macrophages restrains efferocytosis and remodels immune microenvironment in pancreatic cancer by activating the cGAS/STING pathway
2024-Sep-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009318
PMID:39237260
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研究论文 | 研究了 Annexin A1 在胰腺癌中的作用,发现其在巨噬细胞中的缺失通过激活 cGAS/STING 通路抑制了吞噬作用并重塑了免疫微环境 | 揭示了巨噬细胞中 Annexin A1 在胰腺癌中的新作用,通过调节肿瘤相关巨噬细胞的吞噬作用促进抗肿瘤免疫反应 | NA | 研究 Annexin A1 在胰腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 胰腺癌患者样本和 myeloid-specific ANXA1-knockout 小鼠 | NA | 胰腺癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞 RNA 测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、细胞 | 151 例胰腺癌患者样本和 myeloid-specific ANXA1-knockout 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 24724 | 2024-09-11 |
Dissecting viral infections, one cell at a time, by single-cell technologies
2024 Sep-Oct, Microbes and infection
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.micinf.2023.105268
PMID:38008398
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综述 | 本文综述了单细胞基因组技术,特别是单细胞RNA测序(scRNA-seq)在病毒感染研究中的应用 | 探讨了单细胞技术在病毒学中的创新应用,特别是在COVID-19大流行期间的研究 | 技术限制、挑战及其解决方案 | 详细介绍单细胞水平研究病毒感染的优势,以及如何利用scRNA-seq技术实现这一目标 | 病毒与宿主的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24725 | 2024-09-11 |
A polymeric nanoplatform enhances the cGAS-STING pathway in macrophages to potentiate phagocytosis for cancer immunotherapy
2024-Sep, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.07.039
PMID:39038546
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研究论文 | 设计了一种甘露糖修饰的pH响应性纳米平台,通过共封装R848和cGAMP,促进肿瘤相关巨噬细胞的极化和SIRPα表达的下调,从而增强抗肿瘤免疫治疗 | 首次设计了一种甘露糖修饰的pH响应性纳米平台,通过共封装R848和cGAMP,促进肿瘤相关巨噬细胞的极化和SIRPα表达的下调,从而增强抗肿瘤免疫治疗 | NA | 研究通过激活cGAS-STING通路来增强巨噬细胞的吞噬作用,从而提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和其表达的信号调节蛋白α(SIRPα) | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24726 | 2024-09-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals a high-resolution cell atlas of petals in Prunus mume at different flowering development stages
2024-Sep, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae189
PMID:39247887
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术构建了梅花花瓣在不同开花发育阶段的细胞图谱,并揭示了花香合成的主要细胞类型 | 首次构建了梅花花瓣的单细胞图谱,揭示了花香合成的主要细胞类型和相关基因表达 | 研究仅限于特定的梅花品种和两个开花阶段,可能无法完全代表所有梅花品种和开花阶段的情况 | 探究梅花花瓣在不同开花发育阶段的细胞类型及其在花香合成中的作用 | 梅花花瓣在花蕾期和盛开期的细胞类型及其基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个开花阶段的梅花花瓣样本,每个阶段各一个 | NA | NA | NA | NA |
| 24727 | 2024-09-11 |
Leveraging single-cell RNA-seq for uncovering naïve B cells associated with better prognosis of hepatocellular carcinoma
2024-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.563
PMID:39252823
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示与肝细胞癌预后改善相关的幼稚B细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中幼稚B细胞的特定亚群及其与预后的关联 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,尚未在人类临床样本中验证 | 探讨肝细胞癌的免疫微环境及其在肿瘤发生中的动态变化 | 肝细胞癌中的免疫细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 小鼠肝细胞癌模型和人类肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24728 | 2024-09-11 |
Potential regulation and prognostic model of colorectal cancer with extracellular matrix genes
2024-Aug-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36164
PMID:39247375
|
研究论文 | 研究了结直肠癌中细胞外基质基因的潜在调控作用及其在预后模型中的应用 | 首次系统分析了结直肠癌中细胞外基质成分的表达模式及其与患者生存的关系,并开发了一个基于细胞外基质基因的预后模型 | 研究主要基于TCGA-CRC队列数据,样本量有限,可能影响模型的泛化能力 | 探讨结直肠癌中细胞外基质基因的调控机制及其在预后预测中的潜力 | 结直肠癌中的细胞外基质成分及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 结直肠癌肿瘤及配对正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24729 | 2024-09-11 |
