单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 19881 - 19900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19881 | 2024-08-07 |
Prothioconazole exposure disrupts oocyte maturation and fertilization by inducing mitochondrial dysfunction and apoptosis in mice
2024-03, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 研究探讨了新型广谱三唑类杀菌剂普托康唑（PTC）对小鼠卵母细胞成熟和受精的影响，发现PTC通过诱导线粒体功能障碍和细胞凋亡来破坏卵母细胞的发育和受精能力 | 首次报道了PTC对卵母细胞发育能力和受精能力的具体影响，包括破坏纺锤体形态、染色体排列、α-微管蛋白乙酰化水平及动粒-微管连接，以及影响精子结合能力和Juno、皮质颗粒和Ovastacin的动态 | 研究主要集中在PTC对卵母细胞的影响，未涉及对其他生殖细胞或整个生殖系统的影响 | 探究PTC对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响 | 小鼠的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 19882 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals a link of ovule abortion and sugar transport in Camellia oleifera
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1274013
PMID:38371413
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了油茶中胚珠流产与糖运输之间的关联 | 首次报道了木本作物卵巢的单细胞转录组图谱，并探讨了胚珠流产可能与胎盘和胚珠中的糖运输有关 | NA | 探讨胚珠流产的机制及其与糖运输的关系 | 油茶的不同胚珠流产率品种的成熟卵巢细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 20,526个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19883 | 2024-08-07 |
Sputum Transcriptomics Reveals FCN1+ Macrophage Activation in Mild Eosinophilic Asthma Compared to Non-Asthmatic Eosinophilic Bronchitis
2024-Jan, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2024.16.1.55
PMID:38262391
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研究论文 | 本文通过痰液转录组学分析，比较了轻度嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎中FCN1+巨噬细胞活化的差异。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了FCN1+巨噬细胞在嗜酸性哮喘中的活化及其与气道重塑过程的关系。 | 研究样本量较小，且未涉及更广泛的哮喘类型和更深入的分子机制探讨。 | 比较嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎在痰液转录组学层面的差异，探讨其背后的分子机制。 | 嗜酸性哮喘患者、非哮喘性嗜酸性支气管炎患者及健康对照者的痰液细胞。 | 数字病理学 | 哮喘 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 转录组数据 | 嗜酸性哮喘患者18例，非哮喘性嗜酸性支气管炎患者15例，健康对照者28例 | NA | NA | NA | NA |
| 19884 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分子分型，并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用，并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用，并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，CIBERSORT分析，Lasso回归 | NA | 基因组，转录组，蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19885 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
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研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 | NA | NA | NA | NA |
| 19886 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
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研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19887 | 2024-08-07 |
Construction and evaluation of endometriosis diagnostic prediction model and immune infiltration based on efferocytosis-related genes
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1298457
PMID:38370978
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研究论文 | 本研究构建并评估了基于吞噬作用相关基因的子宫内膜异位症诊断预测模型及免疫浸润 | 本研究首次识别并验证了与子宫内膜异位症相关的13个吞噬作用相关差异表达基因，并构建了诊断模型 | 研究主要基于公共数据库和机器学习技术，临床样本验证有限 | 旨在识别子宫内膜异位症的诊断标志物并构建诊断模型 | 子宫内膜异位症及其相关的吞噬作用相关基因 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和SVM回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据库中的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19888 | 2024-08-07 |
Development of a single-cell atlas for woodland strawberry (Fragaria vesca) leaves during early Botrytis cinerea infection using single cell RNA-seq
2022-Jan-19, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhab055
PMID:35043166
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，构建了林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的单细胞图谱，并分析了不同细胞类型的基因表达模式 | 首次报道了植物病原入侵过程中单细胞转录组景观，为宿主-病原体相互作用的全面动态提供了新见解 | NA | 研究植物在病原体入侵时的防御反应及信号转导过程 | 林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的细胞类型及基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过50,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19889 | 2024-08-07 |
Crosstalk between endothelial cells with a non-canonical EndoMT phenotype and cardiomyocytes/fibroblasts via IGFBP5 aggravates TAC-induced cardiac dysfunction
2024-Mar-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176378
PMID:38309679
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在横断主动脉缩窄（TAC）后两周内识别出经历纤维化分化的内皮细胞，并探讨了这些内皮细胞在病理性心脏重塑中的作用。 | 本研究首次描述了一种非经典的内皮细胞向肌成纤维细胞转化（EndoMT）表型，称为短暂纤维化样表型（EndoFP），并揭示了其在心脏重塑中的关键作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 探讨内皮细胞在心脏纤维化和重塑中的作用及其分子机制。 | 内皮细胞、心肌细胞和成纤维细胞在心脏纤维化过程中的相互作用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及内皮细胞、心肌细胞和成纤维细胞的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19890 | 2024-08-04 |
Mapping the cellular landscape of Atlantic salmon head kidney by single cell and single nucleus transcriptomics
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109357
PMID:38181891
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析大西洋鲑鱼头肾的细胞异质性 | 比较了单细胞RNA-seq和单核RNA-seq两种转录组学方法，以揭示细胞类型及其亚群体的复杂性 | 在单细胞悬液准备过程中，某些细胞类型可能丢失，这影响了对特定细胞群体的全面捕捉 | 研究大西洋鲑鱼头肾中免疫细胞类型及其功能 | 健康的养殖大西洋鲑鱼(Salmo salar)头肾中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq(scRNA-seq)和单核RNA-seq(snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 14,149个细胞转录组和18,067个细胞核转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 19891 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of MC1R-inhibited melanocytes
2024-Mar, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13141
PMID:37972124
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了MC1R抑制的黑色素细胞，揭示了与黑色素生成和肿瘤转化相关的新基因集。 | 首次定义了MC1R抑制的基因签名（MiGS），并发现TBX3基因在黑色素生成和细胞衰老逃避中的作用。 | NA | 探究MC1R信号减弱如何影响黑色素生成和增加黑色素瘤易感性的机制。 | MC1R抑制的黑色素细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自红色头发颜色（RHC）小鼠模型的黑色素细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19892 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome landscape of zebrafish liver reveals hepatocytes and immune cell interactions in understanding nonalcoholic fatty liver disease
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109428
PMID:38325594
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了斑马鱼肝脏的转录组图谱，揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病发展中的相互作用 | 首次构建了斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱，并揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病中的相互作用 | NA | 研究非酒精性脂肪肝病中肝细胞与免疫细胞的相互作用 | 斑马鱼肝脏中的肝细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及10种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 19893 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis dissects lncRNA-associated gene networks in Arabidopsis
2024-Feb-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100717
PMID:37715446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了拟南芥中长非编码RNA（lncRNA）相关的基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下绘制了lncRNA及其相关基因调控网络的转录异质性图谱 | NA | 探索植物lncRNA生物学中的单细胞数据整合分析能力，并深入了解lncRNA表达特异性和相关基因调控 | 拟南芥中的lncRNA及其相关基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 28个已发表的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19894 | 2024-08-07 |
Systems Analysis of Immune Changes after B-cell Depletion in Autoimmune Multiple Sclerosis
2024-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.576204
PMID:38370778
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了B细胞耗竭后在多发性硬化症患者中免疫景观的变化 | 首次全面揭示了B细胞耗竭治疗多发性硬化症后免疫细胞类型特异性变化及其功能影响 | NA | 探索B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 19895 | 2024-08-04 |
Breaks for Precision Medicine in Cancer: Development and Prospects of Spatiotemporal Transcriptomics
2024-Feb, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2023.0116
PMID:38181185
|
综述 | 本文回顾了时空转录组学在癌症研究中的整合策略及其最新进展 | 提出时空转录组学与单细胞RNA测序的数据整合，为癌症精确治疗提供新思路 | 对时空转录组学的整体应用仍处于初步探索阶段 | 揭示癌症的基因表达空间模式和细胞群体的空间异质性 | 癌症患者与细胞群体的基因表达及微环境相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19896 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing in melanoma: what have we learned so far?
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104969
PMID:38241976
|
综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在黑色素瘤中的应用及其带来的见解 | 探讨了单细胞测序技术如何促进对黑色素瘤异质性的理解 | 未明确列出局限性 | 分析黑色素瘤中的肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响 | 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19897 | 2024-08-07 |
Genomic profiling and associated B cell lineages delineate the efficacy of neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104971
PMID:38244291
|
研究论文 | 本研究通过整合全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫荧光数据，分析了24名接受新辅助PD-1抑制剂联合紫杉醇和铂类化疗的食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的样本，以确定与治疗反应的相关性 | 研究发现DNA错配修复（MMR）途径的改变在最佳反应患者中频繁出现，并与肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）相关。此外，识别了B细胞在ESCC中的二分发展轨迹，其中LMO2+生发中心B细胞在响应肿瘤中富集，而CD55+记忆B细胞与组合治疗的较差反应相关 | NA | 旨在通过全面的肿瘤MMR途径改变和肿瘤内B细胞特征评估，改进接受新辅助化疗免疫治疗的ESCC患者的筛选和管理 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 24名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 19898 | 2024-08-07 |
High-dimensional profiling of regulatory T cells in psoriasis reveals an impaired skin-trafficking property
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104985
PMID:38306895
|
研究论文 | 本研究通过高维39标记质谱流式细胞术(CyTOF)面板，深入分析了31名银屑病患者和32名健康对照者的皮肤归巢调节性T细胞(Tregs)的免疫景观，并结合体外趋化因子介导的Treg迁移实验、免疫荧光成像以及公共单细胞RNA测序数据，揭示了银屑病患者Tregs的皮肤归巢特性受损。 | 首次深入探索了银屑病患者皮肤归巢Tregs的分子特性，发现CLAhi Tregs和CLAhiCCR5+ Tregs在银屑病患者中的总体减少，以及功能标记物CD39和FoxP3的升高，CCR7表达增加而CCR4和CLA表达减少，这些变化与疾病严重程度相关。 | NA | 探究银屑病患者皮肤归巢调节性T细胞的分子特性和功能状态。 | 银屑病患者的皮肤归巢调节性T细胞。 | 免疫学 | 银屑病 | 质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 31名银屑病患者和32名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 19899 | 2024-08-04 |
Glycogen metabolism-mediated intercellular communication in the tumor microenvironment influences liver cancer prognosis
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029697
PMID:38361757
|
研究论文 | 本研究揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的作用 | 首次揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的机制 | 暂无该研究的局限性信息 | 探讨糖原代谢在肝细胞癌微环境中的功能及其对预后的影响 | 肝细胞癌肿瘤样本中的69个细胞簇和65个糖原代谢基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 10个HCC肿瘤样本，共计64,545个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19900 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectory of FOLR2-expressing tumor-associated macrophages to regulatory T cells in the progression of lung adenocarcinoma
2023-08-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06021-6
PMID:37532692
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌（LUAD）中免疫抑制微环境的形成机制，揭示了FOLR2表达的肿瘤相关巨噬细胞向调节性T细胞的转变轨迹。 | 首次通过单细胞转录组图谱揭示了从癌前到侵袭性LUAD的免疫抑制微环境形成的潜在轨迹，包括ARM-RETN/TAM-FOLR2/DCs/CD4NR4A3/CD4FOXP3的转变。 | 研究样本量较小，仅包括12个LUAD样本和3个正常肺样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究肺腺癌中免疫抑制微环境的细胞机制。 | 肺腺癌样本和正常肺样本中的细胞成分和转录组。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12个肺腺癌样本和3个正常肺样本 | NA | NA | NA | NA |