单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 19961 - 19980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19961 | 2024-08-08 |
A novel risk score model based on fourteen chromatin regulators-based genes for predicting overall survival of patients with lower-grade gliomas
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.957059
PMID:36246611
|
研究论文 | 本文构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型，用于预测低级别胶质瘤患者的总体生存率 | 首次构建并验证了一个基于14个染色质调控因子的风险评分模型，用于预测低级别胶质瘤患者的预后 | NA | 揭示染色质调控因子在低级别胶质瘤患者中的功能和价值 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 870个染色质调控因子 |
| 19962 | 2024-08-08 |
Critical role of guanylate binding protein 5 in tumor immune microenvironment and predictive value of immunotherapy response
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.984615
PMID:36246628
|
研究论文 | 本研究探讨了鸟苷酸结合蛋白5（GBP5）在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次详细分析了GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境（TME）的关系，并构建了基于GBP5表达的预后模型 | 研究主要基于公开的基因表达数据，可能存在样本选择偏倚；预后模型的外部验证有限 | 探索GBP5在泛癌中的免疫作用及其对免疫治疗反应的预测价值 | GBP5在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的33种癌症的RNA测序数据，以及来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞转录组数据 |
| 19963 | 2024-08-08 |
The soldiers needed to be awakened: Tumor-infiltrating immune cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.988703
PMID:36246629
|
研究论文 | 本文综述了肿瘤浸润性免疫细胞（TIICs）在肿瘤微环境中的作用及其在不同肿瘤中的免疫治疗策略 | 介绍了基于TIICs功能开发的各种抗肿瘤策略，如免疫检查点阻断（ICB）、过继细胞疗法（ACT）等，并探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究肿瘤特异性免疫细胞特征中的应用 | NA | 探讨肿瘤浸润性免疫细胞的功能、预后价值及针对不同肿瘤的免疫治疗策略 | 肿瘤浸润性免疫细胞（TIICs）及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 19964 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of immune ferroptosis gene in renal clear cell carcinoma: prognosis and influence of tumor microenvironment
2022, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:36247256
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研究论文 | 本研究深入探讨了免疫系统与铁死亡在肾透明细胞癌中的作用，识别了预测性生物标志物和治疗靶点。 | 构建了一个新的与免疫铁死亡相关基因的预测模型，该模型在免疫浸润、微环境和免疫逃逸中起重要作用。 | NA | 识别肾透明细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点。 | 肾透明细胞癌患者的预后和肿瘤微环境影响。 | 数字病理学 | 肾癌 | lasso-Cox风险评分模型 | lasso-Cox | 基因表达数据 | 103个免疫铁死亡相关差异表达基因 |
| 19965 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of AIM2 inflammasomes with potential implications for immunotherapy in human cancer: A bulk omics research and single cell sequencing validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.998266
PMID:36248785
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研究论文 | 本研究通过大规模组学研究和单细胞测序验证，分析了AIM2炎症小体在泛癌中的作用，并探讨了其对人类癌症免疫治疗的潜在影响。 | 首次在泛癌背景下全面分析AIM2炎症小体，并通过单细胞转录组测序技术验证其在肿瘤微环境中的激活状态。 | 研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚和数据解释的局限性。 | 探讨AIM2炎症小体在泛癌中的表达模式、预后意义及其与免疫治疗的相关性。 | AIM2炎症小体及其相关基因在不同癌症中的表达和功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas (TCGA)和The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库中的数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 19966 | 2024-08-08 |
Single cell meta-analysis of EndMT and EMT state in COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.976512
PMID:36248845
|
meta-分析 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组，以探究COVID-19中的间质过渡状态 | 首次通过分析公共数据库的单细胞测序数据，识别了早期和晚期的内皮间质过渡（EndMT）和上皮-间质过渡（EMT） | NA | 探究COVID-19患者肺部间质过渡状态及其与纤维化的关系 | 健康个体、COVID-19患者和特发性肺纤维化患者的肺细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体45例，COVID-19患者58例，特发性肺纤维化患者64例 |
| 19967 | 2024-08-08 |
Transcriptional states of CAR-T infusion relate to neurotoxicity - lessons from high-resolution single-cell SOM expression portraying
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994885
PMID:36248848
|
