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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 2121 - 2140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2121 | 2026-04-29 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
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研究论文 | 探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失后，巨噬细胞通过代谢适应从免疫监视转向免疫抑制，并证明巨噬细胞谷氨酰胺合成酶条件性删除可减轻肿瘤负荷 | 研究主要基于小鼠模型和TCGA数据分析，人类患者样本的验证可能有限 | 研究β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤发展的影响 | β-连环蛋白突变肝细胞癌患者和小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | TCGA数据库包含CTNNB1突变肝癌患者样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2122 | 2026-04-29 |
Comparative transcriptomics reveals shifts in cortical architecture at the metatherian/eutherian transition
2025-Oct-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680397
PMID:41256371
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研究论文 | 通过比较转录组学揭示有袋类/真兽类过渡期皮层结构的演变 | 首次利用单核RNA测序和空间转录组学比较有袋类与真兽类哺乳动物初级视皮层的细胞类型和层状结构，揭示皮层柱在进化中的重塑特征 | 仅比较两个物种（小鼠和一种有袋类），样本代表性有限；未直接验证功能差异 | 探究有袋类与真兽类哺乳动物分叉后皮层柱细胞类型特异性组织的变化 | 有袋类动物（具体物种未提及）和小鼠的初级视皮层 | 神经科学 | NA | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 两种哺乳动物物种（有袋类和小鼠）的初级视皮层样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', Illumina NovaSeq测序平台 |
| 2123 | 2026-04-29 |
scTWAS: A powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Sep-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6531106/v1
PMID:41256005
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研究论文 | 提出scTWAS统计方法，利用单细胞数据进行细胞类型特异性转录组关联研究 | 创新采用潜变量模型和矩估计方法，解决单细胞数据的高噪声、高稀疏性和技术变异，实现细胞类型特异性TWAS分析 | 未在正文中明确说明，推测可能依赖于基因型数据的可用性和单细胞数据的质量 | 开发一种能够利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性转录组关联研究的统计方法 | 血液和脑组织中的细胞类型，以及29种血液性状、3种免疫相关疾病和阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜变量模型 | 基因表达数据 | 未在标题和摘要中明确提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2124 | 2026-04-29 |
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7603392/v1
PMID:41041542
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现，结肠中存在类似胸腺未成熟和中间前体状态的iNKT细胞群，并且CD1d+杯状细胞通过形成抗原通道扩增这些细胞以限制结肠炎 | 颠覆了结肠iNKT细胞在断奶后固定不变的经典观点，首次证明成年结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞亚群，并揭示杯状细胞作为非传统抗原呈递细胞调控iNKT细胞扩增的新机制 | 未明确说明 | 探究结肠iNKT细胞的异质性及其在结肠炎中的调控机制 | 人类和小鼠结肠中的iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠结肠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2125 | 2026-04-29 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
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协议 | 提出了一种使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 利用变分自编码器建模单细胞RNA测序数据中的剂量依赖性化学扰动效应，实现基因表达预测 | NA | 开发并验证一种预测化学扰动后基因表达的计算协议 | 单细胞基因表达数据及剂量响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2126 | 2026-04-29 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 该研究发现线粒体ATP的模式化分布能够预测组织折叠，揭示了胚胎发育中生物能量学的空间维度 | 首次发现化学能量（ATP）在形态发生过程中呈现空间模式，并且线粒体在细胞顶端富集是多种动物保守的机制，可利用这种亚细胞模式通过计算预测组织折叠 | 未明确说明研究的局限 | 研究胚胎发育期间线粒体ATP模式和空间分布与组织折叠之间的关系 | 果蝇、小鼠、鸡胚胎的上皮细胞 | 生物信息学 | NA | 时序成像、空间转录组学、氧耗率测量 | 计算模型 | 图像、转录组数据 | 涉及果蝇、小鼠和鸡胚胎等多种模式生物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2127 | 2026-04-29 |
Macrophages drive a fibrogenic gene program of periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670195
PMID:40894696
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，整合MERSCOPE空间转录组学、bulk RNA-seq和SomaScan蛋白质组学，揭示巨噬细胞与肝星状细胞在原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞串扰机制 | 首次采用多组学整合分析（空间转录组、批量RNA-seq和蛋白质组）系统描绘PSC中导管周围纤维化区域的细胞-细胞相互作用，并鉴定出巨噬细胞中17个纤维化驱动基因和肝星状细胞中6个效应基因 | NA | 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中导管周围纤维化的细胞串扰和分子机制 | 儿童原发性硬化性胆管炎患者肝组织和血浆样本 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、bulk RNA-seq、SomaScan蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | MERSCOPE | MERSCOPE空间转录组平台 |
| 2128 | 2026-04-29 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
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研究论文 | 通过分析新冠感染合并肺移植患者的免疫特征，发现其RBD特异性抗体显著降低，并利用单细胞RNA测序和多重细胞因子分析揭示了特定的细胞扩增和细胞因子变化 | 首次在COVID-19相关肺损伤合并肺移植患者中全面描述免疫特征，包括RBD抗体水平、单细胞转录组和细胞因子谱的综合分析 | 样本量有限且仅关注循环血液中的免疫细胞，未涉及肺部局部免疫环境 | 探究新冠感染合并肺移植患者的免疫学特征及其与疾病进展的关系 | COVID-19相关肺损伤接受肺移植的患者、非移植新冠患者、血清阴性对照 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子表达数据 | 多项组群对比研究，具体样本量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于白细胞单细胞RNA测序 |
| 2129 | 2026-04-29 |
Senolytic treatment with fisetin reverses age-related endothelial dysfunction partially mediated by SASP factor CXCL12
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670216
PMID:40894771
|
研究论文 | 使用单细胞转录组学评估非瑟酮（fisetin）抗衰老治疗对老年小鼠主动脉内皮细胞衰老和内皮功能障碍的影响，并发现SASP因子CXCL12是部分介导年龄相关性内皮功能障碍的关键因子 | 首次通过单细胞转录组学系统鉴定老年小鼠主动脉内皮细胞中SASP因子的表达变化，并验证非瑟酮可逆转CXCL12等SASP因子的表达，从而改善内皮功能 | 该研究主要基于小鼠模型，体外实验使用人内皮细胞，但尚需在人体中验证非瑟酮的抗衰老效果及其对CXCL12的调控作用 | 探究内皮细胞衰老相关信号通路、内皮来源SASP因子及其对年龄相关性内皮功能障碍的影响，并评估非瑟酮的干预效果 | 年轻（6月龄）和老年（27月龄）小鼠主动脉内皮细胞，以及培养的人内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共4组小鼠：年轻组和老年组（各含非瑟酮处理组和对照组），每组6只（原文未明确提及具体数量，但通常每组3-5只），另用体外分离的小鼠动脉和人内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2130 | 2026-04-29 |
Dynamical systems theory as an organizing principle for single-cell biology
2025-Aug-01, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00565-3
PMID:40750599
|
评论 | 本文提出将动力系统理论作为解释单细胞生物学的组织原则，旨在为单细胞转录组数据提供可解释的因果定量分析框架 | 将动力系统理论首次系统性地应用于单细胞生物学领域，为理解基因表达异质性和细胞轨迹提供因果定量视角 | 未具体阐述该理论在复杂生物系统中的实际验证和实施细节 | 建立单细胞基因表达数据的统一理论框架，融合动力系统理论以增强数据解释能力和医疗应用潜力 | 单细胞转录组数据中的基因表达异质性和细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | NA | 动力系统模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2131 | 2026-04-29 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本文研究双特异性磷酸酶1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞炎症通路中的作用 | 通过多组学方法（单细胞RNA测序和蛋白质组学）发现DUSP1在疏螺旋体脂蛋白诱导的巨噬细胞反应中起关键调控作用 | 仅在小鼠骨髓来源巨噬细胞中进行，未在体内或人类细胞中验证 | 探索DUSP1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞免疫反应中的功能和机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2132 | 2026-04-29 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2025-07-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf079
PMID:40509864
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研究论文 | 通过靶向单细胞表达谱分析，鉴定调控睡眠与代谢状态整合的神经元和基因 | 首次利用靶向单细胞测序技术对单个LHLK神经元进行转录组分析，鉴定出睡眠-代谢相互作用的新调控因子 | 仅限于果蝇模型，且仅关注单个神经元类型，可能遗漏其他相关神经元或全身性调控机制 | 研究单个神经元在睡眠与代谢交互中的转录变化及功能基因 | 果蝇（Drosophila melanogaster）的侧角亮氨酸激酶（LHLK）神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序（single-cell sequencing） | NA | 基因表达数据 | 果蝇LHLK神经元（喂食状态与24小时饥饿状态对比，具体样本未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞CEL-Seq | 靶向单细胞CEL-Seq对单个LHLK神经元进行RNA分离和测序 |
| 2133 | 2026-04-29 |
Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658533
PMID:40661498
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研究论文 | 研究发现，老年小鼠伤口愈合过程中细胞衰老反应减弱且发生了质变，从有益于愈合的细胞外基质重塑转变为有害的促炎状态，导致伤口闭合延迟 | 首次揭示了衰老相关伤口愈合延迟中，伤口微环境的衰老反应不仅数量减少，而且功能发生了从有益到有害的转变，并利用单细胞RNA测序鉴定出p16/p21/Ki67阳性衰老成纤维细胞的独特亚群 | NA | 探究衰老个体皮肤伤口愈合延迟中细胞衰老反应的变化及其机制 | 幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口组织，以及人伤口组织（来自年轻捐赠者） | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 若干幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2134 | 2026-04-29 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
