单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 1961 - 1980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2026-02-25 |
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation: Microglial diversity and response in assembloids
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657874
PMID:40501840
|
研究论文 | 本研究通过构建包含人类小胶质细胞的区域特异性脑类器官和组装体，揭示了小胶质细胞在人类大脑不同区域的多样性及其对神经元过度兴奋的响应机制 | 首次在人类脑类器官和组装体中整合小胶质细胞，系统揭示了其区域特异性亚型多样性，并建立了研究神经免疫相互作用的先进平台 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本规模相对有限 | 探究人类大脑不同区域小胶质细胞的特性及其在神经回路发育和功能中的作用 | 人类小胶质细胞、区域特异性脑类器官（皮质、纹状体、中脑）以及中脑-纹状体组装体 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、钙成像、化学遗传学 | 脑类器官模型、组装体模型 | 单细胞转录组数据、钙信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1962 | 2026-02-25 |
sciLaMA: A Single-Cell Representation Learning Framework to Leverage Prior Knowledge from Large Language Models
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.28.635153
PMID:40501921
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研究论文 | 提出了一种名为sciLaMA的新型单细胞表示学习框架，通过整合多模态大语言模型的静态基因嵌入与单细胞RNA测序数据，以提升下游任务性能 | 首创性地将多模态大语言模型的基因嵌入与单细胞RNA测序数据通过配对变分自编码器架构相结合，生成上下文感知的细胞和基因表示 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据分析中整合外部生物知识、计算效率和可解释性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器，大语言模型 | 基因表达表格数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1963 | 2026-02-25 |
Peptide Driven Identification of TCRs (PDI-TCR) reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2025-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652535
PMID:40654739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PDI-TCR的新方法，用于从人类血液中识别抗原特异性T细胞受体，并应用于结核病研究 | 开发了PDI-TCR方法，通过比较非重叠肽池的响应，能够区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | NA | 识别和监测抗原特异性T细胞，以研究结核病中CD4 T细胞的动态和表型 | 结核病患者、结核分枝杆菌致敏的健康个体（IGRA+）的血液样本 | 免疫学 | 结核病 | 肽池扩增、批量TCR测序、单细胞RNA测序 | NA | 序列数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1964 | 2026-02-25 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 本文开发了一种名为SwarmMAP的去中心化方法，利用群体学习技术，在不共享原始数据的情况下，基于单细胞测序数据训练机器学习模型以进行细胞类型注释 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释，实现了在保护患者隐私前提下的去中心化模型训练与标准化注释 | 未明确说明模型在不同组织或物种间的泛化能力，也未详细讨论计算资源需求或对罕见细胞类型的识别性能 | 开发一种隐私保护、可扩展且标准化的自动化细胞类型注释方法，以解决单细胞数据分析中的可重复性与规模化挑战 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1965 | 2026-02-25 |
A novel biomarker of COVID-19: MMP8 emerged by integrated bulk RNAseq and single-cell sequencing
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82227-8
PMID:39730651
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞测序数据，发现MMP8是COVID-19的一个新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞测序和药理学数据库，鉴定出MMP8作为COVID-19的关键生物标志物，并揭示其在髓系细胞中的异质性表达及细胞间相互作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本量未明确说明；未涉及机制的功能性验证 | 阐明COVID-19的病理进展和分子改变，寻找诊断和治疗靶点 | 健康供体、非重症和重症COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1966 | 2026-02-25 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微孔微针与CAR-TREM2-巨噬细胞的策略，通过调节纤维化微环境来管理疤痕 | 首次将靶向DPP4成纤维细胞并调节内皮细胞亚型的CAR-TREM2-巨噬细胞与微孔微针递送系统相结合，用于多因子调控疤痕微环境 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析，缺乏大规模动物模型或临床验证 | 开发一种通过调控疤痕微环境来有效预防和治疗皮肤创伤后疤痕形成的新策略 | 皮肤疤痕微环境中的DPP4阳性成纤维细胞、异质性血管内皮细胞和TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1967 | 2026-02-25 |
A Single-Cell RNA Sequencing Guided Multienzymatic Hydrogel Design for Self-Regenerative Repair in Diabetic Mandibular Defects
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410962
PMID:39436107
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术指导设计了一种多酶水凝胶支架，用于促进糖尿病下颌骨缺损的自再生修复 | 首次结合单细胞RNA测序分析揭示糖尿病环境下NO和ROS阻碍巨噬细胞重极化的关键机制，并据此设计具有双功能（NO清除和ROS清除）的多酶水凝胶支架 | 研究主要针对糖尿病下颌骨缺损模型，尚未验证在其他骨缺损类型或更广泛糖尿病并发症中的适用性 | 开发能够恢复糖尿病环境下生理性骨重塑功能的骨组织工程材料 | 糖尿病下颌骨缺损模型中的巨噬细胞、骨髓间充质干细胞和内皮细胞 | 组织工程与再生医学 | 糖尿病骨缺损 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1968 | 2026-02-25 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料，通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸，通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型，从而改变纤维-脂肪祖细胞亚群平衡 | 研究主要针对口面部肌肉纤维化，在其他类型肌肉或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪祖细胞 | 生物医学工程 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1969 | 2026-02-25 |
Role of Neutrophils in the Development of Steatotic Liver Disease
2024-08, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0044-1789207
PMID:39117322
|
综述 | 本文综述了中性粒细胞的生物学特性、其在脂肪变性肝病发展中的作用以及其作为疾病治疗靶点的潜力 | 强调了中性粒细胞在无菌性炎症（脂肪变性肝病发病机制的关键组成部分）中的作用，并指出单细胞RNA测序等技术已揭示中性粒细胞亚群的存在，但不同亚群在疾病发展中的具体差异贡献尚不清楚 | 不同中性粒细胞亚群在脂肪变性肝病发展中的具体差异贡献仍不明确 | 探讨中性粒细胞在脂肪变性肝病发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 中性粒细胞及其在脂肪变性肝病中的功能 | NA | 脂肪变性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1970 | 2026-02-25 |
Emerging Roles of Spatial Transcriptomics in Liver Research
2024-05, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/a-2299-7880
PMID:38574750
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在肝脏研究中的新兴作用，包括其在揭示肝细胞分区功能、肝脏疾病发病机制及肝癌异质性方面的应用 | 空间转录组学作为一种突破性技术，能够以高精度映射组织复杂结构中的基因表达，特别是在肝脏研究中揭示了肝细胞的分区功能、脂质相关巨噬细胞在脂肪变性中的作用以及肿瘤微环境与免疫系统的相互作用 | NA | 探讨空间转录组学在肝脏研究中的应用，以增强对肝脏疾病的理解和治疗 | 健康与疾病状态下的肝脏组织，包括肝细胞、巨噬细胞、内皮细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1971 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-03-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1972 | 2026-02-25 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation
2022-Dec-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000032558
PMID:36595859
|
研究论文 | 本研究基于铁死亡相关长链非编码RNA构建了一个膀胱癌预后风险预测模型，并通过单细胞转录组测序进行验证 | 首次从铁死亡相关lncRNAs的角度构建膀胱癌预后模型，并结合单细胞测序验证其在肿瘤微环境中的特异性表达 | 样本量较小（仅4例单细胞测序样本），且依赖于公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 构建膀胱癌预后风险模型以指导临床预后评估并识别潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者样本（包括TCGA数据库中的批量RNA-seq数据和4例患者单细胞测序数据） | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的膀胱癌样本（具体数量未明确）和4例患者单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1973 | 2026-02-25 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
|
研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组数据，阐明了小鼠器官发生过程 | 应用基于图像的单细胞转录组学方法seqFISH，结合空间背景和多路转录测量，揭示了scRNA-seq数据中未显现的细胞分化轴 | 仅检测了387个目标基因的mRNA，可能未覆盖全部相关基因表达 | 研究复杂组织和发育中的细胞命运决定 | 小鼠胚胎组织切片（8-12体节阶段） | 数字病理学 | NA | seqFISH, scRNA-seq | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1974 | 2026-02-24 |
Integrative single-cell analysis reveals transcriptional and epigenetic regulatory features of human developmental dysplasia of the hip
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.02.788
PMID:40154730
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，揭示了人类发育性髋关节发育不良（DDH）的转录和表观遗传调控特征 | 首次在DDH软骨中识别出七种分子上不同的软骨细胞群体，包括一种具有独特分子特征的新型炎症性软骨细胞群体，并重建了软骨细胞的分化轨迹 | 未明确提及样本量限制或技术验证的局限性，可能受限于单细胞测序技术的分辨率和样本来源 | 理解DDH发展中的特定软骨细胞组成，识别有效的DDH预测生物标志物，并阐明驱动DDH进展的基因调控元件 | 人类发育性髋关节发育不良（DDH）的软骨组织 | 数字病理学 | 发育性髋关节发育不良 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学检测 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1975 | 2026-02-24 |
Resolving microenvironment complexity and cellular heterogeneity in osteoarthritis via spatial transcriptomics
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.07.007
PMID:40669534
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在解析骨关节炎微环境复杂性和细胞异质性方面的应用与进展 | 系统性地将新兴的空间转录组学技术应用于骨关节炎研究，强调其在解析组织空间结构与基因表达关系方面的独特优势，并提出了多组学整合的未来方向 | 讨论了当前空间转录组学技术存在的技术限制，如分辨率、通量和多组学整合的挑战 | 探索如何利用空间转录组学技术解析骨关节炎的病理机制、细胞间相互作用及疾病进展的驱动因素 | 骨关节炎的关键关节组织分区，包括软骨、滑膜、软骨下骨和关节周围组织 | 空间转录组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1976 | 2026-02-24 |
Standardizing single-cell approaches to osteoarthritis: Toward a comprehensive cellular atlas
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.016
PMID:40914548
|
评论 | 本文概述了推进骨关节炎单细胞研究的下一步方向，强调标准化细胞类型注释和全面整合历史与新生成数据集的重要性 | 提出标准化单细胞方法以构建骨关节炎全面细胞图谱，强调整合多源数据集的必要性 | NA | 推进骨关节炎单细胞研究，构建全面细胞图谱 | 骨关节炎关节的细胞组成 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1977 | 2026-02-24 |
High-Resolution Spatial Transcriptomics Unveils Spatially Resolved Gene Modules and Fatty Acid Metabolism Dysregulation in Human Skin Aging
2026-Mar, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.011
PMID:40850650
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了人类眼睑皮肤衰老过程中基因模块的空间分布及脂肪酸代谢失调的分子机制 | 首次结合高分辨率空间转录组学与多重FISH技术，在人类皮肤衰老研究中识别出18个空间相关基因模块，并发现脂肪酸合成酶活性降低是驱动表皮衰老的关键因素 | 研究主要聚焦于眼睑皮肤样本，可能无法完全代表其他身体部位的皮肤衰老过程 | 解析人类皮肤衰老的分子机制与空间细胞组织变化 | 人类眼睑皮肤组织、原代人角质形成细胞、重建全层皮肤模型（T-Skin） | 空间转录组学 | 皮肤衰老 | 空间增强分辨率组学测序技术、多重FISH | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1978 | 2026-02-24 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2026-Mar, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
|
研究论文 | 本研究利用空间和单细胞转录组学技术，揭示了角质形成细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次结合空间和单细胞转录组学分析外阴硬化性苔藓，识别了角质形成细胞的双重角色及跨细胞类型的统一分子变化 | 未明确说明样本量或具体技术平台细节，可能限制结果的普适性 | 探究外阴硬化性苔藓的分子发病机制，以寻找潜在生物标志物和治疗靶点 | 外阴皮肤组织，包括病变、非病变和健康样本 | 数字病理学 | 外阴硬化性苔藓 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1979 | 2026-02-24 |
Transcriptomic profiling confirms microRNA-140 is more functional in joint development than in disease
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.11.005
PMID:41242538
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探讨了microRNA-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用 | 利用空间转录组学首次揭示了miR-140-5p在静止软骨细胞和软骨膜中的最显著功能作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 研究miR-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用，并识别新的miR-140-5p靶点 | 小鼠模型（包括Mir140-null小鼠和DMM手术诱导的骨关节炎模型） | 转录组学 | 骨关节炎 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | 7日龄小鼠的肋骨软骨细胞和后肢生长板 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1980 | 2026-02-24 |
Optic Atrophy 1-Mediated Mitochondrial Hyperfusion Orchestrates Yes-Associated Protein 1 Nuclear Translocation to Sustain Ameloblastoma Stemness
2026-Mar, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.12.002
PMID:41478350
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研究论文 | 本研究揭示了视神经萎缩蛋白1介导的线粒体过度融合通过调控YAP1核转位来维持成釉细胞瘤干细胞特性的新机制 | 首次发现OPA1介导的线粒体过度融合是成釉细胞瘤干细胞特性和进展的驱动因素，并揭示了其通过抑制Hippo信号通路促进YAP1核转位的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者来源类器官，缺乏体内动物模型的验证 | 探究成釉细胞瘤干细胞特性维持的分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 成釉细胞瘤组织样本、hTERT-AM细胞系、患者来源类器官 | 单细胞转录组学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 原发AM标本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |