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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2025-11-30 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
|
综述 | 本章概述精准医学如何重塑神经退行性疾病的认知、诊断和治疗方式 | 整合基因治疗、药物基因组学和个性化生活方式策略,并引入单细胞转录组学、数字孪生等未来工具 | 存在试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等应用挑战 | 推动精准医学在神经退行性疾病领域从研究向临床实践转化 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病患者 | 精准医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、成像技术、数字工具、生物标志物分析 | 数字孪生 | 遗传数据、分子数据、生物标志物、临床特征、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2302 | 2025-11-30 |
Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558457
PMID:37786690
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研究论文 | 本研究揭示了桥粒基因突变通过影响肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖的新机制 | 首次发现桥粒基因在人类癌症中的高频突变,并阐明其通过改变角质形成细胞的微环境促进黑色素瘤增殖 | 研究主要基于原发黑色素瘤样本,未在转移性黑色素瘤中观察到相同现象 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本、角质形成细胞与黑色素瘤细胞共培养体系 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白质免疫荧光、基因敲低、细胞共培养 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据、细胞增殖数据 | 未明确样本数量的人类黑色素瘤活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2303 | 2025-11-29 |
Single-Cell Atlas of Aging Human Skin Reveals FOSB-Related Transcriptional Programs and Druggable Targets
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70569
PMID:41293818
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤衰老图谱,揭示FOSB相关转录程序和可药物靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示人类皮肤衰老的转录调控网络,发现FOSB作为关键衰老相关转录因子 | 样本数量有限,仅比较年轻和老年组,缺乏中间年龄段数据 | 研究人类皮肤衰老的细胞类型特异性转录调控机制和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2304 | 2025-11-29 |
Molecular landscape of the mouse adrenal gland and adjacent adipose tissue by spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Folia histochemica et cytobiologica
IF:1.7Q4
DOI:10.5603/fhc.108988
PMID:41311243
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术构建了成年雄性小鼠肾上腺及其周围脂肪组织的高分辨率分子图谱 | 首次提供了成年雄性小鼠肾上腺的空间分辨转录组参考图谱,揭示了肾上腺分区、更新和区室间相互作用的细胞和分子框架 | 研究仅使用CD1 IGS雄性小鼠,未涉及其他品系或雌性动物 | 解析肾上腺分区和皮质更新的分子机制 | 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺及周围脂肪组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无监督聚类、差异基因表达分析、细胞类型反卷积、伪时间轨迹推断 | 空间转录组数据 | 成年CD1 IGS雄性小鼠肾上腺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium CytAssist平台 |
| 2305 | 2025-11-29 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2025-Nov-28, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
|
研究论文 | 开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法,并验证其在靶向癌症治疗中的效果 | 首次使用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原生成肿瘤靶向抗体,并将这些抗体修饰到载药T细胞囊泡上实现靶向治疗 | 研究仅使用卵巢癌细胞系OVCAR-8,尚未在其他癌症类型中验证 | 开发更有效的肿瘤靶向配体以提高实体瘤药物递送效率 | 人卵巢癌细胞系OVCAR-8、小鼠模型 | 靶向治疗 | 卵巢癌 | 杂交瘤技术、RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | OVCAR-8肿瘤荷瘤小鼠 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 2306 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法,通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合,并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2307 | 2025-11-29 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2025-Nov-27, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
|
研究论文 | 本研究利用高通量单核测序平台筛选肝癌治疗药物组合,并通过单细胞转录组学分析揭示HY组合通过诱导铁死亡抑制肿瘤细胞增殖的机制 | 首次将高通量单细胞筛选与机制解析相结合,在单细胞分辨率下系统评估药物组合对肝癌细胞的影响并发现JUN是关键调控因子 | 研究主要聚焦于HY药物组合,其他潜在有效组合可能需要进一步探索 | 筛选抗肝癌药物组合并阐明其作用机制 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单核测序,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | snHH-seq | 高通量高灵敏度单核测序平台 |
| 2308 | 2025-11-29 |
Construction of a Multitissue Cell Atlas Reveals Cell-Type-Specific Regulation of Molecular and Complex Phenotypes in Pigs
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504961
PMID:41309493
|
研究论文 | 构建了猪多组织细胞图谱,揭示细胞类型特异性调控对分子和复杂表型的影响 | 首次在猪中构建大规模单细胞转录组图谱,发现细胞类型特异性eQTL与复杂性状的关联,并揭示猪人类同源基因对人类复杂表型的遗传力富集 | 仅基于19个组织的样本,可能未覆盖所有猪组织类型;样本数量相对有限 | 系统解析猪组织细胞异质性和细胞类型特异性调控机制 | 猪多组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据 | 229,268个高质量细胞核来自19个组织,3,921个批量RNA-seq样本来自17个匹配组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2309 | 2025-11-29 |
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514502
PMID:41309494
|
研究论文 | 开发了一种名为scPER的计算方法,通过整合单细胞RNA测序数据来估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 | 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术,能够从混杂因素中分离真实信号,在细胞比例估计方面优于现有多种方法 | NA | 开发一种严谨的计算方法来确定与癌症表型一致的肿瘤细胞亚型 | 肿瘤微环境中的细胞组成和表型相关细胞亚群 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,总RNA测序 | 对抗自编码器,极端梯度提升 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2310 | 2025-11-29 |
In vitro models to mimic tumor endothelial cell-mediated immune cell reprogramming in lung adenocarcinoma
2025-Nov-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03576-4
PMID:41310721
|
研究论文 | 本研究通过体外模型探究非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞对免疫细胞的重编程作用 | 首次使用2D和3D共培养模型系统研究TEC介导的免疫调控,并通过单细胞RNA测序发现TEC新亚群和血管周M2样巨噬细胞亚群 | 研究主要基于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 阐明非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞调控免疫细胞群的分子机制 | 非小细胞肺癌细胞、正常内皮细胞、免疫细胞(T细胞、巨噬细胞) | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、激酶组学分析 | 2D和3D共培养模型、多细胞肿瘤球体模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2311 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2312 | 2025-11-29 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
|
研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术鉴定出促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构,揭示其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索免疫治疗中T细胞与肿瘤细胞相互作用的时空动态机制 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2313 | 2025-11-29 |
Gut microbiota L-ornithine promotes resistance to obesity through metabolites mediated immunosuppressive macrophages
2025-Nov-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05882-8
PMID:41291317
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物L-鸟氨酸通过调控巨噬细胞功能抵抗肥胖的新机制 | 首次发现L-鸟氨酸通过下游代谢物精胺和亚精胺调控巨噬细胞向免疫抑制表型极化,从而抵抗肥胖 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢物在肥胖发病机制中的保护作用 | 小鼠模型和肥胖人群 | 代谢疾病研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和肥胖人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2314 | 2025-11-29 |
MHC-II-restricted neoantigen vaccine reverses immune microenvironment and overcomes resistance to immune-checkpoint inhibitors in cold tumors
2025-Nov-26, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100936
PMID:41308654
|
研究论文 | 本研究探讨了MHC-II限制性新抗原疫苗如何重塑冷肿瘤的免疫微环境并与TIGIT阻断剂协同克服免疫检查点抑制剂耐药性 | 首次证明MHC-II限制性新抗原疫苗可逆转冷肿瘤的免疫抑制微环境,并通过NicheNet分析发现PVR-TIGIT轴作为联合治疗靶点 | 研究仅使用B16F10小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 开发克服冷肿瘤对免疫检查点抑制剂耐药性的联合治疗策略 | B16F10小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,NicheNet分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2315 | 2025-11-29 |
Impact of single-cell cell cycle regulation of intercellular communication on the prognosis of hepatocellular carcinoma in the tumor microenvironment
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01963-x
PMID:41286375
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对肿瘤进展和患者预后的影响 | 首次在单细胞水平系统分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯网络的相互作用及其临床意义 | 样本量相对有限,仅分析了两个单细胞RNA测序数据集 | 探究肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对患者预后的影响机制 | 肝癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类,CellChat,Monocle,SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 24,637个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2316 | 2025-11-29 |
Decoding colorectal cancer chemotherapy and immunotherapy resistance: revealing the role of NOL3 using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01913-7
PMID:41286470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了NOL3在结直肠癌化疗和免疫治疗耐药中的关键作用 | 首次系统探索缺氧与18种程序性细胞死亡特征之间的关联,并识别NOL3作为结直肠癌预后关键标志物 | 研究基于回顾性多中心队列,需要进一步的前瞻性验证 | 探索结直肠癌化疗和免疫治疗耐药的分子机制 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 机器学习,数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,MTT测定,Western blot | XGBoost,RR,RF | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 4个多中心队列共1294例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2317 | 2025-11-29 |
Lineage plasticity and signal dysregulation define the cellular trajectory of osteoarthritis progression
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01947-x
PMID:41286526
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索骨关节炎进展过程中细胞谱系的可塑性变化及其与信号通路失调的关系 | 首次系统揭示骨关节炎中PreFC细胞向FC和preHTC细胞转化的轨迹,并鉴定HIF1A和ANGPTL4为关键分子调控因子 | NA | 探索骨关节炎进展的细胞轨迹和分子机制,为精准治疗提供新靶点 | 骨关节炎患者的关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,KEGG和GO富集分析,伪时间轨迹分析,体外实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2318 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate a prognostic function of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65421-8
PMID:41290589
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析揭示三级淋巴结构在胃癌中的预后功能 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析不同空间定位模式的三级淋巴结构,发现iTLS富集肿瘤中特定免疫细胞亚群,并揭示HEV通过VCAM1/ICAM1-CXCL13-ACKR1通路促进TLS形成的新机制 | 样本量相对有限(30例胃癌标本),需要在更大队列中验证发现 | 探究三级淋巴结构在胃癌中的预后功能和免疫治疗预测价值 | 30例按TLS空间定位模式分层的胃癌标本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 30例胃癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2319 | 2025-11-29 |
Machine learning driven multiomics analysis identifies disulfidptosis associated molecular subtypes in ovarian cancer
2025-Nov-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26157-z
PMID:41290867
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研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析,在卵巢癌中鉴定出与双硫死亡相关的分子亚型 | 首次将双硫死亡机制纳入卵巢癌分类系统,并构建了10基因预测模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 建立卵巢癌双硫死亡相关分子亚型分类系统 | 卵巢癌患者样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞测序,空间转录组学,免疫组化 | CNN+GRU, LASSO回归,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2320 | 2025-11-29 |
Immune cell-resolved transcriptomics provides insights into the basis for variations of fish genetic resistance to viral disease
2025-Nov-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02452-z
PMID:41291655
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研究论文 | 通过整合批量组织RNA-seq和单细胞RNA-seq技术,揭示虹鳟鱼对病毒性出血性败血症病毒遗传抗性的免疫细胞特异性转录组基础 | 首次在鱼类中结合批量组织和单细胞分辨率转录组学,解析不同遗传抗性品系免疫细胞对病毒感染的异质性响应 | 研究仅针对两个极端抗性品系,可能无法完全代表自然种群中的遗传多样性 | 探究鱼类对病毒感染的遗传抗性机制 | 虹鳟鱼(抗性和易感性等基因系) | 转录组学 | 病毒性出血性败血症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 两个虹鳟鱼等基因系的前肾组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |