单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 19821 - 19840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19821 | 2024-08-05 |
Biglycan promotes hepatic fibrosis through activating heat shock protein 47
2023-Feb, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15477
PMID:36371672
|
研究论文 | 本研究探讨了大肌糖蛋白（BGN）在肝纤维化中的作用及其机制。 | 确认了BGN通过调节HSP47依赖机制影响肝纤维化和细胞外基质沉积。 | 该研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床相关性需要进一步验证。 | 研究BGN在肝纤维化中的作用及其调控机制。 | 使用人类肝样本、BGN缺失小鼠模型及人类LX-2肝星状细胞模型进行研究。 | 数字病理学 | 肝纤维化 | qRT-PCR, 西方印迹, 免疫共沉淀, 免疫荧光染色 | NA | 生物信息数据, 单细胞RNA-seq数据 | 人类肝样本和BGN缺失小鼠模型, LX-2细胞模型 |
| 19822 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq uncovers cellular heterogeneity and provides a signature for paediatric sleep apnoea
2023-02, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01465-2022
PMID:36356973
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞转录组学分析揭示了阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）对外周血单核细胞（PBMC）构成的影响 | 提出了一个由32个基因组成的分子特征，可以精确区分OSA患者与各种对照组 | 文章未详细讨论样本大小和选取的具体标准 | 研究OSA对循环免疫细胞异质性的影响 | 外周血单核细胞（PBMC） | 数字病理学 | 睡眠呼吸暂停 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 基因表达数据 | 独立PBMC大规模RNA表达数据集 |
| 19823 | 2024-08-05 |
Human scattered tubular cells represent a heterogeneous population of glycolytic dedifferentiated proximal tubule cells
2023-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6029
PMID:36373978
|
研究论文 | 本研究表征了人类的散布管细胞（STCs）群体，这是一种在急性肾损伤后数量增加的特殊细胞群体 | 本研究首次揭示了人类STCs是异质性群体，并表明其代谢向糖酵解转变，可能促进肾损伤后的细胞存活 | 研究主要集中于人类STCs的特征，缺乏对其他类型肾细胞的全面比较 | 研究人类散布管细胞（STCs）的特征及其在肾损伤中的角色 | 研究对象为散布管细胞和肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 分析了若干人类肾组织样本 |
| 19824 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of epithelial and stromal cell heterogeneity by lobe and strain in the mouse prostate
2023-02, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24460
PMID:36373171
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了两种常用小鼠品系（FVB/NJ和C57BL/6J）的6个月龄小鼠前列腺中不同前列腺叶的细胞转录组 | 揭示了基底细胞和腔细胞在小鼠品系和前列腺叶之间存在特定的转录组差异，并发现了三种稀有的独立于品系和叶的细胞群 | NA | 评估组织微环境中细胞类型的复杂相互作用，以理解前列腺疾病的发生和发展及干预机会 | 小鼠前列腺中的上皮细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | FVB/NJ品系2只小鼠，C57BL/6J品系3只小鼠，每只小鼠的前列腺分为前叶、背叶、侧叶和腹叶 |
| 19825 | 2024-08-08 |
Cancer-associated fibroblasts potentiate colorectal cancer progression by crosstalk of the IGF2-IGF1R and Hippo-YAP1 signaling pathways
2023-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6033
PMID:36373776
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过IGF2-IGF1R和Hippo-YAP1信号通路的交叉对话促进结直肠癌（CRC）进展的新分子机制 | 发现CAFs分泌的胰岛素样生长因子2（IGF2）通过激活IGF1R和YAP1信号通路促进CRC的肿瘤生长、迁移和侵袭 | NA | 阐明CAF分泌的IGF2在结直肠癌发生中的新分子机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和结直肠癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | HCT 116和DLD-1细胞，CRC类器官和体内研究 |
| 19826 | 2024-08-08 |
scHumanNet: a single-cell network analysis platform for the study of cell-type specificity of disease genes
2023-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1042
PMID:36350625
|
研究论文 | 介绍了一个名为scHumanNet的单细胞网络分析平台，用于研究疾病基因的细胞类型特异性 | scHumanNet基于细胞类型特异性基因网络（CGNs）构建，显示出比其他方法更高的细胞功能相关性，并能优先考虑与特定细胞类型相关的基因 | NA | 提高精准医学中细胞类型特异性基因功能的识别 | 单细胞生物学中的细胞类型特异性基因功能 | 生物信息学 | 乳腺癌, 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组数据分析 | 细胞类型特异性基因网络（CGNs） | 基因网络数据 | NA |
| 19827 | 2024-08-05 |
Liver sinusoidal endothelial cells induce BMP6 expression in response to non-transferrin-bound iron
2023-01-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022016987
PMID:36351237