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研究论文 | 发现脯氨酸能够显著缓解环境浓度下环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调控TCA循环代谢通量降低细菌质子动力势，从而抑制抗生素摄取并减少耐药亚群的形成，且该效应在土壤微宇宙实验中保持了微生物群落多样性 | 基于单一模式菌株（土壤分离大肠杆菌）和短期实验（24天），对其他抗生素和菌群的普适性验证有限 | 探索氨基酸类化合物在环境层面控制抗生素耐药性进化的可行性及机理 | 土壤分离大肠杆菌及土壤微生物群落 | 机器学习 | 传染性疾病 | 转录组学、碳代谢流分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、代谢通量数据、单细胞转录组数据 | 24天进化实验（18种氨基酸筛选）、土壤微宇宙实验（1组最优剂量5 mg/kg） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA-seq分析 |
| 2135 | 2026-04-29 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
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研究论文 | 利用空间转录组学和流式细胞术研究隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构，揭示替代激活的单核细胞来源髓系细胞促进肺真菌肉芽肿中细胞外病原体持续存在的机制 | 挑战了替代激活髓系细胞是真菌内在复制生态位的传统观点，发现真菌主要存在于细胞外环境，并首次提出Th2-髓系回路形成局部免疫抑制环境驱动真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和特定真菌病原体（隐球菌），可能不完全代表人类潜伏感染的真实情况 | 阐明潜伏真菌感染中无法产生杀菌免疫的潜在机制，寻找宿主导向治疗新靶点 | 肺部真菌肉芽肿中的免疫细胞（特别是单核细胞来源髓系细胞和CD4 T辅助2细胞） | 数字病理学 | 肺真菌感染 | 空间转录组学、流式细胞术、命运图谱、小鼠遗传工具 | NA | 空间转录组数据、流式细胞术数据 | 涉及小鼠模型样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 2136 | 2026-04-29 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-05-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 首次构建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，定义其分泌细胞和免疫细胞群体 | 首次对小鼠精囊进行单细胞RNA-seq分析，揭示了该组织的主要细胞类型及其转录组特征 | 未明确说明局限性 | 理解精囊的细胞组成和功能，为精囊在生殖和后代发育中的作用提供资源 | 小鼠精囊组织 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 基因表达数据 | 23只不同年龄的小鼠，暴露于多种饮食挑战 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2137 | 2026-04-29 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-May-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小麦叶片在PEG诱导干旱胁迫下的细胞应答机制 | 首次在单细胞水平系统分析干旱不敏感与敏感小麦幼苗在PEG诱导胁迫下的细胞异质性反应，并识别出多个细胞类型特异基因及主调控转录因子 | 仅依赖于PEG模拟干旱条件，未在自然干旱环境中验证；此外，研究局限于小麦叶片组织，未涵盖根部等其他关键器官 | 研究小麦叶片在干旱胁迫下的细胞层面应答机制 | 干旱不敏感和敏感的小麦幼苗叶片 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小麦品系（干旱不敏感和敏感）的幼苗，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2138 | 2026-04-29 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 研究滑液中常驻滑膜巨噬细胞在免疫调节中的作用及其与滑膜屏障完整性的关系 | 首次在人类滑液中发现常驻滑膜巨噬细胞，并建立新的外植体模型，揭示其在炎性关节炎中上调促纤维化和促破骨信号通路 | 未提及具体局限性 | 探究滑液中常驻滑膜巨噬细胞与滑膜屏障完整性的关联及其在关节炎免疫病理中的作用 | 人类滑液中的常驻滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 关节炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2139 | 2026-04-29 |
Cancer-cell derived S100A11 promotes macrophage recruitment in ER+ breast cancer
2024-12-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2429186
PMID:39587886
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研究论文 | 通过分析25个ER+乳腺肿瘤的单细胞RNA测序数据，发现癌细胞分泌的S100A11促进巨噬细胞招募，揭示其在肿瘤微环境中的调控作用 | 首次发现S100A11在巨噬细胞与癌细胞相互作用中的新角色，并验证其作为潜在治疗靶点调控富含巨噬细胞的肿瘤微环境 | NA | 探究雌激素受体阳性乳腺癌中癌细胞与巨噬细胞的相互作用机制，特别是S100A11的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 25个雌激素受体阳性乳腺肿瘤中的癌细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 25个雌激素受体阳性乳腺肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2140 | 2026-04-29 |
sc-SPLASH provides ultra-efficient reference-free discovery in barcoded single-cell sequencing
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630263
PMID:39763839
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研究论文 | sc-SPLASH是一种高效的分析流程，能够对条形码化的单细胞RNA测序和空间转录组数据进行无参考基因组的从头发现 | 首次将统计学优先、无参考基因组发现的SPLASH框架扩展到条形码化单细胞RNA测序和空间转录组学数据，并提供了优化的预处理和k-mer计数模块BKC | 未提及明显的局限性 | 开发一种高效的流程，用于在单细胞和空间转录组数据中进行无参考基因组的从头发现，以捕捉传统方法遗漏的转录组多样性 | 人类细胞、海鞘、海绵 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 序列数据（k-mer计数） | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |