单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 19901 - 19920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19901 | 2024-08-08 |
scSemiGAN: a single-cell semi-supervised annotation and dimensionality reduction framework based on generative adversarial network
2022-11-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac652
PMID:36193998
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研究论文 | 本文提出了一种基于生成对抗网络的单细胞半监督细胞类型注释和降维框架scSemiGAN | scSemiGAN能够同时进行深度潜在表示学习和细胞类型标签预测，统一了细胞类型注释与降维 | NA | 克服现有方法在单细胞RNA测序数据分析中无法统一细胞类型注释与降维的局限 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 生成对抗网络 | 生成对抗网络 | 单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 19902 | 2024-08-08 |
Interferon α facilitates anti-HBV cellular immune response in a B cell-dependent manner
2022-Nov, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2022.105420
PMID:36165866
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研究论文 | 本研究探讨了B细胞在干扰素α（IFN-α）介导的抗乙型肝炎病毒（HBV）细胞免疫中的作用 | 揭示了B细胞在IFN-α介导的抗HBV细胞免疫中的关键作用，特别是在抗原呈递和共刺激功能方面 | 研究主要基于B细胞缺陷小鼠模型和单细胞RNA测序，可能需要进一步的人体临床试验验证 | 阐明B细胞在IFN-α介导的抗HBV细胞免疫中的作用机制 | B细胞在IFN-α治疗慢性乙型肝炎（CHB）患者中的作用 | NA | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | B细胞缺陷小鼠模型及IFN-α治疗的CHB患者 |
| 19903 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptomics-Based Identification of Molecular Markers for Nanomedicine Distribution in Tumor Tissue
2022-11, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202201091
PMID:36180396
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研究论文 | 本文开发了一种分子标记识别平台，通过整合纳米药物分布的显微荧光图像和空间转录组信息，探索与纳米药物肿瘤摄取相关的因子候选 | 本文提出了一种新的方法，通过结合显微荧光图像和空间转录组信息，识别与纳米药物肿瘤摄取相关的分子标记 | NA | 探索与纳米药物肿瘤摄取相关的因子候选 | 纳米药物在肿瘤组织中的分布 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 19904 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals early heterogeneity during aging in yeast
2022-11, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13712
PMID:36181361
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对酵母衰老过程中的转录组变化进行了系统性和定量性的研究 | 发现了酵母衰老过程中细胞间转录变异性的增加，并揭示了与衰老相关的关键生物过程和细胞组分 | NA | 研究酵母衰老过程中的早期异质性 | 酵母细胞在不同年龄段的转录组变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个酵母细胞 |
| 19905 | 2024-08-08 |
Muscle injury induces a transient senescence-like state that is required for myofiber growth during muscle regeneration
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200289RR
PMID:36190443
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，研究了肌肉损伤后细胞衰老样状态在肌肉再生中的作用 | 首次证明肌肉损伤后多种细胞类型（如巨噬细胞和纤维脂肪原细胞）会短暂表现出衰老特征，这些特征对于肌肉纤维的生长和再生至关重要 | NA | 探讨肌肉损伤后细胞衰老样状态在肌肉再生中的作用 | 肌肉再生过程中的细胞衰老样状态 | NA | 肌肉疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | D2-mdx小鼠模型中的肌肉组织 |
| 19906 | 2024-08-08 |
Competitive cleavage of SARS-CoV-2 spike protein and epithelial sodium channel by plasmin as a potential mechanism for COVID-19 infection
2022-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00152.2022
PMID:36193902
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2刺突蛋白和上皮钠通道通过纤溶酶竞争性切割的机制，以及这对COVID-19感染的影响 | 首次揭示了SARS-CoV-2刺突蛋白和上皮钠通道通过纤溶酶的竞争性切割机制，可能影响病毒的传播和水肿的消退 | NA | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白和上皮钠通道通过纤溶酶的竞争性切割机制及其对COVID-19感染的影响 | SARS-CoV-2刺突蛋白、上皮钠通道、纤溶酶 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括健康组、中度/重度COVID-19患者及SARS-CoV-2感染的气道/肺泡上皮细胞 |
| 19907 | 2024-08-08 |
Characterization of the evolution trajectory and immune profiling of new histologic patterns in lung adenocarcinoma
2022-11, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3455
PMID:36194517
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研究论文 | 本研究重新分析了TCGA-LUAD大型数据集，全面描绘了肺腺癌中不同组织学模式的基因组和转录组特征，并探讨了其分子进化机制和免疫微环境特征 | 首次识别出一种新的癌症相关成纤维细胞亚型，该亚型同时表达成纤维细胞激活蛋白-α和干扰素基因刺激因子，并揭示了FAP作为CAFs中STING的重要下游效应因子 | NA | 探讨肺腺癌中不同组织学模式的分子特征及其在原发肿瘤和淋巴结转移中的分子进化机制 | 肺腺癌中的组织学模式及其分子特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 大型TCGA-LUAD数据集 |
| 19908 | 2024-08-08 |
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105123
PMID:36185375
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研究论文 | 本文开发了一种名为SuPERR的新分析流程，用于提高多组学单细胞数据集中细胞类型识别的分辨率和准确性 | SuPERR流程能够更精确地去除细胞双联体，并通过整合细胞表面蛋白和免疫球蛋白转录本计数信息，防止细胞类型错误分类 | NA | 旨在深入理解人类免疫系统的多样性和异质性 | 人类免疫系统的细胞类型及其在不同组织和疾病背景下的多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学和细胞受体组库 | NA | 多组学数据 | NA |
| 19909 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Analysis Reveals the Unexpected Immune Regulatory Effects of Arsenene Nanosheets in Tumor Microenvironment
2022-Oct-12, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.2c10743
PMID:36166745
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研究论文 | 本研究探讨了砷烯纳米片在肿瘤微环境中的免疫调节作用及其机制 | 首次发现砷烯纳米片能够通过激活T细胞受体信号通路和抑制肿瘤细胞的DNA复制及TCA循环途径，重塑肿瘤微环境，增强抗肿瘤免疫反应 | NA | 揭示砷烯纳米片在肿瘤微环境中的免疫调节机制 | 砷烯纳米片及其在肿瘤微环境中的作用 | 纳米医学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 19910 | 2024-08-08 |
Conservation at the uterine-placental interface
2022-10-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210633119
PMID:36191208
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了早期和晚期妊娠阶段大鼠子宫-胎盘界面入侵滋养层细胞及其他细胞群体的转录组特征 | 发现大鼠入侵滋养层细胞的转录本在人类胎盘的入侵绒毛外滋养层细胞中具有保守性 | NA | 探究子宫-胎盘界面中滋养层细胞与母体细胞的相互作用及其对胎儿生长的影响 | 大鼠子宫-胎盘界面中的入侵滋养层细胞及其他细胞群体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早期（妊娠第15.5天）和晚期（妊娠第19.5天）的大鼠子宫-胎盘界面细胞样本 |
| 19911 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing resolves the landscape of immune cells and regulatory mechanisms in HIV-infected immune non-responders
2022-10-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05225-6
PMID:36195585
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）分析了来自HIV-1感染的免疫非应答者（INR）和应答者（IR）的外周血单个核细胞（PBMCs），揭示了INR中黏膜相关不变T细胞（MAIT）低表达及其与受损线粒体功能和凋亡信号相关的转录特征。 | 首次通过单细胞测序技术详细解析了HIV感染后免疫非应答者的免疫细胞图谱及其调控机制，特别是发现了MAIT细胞在INR中的功能障碍及其与线粒体功能的关系。 | 研究样本仅限于外周血单个核细胞，未涉及其他组织或器官的细胞，可能限制了对HIV感染后免疫重建失败机制的全面理解。 | 探究HIV感染后免疫非应答者免疫重建失败的机制。 | HIV-1感染的免疫非应答者（INR）和应答者（IR）的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 细胞 | 来自免疫非应答者（INR）和应答者（IR）的多个样本 |
| 19912 | 2024-08-08 |
Multicellular immune dynamics implicate PIM1 as a potential therapeutic target for uveitis
2022-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33502-7
PMID:36195600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU），揭示了疾病进展中的细胞组成和转录调控变化，并发现PIM1分子与疾病相关 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了葡萄膜炎中细胞动态变化，并识别出PIM1作为潜在治疗靶点 | NA | 探究葡萄膜炎的细胞动态和发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）和人类葡萄膜炎（VKH） | NA | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 19913 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics tools allow for regional exploration of heterogeneous muscle pathology in the pre-clinical rabbit model of rotator cuff tear
2022-Oct-04, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-022-03326-8
PMID:36195913
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研究论文 | 本文评估了空间转录组技术在兔肩袖撕裂模型中探索异质性骨骼肌组织区域细胞活动的潜力和挑战 | 使用3' Visium空间转录组技术，能够在先前获取的组织中探索空间转录模式，并与底层组织学相关联 | 肌肉纤维过长，难以被单细胞液滴包围，且单核转录组学受肌肉纤维多核化的影响 | 评估空间转录组技术在理解异质性骨骼肌组织区域细胞活动中的潜力和挑战 | 兔肩袖撕裂模型的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 3' Visium空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 健康对照组和手术后2周及16周的组织样本，以及储存超过6年的组织样本 |
| 19914 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of mammalian utricular cells over the course of development
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1052
PMID:36178017
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了从新生期到成年期小鼠椭圆囊细胞的异质性，并追踪了新毛细胞的来源 | 发现新毛细胞主要通过Sox9+前体细胞分化产生，而非有丝分裂增殖 | NA | 探究哺乳动物椭圆囊细胞在发育过程中的命运及其特征 | 小鼠椭圆囊中的毛细胞和支持细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 包括新生期和成年期的小鼠椭圆囊样本，具体为P2、P7和P30的小鼠 |
| 19915 | 2024-08-08 |
Cell Heterogeneity Uncovered by Single-Cell RNA Sequencing Offers Potential Therapeutic Targets for Ischemic Stroke
2022-Oct-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2022.0212
PMID:36186129
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示缺血性中风中细胞异质性和潜在治疗靶点方面的应用 | 利用单细胞RNA测序技术无偏倚地确定高分辨率的细胞异质性，并识别细胞标记，揭示了细胞类型特异性基因表达模式中的主要脑簇以及细胞特异性亚簇及其在不同通路中的功能 | NA | 旨在启发新的研究，并为探索单细胞水平上缺血性中风的潜在病理机制和新型治疗策略提供方向 | 缺血性中风中的脑细胞和外周免疫细胞 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19916 | 2024-08-08 |
Fast and interpretable consensus clustering via minipatch learning
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010577
PMID:36191044
|
研究论文 | 本文提出了一种快速且可解释的共识聚类方法IMPACC，通过使用微小块（minipatches）学习来提高聚类的准确性、稳定性和计算效率 | IMPACC方法通过从观测和特征的微小子集中集成聚类共现，显著减少了计算时间，并开发了自适应采样方案以提高可靠性和解释性 | NA | 解决共识聚类在处理大规模生物信息学数据时的计算效率低下和缺乏解释性的问题 | 大规模生物信息学数据，如单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 共识聚类 | NA | 数据集 | 多种真实大规模生物信息学数据集 |
| 19917 | 2024-08-08 |
CaSee: A lightning transfer-learning model directly used to discriminate cancer/normal cells from scRNA-seq
2022-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02478-5
PMID:36192479
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研究论文 | 本研究开发了一种名为pan-Cancer Seeker（CaSee）的转移学习模型，用于直接从scRNA-seq表达矩阵中区分癌细胞和正常细胞 | CaSee是首个直接用于scRNA-seq表达矩阵中区分癌细胞和正常细胞的工具，相较于需要相应参考细胞的拷贝数变异（CNV）方法，具有更广泛的应用领域和更高的效率 | NA | 开发一种基于深度学习的泛癌细胞鉴别模型，以区分癌细胞和正常细胞 | scRNA-seq表达矩阵中的癌细胞和正常细胞 | 基因组学 | 癌症 | scRNA-seq | 转移学习模型 | 表达矩阵 | 在11个回顾性队列和1个独立数据集的多中心数据评估中展示了优异的性能 |
| 19918 | 2024-08-08 |
Therapeutic implications of mitochondrial stress-induced proteasome inhibitor resistance in multiple myeloma
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq5575
PMID:36170375
|
研究论文 | 本文探讨了线粒体应激诱导的蛋白酶体抑制剂抗性在多发性骨髓瘤中的治疗意义 | 首次揭示了电子传递链抑制促进蛋白酶体抑制剂抗性的机制，并提出了针对线粒体代谢状态的联合治疗方案 | NA | 研究多发性骨髓瘤中代谢状态与治疗抗性的关联 | 多发性骨髓瘤患者及细胞模型 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及CoMMpass试验中的患者样本 |
| 19919 | 2024-08-08 |
Rapid and sensitive single-cell RNA sequencing with SHERRY2
2022-09-30, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01416-x
PMID:36175891
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SHERRY2的单细胞RNA测序优化协议，无需第二链cDNA合成，具有高灵敏度和准确性 | SHERRY2利用Tn5转座酶直接切割和标记DNA/RNA异源双链，避免了预扩增和序列依赖性偏差 | NA | 开发一种新型单细胞RNA测序方法，提高测序的灵敏度和准确性 | 单细胞RNA测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个细胞 |
| 19920 | 2024-08-08 |
In vivo generation of bone marrow from embryonic stem cells in interspecies chimeras
2022-Sep-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74018
PMID:36178184
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研究论文 | 本文通过胚胎互补技术，在鼠-鼠嵌合体中从胚胎干细胞生成骨髓细胞系，并分析了其基因表达特征和细胞表面标记 | 首次在鼠-鼠嵌合体中成功生成功能性骨髓，并展示了胚胎干细胞衍生的造血干细胞的长期重建潜力 | 该方法目前仅在鼠-鼠嵌合体中验证，尚未在其他物种中进行测试 | 加速未来针对致命疾病的细胞疗法的开发 | 胚胎干细胞衍生的骨髓细胞系及其在嵌合体中的功能 | 干细胞研究 | NA | 荧光激活细胞分选分析，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了鼠胚胎干细胞和鼠-鼠嵌合体 |