Targeting tumor-associated macrophage-derived CD74 improves efficacy of neoadjuvant chemotherapy in combination with PD-1 blockade for cervical cancer
2024-Aug-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009024
PMID:39107132
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研究论文 | 研究探讨了靶向肿瘤相关巨噬细胞衍生的CD74在宫颈癌新辅助化疗与PD-1阻断联合治疗中的作用 | 首次揭示了CD74在宫颈癌新辅助化疗与PD-1阻断联合治疗中的关键作用,并验证了CD74阻断可以增强治疗效果 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床试验中验证 | 探讨新辅助化疗与PD-1阻断联合治疗对宫颈癌微环境的影响,并寻找增强治疗效果的新靶点 | 宫颈癌细胞、巨噬细胞、T细胞等 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 46,950个细胞,来自9个宫颈癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24730 | 2024-09-11 |
BACH2 regulates diversification of regulatory and proinflammatory chromatin states in TH17 cells
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01901-1
PMID:39009838
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研究论文 | 研究探讨了BACH2在TH17细胞中调控调节性和促炎染色质状态多样化的机制 | 首次揭示了BACH2在TH17细胞中促进免疫调节性npT17程序并抑制促炎性T1样程序的作用 | NA | 研究TH17细胞异质性的调控途径,并探讨BACH2在其中的作用 | TH17细胞的染色质景观及其在体内外的差异 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 染色质可及性和RNA表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24731 | 2024-09-11 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling identify potential cellular targets of the long noncoding RNA Gas5 in renal fibrosis
2024-08, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167206
PMID:38718848
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研究论文 | 研究探讨了长链非编码RNA Gas5在肾纤维化中的表达谱及其作为潜在生物标志物的作用 | 揭示了Gas5缺失加剧肾纤维化的机制,并发现了Gas5调控免疫细胞分化和PPAR信号通路关键基因转录的新见解 | NA | 研究Gas5在慢性肾病进展中的作用及其作为生物标志物的潜力 | Gas5在肾纤维化中的表达及其对肾损伤和细胞外基质沉积的影响 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 24732 | 2024-09-11 |
Targeting JUNB to modulate M2 macrophage polarization in preeclampsia
2024-08, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167194
PMID:38663490
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了子痫前期中胎盘的细胞景观,并发现转录因子JUNB在调节M2巨噬细胞极化中的关键作用 | 首次揭示了JUNB在子痫前期中调节巨噬细胞极化的机制,并提出了通过靶向JUNB来调节巨噬细胞极化以治疗子痫前期的潜在疗法 | NA | 探讨子痫前期的细胞动力学和分子机制,并开发有效的治疗策略 | 子痫前期患者的胎盘细胞和巨噬细胞 | NA | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 子痫前期样本中的11种不同细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 24733 | 2024-09-11 |
Transcriptomic Analysis of the Spatiotemporal Axis of Oogenesis and Fertilization in C. elegans
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597235
PMID:38895354
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研究论文 | 本文对秀丽隐杆线虫雌雄同体的卵母细胞形成过程进行了转录组水平分析 | 通过单细胞RNA测序技术,深入分析了不同阶段的卵母细胞转录组,揭示了基因表达和剪接事件的详细变化,并提供了卵母细胞形成过程的新见解 | NA | 研究秀丽隐杆线虫卵母细胞形成和受精过程中的时空轴转录组变化 | 秀丽隐杆线虫雌雄同体的卵母细胞和受精卵 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个不同阶段的卵母细胞和受精卵 | NA | NA | NA | NA |
| 24734 | 2024-09-11 |
CD4 T cell-secreted IFN-γ in Sjögren's syndrome induces salivary gland epithelial cell ferroptosis
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167121
PMID:38471652
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研究论文 | 研究探讨了干燥综合征中CD4 T细胞分泌的IFN-γ如何诱导唾液腺上皮细胞铁死亡 | 首次揭示了CD4 T细胞在干燥综合征中分泌的IFN-γ诱导唾液腺上皮细胞铁死亡的作用 | NA | 确定干燥综合征中IFN-γ的来源及其对唾液腺上皮细胞的影响 | 干燥综合征患者的唾液腺上皮细胞和CD4 T细胞 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照和干燥综合征小鼠的唾液腺单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 24735 | 2024-09-11 |
Single cell and bulk RNA sequencing identifies tumor microenvironment subtypes and chemoresistance-related IGF1+ cancer-associated fibroblast in gastric cancer
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167123
PMID:38484940
