单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 19921 - 19940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19921 | 2024-08-08 |
Inhibition of APOE potentiates immune checkpoint therapy for cancer
2022, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.70117
PMID:36147474
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研究论文 | 本研究探讨了抑制APOE对免疫检查点疗法在癌症治疗中的增强作用 | 首次报道了APOE抑制剂COG 133TFA与αPD-1联合使用可以抑制肿瘤生长并促进肿瘤消退 | NA | 研究APOE在肿瘤免疫治疗中的作用及其潜在的靶向治疗策略 | APOE在肿瘤浸润巨噬细胞中的表达及其对免疫检查点疗法的影响 | 肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Apoe小鼠和野生型小鼠，以及对αPD-1治疗有反应和无反应的癌症患者 |
| 19922 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis to explore immune cell heterogeneity and novel biomarkers for the prognosis of lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.975542
PMID:36147484
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肺腺癌（LUAD）的细胞异质性，并探索新的预后生物标志物 | 首次对GSE149655单细胞数据进行降维处理，并通过统计分析发现肿瘤组织中高度富集的亚群，构建了10基因预后风险模型，并通过qPCR和免疫组化验证了新分子标记HLA-DRB5和CCDC50 | NA | 探索肺腺癌的免疫细胞异质性和新的预后生物标志物 | 肺腺癌（LUAD）的细胞亚群及其在肿瘤发生发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | GSE149655单细胞数据集中的23个亚群和11个细胞子群，以及TCGA-LUAD数据集中的462个基因 |
| 19923 | 2024-08-08 |
Computational solutions for spatial transcriptomics
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.043
PMID:36147664
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综述 | 本文综述了空间转录组学平台及其计算解决方案的优势与局限，并探讨了如何利用这些平台和方法进行空间转录组学研究 | 介绍了基于深度学习的联合分析表达、空间和图像数据的新解决方案，以提取空间解析转录组中的生物信息 | 当前平台在空间分辨率、转录组异质性捕获和大规模研究吞吐量方面仍存在不足 | 旨在帮助选择适合的空间转录组学研究平台和计算解决方案 | 空间转录组学平台及其计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学平台 | 深度学习 | 转录组数据 | NA |
| 19924 | 2024-08-08 |
Mathematical model for the relationship between single-cell and bulk gene expression to clarify the interpretation of bulk gene expression data
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.062
PMID:36147671
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研究论文 | 本文开发了一个数学模型，用于阐明单细胞和批量基因表达之间的关系，并解释批量基因表达数据的均值和方差 | 提出了一个数学模型，将批量基因表达值与单细胞基因表达轮廓的均值成比例，并通过理论、模拟和真实单细胞RNA-seq数据分析验证了其有效性 | NA | 阐明批量基因表达数据的均值和方差的解释 | 单细胞和批量基因表达之间的关系 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 基因表达数据 | NA |
| 19925 | 2024-08-08 |
scWizard: A web-based automated tool for classifying and annotating single cells and downstream analysis of single-cell RNA-seq data in cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.028
PMID:36147672
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研究论文 | 开发了一个名为scWizard的网络自动化工具，用于分类和注释单细胞以及下游分析单细胞RNA测序数据在癌症中的应用 | scWizard集成了基于深度神经网络学习的细胞注释方法和11种下游分析方法，提供了预训练集供用户灵活选择，并在注释肿瘤衍生淋巴细胞/自然杀伤细胞和骨髓细胞亚型方面具有更高的准确性 | NA | 开发一个集成多种分析方法的自动化工具，用于单细胞RNA测序数据的分类、注释和下游分析 | 单细胞RNA测序数据在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞数据 | 使用113,976个细胞跨越13种癌症类型作为内置参考数据集 |
| 19926 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals several LncRNAs differentially expressed in idiopathic germ cell aplasia
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.952518
PMID:36147743
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了特发性生殖细胞发育不全患者睾丸中的长链非编码RNA（LncRNA）表达差异 | 首次在单细胞水平上揭示了特发性生殖细胞发育不全患者中差异表达的LncRNA，并发现这些LncRNA与转录因子TAF9B及环境污染物双酚A的激活有关 | NA | 深入理解特发性生殖细胞发育不全的分子机制及其临床进程 | 特发性生殖细胞发育不全患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个特发性生殖细胞发育不全患者的睾丸组织样本 |
| 19927 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Different Immune Signatures in HPV- and HPV + Driven Human Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/2079389
PMID:36157879
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了HPV阳性和HPV阴性驱动的人类头颈鳞状细胞癌中不同的免疫特征 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌微环境中的细胞组成和信号通路差异 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据库的数据进行分析，可能影响结果的普遍性 | 评估病毒（特别是人乳头瘤病毒[HPV]）和致癌物驱动的头颈鳞状细胞癌（HNSCC）微环境 | HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 131224个细胞，来自18名HPV阴性HNSCC患者和8名HPV阳性HNSCC患者 |
| 19928 | 2024-08-08 |
Identification of macrophage correlated biomarkers to predict the prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.967982
PMID:36158683
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别与肝内胆管癌（ICC）预后相关的巨噬细胞相关生物标志物，并探讨其对免疫治疗反应的预测作用 | 首次在单细胞水平上研究ICC患者中的巨噬细胞，并发现MMP19和SIRPα可预测ICC的预后和免疫检查点阻断（ICB）反应 | 研究仅限于特定的生物标志物和特定的免疫治疗反应，未来研究需扩大样本量和探索更多潜在的生物标志物 | 探讨巨噬细胞在肝内胆管癌发展及治疗反应中的作用，并寻找相关的预后生物标志物 | 肝内胆管癌患者的巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | ICC和邻近组织的巨噬细胞被分为12个集群 |
| 19929 | 2024-08-08 |
Comparable bidirectional neutrophil immune dysregulation between Kawasaki disease and severe COVID-19
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.995886
PMID:36159873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了川崎病和严重COVID-19之间的免疫失调差异 | 发现川崎病和严重COVID-19在单细胞RNA测序中显示出相似的免疫失调模式，特别是在中性粒细胞活化和MHC II类分子表达减少方面 | NA | 分析川崎病和严重COVID-19在单细胞RNA测序中的差异 | 川崎病患者和严重COVID-19患者的免疫失调机制 | NA | 川崎病, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 22个单细胞RNA测序数据，共102,355个细胞核 |
| 19930 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of DTYMK in human tumors
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.989460
PMID:36159971
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研究论文 | 本研究探讨了脱氧胸苷酸激酶（DTYMK）在人类癌症中的预后价值、功能状态及其与免疫浸润的相关性 | 首次全面分析了DTYMK在多种人类癌症中的表达及其与预后、恶性功能状态和免疫细胞浸润的关系 | NA | 研究DTYMK在人类癌症中的预后作用和免疫学角色 | DTYMK在不同癌症类型中的表达及其与临床病理特征和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个数据库中的数据，包括TCGA、GTEx、UALCAN、CPTAC等 |
| 19931 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the adverse effects of cadmium on the trajectory of neuronal maturation
2023-08, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-022-09775-5
PMID:36114956
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析镉对神经元成熟轨迹的不良影响 | 首次揭示了镉通过改变细胞阶段数量和阻碍细胞成熟来影响神经元成熟轨迹的分子机制 | NA | 探讨镉对神经元成熟的影响及其分子机制 | 新生小鼠侧脑室下区神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 神经干细胞在镉处理24小时后分化7天得到的神经元谱系细胞 |
| 19932 | 2024-08-08 |
The impact of antidepressants on human neurodevelopment: Brain organoids as experimental tools
2023-07-30, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.09.007
PMID:36115764
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研究论文 | 本文探讨了抗抑郁药对人类神经发育的影响，特别是使用脑类器官作为实验工具的研究 | 利用人诱导多能干细胞（hiPSC）生成脑类器官，克服了2D细胞培养和动物模型的局限性，通过单细胞RNA测序和电生理测量评估抗抑郁药对发育中神经元的影响 | 依赖于维度降低方法分析大规模转录组数据，电生理记录依赖于时间数据序列 | 研究抗抑郁药对人类神经发育的影响 | 抗抑郁药对神经发育的影响及脑类器官的应用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、电生理测量 | 脑类器官 | 转录组数据、电生理数据 | 未具体说明 |
| 19933 | 2024-08-08 |
Thymosin β4 and prothymosin α promote cardiac regeneration post-ischaemic injury in mice
2023-05-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac155
PMID:36125329
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研究论文 | 本研究探讨了成年哺乳动物心脏在心肌缺血后心肌细胞的基因表达模式，并发现胸腺素β4和前胸腺素α能促进心脏再生 | 首次揭示了心肌缺血后心肌细胞的转录组特征，并发现胸腺素β4和前胸腺素α的过表达能促进心肌细胞增殖和心脏功能恢复 | NA | 确定心肌缺血后成年心肌细胞的基因表达谱，并识别促进心脏再生的因子 | 成年哺乳动物心脏在心肌缺血后的心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和新生大鼠心肌细胞 |
| 19934 | 2024-08-08 |
Role of lymphoid lineage cells aberrantly expressing alarmins S100A8/A9 in determining the severity of COVID-19
2023-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-022-01285-2
PMID:36107397
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研究论文 | 本研究探讨了淋巴细胞异常表达S100A8/A9在COVID-19严重程度中的作用 | 发现淋巴细胞过度表达S100A8/A9与COVID-19患者早期感染阶段的先天免疫反应失调有关 | NA | 研究淋巴细胞表达S100A8/A9在COVID-19患者中的特征 | COVID-19患者的淋巴细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 轻度COVID-19患者12例，重度COVID-19患者7例 |
| 19935 | 2024-08-08 |
Transcriptomic Heterogeneity of Skin Across Different Anatomic Sites
2023-03, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.08.053
PMID:36122800
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研究论文 | 本研究通过RNA测序、单细胞RNA测序和表观基因组学等多组学方法，分析了来自不同解剖部位的159个皮肤样本的转录组异质性 | 首次详细描述了人体皮肤在不同解剖部位的转录组异质性，并揭示了这些异质性与生理和发育变异的关系 | 研究主要基于手术治疗中废弃的正常皮肤组织，可能存在样本选择偏倚 | 探究皮肤在不同解剖部位的基因表达差异及其与皮肤病易感部位的关联 | 来自不同解剖部位的皮肤样本 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 159个皮肤样本 |
| 19936 | 2024-08-08 |
Mostly natural sequencing-by-synthesis for scRNA-seq using Ultima sequencing
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01452-6
PMID:36109685
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Ultima基因组平台的单细胞RNA测序（scRNA-seq）的mostly natural sequencing-by-synthesis（mnSBS）方法，并系统地将其与当前的scRNA-seq技术进行比较 | mnSBS方法使用大部分天然、未修饰的核苷酸和少量的荧光标记核苷酸，提高了聚合酶的进程性和降低了成本 | mnSBS方法在读取位置相对于注释基因边界的结果与Illumina测序存在细微差异，因为Ultima的单端读取更接近基因末端 | 开发一种成本效益高的单细胞RNA测序方法 | 单细胞RNA测序技术及其在不同生物和技术类型中的应用 | 基因组学 | NA | mostly natural sequencing-by-synthesis (mnSBS) | NA | RNA | 包括来自单个个体的5'和3' scRNA-seq、人外周血单个核细胞以及Perturb-Seq等多种类型的样本 |
| 19937 | 2024-08-05 |
HTCA: a database with an in-depth characterization of the single-cell human transcriptome
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac791
PMID:36130266
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研究论文 | HTCA是一个数据库，深入表征单细胞人类转录组 | HTCA提供了基于230万个高质量细胞的全面表型轮廓和多种在线分析工具 | 仍缺乏全面的特征化，主要侧重于原始数据和基因表达查询 | 整合和深入探索单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 约3000个scRNA-seq样本的2.3百万高质量细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq），空间转录组学 | NA | 多组学数据 | 约3000个scRNA-seq样本，230万高质量细胞 |
| 19938 | 2024-08-08 |
Hypertension Promotes the Proliferation and Migration of ccRCC Cells by Downregulation of TIMP3 in Tumor Endothelial Cells through the miR-21-5p/TGFBR2/P38/EGR1 Axis
2023-01-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-22-0089
PMID:36125433
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研究论文 | 本研究探讨了高血压通过下调肿瘤内皮细胞中的TIMP3促进ccRCC细胞增殖和迁移的分子机制 | 首次揭示了高血压通过miR-21-5p/TGFBR2/P38/EGR1轴下调TIMP3表达，进而促进ccRCC细胞增殖和迁移的机制 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探究高血压与ccRCC肿瘤发生及预后的分子机制 | ccRCC细胞、肿瘤内皮细胞、高血压患者血浆 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 包括手术切除的ccRCC样本、NCG小鼠模型、人脐静脉内皮细胞 |
| 19939 | 2024-08-05 |
Single-cell profile of tumor and immune cells in primary breast cancer, sentinel lymph node, and metastatic lymph node
2023-Jan, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-022-01400-x
PMID:36129636
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌患者淋巴结转移的单细胞序列 | 研究揭示了肿瘤与免疫细胞在淋巴结中的相互作用，尤其是在单细胞水平上的新发现 | 研究仅基于一名患者的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 旨在理解淋巴结区域的肿瘤-宿主相互作用 | 研究对象为三阴性乳腺癌患者的原发肿瘤、哨 lymph 结和转移 lymph 结 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 4个样本 |
| 19940 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas reveals protective characteristics of COVID-19 mRNA vaccine
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28161
PMID:36124363
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞分析，揭示了基于脂多聚复合物（LPP）的mRNA疫苗SW0123在抑制SARS-CoV-2引起的炎症反应和肺损伤中的保护机制 | 首次详细描述了SW0123疫苗通过抑制促炎巨噬细胞的招募和增加多形核髓源抑制细胞的频率来有效抑制SARS-CoV-2诱导的炎症反应，并显著抑制肺上皮和内皮细胞的凋亡过程 | NA | 探究SW0123 mRNA疫苗在肺部保护中的免疫特征和机制 | SARS-CoV-2感染的小鼠和猕猴模型 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和猕猴模型 |