单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 24121 - 24140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24121 | 2024-08-09 |
Methods for Characterization of Senescent Circulating and Tumor-Infiltrating T-Cells: An Overview from Multicolor Flow Cytometry to Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1507-2_6
PMID:34053052
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综述 | 本文综述了从多色流式细胞术到单细胞RNA测序等多种方法在衰老循环和肿瘤浸润T细胞表征中的应用 | 提出结合多色流式细胞术、基因表达阵列和单细胞RNA测序的综合分析方法，以揭示衰老CD8+ T细胞的确切分子标志，并探讨免疫衰老与人类衰老的关联 | 现有表征方法可能不足以区分真正的衰老细胞和耗竭T细胞，且衰老个体或肿瘤微环境中T细胞亚群的高度异质性增加了复杂性 | 开发针对特定T细胞亚群的治疗性调节干预措施 | 衰老的循环和肿瘤浸润T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24122 | 2024-08-09 |
A Cancer-Specific Qualitative Method for Estimating the Proportion of Tumor-Infiltrating Immune Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.672031
PMID:34054849
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tumor-infiltrating Immune Cell Proportion Estimator (TICPE)的癌症特异性定性方法，用于估计肿瘤浸润免疫细胞的比例 | TICPE方法基于基因对的相对表达顺序（REOs），对批次效应不敏感，且在估计免疫细胞比例的准确性上明显优于其他方法 | NA | 开发一种新的方法来估计特定类型癌症中肿瘤浸润免疫细胞的比例，并探讨免疫细胞浸润对免疫治疗效果和癌症预后的影响 | 结直肠癌（CRC）和黑色素瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | mRNA混合物数据、免疫组织化学数据和模拟的批量RNA测序样本 | 使用了公共表达数据和模拟样本 |
| 24123 | 2024-08-09 |
GPCRomics of Homeostatic and Disease-Associated Human Microglia
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.674189
PMID:34054860
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研究论文 | 本文通过分析公开的RNA测序数据，研究了人类和小鼠大脑中微胶质细胞的G蛋白偶联受体（GPCRs）表达情况 | 首次系统性地揭示了微胶质细胞中GPCRs的表达模式，并探讨了其在脑疾病中的潜在作用 | 研究主要基于公开的RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨GPCRs在人类微胶质细胞中的表达及其在脑生理和病理过程中的作用 | 人类和小鼠大脑中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠大脑的批量和单细胞样本 |
| 24124 | 2024-08-09 |
Updating the pathophysiology of arthritic bone destruction: identifying and visualizing pathological osteoclasts in pannus
2021-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2021.1913883
PMID:34010590
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和活体成像技术在关节炎骨破坏病理生理学中的应用 | 应用单细胞RNA测序技术揭示了炎症滑膜中成熟破骨细胞前体的异质性，并使用活体成像技术实时观察破骨细胞和免疫细胞的动态 | NA | 探讨破骨细胞在关节炎骨侵蚀中的作用及其前体细胞的异质性 | 破骨细胞及其前体细胞在不同组织环境中的起源和特性 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多光子显微镜活体成像 | NA | RNA序列、图像 | NA |
| 24125 | 2024-08-09 |
Interfacing Seurat with the R tidy universe
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab404
PMID:34028547
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研究论文 | 本文介绍了tidyseurat，一个轻量级的适配器，用于将Seurat对象与tidyverse生态系统接口，以便用户可以使用熟悉的语法进行单细胞RNA测序数据分析 | 开发了tidyseurat适配器，使得Seurat对象能够与tidyverse生态系统无缝对接，提高了数据操作和可视化的效率 | NA | 提供一个面向tidyverse的Seurat接口，以便数据科学社区的用户能够使用熟悉的语法进行操作 | Seurat对象与tidyverse生态系统的接口 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | NA |
| 24126 | 2024-08-09 |
Deep cross-omics cycle attention model for joint analysis of single-cell multi-omics data
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab403
PMID:34028557
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研究论文 | 本文提出了一种深度跨组学生命周期注意力（DCCA）模型，用于单细胞多组学数据的联合分析 | DCCA模型结合了变分自编码器（VAEs）和注意力转移技术，能够利用一种组学数据来微调为另一种组学数据训练的网络 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据集成分析中由于稀疏性、异质性和维度差异带来的挑战 | 单细胞转录组学和表观组学数据 | 机器学习 | NA | 变分自编码器（VAEs） | 深度跨组学生命周期注意力（DCCA）模型 | 多组学数据 | 涉及模拟数据和来自不同平台的真实数据 |
| 24127 | 2024-08-09 |
Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220256
PMID:34001518
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24128 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing profiling in a patient with discordant primary cutaneous B-cell and T-cell lymphoma reveals micromilieu-driven immune skewing
2021-11, The British journal of dermatology
DOI:10.1111/bjd.20512
PMID:34018188
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对一位同时患有皮肤B细胞和T细胞淋巴瘤的患者进行了分子特征分析 | 首次揭示了肿瘤微环境对免疫偏向的影响，并区分了不同类型淋巴瘤皮肤病变中的特定克隆群体 | NA | 提高复杂类型原发性皮肤淋巴瘤的诊断和分子特征分析 | 原发性皮肤B细胞和T细胞淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一位患者 |
| 24129 | 2024-08-09 |
Integrative analysis of the human brain mural cell transcriptome
2021-11, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X211013700
PMID:34027687
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研究论文 | 本文利用多个独立的人脑单细胞RNA测序数据集，构建了人脑壁细胞的转录组数据库，并分析了人鼠壁细胞转录组的物种差异、人脑周细胞的培养诱导去分化及人壁细胞的器官特异性 | 首次综合利用多个独立的人脑单细胞RNA测序数据集，详细分析了人脑壁细胞的分子特征，填补了该领域的知识空白 | NA | 深入了解人脑壁细胞的分子组成，为研究壁细胞功能提供资源，并促进动物模型与人类模型的比较评估 | 人脑壁细胞，包括周细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个独立的人脑样本 |
| 24130 | 2024-08-09 |
Characterization of the heterogeneity of endothelial cells in bleomycin-induced lung fibrosis using single-cell RNA sequencing
2021-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09795-5
PMID:34028626
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了博莱霉素诱导的肺纤维化中内皮细胞的异质性 | 首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞亚群的特征及其在病理过程中的作用 | 研究仅限于大鼠模型，可能与人类疾病存在差异 | 探讨内皮细胞亚群在肺纤维化发展中的作用 | 博莱霉素诱导的肺纤维化中的内皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大鼠模型中的内皮细胞亚群 |
| 24131 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220209
PMID:34031030
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了系统性硬化症（SSc）患者皮肤中特定的T细胞反应 | 首次使用液滴法单细胞转录组分析SSc皮肤活检，揭示了患者特异性的T细胞异质性，并发现了与SSc皮肤疾病严重程度相关的功能通路中的新基因表达 | 研究样本量有限，仅包括27名活动性SSc患者和10名健康捐赠者的皮肤活检样本 | 旨在深入研究系统性硬化症患者受影响皮肤中的T细胞介导的免疫反应 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤活检样本中的CD3+淋巴细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3729个CD3+淋巴细胞，包括867个来自正常皮肤和2862个来自SSc皮肤样本 |
| 24132 | 2024-08-09 |
Integrated pseudotime analysis of human pre-implantation embryo single-cell transcriptomes reveals the dynamics of lineage specification
2021-09-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.027
PMID:34004179
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据的伪时间分析，重建了早期小鼠和人类胚胎发育过程，并揭示了人类胚胎发育中谱系特化的动态变化 | 本研究首次通过伪时间分析揭示了人类胚胎发育中谱系特化的精确时间点，并识别了转录组特征和细胞命运标记 | NA | 理解人类胚胎植入前发育中的谱系特化过程，以改进辅助生殖技术和干细胞研究 | 人类胚胎植入前发育过程中的谱系特化 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24133 | 2024-08-09 |
Category encoding method to select feature genes for the classification of bulk and single-cell RNA-seq data
2021-08-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9015
PMID:34028849
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研究论文 | 本文提出了一种类别编码（CAEN）方法，用于选择特征基因以分类批量和单细胞RNA-seq数据 | CAEN方法通过使用每个类别中基因序列样本的排名进行类别编码，并考虑样本排名和新的类别排名的相关系数，选择最高基因相关系数作为特征基因 | NA | 改进批量和单细胞RNA-seq数据的分类性能并节省计算时间 | 批量和单细胞RNA-seq数据中的特征基因选择 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 24134 | 2024-08-09 |
Characterization of Global Research Trends and Prospects on Single-Cell Sequencing Technology: Bibliometric Analysis
2021-08-10, Journal of medical Internet research
IF:5.8Q1
DOI:10.2196/25789
PMID:34014832
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研究论文 | 本文通过文献计量分析方法，研究了单细胞测序技术领域的全球合作网络和发展趋势 | 分析了单细胞测序技术在免疫学应用中的潜在研究热点 | NA | 展示单细胞测序方法领域的合作情况，并探索关键主题和未来方向 | 单细胞测序技术 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 文献 | 2489篇文献，涉及14,202位作者，1970个机构，61个国家 |
| 24135 | 2024-08-09 |
Human photoreceptor cells from different macular subregions have distinct transcriptional profiles
2021-07-28, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab140
PMID:34014299
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序比较了人眼中央视网膜同心区域的基因表达，揭示了不同视网膜区域的独特分子特征 | 首次详细描述了视网膜转录组的空间特征，并发现了特定区域特有的基因表达模式和差异剪接基因 | NA | 探究人眼中央视网膜不同区域的基因表达差异 | 人眼中央视网膜的锥状光感受器细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24136 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Atlas of Endothelial Cells of the Human Lung
2021-07-27, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文提供了一个全面的人类肺部内皮细胞参考图谱，通过重新分析6个数据集的单细胞RNA测序数据，揭示了肺部内皮细胞的多样性和组成。 | 发现了先前未被识别的肺部内皮细胞亚群，并通过跨物种分析确认了这些细胞类型在人类和老鼠中的存在。 | NA | 提供一个详细的肺部内皮细胞图谱，以促进对肺部内皮细胞多样性和组成的更好理解。 | 人类和小鼠的肺部内皮细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过15,000个血管内皮细胞来自73个个体 |
| 24137 | 2024-08-09 |
Single-cell co-expression analysis reveals that transcriptional modules are shared across cell types in the brain
2021-07-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.04.010
PMID:34015329
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了大脑中跨细胞类型的转录模块共享现象 | 利用大脑细胞普查网络的单细胞RNA测序数据，首次展示了跨细胞类型的共享转录调控信号 | NA | 探究基因-基因关系如何塑造细胞身份 | 大脑中的细胞类型及其转录调控模块 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 500,000个细胞/核，涵盖7个BICCN数据集 |
| 24138 | 2024-08-09 |
Treg cell-derived osteopontin promotes microglia-mediated white matter repair after ischemic stroke
2021-07-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.04.022
PMID:34015256
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞（Treg细胞）在缺血性中风后对长期组织修复的有益作用及其机制 | 发现Treg细胞通过分泌骨桥蛋白促进小胶质细胞介导的白质修复 | NA | 揭示Treg细胞作为中风恢复的神经修复目标 | Treg细胞在中风后的作用及其对白质修复的影响 | NA | 中风 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠实验中风模型 |
| 24139 | 2024-08-09 |
Functionally distinct POMC-expressing neuron subpopulations in hypothalamus revealed by intersectional targeting
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00854-0
PMID:34002087
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研究论文 | 本文通过交叉定位技术揭示了下丘脑中表达POMC的神经元亚群具有不同的功能特性 | 开发了新的鼠模型，通过交叉Cre/Dre依赖的重组技术成功标记、翻译组学分析和功能表征了表达瘦素受体和胰高血糖素样肽1受体的不同POMC神经元 | 尚未解决POMC神经元异质性的确切分子基础和功能后果 | 揭示下丘脑中POMC表达神经元的功能异质性和分子基础 | 下丘脑弓状核中表达POMC的神经元 | NA | NA | 交叉Cre/Dre依赖的重组技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 24140 | 2024-08-09 |
Nasal ciliated cells are primary targets for SARS-CoV-2 replication in the early stage of COVID-19
2021-07-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI148517
PMID:34003804
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段在上呼吸道中的细胞嗜性，特别是鼻纤毛细胞 | 本文首次展示了SARS-CoV-2在多纤毛上皮细胞中的蛋白质水平相对较高，并且其定位局限于细胞的顶侧 | NA | 探讨SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段的细胞嗜性，并提出预防病毒传播的策略 | SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段的细胞嗜性及病毒复制情况 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-Seq | NA | 蛋白质水平数据 | 患者样本 |