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研究论文 | 本文研究了肝窦内皮细胞如何在非转铁蛋白结合的铁的刺激下诱导BMP6表达 | 研究揭示了肝窦内皮细胞内铁感应机制，并提出了Tfr1在低铁条件下的作用 | 在铁挑战下，尽管最终能够诱导Bmp6，但相对于肝脏铁含量的水平有时略低 | 探讨肝窦内皮细胞对系统性铁过载的适应机制 | 使用转铁蛋白受体1特异性缺失的转基因小鼠进行单细胞转录组分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 转基因小鼠 | mRNA | TfrcTek-Cre和Tfrcfl/fl小鼠 |
| 19828 | 2024-08-05 |
TEDD: a database of temporal gene expression patterns during multiple developmental periods in human and model organisms
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac978
PMID:36350663
|
研究论文 | TEDD是一个关于人类和模式生物在多个发育阶段的时间基因表达模式的数据库。 | 系统策划并整合了来自2760个大样本和超过510万个单细胞的最新和最全面的测序数据集。 | 本研究未提及具体的局限性。 | 研究基因在组织/器官发育以及导致疾病的机制中的作用。 | 涉及481种细胞类型、79种组织类型和92个时间点的基因表达和染色质可及性分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | 2760个大样本和超过510万个单细胞 |
| 19829 | 2024-08-08 |
NPInter v5.0: ncRNA interaction database in a new era
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1002
PMID:36373614
|
研究论文 | 本文介绍了NPInter数据库的第五次更新，该数据库记录了非编码RNA（ncRNA）与其他生物分子之间的相互作用 | 通过手动文献挖掘和高通量数据处理，ncRNA相互作用条目数量翻倍，并集成了来自iMARGI、ChAR-seq和GRID-seq的全球RNA-DNA相互作用数据，显著增加了RNA-DNA相互作用的记录数量 | NA | 更新和扩展NPInter数据库，以记录更多的ncRNA相互作用，为生物学研究提供有价值的信息 | ncRNA与其他生物分子之间的相互作用 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | NA | 文本 | ncRNA相互作用条目从1,100,618增加到2,596,695，RNA-DNA相互作用从888,915增加到8,329,382 |
| 19830 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals mechanisms of uncontrolled inflammation and glycolysis in decidual stromal cell subtypes in recurrent miscarriage
2023-01-05, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac240
PMID:36355621
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了反复流产中基质细胞亚型的炎症和糖酵解机制 | 首次鉴定出三种基质细胞亚型，其中炎症型和糖酵解型在反复流产中显著富集，并提出了一个由缺氧压力、失控炎症和异常糖酵解驱动的病理模型 | 单细胞RNA测序的基质样本数量有限，未来研究需要深入的功能研究 | 探究反复流产中基质细胞亚型的存在及其在疾病中的作用 | 基质细胞亚型及其在反复流产中的作用 | NA | 反复流产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15个早期基质样本，包括5个健康供体和10个反复流产患者 |
| 19831 | 2024-08-05 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
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研究论文 | 该研究系统评估了与cuproptosis相关的基因在头颈癌中的表达和遗传变化，并构建了风险模型来预测患者的生存率 | 提出了cuproptosis相关基因的风险模型，并分析了其与免疫微环境的关系 | 本研究尚未在临床应用中进行验证 | 探讨cuproptosis相关基因在头颈鳞状细胞癌患者中的预后价值 | 头颈鳞状细胞癌患者及其非癌性组织样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 涉及19个cuproptosis相关基因的头颈鳞状细胞癌和非癌性组织样本 |
| 19832 | 2024-08-08 |
Isolation of Murine Articular Chondrocytes for Single-Cell RNA or Bulk RNA Sequencing Analysis
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2839-3_14
PMID:36355293
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研究论文 | 本文介绍了一种从啮齿动物模型关节中分离软骨细胞的技术，用于单细胞RNA或批量RNA测序分析 | 提出了一种优化的技术，通过一系列酶消化和双阴性选择过程，使用流式细胞术从密集的细胞外基质中分离出软骨细胞 | NA | 开发一种有效的方法来分离软骨细胞，以便进行单细胞RNA测序分析 | 啮齿动物模型的关节软骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 流式细胞术 (FACS) | NA | RNA | NA |
| 19833 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals that monocytes with high cathepsin S expression aggravate cerebral ischemia-reperfusion injury
2023-01, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2022.11.001
PMID:36371010
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了外周血中单核细胞的cathepsin S表达在脑缺血-再灌注损伤中的作用 | 首次揭示了cathepsin S在单核细胞中的表达模式及其在脑缺血-再灌注损伤中的关键作用 | NA | 探讨外周免疫细胞如何影响中枢炎症反应及干预措施对缺血-再灌注损伤的影响 | 小鼠外周血中的单核细胞及其在脑缺血-再灌注损伤中的作用 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠外周血样本 |
| 19834 | 2024-08-08 |
Directly induced human retinal ganglion cells mimic fetal RGCs and are neuroprotective after transplantation in vivo
2022-12-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.011
PMID:36368332
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研究论文 | 本文开发了一种快速协议，用于从人干细胞直接诱导视网膜神经节细胞（iRGC）的分化，并通过钙成像和单细胞RNA测序验证了其与胎儿视网膜神经节细胞的高度相似性，并展示了其在移植后的神经保护功能。 | 本文首次展示了直接诱导的人视网膜神经节细胞（iRGC）与胎儿视网膜神经节细胞的高度相似性，并证明了其在移植后的神经保护功能。 | NA | 开发一种新的视网膜神经节细胞替换疗法，以恢复青光眼和其他视神经病变患者的视力。 | 人干细胞直接诱导的视网膜神经节细胞（iRGC）及其在移植后的功能。 | 干细胞研究 | 视神经病变 | 钙成像，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 19835 | 2024-08-08 |
Liver tumour immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05400-x
PMID:36352227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了189个肝癌样本，揭示了肝癌免疫微环境的不同亚型及其与临床相关性的联系 | 首次详细描述了肝癌免疫微环境的五种亚型，并揭示了肿瘤相关中性粒细胞在免疫抑制中的作用 | NA | 探究肝癌免疫微环境的异质性及其与临床相关性的联系 | 肝癌患者的免疫微环境和肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 189个样本，包括124名患者和8只小鼠 |
| 19836 | 2024-08-08 |
Tissue-resident memory T cells: The key frontier in local synovitis memory of rheumatoid arthritis
2022-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102950
PMID:36356551
|
研究论文 | 本文探讨了类风湿性关节炎（RA）中组织驻留记忆T细胞（T）在局部滑膜炎记忆中的作用 | 提出使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）与空间转录组学技术来探索T细胞在时间和空间维度上的基因表达模式，以识别特定的治疗靶点 | 目前对滑膜T细胞的异质性了解不明确 | 研究T细胞在RA局部复发和器官受累中的作用，并探索新的治疗方法 | 组织驻留记忆T细胞（T）及其在RA中的作用 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明 |
| 19837 | 2024-08-08 |
Graph deep learning for the characterization of tumour microenvironments from spatial protein profiles in tissue specimens
2022-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00951-w
PMID:36357512
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研究论文 | 本文展示了利用图神经网络基于组织样本中的空间蛋白质分布来模拟肿瘤微环境，并将其建模为局部子图，以捕捉与不同临床结果相关的独特细胞相互作用 | 本文提出的图深度学习模型在预测患者结果方面比基于细胞类型局部组成的深度学习方法更为准确，并提供了关于肿瘤细胞和粒细胞空间分隔对患者预后影响的见解 | NA | 研究如何从多重免疫荧光成像的丰富数据集中识别和表征与疾病相关的微环境 | 人类头颈部和结直肠癌的组织样本 | 计算机视觉 | 头颈部癌, 结直肠癌 | 多重免疫荧光成像 | 图神经网络 | 图像 | 40-plex免疫荧光成像应用于人类头颈部和结直肠癌的组织样本 |
| 19838 | 2024-08-08 |
A transient inflammatory response contributes to oxaliplatin neurotoxicity in mice
2022-Dec, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.51691
PMID:36369764
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了背根神经节中小神经元和卫星胶质细胞的转录组，揭示了奥沙利铂引起的神经毒性与炎症反应的关系。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了奥沙利铂神经毒性中炎症反应的分子机制，并提出了抗炎策略作为预防奥沙利铂引起的外周神经病变的新治疗方法。 | NA | 确定奥沙利铂神经毒性发展的确切分子机制，并寻找新的治疗靶点。 | 小鼠模型的背根神经节中的感觉神经元和卫星胶质细胞。 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19839 | 2024-08-08 |
Epigenomic landscape study reveals molecular subtypes and EBV-associated regulatory epigenome reprogramming in nasopharyngeal carcinoma
2022-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104357
PMID:36371985
|
研究论文 | 本研究通过整合全基因组亚硫酸氢盐测序、转座酶可及染色质测序、全外显子测序和单细胞RNA测序数据，探讨了EB病毒相关表观遗传失调在鼻咽癌中的作用 | 发现了EB病毒阳性鼻咽癌中一种新的全局低甲基化亚型，并识别了EB病毒特异性差异甲基化区域，这些区域与CTCF结合丢失相关 | NA | 揭示鼻咽癌中的表观遗传异质性，并探讨EB病毒感染与宿主因子在病毒相关表观遗传变化中的作用 | 鼻咽癌中的EB病毒相关表观遗传失调 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）、转座酶可及染色质测序（ATAC-Seq）、全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 19840 | 2024-08-08 |
Single-cell mapping reveals dysregulation of immune cell populations and VISTA+ monocytes in myasthenia gravis
2022-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2022.109184
PMID:36372318
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术分析了重症肌无力患者和健康对照者的免疫细胞组成和功能变化 | 首次揭示了重症肌无力患者中VISTA+单核细胞的增加以及多种免疫检查点的异常表达 | 研究样本量相对较小，且未涉及长期随访数据 | 探究重症肌无力患者免疫细胞的异常调控及其潜在的生物标志物 | 重症肌无力患者和健康对照者的血液样本 | 免疫学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名未接受免疫抑制治疗的重症肌无力患者和10名性别及年龄匹配的健康对照者，以及外部验证队列中的38名重症肌无力患者和21名健康对照者 |