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术,识别了胃癌肿瘤微环境亚型及与化疗耐药相关的IGF1+癌症相关成纤维细胞 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别了胃癌肿瘤微环境的四种亚型,并发现IGF1+癌症相关成纤维细胞与化疗耐药和胃癌复发相关 | 研究样本量有限,且仅限于胃癌患者,结果的普适性有待进一步验证 | 揭示胃癌肿瘤微环境的异质性及其对治疗反应的影响机制 | 胃癌肿瘤微环境及其亚型,特别是与化疗耐药相关的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RT-qPCR,双免疫荧光染色 | 非负矩阵分解(NMF) | RNA | 50个胃癌样本,1406名胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 24736 | 2024-09-11 |
Fructose overconsumption accelerates renal dysfunction with aberrant glomerular endothelial-mesangial cell interactions in db/db mice
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167074
PMID:38354758
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研究论文 | 研究探讨了过量果糖摄入对db/db小鼠肾脏功能的影响及其机制 | 建立了由过量果糖摄入引起的新型糖尿病模型,揭示了果糖摄入通过Lrg1介导的肾小球内皮细胞与系膜细胞之间的异常交流加速糖尿病肾病进展 | 研究仅在db/db小鼠模型中进行,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨过量果糖摄入对糖尿病肾病进展的影响及其机制 | db/db小鼠的肾脏功能及细胞间相互作用 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | db/db小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 24737 | 2024-09-11 |
Reprogramming macrophage by targeting VEGF and CD40 potentiates OX40 immunotherapy
2024-02-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.149546
PMID:38266314
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研究论文 | 研究通过靶向VEGF和CD40重编程巨噬细胞,增强OX40免疫疗法的抗肿瘤效果 | 首次分析了抗OX40治疗对巨噬细胞的抗肿瘤作用,并发现VEGF和CD40信号通路的动态变化,提出这些可能是提高抗OX40激动剂疗效的潜在联合靶点 | 研究仅限于体外实验和细胞水平的分析,尚未进行临床试验验证 | 探索提高OX40免疫疗法抗肿瘤疗效的机制和策略 | 肿瘤浸润免疫细胞、巨噬细胞、VEGF和CD40信号通路 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的肿瘤浸润免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24738 | 2024-09-11 |
Increased Expression of Mevalonate Pathway-Related Enzymes in Angiotensin II-Induced Abdominal Aortic Aneurysms
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-623
PMID:39085115
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研究论文 | 研究探讨了血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中甲羟戊酸途径相关酶的表达变化 | 首次揭示了甲羟戊酸途径在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的重要作用 | 仅限于动物模型研究,未涉及临床数据 | 探讨甲羟戊酸途径在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的作用 | 腹主动脉瘤的形成和动脉重塑 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | Western blot和单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和RNA | 包括Ang II 28D、Ang II 5D和Sham组 | NA | NA | NA | NA |
| 24739 | 2024-09-11 |
Transcriptomic analysis of the spatiotemporal axis of oogenesis and fertilization in C. elegans
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1436975
PMID:39224437
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行了转录组分析,揭示了卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件 | 本文首次对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行了详细的转录组分析,揭示了卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件,并提供了新的机制见解 | 本文仅限于对秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统进行分析,未涉及其他物种或性别 | 研究秀丽隐杆线虫卵母细胞形成过程中的基因表达和剪接事件 | 秀丽隐杆线虫的雌雄同体生殖系统 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个不同阶段的生殖系统组织和受精卵 | NA | NA | NA | NA |
| 24740 | 2024-09-11 |
Integrating single-cell transcriptomics to reveal the ferroptosis regulators in the tumor microenvironment that contribute to bladder urothelial carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427124
PMID:39238647
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据,通过非负矩阵分解(NMF)聚类分析,揭示了膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中铁死亡调控因子及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 首次通过单细胞转录组数据识别出膀胱癌肿瘤微环境中与铁死亡相关的新型细胞亚型,并发现ACSL4+CAFs和SDC1作为重要的膀胱癌生物标志物 | 本研究主要基于单细胞转录组数据进行分析,缺乏体内实验验证 | 探讨铁死亡在膀胱癌肿瘤微环境中的调控机制及其对癌症进展和免疫治疗的影响 | 膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中的细胞亚型及其与铁死亡的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |