单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 19941 - 19960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19941 | 2024-08-08 |
Anomalous Epithelial Variations and Ectopic Inflammatory Response in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2021-0555OC
PMID:36108172
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者、吸烟但无COPD者和非吸烟者的肺细胞，以识别与COPD进展相关的细胞类型特异性机制和细胞间相互作用 | 发现了COPD患者中增加的独特AT2细胞亚群，并揭示了这些细胞在炎症反应中的特殊分化路径和细胞间相互作用网络 | 由于肺实质和间质结构的复杂性，COPD中持续炎症过程的具体机制仍未完全明了 | 旨在识别推动COPD进展的细胞类型特异性机制和细胞间相互作用 | COPD患者、吸烟但无COPD者和非吸烟者的肺细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 57,918个细胞 |
| 19942 | 2024-08-08 |
A transcriptional cross species map of pancreatic islet cells
2022-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2022.101595
PMID:36113773
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对来自健康人、猪和鼠的胰腺胰岛内分泌细胞进行了转录组分析，构建了一个跨物种的转录图谱 | 首次系统地描绘了跨物种的胰腺胰岛内分泌细胞的转录异质性和进化保守性，并揭示了人类α-和β-细胞状态的连续转录景观 | 研究主要集中在健康胰岛细胞，未涉及病理状态下的细胞功能 | 旨在精确描述胰腺胰岛内分泌细胞的分子基础，特别是连接动物模型与人类胰岛细胞的关系 | 健康人、猪和鼠的胰腺胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个内分泌细胞 |
| 19943 | 2024-08-08 |
Cancer-associated fibroblasts subtypes and role in invasion and metastasis of gastric cancer
2022-Dec, Neoplasma
IF:2.0Q3
DOI:10.4149/neo_2022_220513N511
PMID:36129833
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在胃癌（GC）侵袭和转移中的作用 | 探讨了单细胞RNA测序技术在分类CAFs中的应用前景，并提出了基于细胞标记和功能的CAFs分选方法 | CAFs的异质性限制了靶向治疗的应用，需要寻找特定的标记物并将其划分为不同的亚群 | 探讨CAFs在胃癌发展中的作用及靶向治疗的可能性 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在胃癌侵袭和转移中的作用 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19944 | 2024-08-08 |
Hyaluronic acids mediate the infiltration, migration, and M2 polarization of macrophages: evaluating metabolic molecular phenotypes in gliomas
2022-12, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13315
PMID:36134697
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研究论文 | 本研究系统评估了通过代谢相关通路分类的3068个胶质瘤样本和33个胶质母细胞瘤单细胞测序样本的免疫景观，并验证了代谢集群的分子特征。 | 首次揭示了透明质酸（HA）与胶质瘤免疫浸润之间的显著联系，并发现HA通过IL-1/CHI3L1和TGF-β/CHI3L1轴促进巨噬细胞招募和M2极化。 | NA | 探讨代谢模式与胶质瘤患者生存结果和免疫活性的关系。 | 胶质瘤样本和胶质母细胞瘤单细胞测序样本。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 机器学习预测分析（pamr）、代谢组学、RNA测序 | NA | 微阵列数据、单细胞测序数据 | 3068个胶质瘤样本和33个胶质母细胞瘤单细胞测序样本，以及5842个泛癌样本 |
| 19945 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of multimodal single-cell data with structural similarity
2022-11-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac781
PMID:36130281
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研究论文 | 本文提出了一种名为SAILERX的深度学习框架，用于高效、稳健和灵活地分析多模态单细胞数据 | SAILERX框架采用变分自编码器和不变表示学习来校正测序过程中的技术噪声，并通过多模态数据对齐机制整合来自不同模态的信息，避免了硬对齐导致的噪声过拟合问题 | NA | 旨在解决多模态单细胞数据分析中的计算挑战，有效利用单细胞多组学信息来描绘细胞状态并识别有意义的信号 | 多模态单细胞数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序技术 | 变分自编码器（VAE） | 单细胞数据 | NA |
| 19946 | 2024-08-08 |
Comparison of scRNA-seq data analysis method combinations
2022-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac027
PMID:36124658
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研究论文 | 本文比较了不同组合的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法，并评估了这些组合在提高分析效率和准确性方面的效果 | 提出了12种技术组合，每种组合包含一整套scRNA-seq数据分析流程，并通过实验验证了这些组合的有效性 | NA | 评估不同scRNA-seq数据分析方法组合的效果 | scRNA-seq数据分析方法的组合 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用公开的scRNA-seq数据集Goolam，可在ArrayExpress数据库中获取，编号为E-MTAB-3321 |
| 19947 | 2024-08-08 |
sgcocaller and comapr: personalised haplotype assembly and comparative crossover map analysis using single-gamete sequencing data
2022-11-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac764
PMID:36107768
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研究论文 | 本文介绍了用于从单配子DNA测序数据生成个性化单体型和调用交叉点的软件工具sgcocaller，以及用于从单配子构建、可视化和比较个性化交叉景观的comapr | 提出了sgcocaller和comapr工具，能够在高覆盖率数据集上生成无瑕的单体型结果，并且在低覆盖率单配子测序数据上表现优于现有方法 | NA | 开发高效的软件工具，用于从单配子DNA测序数据生成个性化单体型和调用交叉点，并构建、可视化和比较个性化交叉景观 | 单配子DNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA序列 | 大量单配子样本 |
| 19948 | 2024-08-08 |
Cell type markers indicate distinct contributions of decidual stromal cells and natural killer cells in preeclampsia
2022-11-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-22-0079
PMID:36111648
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研究论文 | 本研究通过整合分析先兆子痫转录组和单细胞转录组数据，预测了基质细胞和子宫自然杀伤细胞在早期和晚期先兆子痫中的特定贡献 | 本研究结合了先兆子痫的转录组结果和单细胞测序数据，预测了基质细胞和子宫自然杀伤细胞在先兆子痫中的特定贡献，其中部分结果是出乎意料的 | NA | 研究先兆子痫中不同细胞类型的具体贡献 | 先兆子痫中的基质细胞和子宫自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19949 | 2024-08-08 |
Survival prediction optimization of acute myeloid leukaemia based on T-cell function-related genes and plasma proteins
2022-11, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18453
PMID:36113865
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研究论文 | 本研究基于T细胞功能相关基因和血浆蛋白，优化了急性髓系白血病（AML）患者的生存预测模型 | 本研究首次将T细胞功能相关基因特征纳入AML生存预测模型，并通过随机生存森林变量狩猎算法开发了八基因T细胞功能相关特征 | NA | 优化急性髓系白血病患者的生存预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 白血病 | RNA矩阵 | 随机生存森林 | RNA序列 | 1611名AML患者的数据 |
| 19950 | 2024-08-08 |
Cancer-associated fibroblasts-derived FMO2 as a biomarker of macrophage infiltration and prognosis in epithelial ovarian cancer
2022-11, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2022.09.003
PMID:36114029
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞衍生的FMO2作为上皮性卵巢癌中巨噬细胞浸润和预后标志物的角色 | 首次研究FMO2作为癌症相关成纤维细胞衍生的新型预后生物标志物在上皮性卵巢癌中的作用 | 研究主要基于现有数据库和独立队列的数据，可能需要更多临床样本验证 | 研究FMO2在上皮性卵巢癌中的作用及其与免疫成分的关联 | 上皮性卵巢癌样本中的成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 独立队列包含113个样本 |
| 19951 | 2024-08-08 |
Deficiency of Irx5 protects mice from obesity and associated metabolic abnormalities
2022-11, International journal of obesity (2005)
DOI:10.1038/s41366-022-01221-0
PMID:36115924
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研究论文 | 本研究探讨了Irx5基因在调节肥胖及相关代谢异常中的作用 | 首次揭示了Irx5在能量稳态中的功能，并通过单细胞RNA测序分析了其在下丘脑中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类中验证Irx5的作用 | 解析Irx5在肥胖和代谢异常调节中的作用 | Irx5基因敲除小鼠及其在高脂饮食挑战下的代谢表型 | 遗传学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Irx5KO小鼠模型 |
| 19952 | 2024-08-08 |
Transcriptomic changes in autophagy-related genes are inversely correlated with inflammation and are associated with multiple sclerosis lesion pathology
2022-Nov, Brain, behavior, & immunity - health
DOI:10.1016/j.bbih.2022.100510
PMID:36120103
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研究论文 | 本文研究了自噬相关基因在多发性硬化症（MS）病变病理中的表达变化及其与炎症的关系 | 首次展示了自噬相关基因在MS急性期和混合活动/非活动性病变中的表达减少，并提出了mTORC1通路可能通过持续激活抑制自噬的假设 | NA | 探讨自噬在多发性硬化症不同阶段病理中的作用及其调控机制 | 自噬相关基因在多发性硬化症病变中的表达变化及其与炎症的关系 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型及人类MS脑组织样本 |
| 19953 | 2024-08-08 |
Progressively Decreased HCN1 Channels Results in Cone Morphological Defects in Diabetic Retinopathy
2022-10-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2550-21.2022
PMID:36123121
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研究论文 | 本研究报告了在糖尿病视网膜病变中，HCN1通道的逐渐减少导致视锥细胞形态缺陷，并使用斑马鱼模型进行了系统性的单细胞转录组分析。 | 首次揭示了HCN1通道在糖尿病视网膜病变中的作用，并提出了视锥细胞在不同葡萄糖水平下的两种新型细胞状态。 | NA | 探讨糖尿病视网膜病变中视锥细胞形态缺陷的分子机制。 | 糖尿病视网膜病变中的视锥细胞及其HCN1通道表达。 | NA | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼模型 |
| 19954 | 2024-08-08 |
Unraveling unique features of plasma cell clones in POEMS syndrome with single-cell analysis
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151482
PMID:36129760
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了POEMS综合征患者的骨髓浆细胞，识别出具有特定Igλ轻链序列的POEMS克隆，并探讨了其特征和病理机制 | 首次成功通过单细胞RNA测序技术分离和鉴定了POEMS综合征中的浆细胞克隆，揭示了其独特的分子特征 | 研究样本量较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 揭示POEMS综合征中浆细胞克隆的独特特征及其病理机制 | POEMS综合征患者的骨髓浆细胞 | 数字病理学 | 浆细胞疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自POEMS综合征患者的骨髓浆细胞样本 |
| 19955 | 2024-08-08 |
Inhibition of APOC1 promotes the transformation of M2 into M1 macrophages via the ferroptosis pathway and enhances anti-PD1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2022-10, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102463
PMID:36108528
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了APOC1抑制在肝细胞癌中通过铁死亡途径促进M2巨噬细胞向M1型转化，并增强抗PD1免疫治疗的效果。 | 首次揭示了APOC1在肝细胞癌中的过度表达及其通过铁死亡途径影响巨噬细胞表型的机制，为抗PD1免疫治疗提供了新的策略。 | 研究样本量较小，仅包括四例肝细胞癌病例和两例非癌对照，可能影响结果的普遍性。 | 探讨APOC1抑制在肝细胞癌治疗中的作用及其机制。 | 肝细胞癌中的巨噬细胞表型转化及其与抗PD1免疫治疗的关系。 | digital pathology | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 212,494个细胞，包括四例肝细胞癌病例和两例非癌对照的免疫细胞。 |
| 19956 | 2024-08-08 |
Downregulation of zinc finger protein 71 expression in oral squamous cell carcinoma tissues and its underlying molecular mechanism
2022-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2022.154109
PMID:36115333
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研究论文 | 本研究探讨了锌指蛋白71（ZNF71）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）组织中的表达水平及其潜在的分子机制 | 首次描述了ZNF71在OSCC中的表达状态及其分子机制 | 需要进一步研究以验证ZNF71下调对OSCC启动和促进的影响 | 旨在确定ZNF71在OSCC组织中的特定表达水平并解释其在OSCC发病机制中的潜在分子机制 | 口腔鳞状细胞癌组织中ZNF71的表达及其分子机制 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，单细胞RNA测序，高通量RNA测序 | NA | 蛋白质，mRNA | 116例OSCC样本和29例非OSCC样本用于免疫组织化学染色，7例OSCC样本用于单细胞RNA测序，893例OSCC样本和301例非OSCC样本用于高通量RNA测序 |
| 19957 | 2024-08-08 |
Chemically-induced osteogenic cells for bone tissue engineering and disease modeling
2022-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文报道了将人纤维母细胞重编程为化学诱导的成骨细胞（ciOG），并探讨了ciOG在骨修复和疾病治疗中的应用潜力 | 使用化学混合物RepSox、forskolin和phenamil激活RUNX2表达，成功将纤维母细胞诱导为成骨细胞，并在免疫缺陷小鼠的异位部位形成矿化组织 | NA | 研究化学诱导的成骨细胞在骨组织工程和疾病模型中的应用 | 人纤维母细胞、化学诱导的成骨细胞（ciOG） | 组织工程 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19958 | 2024-08-08 |
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05242-7
PMID:36131018
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研究论文 | 本文通过结合小鼠遗传学、单细胞和空间转录组学、谱系追踪和定量建模，揭示了黑色素瘤中肿瘤生长的层次模型，该模型反映了胚胎神经嵴细胞命运指定和分化的细胞和分子逻辑。 | 本文首次展示了黑色素瘤细胞在空间上定位的血管周围微环境中，通过内皮细胞建立的细胞间通讯途径获得肿瘤发生能力，并揭示了支持生长和转移的细胞池是不同的。 | NA | 研究黑色素瘤中细胞状态多样性的起源和程度，以及生长和转移扩散是否由重叠或不同的黑色素瘤亚群支持。 | 黑色素瘤细胞的生长和转移机制。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞和空间转录组学 | 定量建模 | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和黑色素瘤细胞样本 |
| 19959 | 2024-08-08 |
Malignant clonal evolution drives multiple myeloma cellular ecological diversity and microenvironment reprogramming
2022-09-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01648-z
PMID:36131282
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和单分子长读长基因组测序数据，构建了多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞生态景观，分析了恶性克隆演化模式及其对肿瘤微环境的影响 | 首次在单细胞水平上描述了多发性骨髓瘤的恶性克隆演化模式，并揭示了克隆演化与肿瘤微环境之间的交互关系 | NA | 探讨多发性骨髓瘤的恶性克隆演化及其对肿瘤微环境的影响，为个性化精准治疗策略提供理论依据 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，单分子长读长基因组测序 | NA | 基因组数据 | 所有多发性骨髓瘤患者 |
| 19960 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals cellular hierarchies and guides p-EMT-targeted trial in skull base chordoma
2022-Sep-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00459-2
PMID:36127333
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了颅底脊索瘤的细胞层次结构，并探索了新的治疗靶点 | 首次对颅底脊索瘤进行单细胞RNA测序，并发现了与放射抵抗性相关的干细胞样细胞簇和部分上皮-间质转化（p-EMT）相关的恶性细胞特征 | 研究样本仅包括三名颅底脊索瘤患者，临床试验的样本量较小 | 揭示颅底脊索瘤的细胞层次结构并探索新的治疗靶点 | 颅底脊索瘤的单细胞转录组 | 数字病理学 | 颅底脊索瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 90,691个单细胞样本，三名颅底脊索瘤患者参与临床试验 |