单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 19961 - 19980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19961 | 2024-08-08 |
Immune-infiltrating signature-based classification reveals CD103+CD39+ T cells associate with colorectal cancer prognosis and response to immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011590
PMID:36311750
|
研究论文 | 本文开发了一种基于免疫相关特征的评分系统，用于结直肠癌患者的预后预测和免疫治疗效果评估 | 构建了基于54个无复发生存期相关免疫特征的免疫相关特征评分（IRScore），并发现CD103+CD39+ T细胞在CRC患者中的富集与良好的预后和免疫检查点阻断治疗反应相关 | NA | 构建一个基于详细免疫特征的评分系统，以对结直肠癌患者进行分层 | 结直肠癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | CRC患者的CD45+细胞 |
| 19962 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on T-cell marker genes to predict prognosis and therapeutic response in lung squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.992990
PMID:36311764
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于T细胞标记基因的签名，用于预测肺鳞状细胞癌的预后和治疗反应 | 首次在肺鳞状细胞癌中利用T细胞标记基因构建预后签名，并验证其在不同队列中的有效性 | NA | 探索肺鳞状细胞癌中T细胞标记基因的预后价值和治疗反应 | 肺鳞状细胞癌患者的预后和治疗反应 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练队列、测试队列和GEO队列中的多个样本 |
| 19963 | 2024-08-08 |
Significance of macrophage infiltration in the prognosis of lung adenocarcinoma patients evaluated by scRNA and bulkRNA analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1028440
PMID:36311801
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA分析技术，探讨巨噬细胞浸润对肺腺癌患者预后的影响 | 本研究首次通过单细胞测序技术识别肺腺癌组织中巨噬细胞亚型的标记基因，并构建了基于这些基因的风险评分模型 | NA | 探讨巨噬细胞浸润对肺腺癌患者预后的影响 | 肺腺癌患者的巨噬细胞浸润及其对预后的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, WGCNA (加权基因共表达网络分析) | 风险评分模型 | RNA | 多个数据队列（TCGA-LUAD, GSE11969, GSE31210, GSE50081, GSE72094, GSE8894, GSE19188, GSE26939, GSE42127）和临床样本 |
| 19964 | 2024-08-08 |
Insights into the roles and driving forces of CCT3 in human tumors
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1005855
PMID:36313331
|
研究论文 | 本研究从泛癌角度探讨CCT3的特征及其在肿瘤中的驱动作用 | 首次构建了lncRNA/circRNA-miRNA-CCT3调控网络，并预测了CCT3的敏感药物 | NA | 探索CCT3在多种肿瘤中的作用及其驱动因素 | CCT3在肿瘤中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | 生物信息学分析，单细胞测序 | NA | mRNA，蛋白质，单细胞测序数据 | 多种肿瘤类型的样本 |
| 19965 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the difference in human normal and degenerative nucleus pulposus tissue profiles and cellular interactions
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1051707
PMID:36313561
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19966 | 2024-08-08 |
Single-nuclei analysis reveals depot-specific transcriptional heterogeneity and depot-specific cell types in adipose tissue of dairy cows
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1025240
PMID:36313560
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析，揭示了奶牛内脏和皮下脂肪组织中细胞类型的差异性和特定亚型 | 首次在奶牛脂肪组织中展示了细胞类型和库特异性异质性，为针对脂肪组织的策略开发提供了新见解 | NA | 阐明奶牛内脏和皮下脂肪组织在单核水平上的细胞多样性差异 | 奶牛的内脏和皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从三头奶牛收集的匹配的皮下和内脏脂肪组织样本 |
| 19967 | 2024-08-08 |
Cellular milieu in clear cell renal cell carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.943583
PMID:36313721
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综述 | 本文综述了最近关于透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的单细胞转录组学研究，旨在阐明PTEC在ccRCC发展中的转变以及可能限制靶向免疫治疗反应的免疫细胞类型、状态和相互作用 | 提出基质细胞可能是ccRCC复发和局部侵袭的关键驱动因素 | 对于ccRCC恶性转变和免疫检查点治疗抵抗的机制仍不完全清楚 | 阐明ccRCC微环境中的细胞环境，从而定义ccRCC的临床、治疗和预后特征 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其发展过程中的细胞转变和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19968 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling lights different cell trajectories in plants
2021-Mar, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-021-00040-7
PMID:36304478
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综述 | 本文主要讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）方法在植物干细胞维持和分化、细胞对环境变化的响应以及scRNA-seq改进策略方面的最新见解 | 介绍了scRNA-seq在植物干细胞维持和分化中的应用，以及空间转录组学、表观基因组学和单细胞多组学等技术的新视角 | NA | 探讨scRNA-seq在植物干细胞维持和分化中的应用及其改进策略 | 植物干细胞的维持和分化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 19969 | 2024-08-08 |
The regenerative response of cardiac interstitial cells
2023-03-29, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac059
PMID:36271843
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研究论文 | 研究心脏间质细胞在心脏再生过程中的作用 | 采用单细胞RNA测序技术研究斑马鱼心脏再生过程中的间质细胞行为，并结合免疫组化、化学抑制和转基因动物等方法，揭示了间质细胞在心脏再生中的重要作用 | NA | 理解心脏再生过程，并探索如何在人类中诱导这一过程以逆转心肌梗塞造成的损伤 | 心脏间质细胞在心脏再生中的行为 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼心脏的间质细胞 |
| 19970 | 2024-08-08 |
Functional genomics analysis identifies loss of HNF1B function as a cause of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2023-03-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddac262
PMID:36282544
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研究论文 | 本研究通过功能基因组学分析，确定了HNF1B功能的丧失是Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的一个原因 | 首次建立了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征II型的小鼠模型，并揭示了HNF1B功能丧失导致的分子机制 | NA | 探讨Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的遗传基础及其分子机制 | Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征患者及小鼠模型 | 遗传学 | 生殖系统疾病 | 微阵列分析，单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据，RNA序列数据 | 13名Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征患者及Hnf1b敲除小鼠胚胎的子宫组织 |
| 19971 | 2024-08-05 |
The transcription factor JUN is a major regulator of quiescent pancreatic stellate cell maintenance
2023-Jan-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147000
PMID:36283605
|
研究论文 | 该研究识别了转录因子JUN在维持胰腺星状细胞静止状态中的关键作用 | 通过整合单细胞测序数据并使用WGCNA和SCENIC算法，首次揭示了JUN作为主要转录因子的作用 | 本研究未详细探讨JUN的其他潜在调控机制 | 探讨胰腺星状细胞从静止状态转化为激活状态的主要机制 | 胰腺星状细胞及其在胰腺损伤相关疾病中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | RNA测序 | 多个胰腺组织的单细胞样本 |
| 19972 | 2024-08-08 |
OrganoidDB: a comprehensive organoid database for the multi-perspective exploration of bulk and single-cell transcriptomic profiles of organoids
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac942
PMID:36271792
|
research paper | 介绍了一个名为OrganoidDB的综合性数据库，用于多角度探索组织体的批量和单细胞转录组数据 | OrganoidDB整合了来自人和鼠的16,218个组织体样本的批量和单细胞转录组数据，并允许在不同模式下查询基因表达 | NA | 促进对组织体的更好理解，并帮助改进组织体培养协议 | 组织体的转录组数据 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 16,218个组织体样本 |
| 19973 | 2024-08-08 |
VISTA Targeting of T-cell Quiescence and Myeloid Suppression Overcomes Adaptive Resistance
2023-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0116
PMID:36260656
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研究论文 | 本研究探讨了VISTA在肿瘤治疗中的作用，特别是在克服适应性免疫检查点抵抗中的应用 | 首次报道了检查点调节剂影响CD8+ T细胞静止状态，并首次表明静止状态可能是T细胞衰竭和癌症治疗中的一个目标 | NA | 研究VISTA在开发抗肿瘤免疫中的作用，并提供重要的机制见解 | VISTA在肿瘤治疗中的作用及其对T细胞和骨髓细胞的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重图像分析、流式细胞术 | NA | 图像、RNA | CT26结直肠癌细胞模型 |
| 19974 | 2024-08-05 |
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2815-7_12
PMID:36264495
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研究论文 | 文章概述了单细胞RNA测序数据的标准计算工作流程 | 提供了对单细胞RNA测序数据分析标准工作流程的全面理解 | 未具体提及数据集的规模和具体实例 | 探讨单细胞RNA测序数据的计算分析方法 | 单细胞RNA测序(SCNRA-seq)技术 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 19975 | 2024-08-05 |
Unravelling the landscape of skin cancer through single-cell transcriptomics
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101557
PMID:36257209
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综述 | 本论文综述了通过单细胞转录组学深入研究皮肤癌的最新进展 | 创新点在于强调了单细胞转录组学在皮肤癌研究中的应用，特别是在免疫细胞的贡献方面 | 该文献未提及具体的技术局限性或数据缺陷 | 研究旨在利用单细胞转录组学技术明确皮肤癌的细胞类型和状态 | 研究对象为皮肤癌相关的细胞类型及其在疾病演变中的角色 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 19976 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed cellular and molecular immune profiles in lung squamous cell carcinoma
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101568
PMID:36270103
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肺鳞状细胞癌（LUSC）微环境的细胞和分子免疫特征 | 发现了高表达的免疫抑制受体TIGIT在调节性T细胞和耗竭的CD8T细胞中的作用，以及肿瘤相关中性粒细胞（TAN）通过表达IL1RN发挥免疫抑制作用，同时观察到SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的增加与患者不良生存相关 | NA | 深入了解肺鳞状细胞癌的免疫景观，并为未来的药物发现提供重要资源 | 肺鳞状细胞癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及7种主要细胞类型 |
| 19977 | 2024-08-08 |
Hepatitis B Virus Utilizes a Retrograde Trafficking Route via the Trans-Golgi Network to Avoid Lysosomal Degradation
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.10.008
PMID:36270602
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了DOCK11在HBV生命周期中的作用及其对cccDNA水平的影响，揭示了HBV通过逆向运输途径避免溶酶体降解的机制。 | 发现DOCK11与HBV衣壳及逆向运输蛋白相互作用，开辟了从早期内体到高尔基体再到内质网的替代逆向运输途径，帮助HBV避免溶酶体降解。 | NA | 探讨DOCK11在HBV生命周期中的作用及其对cccDNA水平的影响，揭示HBV感染的机制。 | DOCK11在HBV生命周期中的作用及HBV的逆向运输途径。 | NA | 肝炎B | 单细胞转录组分析、超分辨率显微镜、邻位连接分析、时间流逝分析、液相色谱-串联质谱、免疫印迹、酶联免疫吸附试验 | NA | 转录组数据 | HBV阳性和HBV阴性的肝细胞癌细胞系 |
| 19978 | 2024-08-08 |
Cell Dissociation Techniques in Salamanders
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2659-7_25
PMID:36272089
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研究论文 | 本文描述了在蝾螈中使用四种不同分离条件（酶解/非酶解）进行细胞解离的技术，并评估了这些方法对细胞表面表型和细胞多样性的影响 | 介绍了不同酶解方法对细胞解离效果的影响，并提供了优化协议的模板 | 文章中提到的酶解方法在某些情况下可能导致细胞表面标记物的丢失 | 研究细胞解离技术对细胞表型和细胞多样性的影响 | 蝾螈的脾脏和再生肢体 | NA | NA | 细胞解离技术 | NA | 细胞 | 使用蝾螈的脾脏和再生肢体进行实验 |
| 19979 | 2024-08-08 |
Tetramer-aided sorting and single-cell RNA sequencing facilitate transcriptional profiling of antigen-specific CD8+ T cells
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101559
PMID:36279715
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研究论文 | 本研究探讨了使用四聚体辅助流式细胞术分选抗原特异性CD8+ T细胞进行单细胞分析的可行性，并识别出一个与癌症免疫治疗反应预测相关的抗原特异性反应（ASR）基因特征 | 本研究首次识别出一个具有预测价值的抗原特异性反应（ASR）基因特征，该特征与肺癌患者接受抗PD-L1、抗VEGF和化疗联合治疗的无进展生存期显著相关 | 研究仅使用了HLA-A*02:01限制性的人巨细胞病毒（CMV）pp65肽特异性CD8+ T细胞作为模型，可能限制了结果的普遍性 | 验证使用四聚体辅助流式细胞术分选抗原特异性CD8+ T细胞进行单细胞分析的方法，并识别与癌症免疫治疗反应相关的基因特征 | 抗原特异性CD8+ T细胞的频率和基因表达谱 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及肺癌患者接受抗PD-L1、抗VEGF和化疗联合治疗的样本 |
| 19980 | 2024-08-08 |
Applications of Transcriptomics in the Research of Antibody-Mediated Rejection in Kidney Transplantation: Progress and Perspectives
2022-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2022.2131357
PMID:36259540
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研究论文 | 本文探讨了转录组学方法在肾移植中抗体介导排斥反应研究中的应用及其进展和展望 | 引入单细胞RNA测序技术，提供高分辨率的免疫细胞转录组图谱，以揭示抗体介导排斥反应的发病机制 | 传统的批量转录组方法仅反映平均基因表达，忽略了单个细胞间的转录组异质性 | 改进抗体介导排斥反应的临床诊断标准，并探索新的治疗策略 | 肾移植中的抗体介导排斥反应 | 转录组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及移植肾活检样本 |