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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2025-11-28 |
Unraveling Diabetes Mechanisms: A Computational scRNA-Seq Approach to Inflammation and Diabetes
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_50
PMID:41273592
|
研究论文 | 本研究通过计算分析单细胞RNA测序数据探索营养、炎症与糖尿病之间的分子机制关系 | 采用单细胞RNA测序数据和先进计算方法揭示饮食条件如何影响免疫反应并促进糖尿病发展的分子通路 | NA | 探索炎症与糖尿病之间的分子机制,识别关键基因表达谱和分子通路 | 单细胞RNA测序数据集GSE161872中的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2362 | 2025-11-28 |
Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2579909
PMID:41277366
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研究论文 | 通过整合多种转录组测序技术,揭示了小鼠沙门氏菌感染期间结肠的时空单细胞转录组景观,发现远端结肠细胞在炎症反应中的关键作用 | 首次结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间RNA-seq数据,系统描绘了肠道感染过程中的时空转录组动态,并鉴定出远端结肠细胞的关键响应作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证相对有限 | 阐明肠道对病原体感染的区室化反应的细胞和分子基础 | 小鼠结肠组织和人类肠道单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | 肠道感染 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间RNA-seq | NA | 转录组数据 | 一周感染时间过程的小鼠结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2363 | 2025-11-28 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型揭示了PRMT5在表皮发育中的关键作用,发现其缺失会导致基底角质形成细胞出现衰老样表型和表皮分层缺陷 | 首次在体内证明PRMT5通过抑制Cdkn1a(p21)防止基底角质形成细胞衰老,并鉴定出一群非典型的基底角质形成细胞样细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类皮肤中验证;PRMT5的具体下游靶标和分子机制仍需进一步阐明 | 探究PRMT5在表皮发育和角质形成细胞维持中的作用机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠模型及其表皮组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 2364 | 2025-11-28 |
ENO1 promotes cancer metastasis via stimulating metabolism reprogramming in osteosarcoma
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03182-3
PMID:40983627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ENO1基因通过刺激代谢重编程促进骨肉瘤转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示ENO1通过调控糖酵解促进骨肉瘤转移的作用机制 | 样本量较小(仅10例儿科骨肉瘤样本),需要更大样本验证 | 阐明骨肉瘤转移的潜在分子机制 | 儿科骨肉瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 10例儿科骨肉瘤样本(分为原发无转移组、原发有转移组和转移灶组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2365 | 2025-11-28 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Dec, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中粒细胞样髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制,发现PTGS1作为关键标志物并构建了高精度预后预测模型 | 样本量有限且患者间存在异质性,结果具有探索性,需要更大更多样化的队列验证 | 全面分析G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(单细胞数据),713例多发性骨髓瘤患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2366 | 2025-11-28 |
Single cell RNA seq of the major cell types in the larva of the sea star, Patiria miniata
2025-Nov-27, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70100
PMID:41306072
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria miniata幼虫发育过程中的主要细胞类型及其基因表达轨迹 | 首次提供了海星幼虫发育的单细胞转录组图谱,发现原始生殖细胞与体腔囊细胞具有相似的基因表达谱,并揭示了外胚层上皮的高度异质性 | 研究主要聚焦于第3天幼虫,其他发育时间点的分析相对有限 | 研究海星发育过程中细胞类型分化和基因表达机制 | 海星Patiria miniata受精后1-4天的幼虫 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位RNA杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 海星幼虫发育1-4天的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2367 | 2025-11-28 |
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02447-z
PMID:41307600
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂的动态调控机制 | 首次在单细胞水平提出UPR变阻器概念,开发了臂特异性指标来量化三臂协调性,发现IRE1/ATF6紧密耦合而PERK相对独立的调控模式 | 研究基于转录组数据推断UPR臂协调性,需要扰动实验和蛋白水平验证 | 探究胶质母细胞瘤中UPR三臂在单细胞分辨率下是否作为分级控制系统运作 | 胶质母细胞瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机效应模型,转录因子活性推断 | 单细胞转录组数据 | 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SMART-seq | SMART-seq和10x Chromium单细胞测序平台 |
| 2368 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2025-Nov-27, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示EGFR阳性肺腺癌在福莫替尼治疗前后的细胞和分子变化 | 首次在EGFR阳性肺腺癌中整合治疗前后配对样本的单细胞转录组数据,系统分析福莫替尼对肿瘤微环境的重塑作用 | 样本量有限,耐药机制仍需进一步验证 | 探究福莫替尼治疗EGFR阳性肺腺癌的细胞分子机制及肿瘤微环境变化 | EGFR阳性肺腺癌患者的肿瘤组织及癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后配对样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2369 | 2025-11-28 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor requires actomyosin forces
2025-Nov-26, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了小鼠门牙发育过程中干细胞特化和生态位形成的时序关系 | 发现肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制Sox2+干细胞定位和维持其干性中的关键作用 | 研究仅限于小鼠门牙发育模型,未验证其他牙齿类型或物种 | 探究牙齿发育过程中干细胞特化与生态位形成的时序关系和机制 | 小鼠门牙发育过程中的上皮干细胞 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Sox2CreERT2/+; R26RmT/mG和Sox2CreERT2/+; R26RtdT/+胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2370 | 2025-11-28 |
DBP: Adaptive and Interpretable Factor Analysis for Single-cell RNA-seq Data with Deep Beta Processes
2025-Nov-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf117
PMID:41298306
|
研究论文 | 提出一种基于深度Beta过程的单细胞RNA-seq数据自适应可解释因子分析方法 | 通过stick-breaking Beta过程实现因子数量的自适应选择,并采用对抗学习策略进行批次校正 | NA | 开发自适应且可解释的因子分析方法用于单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度概率框架,Beta过程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2371 | 2025-11-28 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk转录组分析揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统分析巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的异质性,并识别出三个关键特征基因 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证;样本来源和数量未详细说明 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制,寻找诊断标志物和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,细胞实验 | 逻辑回归,共识聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2372 | 2025-11-28 |
Differential expression of viral entry protein neuropilin 1 (NRP1) and neuropilin 2 (NRP2) in fatal COVID-19
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01384-25
PMID:41159753
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研究论文 | 本研究分析了致命性COVID-19病例中病毒进入蛋白神经纤毛蛋白1和2的表达差异及其与SARS-CoV-2刺突蛋白的结合特性 | 首次系统比较NRP1和NRP2在致命COVID-19组织中的表达分布,并发现它们与SARS-CoV-2刺突蛋白片段具有不同的结合特性 | 样本量有限(n=20),且仅针对致命病例,可能无法代表轻中度COVID-19的情况 | 探究神经纤毛蛋白作为SARS-CoV-2辅助受体在COVID-19发病机制中的作用 | 致命COVID-19患者的尸检组织(心脏、肺和血液淋巴器官) | 病理学 | COVID-19 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,空间多重免疫荧光,免疫荧光显微镜 | NA | 组织图像,基因表达数据 | 20例尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | CODEX | 空间多重免疫荧光表型分析 |
| 2373 | 2025-11-28 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of epithelial-immune dual features of proximal tubule cells in BK polyomavirus nephropathy
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01394-25
PMID:41055342
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究BK多瘤病毒肾病微环境,发现具有上皮-免疫双重特征的近端肾小管细胞新亚群 | 首次发现IGKC+ PT细胞亚群具有上皮-免疫双重特征,可能通过T细胞耗竭机制促进BKPyVN进展 | NA | 研究BK多瘤病毒肾病的微环境特征,探索新的治疗和诊断方法 | BK多瘤病毒肾病样本和稳定移植肾样本 | 单细胞测序 | 肾病 | 单细胞RNA测序,共免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,尿液样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2374 | 2025-11-28 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts modulate T cell activation
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193054
PMID:41055954
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研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗调控T细胞活化的新机制 | 首次发现滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗诱导T细胞低反应性,并证实其在滑膜微环境中的主导免疫调节作用 | 未明确说明研究样本的具体数量及实验设计的局限性 | 探究类风湿关节炎滑膜成纤维细胞对T细胞活化的调节机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞和T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2375 | 2025-11-28 |
Multi-omics analysis reveals different cholesterol metabolism subtypes in colorectal cancer
2025-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03993-z
PMID:41283923
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研究论文 | 通过多组学分析识别结直肠癌中不同的胆固醇代谢亚型及其临床意义 | 首次基于胆固醇代谢相关基因对结直肠癌进行分子分型,并系统揭示不同亚型的肿瘤微环境特征和免疫治疗响应差异 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 识别结直肠癌的胆固醇代谢亚型并揭示其分子和免疫学特征 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 基因组分析 | 无监督聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | TCGA数据库结直肠癌样本及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 2376 | 2025-11-28 |
Dose-dependent effects of wheat germ oil and vitamin E on apoptosis and gene expression in breast and cervical cancer cell lines with single-cell RNA-seq profiling
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25408-3
PMID:41285842
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨小麦胚芽油和维生素E对乳腺癌和宫颈癌细胞凋亡及基因表达的剂量依赖性影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估小麦胚芽油和维生素E在乳腺癌和宫颈癌细胞中的剂量依赖性抗肿瘤效应 | 仅使用MCF-7和HeLa两种细胞系,缺乏体内实验验证 | 探究天然代谢物在癌症治疗中的潜在应用价值 | MCF-7乳腺癌细胞系和HeLa宫颈癌细胞系 | 单细胞组学 | 乳腺癌,宫颈癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,实时荧光定量PCR | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 两种癌细胞系(MCF-7和HeLa) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2377 | 2025-11-28 |
Integrated scRNA-seq and transcriptome analyses uncover the effects of UBE2H on the immune microenvironment regulation in pancreatic cancer
2025-Nov-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04059-4
PMID:41286881
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了UBE2H在胰腺癌免疫微环境调控中的作用 | 首次在胰腺导管细胞生态位中发现UBE2H+细胞群体,并系统阐明UBE2H通过抑制T细胞功能、损害抗原呈递和激活中性粒细胞胞外诱捕网等方式调控免疫微环境的机制 | NA | 探索胰腺癌'冷'肿瘤形成的关键调控分子及其功能机制 | 胰腺癌样本中的细胞群体,特别是胰腺导管细胞生态位 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, inferCNV分析, 体内实验 | 15基因模型 | 单细胞测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2378 | 2025-11-28 |
Intratumour Ploidy Heterogeneity and Clonal Evolution in Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-24, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.11.015
PMID:41297676
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研究论文 | 开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法评估肝细胞癌倍性,揭示了倍性异质性与克隆演化的关系 | 创建了首个基于全玻片成像的高通量定量数字病理学方法,能够原位评估HCC倍性并空间重建超倍体核的分布 | 样本量相对有限(111例),主要基于回顾性分析 | 研究肝细胞癌中肿瘤内倍性异质性和克隆演化机制 | 111例人类肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 定量数字病理学,全外显子组测序,bulk RNA测序,3' mRNA测序,空间转录组学 | NA | 病理图像,基因组测序数据,转录组数据,空间转录组数据 | 111例人类肝细胞癌 | NA | 全外显子组测序,bulk RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2379 | 2025-11-28 |
Early female germline development in Xenopus laevis: Stem cells, nurse cells, and germline cysts
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2522343122
PMID:41213017
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术重建了非洲爪蟾早期雌性生殖系发育过程,揭示了生殖细胞囊肿的极性和功能 | 首次在非哺乳类脊椎动物中识别出具有神经元特异性和转座子沉默基因表达的生殖干细胞群体,并发现由稳定微管组成的不对称fusome样结构 | 研究仅限于非洲爪蟾模型,结果在哺乳动物中的普适性需要进一步验证 | 探究非哺乳类脊椎动物卵巢中生殖细胞囊肿的极性和功能 | 非洲爪蟾的雌性生殖系发育过程,包括生殖干细胞、保育细胞和生殖细胞囊肿 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2380 | 2025-11-28 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
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研究论文 | 本研究揭示了DPF2通过调控CACNA1D表达和MAPK通路在巨噬细胞炎症极化及肠道损伤修复中的关键作用 | 首次发现DPF2通过调节CACNA1D介导的钙信号和MAPK通路调控巨噬细胞炎症极化的新机制 | NA | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病患者样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,小鼠遗传学,类器官培养 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |