单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 19781 - 19800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19781 | 2024-08-08 |
Novel IKZF3 transcriptomic signature correlates with positive outcomes of skin cutaneous melanoma: A pan-cancer analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1036402
PMID:36353107
|
研究论文 | 本研究通过多数据库分析，探讨了Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）之间的潜在关系，并评估了其在不同癌症类型中的转录特征和临床预后。 | 首次识别出Ikaros基因家族在不同癌症中的泛癌基因组特征，并发现其高表达与SKCM的良好免疫状态和有益临床结果相关。 | NA | 研究Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤的关系及其在不同癌症类型中的表达特征和临床预后。 | Ikaros家族基因在皮肤皮肤黑色素瘤及其他癌症中的表达及其与临床预后的关系。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10,327个转录组样本 |
| 19782 | 2024-08-08 |
Identification of biomarkers for hepatocellular carcinoma based on single cell sequencing and machine learning algorithms
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.873218
PMID:36353113
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和机器学习算法，从八名肝细胞癌患者的肿瘤细胞和配对正常肝细胞中筛选出区分肝细胞癌和正常肝组织的核心生物标志物 | 采用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性，并结合机器学习算法筛选生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及八名患者 | 提高肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 八名肝细胞癌患者 |
| 19783 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of human gut T cells identifies cytotoxic CD4+CD8A+ T cells related to mouse CD4 cytotoxic T cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.977117
PMID:36353619
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在人类肠道T细胞中鉴定出与小鼠CD4细胞毒性T细胞相关的细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞 | 首次在人类肠道中发现细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞，并与小鼠CD4细胞毒性T细胞进行比较分析 | 研究主要集中在肠道炎症疾病患者，未涉及其他疾病状态 | 鉴定人类肠道中的细胞毒性CD4 T细胞，并分析其在炎症性肠病（IBD）患者中的特征 | 人类肠道T细胞及炎症性肠病患者的细胞毒性CD4 T细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19784 | 2024-08-05 |
Establishment and characterization of adult human gastric epithelial progenitor-like cell lines
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13355
PMID:36331058
|
研究论文 | 本研究建立和表征了成人人体胃上皮前体细胞系 | 提出了一种新型的单层细胞培养系统，以克服3D类器官培养的限制 | 目前未提及该培养系统在体内模型中的应用 | 研究成人人体胃上皮前体细胞系的自我更新与分化潜力 | 成人人体胃上皮前体细胞 | 数字病理学 | 胃相关疾病 | 单细胞转录组测序 | 单层细胞培养 | 转录组数据 | 成人人体胃上皮细胞系 |
| 19785 | 2024-08-08 |
Basal Cell-derived WNT7A Promotes Fibrogenesis at the Fibrotic Niche in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-03, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0074OC
PMID:36318668
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研究论文 | 本研究探讨了基底细胞衍生的WNT7A在特发性肺纤维化（IPF）中的促纤维化作用 | 发现基底细胞衍生的WNT7A在IPF进展中起关键作用，并提供了一种新的IPF治疗策略 | NA | 研究基底细胞在特发性肺纤维化中的作用及其机制 | 基底细胞、成纤维细胞和肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、Luminex分析、三维器官培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | IPF移植组织和健康供体肺组织的基底细胞 |
| 19786 | 2024-08-08 |
C1Q labels a highly aggressive macrophage-like leukemia population indicating extramedullary infiltration and relapse
2023-02-16, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017046
PMID:36322939
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别并验证了一种表达C1Q的巨噬细胞样白血病亚群，该亚群与急性髓系白血病（AML）的髓外浸润（EMI）和复发有关。 | 首次发现C1Q标记的巨噬细胞样白血病亚群与AML的髓外浸润和复发密切相关，并揭示了其分子机制和潜在的治疗靶点。 | 研究主要基于单个病例和少数患者的数据，需要进一步的大规模临床验证。 | 探讨AML中髓外浸润的分子机制及其与不良预后的关系。 | 急性髓系白血病患者及其骨髓和髓外浸润样本。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个AML患者样本 |
| 19787 | 2024-08-05 |
TISCH2: expanded datasets and new tools for single-cell transcriptome analyses of the tumor microenvironment
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac959
PMID:36321662
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研究论文 | TISCH2是一个用于肿瘤微环境单细胞转录组分析的资源，包含来自人类和小鼠肿瘤的单细胞RNA测序数据 | 更新后的TISCH2包含190个肿瘤scRNA-seq数据集，涵盖600万个细胞，并增加了多个新功能以优化数据利用 | NA | 提供肿瘤微环境中基因表达的全面特征化 | 人类和小鼠肿瘤的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 190个数据集，覆盖600万个细胞 |
| 19788 | 2024-08-05 |
AE-TPGG: a novel autoencoder-based approach for single-cell RNA-seq data imputation and dimensionality reduction
2023, Frontiers of computer science
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s11704-022-2011-y
PMID:36320820
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于自编码器的新方法AE-TPGG，用于单细胞RNA测序数据的插补和降维 | 提出了一种基于两部分广义伽马分布的自定义自编码器，能够处理单细胞RNA测序数据中的混合离散-连续随机变量 | 未提及 | 旨在改善单细胞RNA测序数据的分析，特别是针对掉落事件的处理 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 自编码器 | 两部分广义伽马分布模型 | RNA测序数据 | 真实数据集 |
| 19789 | 2024-08-08 |
Pleural CD14+ monocytes/macrophages of healthy adolescents show a high expression of metallothionein family genes
2023-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250019
PMID:36321537
|
研究论文 | 本文通过腹腔镜技术从健康年轻成人中分离出胸膜单核细胞/巨噬细胞，并进行RNA测序分析，发现这些细胞中金属硫蛋白家族基因的高表达 | 首次在健康年轻成人的胸膜液中发现高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群 | 需要进一步研究高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群在肺防御、修复和稳态中的具体作用 | 研究健康年轻成人胸膜单核细胞/巨噬细胞中金属硫蛋白家族基因的表达 | 健康年轻成人的胸膜单核细胞/巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 健康年轻成人的胸膜单核细胞/巨噬细胞 |
| 19790 | 2024-08-08 |
Vaeda computationally annotates doublets in single-cell RNA sequencing data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac720
PMID:36342203
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Vaeda的新方法，用于计算注释单细胞RNA测序数据中的双细胞 | Vaeda结合了变分自编码器和正无标记学习，生成双细胞得分和二进制双细胞调用，表现优于其他基于Python的方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中双细胞/多细胞技术伪影的问题 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞/多细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | RNA测序数据 | 16个基准数据集 |
| 19791 | 2024-08-08 |
TREM2 knockdown improves the therapeutic effect of PD-1 blockade in hepatocellular carcinoma
2022-12-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.10.079
PMID:36332476
|
研究论文 | 研究通过使用自补体腺相关病毒（scAAV）在体内有效抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的TREM2表达，发现TREM2敲低能抑制肝细胞癌的生长，并增强PD-1免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次揭示了TREM2在肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表达功能，并发现TREM2敲低能重塑TAMs为免疫刺激状态，增强PD-1阻断疗法的疗效 | NA | 探讨TREM2在肝细胞癌中的作用及其对PD-1阻断疗法效果的影响 | 肝细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用TREM2敲除小鼠和野生型小鼠进行比较研究 |
| 19792 | 2024-08-08 |
Rethinking the visceral innervation --- Peek into the emerging field of molecular dissection of neural signals
2022-12-10, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.09.011
PMID:36344152
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研究论文 | 本文探讨了神经系统与内脏之间的交流，特别是内脏神经支配的细胞和分子特性，并介绍了单细胞RNA测序等新兴技术在神经科学中的应用 | 本文利用单细胞RNA测序等新兴技术，为解决内脏神经支配的未解之谜提供了强大的工具 | NA | 旨在基于最新的研究进展，深入理解神经系统在维持体内平衡中的整合作用 | 神经系统与内脏之间的交流及其细胞和分子特性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19793 | 2024-08-08 |
Combined PD-L1 and TIM3 blockade improves expansion of fit human CD8+ antigen-specific T cells for adoptive immunotherapy
2022-Dec-08, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2022.09.016
PMID:36320412
|
研究论文 | 本文研究了通过结合PD-L1和TIM3阻断剂来改善人类CD8+抗原特异性T细胞的扩增，以用于过继免疫治疗 | 本文首次提出结合PD-L1和TIM3阻断剂来改善抗原特异性T细胞的扩增，而不引起T细胞功能障碍 | 研究主要集中在EBV和WT1抗原特异性CD8 T细胞上，可能不适用于所有类型的抗原特异性T细胞 | 旨在改善抗原特异性T细胞的扩增，以提高过继免疫治疗的效果 | 人类CD8+抗原特异性T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(RNA-seq)和T细胞受体(TCR)谱分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 19794 | 2024-08-08 |
In vivo single-cell transcriptomics reveal Klebsiella pneumoniae skews lung macrophages to promote infection
2022-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202216888
PMID:36337046
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研究论文 | 本文揭示了耐药性细菌克雷伯氏肺炎菌如何通过改变肺泡巨噬细胞的极化状态来促进感染的机制 | 首次发现克雷伯氏肺炎菌通过诱导肺泡巨噬细胞向M(Kp)型极化，利用TLR-I型IFN-IL10-STAT6轴重塑巨噬细胞，这是一种新的克服宿主限制的策略 | NA | 阐明耐药性细菌克雷伯氏肺炎菌与宿主防御之间的相互作用机制 | 肺泡巨噬细胞的极化状态及克雷伯氏肺炎菌对其的影响 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞的单细胞转录组数据 |
| 19795 | 2024-08-08 |
Targeting of Scavenger Receptors Stabilin-1 and Stabilin-2 Ameliorates Atherosclerosis by a Plasma Proteome Switch Mediating Monocyte/Macrophage Suppression
2022-12-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了通过靶向清道夫受体Stabilin-1和Stabilin-2来减轻动脉粥样硬化的机制，主要通过改变血浆蛋白质组来抑制单核细胞/巨噬细胞的活性 | 首次全面研究了靶向Stabilin-1和Stabilin-2对动脉粥样硬化的影响，并发现了一种新的治疗动脉粥样硬化的方法 | NA | 研究靶向Stabilin-1和Stabilin-2对动脉粥样硬化的影响 | Stabilin-1和Stabilin-2在动脉粥样硬化中的作用 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 血浆蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质，RNA | ApoE-KO小鼠，Stab1-KO小鼠，Stab2-KO小鼠，Ldlr-KO小鼠 |
| 19796 | 2024-08-08 |
Biologic insights from single-cell studies of psoriasis and psoriatic arthritis
2022-12, Expert opinion on biological therapy
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/14712598.2022.2142465
PMID:36317702
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研究论文 | 本文讨论了单细胞技术在银屑病和银屑病关节炎研究中的应用，特别是单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性和相互作用 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了多种细胞类型在银屑病发病机制中的辅助作用，并展示了机器学习模型在早期诊断中的潜力 | 文章提到了单细胞研究的局限性和未来挑战，但未具体说明 | 探讨单细胞技术在银屑病和银屑病关节炎病理机制中的应用 | 研究对象包括T细胞、髓样细胞、角质形成细胞、先天淋巴细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA | 22项单细胞研究 |
| 19797 | 2024-08-08 |
SREBP2/Rab11s/GLUT1/6 network regulates proliferation and migration of glioblastoma
2022-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2022.154176
PMID:36327817
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研究论文 | 研究探讨了SREBP2/Rab11s/GLUT1/6网络在胶质母细胞瘤增殖和迁移中的调控作用 | 首次揭示了SREBP2/Rab11/GLUT网络在胶质母细胞瘤细胞生长中的作用，并识别了潜在的治疗靶点 | NA | 研究SREBP2/Rab11s/GLUT1/6网络在胶质母细胞瘤进展中的调控作用 | 胶质母细胞瘤组织和T98G细胞系 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 蛋白质印迹（western blotting）, 反转录定量PCR | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤组织和T98G细胞系 |
| 19798 | 2024-08-08 |
An artificial LAMA2-GelMA hydrogel microenvironment for the development of pancreatic endocrine progenitors
2022-12, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 研究开发了一种基于LAMA2-GelMA的混合水凝胶，作为内分泌谱系形成和成熟的仿生载体，用于改善人胚胎干细胞衍生的β细胞的分化效率和功能。 | 本研究首次开发了LAMA2-GelMA混合水凝胶，通过调节转录因子的表达和整合素-AKT信号传导，显著提高了胰腺内分泌祖细胞的功能和成熟度。 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体试验来验证其临床应用的可行性。 | 旨在开发一种基于蛋白质组学和组织工程的胰腺特异性微环境，用于糖尿病的治疗。 | 研究对象包括胰腺内分泌祖细胞、人胚胎干细胞衍生的β细胞以及LAMA2-GelMA混合水凝胶。 | 组织工程 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 蛋白质 | 使用小鼠模型进行体内实验，具体样本数量未详细说明。 |
| 19799 | 2024-08-08 |
An improved Fuzzy based GWO algorithm for predicting the potential host receptor of COVID-19 infection
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106050
PMID:36334362
|
研究论文 | 本文通过改进的模糊聚类技术结合灰狼优化算法（GWO），预测COVID-19感染的潜在宿主受体 | 提出了一种结合进化算法变异和交叉操作的改进GWO算法，增强了灰狼种群的遗传多样性，并通过消除弱个体提高了算法的探索和开发能力 | NA | 旨在识别与ACE2和TMPRSS2转录和生物学上相似的新型病毒受体或膜蛋白，以帮助理解COVID-19感染在人类中的趋向性、传播和发病机制 | COVID-19病毒的潜在宿主受体 | 生物信息学 | COVID-19 | 灰狼优化算法（GWO） | 模糊聚类 | 蛋白质表达谱 | 58种新型病毒受体和816种膜蛋白 |
| 19800 | 2024-08-08 |
scBPGRN: Integrating single-cell multi-omics data to construct gene regulatory networks based on BP neural network
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106249
PMID:36335815
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研究论文 | 提出了一种基于BP神经网络的算法scBPGRN，用于整合单细胞RNA测序数据和DNA甲基化数据构建基因调控网络 | 使用双权极端相关系数衡量因子间的相关性，并利用神经网络计算广义权重来构建基因调控网络 | NA | 通过整合单细胞多组学数据构建包含更多组学信息的基因调控网络，以深入理解癌症的发病机制 | 肝细胞癌（HCC）数据 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化 | BP神经网络 | 基因调控网络 | 涉及两个亚群的单细胞数据 |