单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 19761 - 19780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19761 | 2024-08-08 |
Genome-wide Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify the causal effects of COVID-19 on 41 cytokines
2022-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac033
PMID:36281737
|
研究论文 | 本研究通过整合COVID-19和41种细胞因子的全基因组关联研究数据，采用孟德尔随机化分析方法，确定了COVID-19对某些细胞因子的因果效应，并利用单细胞RNA测序数据探讨了潜在的分子机制 | 本研究首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了COVID-19对特定细胞因子的因果效应及其分子机制 | 研究仅分析了41种细胞因子，可能未涵盖所有与COVID-19相关的细胞因子 | 探讨COVID-19对细胞因子的因果效应及其分子机制 | COVID-19患者中的41种细胞因子及其分子机制 | 基因组学 | COVID-19 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA数据 | 涉及COVID-19患者和41种细胞因子的样本 |
| 19762 | 2024-08-08 |
Histone Lactylation Boosts Reparative Gene Activation Post-Myocardial Infarction
2022-11-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.320488
PMID:36268709
|
研究论文 | 本研究探讨了心肌梗死后组蛋白乳酸化在修复基因表达中的作用 | 首次揭示了组蛋白乳酸化在心肌梗死后早期和远程激活修复基因表达中的作用 | NA | 研究组蛋白乳酸化在心肌梗死后修复反应中的作用 | 心肌梗死后的单核细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、Western blotting、免疫荧光染色、CUT&Tag、RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR、逆转录-qPCR | NA | 转录组数据 | NA |
| 19763 | 2024-08-08 |
Deciphering the roadmap of in vivo reprogramming toward pluripotency
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.009
PMID:36270281
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺细胞在重编程过程中的标记物，揭示了从腺泡细胞到多能性的轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了胰腺细胞重编程过程中的中间状态标记物，并发现这些标记物在胃、结肠和培养的成纤维细胞中也存在 | NA | 揭示体内重编程向多能性转变的路径 | 胰腺细胞重编程过程中的细胞状态和标记物 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 19764 | 2024-08-08 |
Profiling transcriptional heterogeneity of epithelium, fibroblasts, and immune cells in esophageal squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200898R
PMID:36260317
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞的转录异质性 | 揭示了肿瘤内和肿瘤间上皮细胞的异质性，以及成纤维细胞亚型在食管鳞状细胞癌进展中的重要作用 | NA | 深入理解食管鳞状细胞癌的复杂肿瘤微环境和细胞异质性 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25,796个免疫细胞和8,197个非免疫细胞来自三个原发性肿瘤和配对正常样本 |
| 19765 | 2024-08-08 |
Shared and distinct biological circuits in effector, memory and exhausted CD8+ T cells revealed by temporal single-cell transcriptomics and epigenetics
2022-11, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01338-4
PMID:36271148
|
研究论文 | 本文通过时间序列单细胞转录组学和表观遗传学分析，揭示了效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞中的共享和独特生物电路 | 发现了新的T细胞亚群，包括表达自然杀伤细胞相关基因的亚群和多个独特的TCF-1干细胞/祖细胞样亚群，并揭示了PD-1通路阻断后T细胞亚群的重塑 | NA | 阐明CD8+ T细胞发育路径中的分子电路及其异质性 | 效应性、记忆性和耗竭性CD8+ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 19766 | 2024-08-08 |
Geometric engineering of organoid culture for enhanced organogenesis in a dish
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01643-8
PMID:36280722
|
research paper | 本文介绍了一种简便且可扩展的工程方法，用于促进长期器官发生和器官成熟。 | 重新设计了传统的器官培养配置，开发了一个平台，可以将单次注射的干细胞悬液转化为可以长期维持的放射状器官阵列，无需传代。 | NA | 开发一种平台技术，用于在体外工程化更真实的类器官结构。 | 肠道器官、炎症性肠病（IBD）患者来源的器官模型、血管化可灌注的人体肠样。 | digital pathology | inflammatory bowel disease | single-cell RNA sequencing | NA | organoid | NA |
| 19767 | 2024-08-08 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为clampFISH 2.0的方法，该方法通过倒置的padlock设计，能够高效检测多种RNA种类并同时指数级放大其信号，同时减少了时间成本 | clampFISH 2.0方法通过倒置的padlock设计，实现了对多种RNA种类的高效检测和信号指数级放大，同时减少了时间和成本 | NA | 开发一种能够快速、可扩展地检测RNA并放大信号的新方法 | 多种RNA种类及其在单细胞中的表达水平 | NA | NA | clampFISH 2.0 | NA | RNA | 超过100万细胞 |
| 19768 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in planaria: new tools allow new insights into cellular and evolutionary features
2022-10-31, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210825
PMID:36281987
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在淡水涡虫中的应用，以及这些新技术如何帮助我们深入理解细胞和进化特征 | 介绍了单细胞转录组学在淡水涡虫中的最新进展和应用，包括板式方法、纳米滴方法和原位条形码方法 | NA | 回顾单细胞转录组学在淡水涡虫中的应用，并展望未来的研究方向 | 淡水涡虫的细胞类型及其分化轨迹 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19769 | 2024-08-08 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
|
研究论文 | 本研究使用特定抗原的双尺寸微粒（dMP）治疗系统，成功逆转了小鼠晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的后肢瘫痪 | 该治疗方法通过影响树突状细胞、巨噬细胞、B细胞和微胶质细胞中的MHC II抗原呈递途径，减少了中枢神经系统（CNS）的免疫细胞浸润、脱髓鞘和炎症细胞因子水平 | 当B细胞缺失时，治疗效果减弱，表明B细胞在此疗法中的重要作用 | 探索特定抗原疗法在治疗多发性硬化症等自身免疫性疾病中的应用 | 小鼠晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE） | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 19770 | 2024-08-08 |
An asparagine metabolism-based classification reveals the metabolic and immune heterogeneity of hepatocellular carcinoma
2022-10-25, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01380-z
PMID:36284275
|
研究论文 | 本研究基于天冬酰胺代谢水平对肝细胞癌（HCC）患者进行分类，并探讨其代谢和免疫异质性 | 首次详细探讨了天冬酰胺代谢在HCC中的状态及其相关机制，并发现GOT2作为潜在的预后标志物和治疗靶点 | NA | 探讨肝细胞癌中天冬酰胺代谢的状态及其相关机制，并寻找潜在的预后标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌患者及其天冬酰胺代谢水平 | 数字病理学 | 肝癌 | 共识聚类、最小绝对收缩与选择算子回归、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、基因集富集分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | UMAP | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 来自三个队列的HCC样本 |
| 19771 | 2024-08-08 |
Combining denoising of RNA-seq data and flux balance analysis for cluster analysis of single cells
2022-Oct-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04967-6
PMID:36284276
|
研究论文 | 本文研究了去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并将其应用于代谢网络分析和单细胞聚类分析 | 首次探讨了去噪策略在整合单细胞RNA测序数据到代谢网络分析中的应用，并展示了去噪对恢复重要代谢特性的效果 | NA | 研究去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并探讨其对代谢表型聚类分析的影响 | 单细胞RNA测序数据的去噪处理及其在代谢网络分析中的应用 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个公共单细胞RNA测序数据集 |
| 19772 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic inventory of murine smooth muscle cells
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.015
PMID:36283392
|
研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序结合原位基因和蛋白表达分析，研究了小鼠心脏、主动脉、肺和结肠中平滑肌细胞的分子基础 | 首次揭示了血管、内脏和气道平滑肌细胞之间的高水平差异，以及弹性动脉和肌性动脉平滑肌细胞之间的细微差异 | NA | 探索平滑肌细胞在不同器官系统中的分子差异 | 小鼠的平滑肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及心脏、主动脉、肺和结肠四个器官 |
| 19773 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights origin and pathological process of human endometrioid endometrial carcinoma
2022-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33982-7
PMID:36273006
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞，揭示了子宫内膜癌的起源和病理过程 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了子宫内膜样子宫内膜癌起源于子宫内膜上皮细胞而非基质细胞，并识别了LCN2+/SAA1/2+细胞作为子宫内膜癌变的一个特征性亚群 | NA | 阐明子宫内膜样子宫内膜癌发展过程中细胞群体的演变 | 正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19774 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing deconvolutes cellular responses to exercise in human skeletal muscle
2022-10-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04088-z
PMID:36273106
|
研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了人类骨骼肌在剧烈运动前后细胞组成和细胞类型特异性过程的变化 | 首次通过单细胞测序揭示了运动对骨骼肌细胞类型特异性适应机制的影响 | NA | 探究运动对人类骨骼肌细胞类型特异性适应机制的影响 | 人类骨骼肌细胞在运动前后的变化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 15个细胞集群，来自6种不同的细胞群体 |
| 19775 | 2024-08-08 |
Gossypetin ameliorates 5xFAD spatial learning and memory through enhanced phagocytosis against Aβ
2022-10-21, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-022-01096-3
PMID:36271414
|
研究论文 | 研究探讨了gossypetin通过增强小胶质细胞对Aβ的吞噬作用，改善5xFAD小鼠的空间学习和记忆能力 | gossypetin能够增强小胶质细胞对Aβ的吞噬活性，减少其胶质化，并增加MHC II+小胶质细胞群体 | NA | 探索gossypetin作为治疗阿尔茨海默病（AD）的新型潜在治疗候选药物 | 5xFAD AD模型小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 实验涉及5xFAD AD模型小鼠，进行了13周的gossypetin治疗 |
| 19776 | 2024-08-08 |
scRNA-sequencing reveals subtype-specific transcriptomic perturbations in DRG neurons of PirtEGFPf mice in neuropathic pain condition
2022-10-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76063
PMID:36264609
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在神经病理性疼痛条件下，PirtEGFPf小鼠背根神经节（DRG）神经元的亚型特异性转录组扰动 | 首次揭示了神经病理性疼痛条件下DRG神经元的亚型特异性转录组变化，并发现了性别差异在转录组水平上的表现 | 研究仅限于特定的小鼠模型和特定的神经损伤模型，可能限制了结果的普遍性 | 探究神经病理性疼痛条件下DRG神经元的转录组变化，以期发现新的治疗靶点和优化神经病理性疼痛治疗 | PirtEGFPf小鼠的背根神经节（DRG）神经元 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及多个DRG神经元亚型和性别的小鼠样本 |
| 19777 | 2024-08-08 |
Blood monocyte-derived CD169+ macrophages contribute to antitumor immunity against glioblastoma
2022-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34001-5
PMID:36266311
|
研究论文 | 本文研究了血液单核细胞来源的CD169+巨噬细胞在对抗胶质母细胞瘤（GBM）中的抗肿瘤免疫作用 | 本文首次鉴定了一种促进抗肿瘤微环境的CD169巨噬细胞亚群，并揭示了其通过产生促炎性趋化因子吸引T细胞和NK细胞的机制 | NA | 研究肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在胶质母细胞瘤免疫治疗中的作用 | CD169+巨噬细胞及其在胶质母细胞瘤中的作用 | NA | 脑瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 人类和小鼠的胶质瘤样本 |
| 19778 | 2024-08-08 |
High-resolution single-cell analysis paves the cellular path for brain regeneration in salamanders
2022-Oct-19, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00144-5
PMID:36258096
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了蝾螈端脑细胞的分化路径，为理解脊椎动物大脑的进化、发育和再生提供了新见解 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描述了蝾螈大脑再生的细胞分化路径 | NA | 探索蝾螈大脑再生的分子和细胞机制，以及脊椎动物大脑结构的进化 | 蝾螈端脑细胞的分化路径 | 数字病理学 | NA | 高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 19779 | 2024-08-08 |
Insights into skeletal stem cells
2022-Oct-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00235-8
PMID:36261411
|
综述 | 本文回顾了骨骼干细胞（SSCs）的鉴定和功能研究，讨论了鉴定真正SSCs的原则和方法，并强调了绘制SSCs谱系图谱的开创性发现。 | 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术，识别了多种类型的SSCs，并绘制了谱系承诺轨迹，部分揭示了其在生理和病理条件下的特性。 | 文章主要集中在争议和SSC研究中的挑战，未详细说明具体的局限性。 | 回顾和讨论骨骼干细胞的鉴定、功能及其在骨骼系统中的作用。 | 骨骼干细胞及其在长骨、颅面组织和骨膜中的作用。 | NA | NA | 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 19780 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome profiling of normal human liver
2022-10-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01676-w
PMID:36261431
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术对正常人肝脏组织切片进行了详细研究，提供了肝脏分区在转录水平上的详细信息 | 本文首次提供了来自两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot，并对肝细胞进行了四个亚组的分类 | NA | 研究人类肝脏的空间细胞解剖结构，以解决肝脏疾病的细胞起源问题 | 正常人肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot |