单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 19821 - 19840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19821 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Endothelial Cells in Upper and Lower Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2022-10-14, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol29100607
PMID:36290884
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人体食管鳞状细胞癌中上部和下部内皮细胞的转录组，以寻找新的抗血管生成治疗靶点 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了食管鳞状细胞癌中上部和下部内皮细胞的差异表达基因，并分析了这些基因在血管生成和细胞运动中的作用 | 研究结果需要进一步的临床试验验证，以确定所识别的靶基因在抗血管生成治疗中的实际效果 | 寻找食管鳞状细胞癌中新的抗血管生成治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌中的上部和下部内皮细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19822 | 2024-08-08 |
Intercellular Communication Reveals Therapeutic Potential of Epithelial-Mesenchymal Transition in Triple-Negative Breast Cancer
2022-Oct-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12101478
PMID:36291687
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了五名三阴性乳腺癌患者的8938个细胞基因表达谱，探讨了上皮-间质转化在三阴性乳腺癌中的治疗潜力及其细胞间通讯机制 | 首次通过单细胞RNA测序详细描述了三阴性乳腺癌中的上皮-间质转化过程，并揭示了肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL-CXCR2信号支持恶性上皮细胞侵袭的新机制 | 研究样本仅限于五名三阴性乳腺癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨上皮-间质转化在三阴性乳腺癌中的治疗潜力及其细胞间通讯机制 | 三阴性乳腺癌患者的细胞基因表达谱 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8938个细胞基因表达谱，来自五名三阴性乳腺癌患者 |
| 19823 | 2024-08-08 |
Increased CD4+CD8+ Double Positive T Cells during Hantaan Virus Infection
2022-10-13, Viruses
DOI:10.3390/v14102243
PMID:36298798
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序数据分析了汉坦病毒感染引起的出血热伴肾综合征患者中双阳性T细胞的变化及其作用 | 首次发现汉坦病毒感染导致外周血中双阳性T细胞的积累，并表明这些细胞属于CD8T细胞系，具有类似细胞毒性T细胞的特征并发挥抗病毒作用 | NA | 探索汉坦病毒感染期间双阳性T细胞的动态变化及其在疾病中的作用 | 汉坦病毒感染引起的出血热伴肾综合征患者中的双阳性T细胞 | NA | 出血热伴肾综合征 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞术数据, 单细胞RNA测序数据 | HFRS患者 |
| 19824 | 2024-08-08 |
A Novel Algorithm for Feature Selection Using Penalized Regression with Applications to Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-Oct-12, Biology
DOI:10.3390/biology11101495
PMID:36290397
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研究论文 | 本文分析并比较了多种基于惩罚回归的方法在单细胞RNA测序数据中的特征选择性能，并提出了一种新的算法 | 提出了一种新的特征选择算法，该算法通过选择一小部分基因并应用稀疏组套索（SGL）方法来识别差异表达基因，无需特定领域的基因分组知识 | NA | 研究并改进单细胞RNA测序数据中的特征选择方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因（特征）选择 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚回归方法（如稀疏组套索SGL、岭回归、套索回归等） | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 19825 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling in Inherited Retinal Degeneration Reveals Distinct Metabolic Pathways in Rod and Cone Photoreceptors
2022-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232012170
PMID:36293024
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在遗传性视网膜变性的背景下，系统地绘制了小鼠视网膜在单细胞水平上的转录变化图谱 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了遗传性视网膜变性中杆状和锥状光感受器的特定代谢途径变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类 | 旨在系统地映射遗传性视网膜变性中发生的转录变化 | 遗传性视网膜变性中的小鼠视网膜细胞 | 数字病理学 | 遗传性视网膜变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 43,979个单独细胞，分为20个不同的集群 |
| 19826 | 2024-08-08 |
COVID-GWAB: A Web-Based Prediction of COVID-19 Host Genes via Network Boosting of Genome-Wide Association Data
2022-10-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12101446
PMID:36291657
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研究论文 | 本文介绍了COVID-GWAB，一个基于网络的工具，用于通过整合独立的功能信息来增强COVID-19患者的GWAS信号，并重新优先考虑候选宿主基因 | 通过整合分子相互作用等独立功能信息，增强弱关联信号，克服传统GWAS的统计能力限制 | NA | 研究影响COVID-19易感性和反应的宿主基因遗传因素 | COVID-19患者的宿主基因 | 生物信息学 | COVID-19 | GWAS | NA | 基因组数据 | NA |
| 19827 | 2024-08-08 |
Global genome decompaction leads to stochastic activation of gene expression as a first step toward fate commitment in human hematopoietic cells
2022-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001849
PMID:36288293
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研究论文 | 研究人类造血细胞在分化过程中基因表达激活的机制及其对命运承诺的影响 | 首次揭示了全局基因组解压缩作为命运承诺第一步的随机基因表达激活机制 | 研究主要集中在单个细胞层面，未涉及细胞群体层面的动态变化 | 理解人类造血细胞从多谱系预备状态建立和退出的机制 | 人类脐带血来源的CD34+细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 未明确具体样本数量 |
| 19828 | 2024-08-08 |
Unravelling Tumour Microenvironment in Melanoma at Single-Cell Level and Challenges to Checkpoint Immunotherapy
2022-Sep-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101757
PMID:36292642
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综述 | 本文综述了黑色素瘤肿瘤微环境在单细胞水平上的复杂性及其对免疫检查点疗法的挑战 | 强调了使用单细胞测序和空间平台解析肿瘤异质性的机会 | 并非所有癌症患者都能对免疫疗法产生长期持久的反应，且部分患者会产生耐药性 | 探讨肿瘤异质性和微环境复杂性对当前癌症免疫疗法研究的主要挑战 | 黑色素瘤的肿瘤微环境及其对免疫疗法的影响 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 19829 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of T-Cell Activation Can Serve as Predictors of Functionality for SARS-CoV-2-Specific T-Cell Receptors
2022-Sep-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10101617
PMID:36298482
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研究论文 | 本研究展示了基于近期肽刺激诱导的T细胞激活基因签名来区分高度功能性和旁观者TCR的可能性 | 本研究通过CRISPR-Cas9介导的基因编辑和单细胞RNA测序，验证了T细胞激活基因签名可以准确识别和预测SARS-CoV-2特异性TCR | NA | 探索T细胞在控制SARS-CoV-2感染中的功能，并提高抗原特异性TCR库功能分析的通量 | SARS-CoV-2特异性T细胞受体（TCR）的功能性 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 19830 | 2024-08-08 |
Identification of the Thyrotropin-Releasing Hormone (TRH) as a Novel Biomarker in the Prognosis for Acute Myeloid Leukemia
2022-Sep-23, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12101359
PMID:36291567
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现促甲状腺素释放激素（TRH）作为急性髓系白血病（AML）的新型生物标志物，并探讨其在AML患者中的表达模式及临床意义 | 首次揭示TRH作为AML的生物标志物，并验证其在不同AML患者群体中的表达差异 | 对TRH在AML中的临床和遗传特征理解不足 | 探索TRH作为AML预后标志物的潜在价值 | 急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA AML数据集及三个其他AML队列（Beat AML n=223，GSE6891 n=461，GSE17855 n=237） |
| 19831 | 2024-08-08 |
Single Cell Sequencing Reveals Mechanisms of Persistent Truncus Arteriosus Formation after PDGFRα and PDGFRβ Double Knockout in Cardiac Neural Crest Cells
2022-Sep-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13101708
PMID:36292593
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研究论文 | 本文通过构建持久性动脉干（PTA）小鼠模型，研究了心脏神经嵴细胞中PDGFRα和PDGFRβ双敲除后导致PTA的机制 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示了双敲除组中心脏神经嵴细胞衍生细胞在心脏流出道的分隔和重塑过程中的异常 | NA | 探讨心脏神经嵴细胞中PDGFRα和PDGFRβ双敲除后导致持久性动脉干形成的机制 | 心脏神经嵴细胞及其在心脏流出道的分隔和重塑过程中的作用 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 19832 | 2024-08-08 |
FTH1- and SAT1-Induced Astrocytic Ferroptosis Is Involved in Alzheimer's Disease: Evidence from Single-Cell Transcriptomic Analysis
2022-Sep-22, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph15101177
PMID:36297287
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了阿尔茨海默病中星形胶质细胞铁死亡的作用及其分子机制 | 首次揭示了FTH1和SAT1在星形胶质细胞中诱导的铁死亡与阿尔茨海默病病理过程的关系 | 研究主要基于数据库中的单细胞RNA测序数据，未来需通过实验进一步验证 | 探索阿尔茨海默病中星形胶质细胞的铁死亡机制及其对疾病进程的影响 | 阿尔茨海默病患者和健康对照者的脑组织细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的阿尔茨海默病患者和健康对照者的样本 |
| 19833 | 2024-08-08 |
The Tumor Immune Profile of Murine Ovarian Cancer Models: An Essential Tool For Ovarian Cancer Immunotherapy Research
2022-06, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.crc-22-0017
PMID:36311166
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化技术，对六种卵巢肿瘤模型进行了免疫原性分析，以全面表征和比较这些模型系统，反映卵巢癌的多样性。 | 本文首次详细分析了六种卵巢肿瘤模型的免疫特征，包括T细胞和骨髓细胞的浸润情况，以及免疫成分和细胞因子的分布，为卵巢癌免疫治疗研究提供了新的工具。 | 研究仅限于小鼠模型，可能与人类疾病的实际情况存在差异。 | 旨在为卵巢癌免疫治疗研究提供一个全面的模型系统，以测试免疫疗法的效果，探索免疫反应机制，并指导患者治疗方案的选择。 | 六种卵巢肿瘤模型，包括ID8-p53-/-, ID8-C3, STOSE, MOE-PTEN/KRAS等。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 细胞 | 六种卵巢肿瘤模型 |
| 19834 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq reveals the role of MYC signaling in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1021978
PMID:36299592
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研究论文 | 本文通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，揭示了MYC信号在肺腺癌中的作用 | 首次将大量和单细胞RNA测序数据结合，通过GSVA评分和Spearman相关性分析，将基因分为与MYC信号高度相关的两个基因集，并验证了MYC信号与细胞分化的关联 | NA | 揭示MYC信号在肺腺癌中的作用及其对疾病进展的影响 | 肺腺癌的多组学数据，包括基因组、转录组和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 多个队列的肺腺癌样本 |
| 19835 | 2024-08-08 |
Combining single-cell sequencing data to construct a prognostic signature to predict survival, immune microenvironment, and immunotherapy response in gastric cancer patients
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1018413
PMID:36300104
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据构建了一个预测胃癌患者生存、免疫微环境和免疫治疗反应的预后标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个免疫相关的遗传标志物，用于分类胃癌病例并预测患者的预后、免疫状态和治疗反应 | NA | 开发一个免疫相关的遗传标志物，用于分类胃癌病例并预测患者的预后、免疫状态和治疗反应 | 胃癌患者的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 多个胃癌患者的样本 |
| 19836 | 2024-08-08 |
Advances in single-cell sequencing technology in the field of hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.996890
PMID:36303541
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肝细胞癌研究中的应用及其基本流程和发展 | 单细胞测序技术能够以单细胞分辨率解析人类肿瘤，精细描绘不同细胞类型，揭示肿瘤细胞的异质性 | NA | 探讨单细胞测序技术在肝细胞癌研究中的应用，以改善其临床诊断、治疗和预后判断 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性、肿瘤免疫微环境及肿瘤细胞的克隆进化 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组或代谢组数据 | NA |
| 19837 | 2024-08-08 |
TransCluster: A Cell-Type Identification Method for single-cell RNA-Seq data using deep learning based on transformer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1038919
PMID:36303549
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研究论文 | 本文提出了一种名为TransCluster的混合网络结构，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别，该方法结合线性判别分析和改进的Transformer模型，提高了细胞类型识别的准确性和鲁棒性 | TransCluster是首个使用Transformer模型进行单细胞RNA测序数据细胞类型注释的方法，显著提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 开发一种新的细胞类型识别方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 转录组数据 | 多个不同人体组织的数据集 |
| 19838 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of potential cellular communication networks in advanced osteosarcoma using single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1013737
PMID:36303551
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据对高级骨肉瘤中的潜在细胞通信网络进行了综合分析 | 揭示了11种细胞类型和17种潜在的细胞通信网络，为骨肉瘤的分子机制提供了新的见解 | NA | 深入理解肿瘤微环境，以开发有效的骨肉瘤治疗方法 | 骨肉瘤中的细胞类型和细胞通信网络 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个骨肉瘤组织，包含25个细胞集群 |
| 19839 | 2024-08-08 |
SingleCAnalyzer: Interactive Analysis of Single Cell RNA-Seq Data on the Cloud
2022, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2022.793309
PMID:36304292
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研究论文 | 本文介绍了SingleCAnalyzer，一个云平台，用于通过易于使用的自探索网页界面进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的完整分析 | 开发了SingleCAnalyzer平台，提供了一个完整的scRNA-Seq分析流程，并通过交互式图形界面增强了探索和分析功能 | 需要生物信息学专业知识以正确应用这些计算方法，否则难以获得可靠和可重复的结果 | 开发一个用户友好的云平台，用于单细胞RNA测序数据的交互式分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 文本 | NA |
| 19840 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals the cell map and transcriptional network of sporadic vestibular schwannoma
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.984529
PMID:36304995
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研究论文 | 本研究基于来自散发性前庭神经鞘瘤患者的三个肿瘤样本，通过单细胞转录组测序获得32,011个细胞，质量控制和双细胞去除后得到22,309个高质量细胞。随后，通过聚类分析得到18个细胞簇，并将其注释为六种类型的细胞。基于这六种细胞簇进行了深入分析，包括描述每个细胞亚型的功能特征、细胞发育和分化途径、细胞间相互作用以及簇内的转录调控网络。 | 首次详细描述了散发性前庭神经鞘瘤肿瘤组织中各种类型细胞的单细胞图谱，揭示了不同细胞类型的功能状态和发展轨迹，并探索了Schwann细胞在周围神经系统中的功能状态，这在以往研究中未被报道。 | NA | 描述散发性前庭神经鞘瘤的单细胞图谱，揭示不同细胞类型的功能状态和发展轨迹。 | 散发性前庭神经鞘瘤患者的肿瘤样本中的细胞。 | 数字病理学 | 神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 3个肿瘤样本，32,011个细胞，质量控制后22,309个高质量细胞 |