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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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19841 | 2024-08-08 |
Toward a granular molecular-anatomic map of the blood vasculature - single-cell RNA sequencing makes the leap
2022, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v127.9051
PMID:36337278
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNAseq)在生理学和医学领域的新时代中的应用,特别是在血管生物学研究中的潜在影响 | scRNAseq技术使得我们能够精确了解体内不同细胞类型和亚型的基因表达水平及其在发育、组织修复或疾病中的特定细胞状态 | NA | 探讨scRNAseq技术在血管生物学研究中的应用及其对生命科学各领域的影响 | 血管细胞的基因表达差异及其在器官特异性功能中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA |
19842 | 2024-08-08 |
Fatty acid metabolism predicts prognosis and NK cell immunosurveillance of acute myeloid leukemia patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1018154
PMID:36338749
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸代谢(FAM)与急性髓系白血病(AML)患者预后及自然杀伤细胞免疫监视之间的关系 | 首次揭示了FAM在AML患者中的预后价值及其对TME免疫监视的影响,并开发了一种基于FAM相关基因的预后模型 | NA | 研究FAM与AML患者预后及免疫监视之间的关系 | 急性髓系白血病患者及其脂肪酸代谢 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据 |
19843 | 2024-08-08 |
Combining bulk RNA-sequencing and single-cell RNA-sequencing data to reveal the immune microenvironment and metabolic pattern of osteosarcoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.976990
PMID:36338972
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了骨肉瘤的免疫微环境和代谢模式 | 首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,结合四种代谢模型,分析了骨肉瘤的肿瘤间异质性和肿瘤内异质性 | NA | 探索骨肉瘤的肿瘤微环境异质性和代谢调控模式 | 骨肉瘤的肿瘤微环境和代谢模式 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 28608个免疫细胞样本,其中7617个为恶性细胞 |
19844 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing technologies in bladder cancer research: Applications and challenges
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1027909
PMID:36338973
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用及其面临的挑战 | 单细胞测序技术提供了高吞吐量的测序工具,揭示了膀胱肿瘤的发生、进展和侵袭机制,并有助于发现新的治疗靶点和预后模型 | 缺乏针对膀胱癌的有效靶向治疗或免疫治疗的特定生物标志物 | 探讨单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用,以增进对膀胱肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境复杂生态系统的理解 | 膀胱癌及其治疗抵抗机制和尿液脱落肿瘤细胞的检测 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
19845 | 2024-08-08 |
Characterization of the SARS-CoV-2 co-receptor NRP1 expression profiles in healthy people and cancer patients: Implication for susceptibility to COVID-19 disease and potential therapeutic strategy
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.995736
PMID:36338984
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研究论文 | 研究分析了NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况,并探讨了其作为SARS-CoV-2感染易感性和治疗策略的潜在生物标志物的作用 | 首次全面分析NRP1在不同人群中的表达情况及其与SARS-CoV-2感染和肿瘤发生的关系 | NA | 预测健康人群和癌症患者对SARS-CoV-2的易感性和感染后的预后 | NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况 | 数字病理学 | COVID-19疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及健康人群、COVID-19患者和癌症患者的样本 |
19846 | 2024-08-08 |
Pathological implications of metabolic reprogramming and its therapeutic potential in medulloblastoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1007641
PMID:36340043
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤(MB)中代谢重编程的机制及其在治疗中的潜在应用 | 强调了MB细胞如何通过重编程代谢和能量生产网络来支持快速生长、生存、侵袭、转移和治疗抵抗 | NA | 探讨靶向能量代谢的现有药物在抑制MB进展和提高当前MB治疗效果方面的潜在临床益处 | 髓母细胞瘤及其代谢重编程机制 | NA | 儿童脑肿瘤 | 基因组学、单细胞测序 | NA | NA | NA |
19847 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome of Nepeta tenuifolia leaves reveal differentiation trajectories in glandular trichomes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.988594
PMID:36340347
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞,揭示了其分化轨迹 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细描绘了Nepeta tenuifolia叶片腺毛细胞的分化和发展轨迹 | NA | 探索植物细胞发育和分化,特别是腺毛的启动和发展 | Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 33,254个原生质体 |
19848 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of the lacrimal gland features macrophage activity and epithelium metabolism as key alterations during chronic inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011125
PMID:36341342
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研究论文 | 本研究分析了NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中泪腺的慢性炎症,利用bulk RNAseq和Visium空间基因表达技术,通过Seurat进行无监督聚类,分析了泪腺切片中细胞的空间分布和基因表达变化。 | 首次使用Visium技术验证了bulk RNAseq定义的特定通路在泪腺切片中的激活情况,并发现了一个在Sjögren's综合征中未曾描述过的“TYROBP因果网络”。 | NA | 探讨泪腺慢性炎症过程中的关键改变及其对干眼症的治疗潜力。 | 泪腺的慢性炎症及其在Sjögren's综合征中的表现。 | 数字病理学 | 干眼症 | bulk RNAseq, Visium空间基因表达 | NA | 基因表达数据 | NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中的泪腺组织 |
19849 | 2024-08-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights LCK as an immune-related prognostic biomarker in melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1024931
PMID:36341345
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研究论文 | 本研究通过整合多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集,识别与黑色素瘤免疫治疗相关的潜在预后生物标志物,特别是LCK基因。 | 首次揭示LCK作为免疫相关预后生物标志物在黑色素瘤中的作用,并通过多种分析方法验证其表达与免疫细胞浸润水平及临床预后的关联。 | 研究主要基于现有数据库和测序数据,未涉及大规模临床试验验证。 | 识别与黑色素瘤免疫治疗相关的预后生物标志物。 | 黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫逃逸相关基因。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | 回归分析 | 转录组数据 | 涉及多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集 |
19850 | 2024-08-08 |
The shared biomarkers and pathways of systemic lupus erythematosus and metabolic syndrome analyzed by bioinformatics combining machine learning algorithm and single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1015882
PMID:36341378
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合机器学习算法和单细胞测序分析,探讨了系统性红斑狼疮(SLE)和代谢综合征(MetS)之间的共享生物标志物和通路 | 本研究首次通过机器学习技术和单细胞RNA测序验证了SLE和MetS之间的共享关键基因,并构建了有效的诊断模型 | NA | 探讨系统性红斑狼疮和代谢综合征之间的潜在关联及其发病机制 | 系统性红斑狼疮和代谢综合征的共享基因及其在免疫和代谢过程中的作用 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | XG-Boost | 基因表达数据 | NA |
19851 | 2024-08-05 |
Distinct Mechanisms of Mismatch-Repair Deficiency Delineate Two Modes of Response to Anti-PD-1 Immunotherapy in Endometrial Carcinoma
2023-02-06, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0686
PMID:36301137
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研究论文 | 本研究探讨了错配修复缺陷(MMRd)子类型在对抗PD-1免疫治疗中的不同反应机制 | 揭示了突变型与表观遗传型MMRd肿瘤在抗肿瘤免疫方面的不同机制和细胞特征 | 样本量较小,且仅覆盖两种类型的MMRd肿瘤 | 研究MMRd子型在抗PD-1免疫治疗中的反应差异 | 24名MMRd子型的子宫内膜癌患者 | NA | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因组数据 | 24名MMRd子宫内膜癌患者 |
19852 | 2024-08-08 |
CellMarker 2.0: an updated database of manually curated cell markers in human/mouse and web tools based on scRNA-seq data
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac947
PMID:36300619
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research paper | CellMarker 2.0是一个更新的人类和小鼠不同组织中各种细胞类型的实验支持标记物的手动策划数据库,并提供了基于单细胞测序数据的网络工具 | CellMarker 2.0新增了36,300个组织-细胞类型-标记物条目,474个组织,1901种细胞类型和4566个标记物,并增加了29种类型的细胞标记物,包括蛋白质编码基因、lncRNA和处理过的假基因等 | NA | 更新和扩展CellMarker数据库,并开发用于分析单细胞测序数据的网络工具 | 人类和小鼠不同组织中的细胞类型及其标记物 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据库 | 83,361个组织-细胞类型-标记物条目 |
19853 | 2024-08-08 |
Protocol to dissociate, process, and analyze the human lung tissue using single-cell RNA-seq
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101776
PMID:36313536
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类肺部生物样本中获取高质量单细胞转录组数据的方法 | 采用机械和酶解法处理组织,通过荧光激活细胞分选(FACS)富集活细胞,并使用基于液滴的单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术 | NA | 开发一种高效获取人类肺组织单细胞转录组数据的方法 | 人类肺部生物样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及来自核心针活检、细针抽吸、手术切除和胸腔积液的人类肺部生物样本 |
19854 | 2024-08-08 |
Insights gained from single-cell analysis of immune cells in tofacitinib treatment of Vogt-Koyanagi-Harada disease
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162335
PMID:36301664
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,首次进行了多模态、高维度的分析,生成了一份关于VKH患者在接受TOFA治疗期间免疫细胞亚群组成、基因特征、富集通路和细胞间相互作用的全面人类免疫图谱 | 首次进行了多模态、高维度的分析,生成了一份全面的人类免疫图谱,并识别出与炎症和JAK相关的两种单核细胞亚群,这些亚群在VKH发病机制和TOFA治疗机制中起重要作用 | NA | 探讨TOFA治疗Vogt-Koyanagi-Harada病(VKH)的具体发病机制和靶向治疗策略 | VKH患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
19855 | 2024-08-08 |
The Tumor Microenvironment Reprograms Immune Cells
2022-12, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2022.0047
PMID:36301256
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境如何通过创建免疫抑制环境和代谢竞争来重新编程免疫细胞和其他基质细胞,以限制其抗肿瘤能力 | 利用单细胞测序技术分析了肿瘤微环境中免疫细胞和其他基质细胞的肿瘤特异性特征 | NA | 探讨肿瘤细胞如何重新编程肿瘤微环境及外周血中的免疫细胞,以提高当前免疫治疗效率并提出新的抗癌思路 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和其他基质细胞 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
19856 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional and functional analysis of dopaminergic neurons in organoid-like cultures derived from human fetal midbrain
2022-12-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200504
PMID:36305490
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了从人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中多巴胺能神经元的转录组和功能成熟过程 | 本文首次揭示了3D类器官培养条件比单层培养条件更能有效地生成和维持成熟的多巴胺能神经元 | NA | 研究旨在开发从多能干细胞生成中脑多巴胺神经元的精细分化协议,以应用于疾病模型、诊断、药物筛选和基于细胞的治疗方法 | 人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中的多巴胺能神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6-11周龄的人类胎儿中脑组织 |
19857 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 synchronizes lunar-regulated beach spawning in grass puffers
2022-11-21, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.09.062
PMID:36306789
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研究论文 | 本研究探讨了草河豚在月相周期下海滩产卵的同步机制 | 首次揭示了前列腺素E2(PGE)在月相周期下同步草河豚海滩产卵行为中的作用 | NA | 理解草河豚在月相周期下海滩产卵的机制 | 草河豚的垂体和下丘脑 | NA | NA | RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 2个月内每周收集的雄性草河豚的垂体和下丘脑样本 |
19858 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals heterogeneous neutrophils with prognostic values in sepsis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105301
PMID:36304125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对近300,000个人类外周血细胞进行转录组分析,揭示了具有预后价值的异质性中性粒细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细划分了中性粒细胞的四种亚型,并发现其中一种亚型Neu1与脓毒性休克显著相关,其基因表达模块Neu1_C具有高预测性 | NA | 研究中性粒细胞在脓毒症中的异质性及其作为预后生物标志物的潜力 | 人类外周血细胞中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 近300,000个人类外周血细胞 |
19859 | 2024-08-08 |
Adult human kidney organoids originate from CD24+ cells and represent an advanced model for adult polycystic kidney disease
2022-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01202-z
PMID:36303074
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研究论文 | 本文报道了成人肾脏类器官来源于CD24+细胞,并展示了其在成人多囊肾病模型中的高级应用 | 首次揭示了成人肾脏类器官(tubuloids)来源于特定的CD24上皮亚群,并展示了其在模拟常染色体显性多囊肾病(ADPKD)中的应用 | NA | 研究成人肾脏类器官的细胞起源及其在成人多囊肾病模型中的应用 | 成人肾脏类器官(tubuloids)及其在成人多囊肾病中的应用 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及CRISPR-Cas9基因编辑的PKD1和PKD2敲除类器官以及人类ADPKD和对照组织 |
19860 | 2024-08-08 |
Characterization of the tumour microenvironment phenotypes in malignant tissues and pleural effusion from advanced osteoblastic osteosarcoma patients
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1072
PMID:36305631
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期成骨性骨肉瘤患者恶性组织和胸腔积液中的肿瘤微环境表型 | 首次提供了晚期成骨性骨肉瘤患者胸腔积液和原发肿瘤的细胞图谱 | NA | 探究成骨性骨肉瘤患者胸腔积液中的细胞环境,并寻找潜在的治疗靶点 | 成骨性骨肉瘤患者的胸腔积液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 27,260个细胞来自7个胸腔积液样本,91,186个细胞来自8个骨肉瘤组织样本 |