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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2081 | 2026-04-30 |
Spatial and temporal expression analysis of BMP signal modifiers, Smoc1 and Smoc2, from postnatal to adult developmental stages in the mouse testis
2024-12, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119383
PMID:39510490
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research paper | 研究小鼠睾丸从出生后到成年发育阶段中BMP信号调节因子Smoc1和Smoc2的时空表达 | 首次分析了Smoc1和Smoc2在出生后睾丸中的时空表达模式,揭示其在雄性生殖细胞和支持细胞中的差异表达 | 未探讨Smoc1和Smoc2在生殖过程中的具体功能机制 | 阐明Smoc1和Smoc2在小鼠睾丸发育和精子发生中的表达动态 | 小鼠(新生、幼年和成年)的睾丸组织 | machine learning | NA | RNA原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠睾丸样本,涵盖新生、幼年和成年阶段 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 2082 | 2026-04-30 |
Expression of ABC transporters in the Drosophila testis stem cell niche: Comparison of two approaches
2024-12, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119386
PMID:39638273
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研究论文 | 研究了果蝇睾丸干细胞微环境中ABC转运蛋白的表达,并比较了两种方法的结果 | 首次在果蝇睾丸这一干细胞微环境模型中系统筛选ABC转运蛋白的表达,并对比增强子/基因陷阱筛选与单细胞测序两种方法的相关性 | 两种方法结果相关性较弱,提示单一技术可能不足以准确反映基因表达 | 探讨ABC转运蛋白在果蝇睾丸干细胞微环境中的表达模式 | 果蝇睾丸干细胞微环境 | 机器学习 | NA | 增强子/基因陷阱筛选、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2083 | 2026-04-30 |
Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.19.590370
PMID:38895328
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了酵母和细菌中单细胞核糖体含量的异质性及其对生长法则的影响 | 首次在单细胞水平上研究生长法则,发现单细胞核糖体含量与生长速率并不紧密相关,挑战了传统群体平均水平下的生长法则模型 | 仅研究了两种微生物,可能不适用于所有物种;未深入探讨引起单细胞核糖体含量变异的分子机制 | 探究单细胞水平的核糖体含量异质性及其与生长速率的关系,评估生长法则在单细胞层面的适用性 | 酿酒酵母(真核单细胞生物)与细菌(原核生物)中的单细胞 | 机器学习和生物信息学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | 来自多种条件、重复和物种的数千个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2084 | 2026-04-30 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532947
PMID:36993595
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研究论文 | mosna是一个Python包,用于分析空间组学数据并整合临床数据,以揭示与免疫治疗反应和癌症生存相关的细胞相互作用模式 | 开发了一个与所有空间组学方法兼容的Python包,能够整合多种算法并利用临床数据构建准确的空间网络,无缝训练机器学习模型并识别最具预测力的变量 | NA | 使空间组学数据与临床或生物数据的集成分析更加易于进行,从而获得对细胞相互作用模式或组织结构的生物学洞察 | 空间组学数据产生的数据集,包括亚细胞分辨转录组学(MERFISH、seqFISH)、蛋白质组学(CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光)以及基于斑点的空间转录组学(10x Visium) | 计算机视觉 | 癌症 | 空间组学 | 机器学习 | 模态数据(空间组学数据与临床数据) | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 2085 | 2026-04-30 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了PERCEPTION计算流程,利用单细胞转录组数据预测癌症患者治疗反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量与单细胞表达谱构建个性化治疗反应模型,并成功在多个临床试验中验证 | NA | 开发基于单细胞转录组的精准肿瘤学计算工具,实现患者分层与治疗优化 | 培养细胞、患者肿瘤来源的原代细胞、多发性骨髓瘤和乳腺癌临床试验样本、肺癌患者 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤, 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 大规模细胞系药物筛选数据及多个临床队列 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 2086 | 2026-04-30 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 该研究揭示肿瘤细胞PD-L1通过与髓系细胞PD-1结合,激活SHP2抑制I型干扰素信号通路,从而削弱细胞毒性T淋巴细胞向肺转移灶的募集,促进肿瘤免疫逃逸 | 首次发现肿瘤PD-L1并非直接抑制T细胞活性,而是通过髓系PD-1介导的SHP2-IFN-I-STAT1-CXCL9信号轴调控CTL募集,并证实该机制在肺转移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅显示相关性,未完全验证机制;未阐明其他肿瘤模型或器官转移中的普适性 | 阐明肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中通过髓系细胞介导的分子机制 | 肿瘤细胞(PD-L1)、髓系细胞(PD-1)、细胞毒性T淋巴细胞、小鼠肺转移模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(未明确具体数量);人癌症患者样本(数量未指定) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2087 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2088 | 2026-04-30 |
Expansion, persistence, and efficacy of donor memory-like NK cells infused for posttransplant relapse
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154334
PMID:35349491
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研究论文 | 该研究通过I期临床试验,评估了供者来源的记忆样自然杀伤细胞在单倍体相合造血干细胞移植后复发患者中的扩增、持久性和疗效 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式技术在纵向时间点对输入体内的记忆样NK细胞亚群进行高分辨率特征分析,揭示了其在免疫相容环境中的快速扩增和长期持续能力 | 初始仅纳入6例患者,样本量较小,且未详细阐述记忆样NK细胞与T细胞和肿瘤靶标的相互作用机制 | 评估供者来源的细胞因子诱导的记忆样NK细胞治疗异基因造血干细胞移植后髓系肿瘤复发的安全性和有效性 | 接受单倍体相合造血干细胞移植后复发的髓系肿瘤患者 | 数字病理学 | 髓系肿瘤 | 单细胞RNA测序,质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据,免疫表型数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2089 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals evolution of immune landscape during glioblastoma progression
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01215-0
PMID:35624211
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演变 | 首次在小鼠模型中通过单细胞转录组学系统描绘了GBM进展全过程中免疫细胞组成的大规模纵向变化,并发现与临床样本的低级别胶质瘤和GBM中相似的微胶质细胞和巨噬细胞关系 | 未明确提及局限性 | 研究胶质母细胞瘤进展过程中免疫微环境的动态演变及标准治疗的影响 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者活检样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者低级别胶质瘤和GBM活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2090 | 2026-04-30 |
Human CD206+ macrophages associate with diabetes and adipose tissue lymphoid clusters
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146563
PMID:34990410
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研究论文 | 本研究分析了人类脂肪组织中三种巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用,发现CD206+CD11c-巨噬细胞与糖尿病相关,并在血管化淋巴样簇中聚集 | 首次在人类脂肪组织中定义CD206+巨噬细胞亚型与2型糖尿病的关联,并揭示其独特的基因表达谱和空间分布特征 | 样本量有限且仅来自肥胖参与者,未纳入正常体重或非糖尿病对照组 | 探究人类脂肪组织巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用及其基因表达特征 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的内脏脂肪组织和皮下脂肪组织 | 机器学习和数据分析 | 糖尿病、肥胖 | 单细胞转录组学、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 2091 | 2026-04-30 |
External signals regulate continuous transcriptional states in hematopoietic stem cells
2021-12-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66512
PMID:34939923
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序,研究造血干细胞在外部信号刺激下的转录状态变化及其调控机制 | 首次在体内单细胞水平揭示造血干细胞对干扰素、G-CSF和前列腺素等微环境信号的转录反应异质性,发现六种标记基因富集但不排他的HSC状态,并证明染色质状态预先决定了HSC对信号的响应能力 | 未明确说明局限性 | 探究造血干细胞在外部应激信号下调控连续转录状态的分子机制 | 小鼠造血干细胞和LSK祖细胞 | 单细胞组学 | 血液疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 功能验证的小鼠HSC和LSK祖细胞(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 2092 | 2026-04-30 |
Sequential regulation of hemogenic fate and hematopoietic stem and progenitor cell formation from arterial endothelium by Ezh1/2
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.014
PMID:34143974
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研究论文 | 描述了Ezh1/2通过调控动脉内皮的血液命运和造血干细胞与前体细胞形成的顺序机制 | 首次阐明Ezh1在脊椎动物HSPC生产中通过调控血液体细胞承诺的机制作用,揭示Ezh1/2的非冗余顺序功能 | 未提供 | 研究Ezh1/2在造血干细胞和前体细胞形成中的调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 斑马鱼胚胎样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2093 | 2026-04-30 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 建立了三维鼠支气管肺泡类器官模型,模拟远端肺发育和疾病 | 首次通过FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养,实现了高度分支的三维结构生成,并结合单细胞RNA测序和电镜验证细胞组成,支持巨噬细胞植入和病毒建模 | 未提及体外模型与体内环境的完全对应性及长期培养稳定性 | 建立复杂类器官模型以研究远端肺发育、感染和再生过程 | 小鼠支气管肺泡干细胞和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、电子显微镜 | 三维类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2094 | 2026-04-30 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
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research paper | 通过对五例三阴性乳腺癌进行单细胞RNA测序,揭示了肿瘤基质中成纤维细胞和血管周细胞的异质性及其与免疫逃逸的关联 | 首次描绘了三阴性乳腺癌中两种癌症相关成纤维细胞和两种血管周样细胞亚群,并揭示了它们与细胞毒性T细胞功能障碍和排斥的强相关性 | 未明确说明局限性 | 探究人类三阴性乳腺癌中肿瘤基质的细胞异质性及其与免疫逃逸的关系 | 五例三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本 | machine learning | lung cancer | NA | NA | 文本和测序数据 | 5例三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2095 | 2026-04-30 |
A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006
PMID:32758425
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研究论文 | 研究发现,当Notch信号被阻断时,大脑皮层星形胶质细胞在损伤后能够产生新的神经元,并揭示了其分子调控机制 | 首次证明Notch信号缺陷的星形胶质细胞在损伤后可转变为神经干细胞样状态并启动神经发生程序,且成功将星形胶质细胞神经发生与反应性胶质增生在单细胞水平上解耦 | 仅在小鼠模型中验证,且神经发生效率较低,仅少数预激活的星形胶质细胞在损伤后启动神经发生程序 | 阐明非神经源性脑区星形胶质细胞在损伤后产生新神经元的分子调控机制 | 小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2096 | 2026-04-30 |
Endothelial, pericyte and tumor cell expression in glioblastoma identifies fibroblast activation protein (FAP) as an excellent target for immunotherapy
2020, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1191
PMID:33082953
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研究论文 | 研究确认成纤维细胞活化蛋白(FAP)作为胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点,并详细分析其在肿瘤血管内皮细胞、周细胞及肿瘤细胞中的表达情况 | 首次通过多模态分析揭示FAP在胶质母细胞瘤的血管内皮细胞和周细胞上显著表达,而非正常组织血管,提出FAP可作为同时靶向肿瘤细胞及血管网络的理想免疫治疗抗原 | 未提及具体临床试验验证或体内功能研究,且儿童脑肿瘤样本的泛癌表达分析可能局限于已公开转录组数据集 | 验证FAP作为胶质母细胞瘤免疫治疗抗原的可行性,并明确其细胞定位与表达特征 | 人类胶质母细胞瘤组织样本、正常脑组织、胶质瘤神经干细胞(GNS)培养物、健康星形胶质细胞和神经元培养物及多个儿科脑肿瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫染色、流式细胞术、单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 组织切片、细胞培养物、单细胞测序数据 | 包含多个胶质母细胞瘤患者组织样本及公开转录组数据集,具体数字未明确说明 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序试剂盒及Illumina NovaSeq测序平台 |
| 2097 | 2026-04-30 |
Dynamics of genomic clones in breast cancer patient xenografts at single-cell resolution
2015-Feb-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13952
PMID:25470049
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研究论文 | 通过深度基因组和单细胞测序方法,以单细胞分辨率研究乳腺癌患者异种移植模型中基因组克隆的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下系统检查了移植和传代对肿瘤基因组克隆结构的影响,并揭示了克隆选择的重复性 | 未明确提及,但可能包括样本量有限(15例)及免疫缺陷小鼠模型的局限性 | 探讨乳腺癌异种移植过程中克隆动态的机制及其对肿瘤生物学研究的意义 | 原发性和转移性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度基因组测序、单细胞测序 | NA | 基因组测序数据、单细胞测序数据 | 15例乳腺癌病例 | NA | NA | NA | NA |
| 2098 | 2026-04-29 |
Extracellular vesicle-mediated transcellular mitophagy as a modulatory target for moderate hyperoxia-induced alveolar developmental arrest in bronchopulmonary dysplasia
2026-Jun, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 揭示中度高氧诱导支气管肺发育不良中成纤维细胞通过细胞外囊泡介导的线粒体自噬传递导致肺泡发育停滞的机制 | 首次阐明成纤维细胞通过富含外线粒体膜蛋白VDAC1的细胞外囊泡抑制肺泡上皮细胞线粒体自噬,从而在BPD中发挥关键作用 | NA | 探究中度高氧下成纤维细胞如何参与肺泡发育停滞的机制,为支气管肺发育不良寻找治疗靶点 | 中度高氧诱导的支气管肺发育不良小鼠模型中的成纤维细胞和II型肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡分析 | NA | 基因表达数据, 图像 | 中度高氧(60%氧气)暴露的BPD小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2099 | 2026-04-29 |
Advancing single-cell omics and cell-based therapeutics with quantum computing
2026-May, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-025-00918-0
PMID:41478876
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综述 | 探讨量子计算在单细胞组学和基于细胞的治疗中的进展与挑战,通过高分辨率检测与先进计算工具整合,构建细胞行为的精准模型 | 首次系统阐述量子计算如何协同人工智能,解决单细胞分析中捕获细胞动态的计算瓶颈,并提出与基于细胞治疗的整合路径 | 作为路线图文章,未提供实验验证或具体算法实现,主要基于理论探讨和案例研究 | 探索量子计算在单细胞空间转录组学和多组学技术中的应用,推动细胞行为模型的变革 | 单细胞和细胞群体行为模型、基于细胞的治疗策略 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、空间转录组学、多组学技术 | NA | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 2100 | 2026-04-29 |
Serial Spatial Transcriptomes Reveal Regulatory Transitions in Maize Leaf Development
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70515
PMID:41493197
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研究论文 | 优化了使用10× Genomics Visium系统的空间转录组学协议,并开发计算流程重建玉米幼苗中SAM和连续发育叶片的三维基因表达谱,揭示从SAM中未分化干细胞到功能分化叶片结构的动态转变 | 首次优化了基于10× Genomics Visium系统的空间转录组学实验流程与计算分析管线,实现了玉米叶片发育过程中基因表达的三维空间定位与动态追踪,优于缺乏时空背景的单细胞转录组分析 | 目前该方法的应用仍需要进一步的样品制备和数据处理优化,可能对某些植物组织或特定发育阶段存在适用性挑战 | 揭示玉米叶片从茎尖分生组织起源到功能分化过程中的基因表达调控网络与发育转变机制 | 玉米幼苗中的茎尖分生组织(SAM)和连续发育的叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个连续发育阶段的玉米幼苗茎尖分生组织和叶片样品 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10× Genomics Visium系统用于空间转录组学实验优化 |