单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 19801 - 19820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19801 | 2024-08-08 |
Identification of underexplored mesenchymal and vascular-related cell populations in human skeletal muscle
2022-12-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00364.2022
PMID:36342160
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人体骨骼肌中的未充分探索的间质细胞群体，特别是血管相关细胞类型。 | 首次在人体骨骼肌中发现并描述了表达pericyte和pan-endothelial基因的endothelial-like pericytes (ELPCs)，并探讨了其在细胞转化中的潜在作用。 | 研究仅限于年轻个体的骨骼肌样本，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性。 | 揭示人体骨骼肌中未充分探索的间质细胞群体的特征和功能。 | 人体骨骼肌中的间质细胞群体，特别是血管相关细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 约2,000个细胞 |
| 19802 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals immunopathological cell composition of skin lesions in subacute cutaneous lupus erythematosus
2022-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2022.109172
PMID:36343898
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了亚急性皮肤红斑狼疮（SCLE）皮肤病变中的细胞组成，并与健康对照组进行了比较 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SCLE中扩展的成纤维细胞和角质形成细胞亚型，以及异常激活的淋巴细胞和炎症性M1巨噬细胞 | NA | 探究亚急性皮肤红斑狼疮（SCLE）的免疫发病机制 | SCLE皮肤病变中的细胞组成 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | SCLE皮肤病变和健康对照组皮肤组织的scRNA-seq数据 |
| 19803 | 2024-08-08 |
BISC: accurate inference of transcriptional bursting kinetics from single-cell transcriptomic data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac464
PMID:36326081
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BISC的贝叶斯方法，用于从单细胞转录组数据中准确推断转录爆发动力学参数 | BISC基于beta-gamma-Poisson模型，通过建模均值-方差依赖性，实现了从噪声数据中准确估计爆发参数，相比现有方法在低表达基因上表现出更高的准确性和可靠性 | NA | 探索单细胞转录组数据中的转录爆发动力学 | 单细胞转录组数据中的转录爆发参数 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 贝叶斯方法 | 单细胞转录组数据 | 包括小鼠胚胎细胞和成纤维细胞数据集、人类免疫细胞数据集和人类胰腺细胞数据集 |
| 19804 | 2024-08-08 |
IReNA: Integrated regulatory network analysis of single-cell transcriptomes and chromatin accessibility profiles
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105359
PMID:36325073
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研究论文 | 本文开发了集成调控网络分析（IReNA）方法，通过整合单细胞转录组和染色质可及性数据进行网络推断和模块化分析 | IReNA方法能够更精确地识别已知调控因子，并优于现有方法 | NA | 开发一种新的方法来整合单细胞转录组和染色质可及性数据，以进行更精确的调控网络分析 | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 使用公开数据集 |
| 19805 | 2024-08-08 |
Cellular plasticity and immune microenvironment of malignant pleural effusion are associated with EGFR-TKI resistance in non-small-cell lung carcinoma
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105358
PMID:36339256
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研究论文 | 本研究评估了非小细胞肺癌（NSCLC）相关恶性胸腔积液（MPE）在理解肿瘤异质性和识别EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗反应因素方面的诊断潜力 | 研究通过单细胞RNA测序分析，发现EGFR TKI耐药组中肺上皮前体样细胞和过渡效应T细胞、浆细胞样树突状细胞的富集 | NA | 探讨恶性胸腔积液中的细胞可塑性和免疫抑制微环境与EGFR突变非小细胞肺癌患者TKI反应的关系 | 非小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 9名非小细胞肺癌患者（5名耐药，4名敏感）的31,743个细胞 |
| 19806 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq transcriptomic landscape of human and mouse islets and pathological alterations of diabetes
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105366
PMID:36339258
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了人鼠胰岛细胞的转录组图谱，并探讨了2型糖尿病的病理变化 | 首次详细描绘了胰岛细胞的完整细胞景观，并发现了2型糖尿病中β细胞的显著异质性和表达变化 | NA | 深入理解糖尿病的病理机制 | 人鼠胰岛细胞及2型糖尿病的病理变化 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和2型糖尿病小鼠的胰岛细胞 |
| 19807 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals different signatures of mesenchymal stromal cell pluripotent-like and multipotent populations
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105395
PMID:36339265
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了人骨髓间充质基质细胞中多能样和多能群体的不同基因表达特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细比较了多能样Muse-MSCs和多能MSCs在基因表达上的差异，并进一步通过无监督聚类分析了这些细胞亚群的基因表达模式 | NA | 探究维持干细胞特性的必要属性 | 人骨髓间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多能样Muse-MSCs和多能MSCs的多个样本 |
| 19808 | 2024-08-08 |
Estrogen regulates divergent transcriptional and epigenetic cell states in breast cancer
2022-11-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac908
PMID:36318267
|
研究论文 | 本研究系统地追踪了乳腺癌细胞系和类器官模型中雌激素反应在单细胞水平上的时间变化，并开发了一种计算工具（TITAN）来量化单细胞数据集中的信号梯度 | 本研究首次揭示了雌激素反应在单细胞水平上的异质性，并发现了由ER和FOXM1驱动的两种最显著的转录网络 | NA | 探讨雌激素在乳腺癌中的转录和表观遗传调控机制 | 乳腺癌细胞系和类器官模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多个细胞系和类器官模型 |
| 19809 | 2024-08-08 |
Whole-brain comparison of rodent and human brains using spatial transcriptomics
2022-11-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79418
PMID:36342372
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学数据，比较了啮齿类和人类大脑的相似性 | 采用了一种新的监督机器学习方法来提高跨物种对应关系的分辨率 | NA | 改进啮齿类模型与人类大脑研究结果之间的翻译方法 | 啮齿类和人类大脑的神经解剖学组织 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | 监督机器学习 | 转录组数据 | 使用了公开可获得的脑部转录组数据集 |
| 19810 | 2024-08-08 |
Rooting through single-cell sequencing in phloem pole cells
2022-11-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04180-4
PMID:36344596
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19811 | 2024-08-08 |
GLI1+ cells are a source of repair-supportive mesenchymal cells (RSMCs) during airway epithelial regeneration
2022-Nov-05, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04599-2
PMID:36333491
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研究论文 | 本研究探讨了修复支持性间充质细胞（RSMCs）在气道上皮再生中的作用，特别是GLI1+细胞在其中的角色 | 首次报道了GLI1+细胞在气道上皮再生中作为RSMCs的来源，并通过遗传学方法证明了Fgf10在这些细胞中的关键作用 | 研究主要集中在实验室条件下，可能需要进一步的临床验证 | 探究GLI1+细胞在气道上皮再生中的作用及其机制 | GLI1+细胞和修复支持性间充质细胞（RSMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自非损伤或损伤肺的GLI1+细胞 |
| 19812 | 2024-08-08 |
Astrocytic dysfunction induced by ABCA1 deficiency causes optic neuropathy
2022-Nov-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq1081
PMID:36332025
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研究论文 | 本文研究了ABCA1缺乏导致视网膜星形胶质细胞功能障碍及其在老年小鼠中引起类似青光眼的视神经病变的作用 | 首次揭示了ABCA1在视网膜星形胶质细胞中的高表达及其缺乏导致视神经病变的新机制 | NA | 探讨ABCA1缺乏在视网膜星形胶质细胞中引起的功能障碍及其对视神经病变的影响 | ABCA1缺乏的视网膜星形胶质细胞及老年小鼠模型 | NA | 视神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年Glia-KO小鼠 |
| 19813 | 2024-08-08 |
Whole-embryonic identification of maternal microchimeric cell types in mouse using single-cell RNA sequencing
2022-11-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-20781-9
PMID:36333354
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，成功识别了小鼠胚胎中的母源微嵌合细胞类型 | 首次成功估计了单个小鼠胚胎中母源微嵌合细胞的细胞类型谱 | NA | 探究母源微嵌合细胞在不同胚胎中的细胞类型谱及其对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎中的母源微嵌合细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26个小鼠胚胎 |
| 19814 | 2024-08-08 |
Single cell profiling of CD45+ spinal cord cells reveals microglial and B cell heterogeneity and crosstalk following spinal cord injury
2022-Nov-04, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02627-3
PMID:36333772
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了脊髓损伤后脊髓中CD45+细胞的异质性和相互作用 | 揭示了脊髓损伤后微胶质细胞和B细胞的新型相互作用，为脊髓损伤修复提供了新的潜在治疗靶点 | NA | 探讨脊髓损伤后免疫细胞的响应及其在损伤修复中的作用 | 脊髓损伤后的CD45+细胞，包括微胶质细胞和B细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 来自未受伤和受伤的Swiss-webster小鼠的脊髓CD45+细胞，分别在损伤后3天、7天和60天采集 |
| 19815 | 2024-08-08 |
JAK2V617F mutation drives vascular resident macrophages toward a pathogenic phenotype and promotes dissecting aortic aneurysm
2022-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34469-1
PMID:36329047
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研究论文 | 本研究探讨了JAK2V617F突变在主动脉疾病发展中的作用，发现该突变促使血管驻留巨噬细胞向病理性表型转变，并促进主动脉夹层动脉瘤的形成。 | 通过单细胞RNA测序、遗传修饰小鼠模型和药物治疗等方法，揭示了JAK2V617F突变在早期促进有害的主动脉壁重塑和晚期通过招募循环单核细胞促进主动脉夹层动脉瘤的机制。 | NA | 研究JAK2V617F突变在主动脉疾病发展中的作用及其机制。 | JAK2V617F突变、血管驻留巨噬细胞、主动脉疾病。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 包括患有骨髓增生性肿瘤的患者和遗传修饰小鼠模型。 |
| 19816 | 2024-08-08 |
Trade-off between conservation of biological variation and batch effect removal in deep generative modeling for single-cell transcriptomics
2022-Nov-03, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-05003-3
PMID:36329399
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞转录组学中使用深度生成模型时，生物变异保留与批次效应去除之间的权衡问题 | 引入Pareto多任务学习（Pareto MTL）和互信息神经估计（MINE）来优化生物变异保留与批次效应去除之间的权衡 | NA | 提供生物变异保留与批次效应去除之间权衡的全局视图 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成模型 | 高维数据 | NA |
| 19817 | 2024-08-08 |
Defects of microtubule cytoskeletal organization in NOA human testes
2022-Nov-03, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-022-01026-w
PMID:36329464
|
研究论文 | 本研究通过组织病理学、免疫荧光和单细胞RNA测序分析了非阻塞性无精子症（NOA）患者睾丸中微管细胞骨架的缺陷 | 首次探讨了微管细胞骨架在人类非阻塞性无精子症发病机制中的作用 | 样本量较小，且仅限于特定类型的NOA患者 | 研究微管细胞骨架在人类非阻塞性无精子症中的作用及其对精子发生的影响 | NOA患者和正常男性的睾丸组织 | NA | 男性不育症 | 免疫荧光（IF）、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 组织样本、基因表达数据 | 正常男性6例，NOA患者（SCO型3例，减数分裂阻滞型3例） |
| 19818 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals rebalancing of immunological response in patients with periodontitis after non-surgical periodontal therapy
2022-11-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03702-2
PMID:36329504
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了牙周炎患者在接受非手术牙周治疗前后外周血单个核细胞（PBMCs）的转录组变化 | 首次揭示了牙周炎患者在接受非手术牙周治疗后免疫反应的重新平衡，并识别了牙周炎特有的系统性炎症指标 | NA | 探究牙周炎患者的系统性免疫反应及其治疗效果 | 牙周炎患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康对照组及配对的牙周炎患者治疗前后的PBMCs样本 |
| 19819 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies the properties of myelodysplastic syndrome stem cells
2022-11-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03709-9
PMID:36329516
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19820 | 2024-08-08 |
Uncovering the emergence of HSCs in the human fetal bone marrow by single-cell RNA-seq analysis
2022-11-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.10.005
PMID:36332570
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿骨髓和脾脏中造血干细胞/祖细胞及其微环境的转录组图谱，揭示了造血干细胞在骨髓中出现的时间点及其功能。 | 首次通过单细胞RNA测序技术精确确定了人类胎儿骨髓中功能性造血干细胞出现的时间点，并探讨了造血干细胞迁移和维持的可能机制。 | NA | 揭示人类胎儿骨髓中造血干细胞的出现时间及其功能，并探讨其迁移和维持机制。 | 人类胎儿骨髓和脾脏中的造血干细胞/祖细胞及其微环境。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从10到14周的胎儿骨髓和脾脏样本 |