研究论文 | 本文通过重新分析24名患者的单细胞RNA测序数据，探讨了CAR-T细胞免疫疗法中细胞状态与神经毒性的关系 | 开发了一种单细胞数据描绘工作流程，用于解析单细胞分辨率的转录状态空间，并通过直观的可视化、功能挖掘、分子细胞分层和变异性分析展示了单细胞数据描绘的能力 | NA | 研究CAR-T细胞免疫疗法中的细胞状态与神经毒性的关系 | 24名患者的单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 24名患者，超过130,000个细胞 |
| 19968 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals effects of chemotherapy on the immune landscape and TCR/BCR clonal expansion in a relapsed ovarian cancer patient
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.985187
PMID:36248860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了化疗对复发性卵巢癌患者免疫景观及TCR/BCR克隆扩增的影响 | 首次在单细胞分辨率下，全面描述了化疗耐药患者在不同治疗阶段肿瘤、腹水和外周血中的多维细胞和免疫学图谱 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探讨化疗对复发性卵巢癌患者免疫环境的具体影响，并提出改善化疗引起的免疫损伤的策略 | 复发性化疗耐药的卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 单一患者 |
| 19969 | 2024-08-08 |
Evaluating the role of IDO1 macrophages in immunotherapy using scRNA-seq and bulk-seq in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1006501
PMID:36248886
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq）分析结直肠癌（CRC）患者，以评估IDO1巨噬细胞在免疫治疗中的作用 | 首次详细分类了结直肠癌中的巨噬细胞亚群，并揭示了IDO1巨噬细胞在不同亚群中的浸润程度差异 | NA | 研究IDO1巨噬细胞在结直肠癌免疫治疗中的作用 | 结直肠癌患者及其巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序（bulk-seq） | NA | RNA序列数据 | 多个结直肠癌患者样本 |
| 19970 | 2024-08-08 |
Metabolic-related gene pairs signature analysis identifies ABCA1 expression levels on tumor-associated macrophages as a prognostic biomarker in primary IDHWT glioblastoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.869061
PMID:36248907
|
研究论文 | 本研究通过分析代谢相关基因对签名，确定了肿瘤相关巨噬细胞中ABCA1表达水平作为原发性IDHWT胶质母细胞瘤的预后生物标志物。 | 开发了一种基于代谢相关基因对的预后签名，用于原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的个性化管理。 | NA | 开发一种针对IDHWT胶质母细胞瘤患者的稳健预后签名。 | 原发性IDHWT胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和临床数据。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了377个样本，包括204个训练集样本和173个验证集样本。 |
| 19971 | 2024-08-08 |
Expression Analysis of Ligand-Receptor Pairs Identifies Cell-to-Cell Crosstalk between Macrophages and Tumor Cells in Lung Adenocarcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/9589895
PMID:36249427
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了肺腺癌中的配体-受体对表达，揭示了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间对话。 | 首次在肺腺癌中详细分析了巨噬细胞与肿瘤细胞之间的自分泌和旁分泌网络，并构建了基于细胞间相互作用的机器学习预测模型。 | 研究依赖于已发表文献和公开数据库中的样本，可能存在数据来源的局限性。 | 探索肺腺癌中巨噬细胞与肿瘤细胞之间的细胞间通信，并识别与患者预后相关的关键基因对。 | 肺腺癌患者的单细胞和批量RNA测序样本，以及巨噬细胞和肿瘤细胞的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 159,219个单细胞（包括18,248个肿瘤细胞和29,520个巨噬细胞） |
| 19972 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and immunogenicity of chondrocytes via single-cell RNA sequencing technique in human osteoarthritis
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1004766
PMID:36249797
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中软骨细胞的异质性和免疫原性 | 首次定义了八种具有不同生物学功能的软骨细胞亚型，并发现效应软骨细胞和纤维软骨细胞可能促进骨关节炎的发展 | NA | 探索软骨细胞的生物学功能和标志物，以促进骨关节炎的准确诊断和靶向治疗 | 人骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19973 | 2024-08-08 |
SCAN-IT: Domain segmentation of spatial transcriptomics images by graph neural network
2021-Nov, BMVC : proceedings of the British Machine Vision Conference. British Machine Vision Conference
PMID:36227018
|
研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的方法SCAN-IT，通过将空间域识别问题转化为图像分割问题，利用图神经网络对空间转录组图像进行域分割 | SCAN-IT方法结合了几何建模、图神经网络和DeepGraphInfomax信息学方法，能够处理来自不同空间转录组技术的数据，包括高空间分辨率低基因覆盖率和低空间分辨率高基因覆盖率的数据 | NA | 开发一种新的方法用于空间转录组图像的域分割，以更好地理解和控制生物功能 | 复杂生物组织的空间和功能域分割 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组技术 | 图神经网络 | 图像 | NA |
| 19974 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomic analysis delineates epithelial and mesenchymal subpopulations and transition stages in childhood ependymoma
2023-04-06, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac219
PMID:36215273
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研究论文 | 利用空间转录组学分析了儿童脑肿瘤神经上皮瘤的细胞亚群和转变阶段 | 揭示了儿童神经上皮瘤的细胞组成及其在肿瘤进展中的相互作用 | 研究未说明样本的具体数量和来源 | 加深对儿童神经上皮瘤微环境的理解 | 儿童神经上皮瘤后脑室亚组A（PFA） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19975 | 2024-08-05 |
The heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations: Their origins, biomarkers, and roles in the tumor microenvironment
2023-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15609
PMID:36197901
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研究论文 | 本文探讨了癌症相关成纤维细胞亚群体的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 本研究通过单细胞转录组学策略分析CAFs的不同亚群体及其来源和生物标志物 | 未提及具体的实验数据和样本规模，可能影响结论的普适性 | 旨在深入探讨癌症相关成纤维细胞在不同肿瘤中的角色 | 研究癌症相关成纤维细胞的不同亚群体及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胃癌，结直肠癌，胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 19976 | 2024-08-05 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Early Molecular and Immune Alterations Underlying the Serrated Neoplasia Pathway Toward Colorectal Cancer
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.10.001
PMID:36216310
|
研究论文 | 本研究揭示了锯齿性肿瘤途径与结直肠癌相关的早期分子和免疫改变 | 首次通过单细胞转录组学描绘了锯齿性病变中的分子和免疫改变 | 研究样本数量有限，可能影响研究结果的广泛性 | 解析锯齿性病变中尚未明确的分子和免疫改变 | 16个锯齿性病变样本与3个正常结肠组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 19个样本（16个锯齿性病变，3个正常结肠组织） |
| 19977 | 2024-08-08 |
Implications of microglial heterogeneity in spinal cord injury progression and therapy
2023-01, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2022.114239
PMID:36216123
|
综述 | 本文综述了微胶质细胞在脊髓损伤进展和治疗中的异质性及其作用 | 利用单细胞RNA测序(Sc-RNAseq)等技术，深入研究了微胶质细胞在整个生命周期中的异质性 | NA | 探讨微胶质细胞在脊髓损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 微胶质细胞在脊髓损伤中的异质性及其功能 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | NA | NA |
| 19978 | 2024-08-08 |
Integrative genomic and transcriptomic profiling reveals distinct molecular subsets in adult mixed phenotype acute leukemia
2023-01, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.26758
PMID:36219502
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研究论文 | 本研究通过综合基因组和转录组分析方法，探索了176名成人混合表型急性白血病患者的分子特征，并定义了八个具有独特突变和基因表达特征的分子亚群 | 首次通过综合基因组和转录组分析方法，定义了混合表型急性白血病的八个分子亚群，并分析了各亚群的基因突变和表达特征 | 研究样本主要集中在成人患者，且样本量相对有限，可能影响结果的普遍性 | 通过综合基因组和转录组分析，揭示混合表型急性白血病的分子特征，以促进更精确的诊断和治疗 | 176名成人混合表型急性白血病患者及其分子特征 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序, RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 176名成人混合表型急性白血病患者，包括86名T-淋巴/髓系MPAL患者，42名Ph+ MPAL患者，36名B-淋巴/髓系MPAL患者，4名t(v;11q23)患者，8名MPAL, NOS, 罕见类型患者 |
| 19979 | 2024-08-08 |
H3K4me3 as a target of di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) impairing primordial follicle assembly
2023-Jan, Chemosphere
IF:8.1Q1
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研究论文 | 本研究探讨了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对原始卵泡组装的影响及其分子机制，特别是H3K4me3的作用。 | 发现Smyd3-H3K4me3是DEHP对小鼠早期卵泡发生过程中原始卵泡形成的新的有害ER介导效应的目标，并强调表观遗传变化作为DEHP等内分泌干扰物的重要目标。 | NA | 研究DEHP对原始卵泡组装的影响及其分子机制。 | 小鼠卵巢中的原始卵泡和H3K4me3水平。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 从DEHP暴露的母亲的后代卵巢中获取样本 |
| 19980 | 2024-08-08 |
Subcapsular Sinus Macrophages Promote Melanoma Metastasis to the Sentinel Lymph Nodes via an IL1α-STAT3 Axis
2022-12-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0225
PMID:36206577
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研究论文 | 研究了皮肤来源的肿瘤细胞通过淋巴管迁移至前哨淋巴结（sLN）的过程，并探讨了亚被膜窦（SS）中的巨噬细胞通过IL1α-STAT3轴促进黑色素瘤转移的机制 | 发现了亚被膜窦中的巨噬细胞在识别肿瘤抗原后产生促肿瘤的IL1α，并通过单细胞RNA测序揭示了IL1α信号在转移性肿瘤细胞中的STAT3为主要靶点 | NA | 探讨黑色素瘤转移至前哨淋巴结的机制及潜在的免疫治疗策略 | 亚被膜窦中的巨噬细胞、IL1α、STAT3信号通路 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受IL1α特异性阻断抗体治疗的动物中获取的微切割转移样本 |