单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 19741 - 19760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19741 | 2024-08-08 |
Functional genomics analysis identifies loss of HNF1B function as a cause of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2023-03-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddac262
PMID:36282544
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研究论文 | 本研究通过功能基因组学分析，确定了HNF1B功能的丧失是Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的一个原因 | 首次建立了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征II型的小鼠模型，并揭示了HNF1B功能丧失导致的分子机制 | NA | 探讨Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的遗传基础及其分子机制 | Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征患者及小鼠模型 | 遗传学 | 生殖系统疾病 | 微阵列分析，单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据，RNA序列数据 | 13名Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征患者及Hnf1b敲除小鼠胚胎的子宫组织 |
| 19742 | 2024-08-05 |
The transcription factor JUN is a major regulator of quiescent pancreatic stellate cell maintenance
2023-Jan-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147000
PMID:36283605
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研究论文 | 该研究识别了转录因子JUN在维持胰腺星状细胞静止状态中的关键作用 | 通过整合单细胞测序数据并使用WGCNA和SCENIC算法，首次揭示了JUN作为主要转录因子的作用 | 本研究未详细探讨JUN的其他潜在调控机制 | 探讨胰腺星状细胞从静止状态转化为激活状态的主要机制 | 胰腺星状细胞及其在胰腺损伤相关疾病中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | RNA测序 | 多个胰腺组织的单细胞样本 |
| 19743 | 2024-08-08 |
OrganoidDB: a comprehensive organoid database for the multi-perspective exploration of bulk and single-cell transcriptomic profiles of organoids
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac942
PMID:36271792
|
research paper | 介绍了一个名为OrganoidDB的综合性数据库，用于多角度探索组织体的批量和单细胞转录组数据 | OrganoidDB整合了来自人和鼠的16,218个组织体样本的批量和单细胞转录组数据，并允许在不同模式下查询基因表达 | NA | 促进对组织体的更好理解，并帮助改进组织体培养协议 | 组织体的转录组数据 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 16,218个组织体样本 |
| 19744 | 2024-08-08 |
VISTA Targeting of T-cell Quiescence and Myeloid Suppression Overcomes Adaptive Resistance
2023-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0116
PMID:36260656
|
研究论文 | 本研究探讨了VISTA在肿瘤治疗中的作用，特别是在克服适应性免疫检查点抵抗中的应用 | 首次报道了检查点调节剂影响CD8+ T细胞静止状态，并首次表明静止状态可能是T细胞衰竭和癌症治疗中的一个目标 | NA | 研究VISTA在开发抗肿瘤免疫中的作用，并提供重要的机制见解 | VISTA在肿瘤治疗中的作用及其对T细胞和骨髓细胞的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重图像分析、流式细胞术 | NA | 图像、RNA | CT26结直肠癌细胞模型 |
| 19745 | 2024-08-05 |
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2815-7_12
PMID:36264495
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研究论文 | 文章概述了单细胞RNA测序数据的标准计算工作流程 | 提供了对单细胞RNA测序数据分析标准工作流程的全面理解 | 未具体提及数据集的规模和具体实例 | 探讨单细胞RNA测序数据的计算分析方法 | 单细胞RNA测序(SCNRA-seq)技术 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 19746 | 2024-08-05 |
Unravelling the landscape of skin cancer through single-cell transcriptomics
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101557
PMID:36257209
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综述 | 本论文综述了通过单细胞转录组学深入研究皮肤癌的最新进展 | 创新点在于强调了单细胞转录组学在皮肤癌研究中的应用，特别是在免疫细胞的贡献方面 | 该文献未提及具体的技术局限性或数据缺陷 | 研究旨在利用单细胞转录组学技术明确皮肤癌的细胞类型和状态 | 研究对象为皮肤癌相关的细胞类型及其在疾病演变中的角色 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 19747 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed cellular and molecular immune profiles in lung squamous cell carcinoma
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101568
PMID:36270103
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肺鳞状细胞癌（LUSC）微环境的细胞和分子免疫特征 | 发现了高表达的免疫抑制受体TIGIT在调节性T细胞和耗竭的CD8T细胞中的作用，以及肿瘤相关中性粒细胞（TAN）通过表达IL1RN发挥免疫抑制作用，同时观察到SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的增加与患者不良生存相关 | NA | 深入了解肺鳞状细胞癌的免疫景观，并为未来的药物发现提供重要资源 | 肺鳞状细胞癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及7种主要细胞类型 |
| 19748 | 2024-08-08 |
Hepatitis B Virus Utilizes a Retrograde Trafficking Route via the Trans-Golgi Network to Avoid Lysosomal Degradation
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.10.008
PMID:36270602
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了DOCK11在HBV生命周期中的作用及其对cccDNA水平的影响，揭示了HBV通过逆向运输途径避免溶酶体降解的机制。 | 发现DOCK11与HBV衣壳及逆向运输蛋白相互作用，开辟了从早期内体到高尔基体再到内质网的替代逆向运输途径，帮助HBV避免溶酶体降解。 | NA | 探讨DOCK11在HBV生命周期中的作用及其对cccDNA水平的影响，揭示HBV感染的机制。 | DOCK11在HBV生命周期中的作用及HBV的逆向运输途径。 | NA | 肝炎B | 单细胞转录组分析、超分辨率显微镜、邻位连接分析、时间流逝分析、液相色谱-串联质谱、免疫印迹、酶联免疫吸附试验 | NA | 转录组数据 | HBV阳性和HBV阴性的肝细胞癌细胞系 |
| 19749 | 2024-08-08 |
Cell Dissociation Techniques in Salamanders
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2659-7_25
PMID:36272089
|
研究论文 | 本文描述了在蝾螈中使用四种不同分离条件（酶解/非酶解）进行细胞解离的技术，并评估了这些方法对细胞表面表型和细胞多样性的影响 | 介绍了不同酶解方法对细胞解离效果的影响，并提供了优化协议的模板 | 文章中提到的酶解方法在某些情况下可能导致细胞表面标记物的丢失 | 研究细胞解离技术对细胞表型和细胞多样性的影响 | 蝾螈的脾脏和再生肢体 | NA | NA | 细胞解离技术 | NA | 细胞 | 使用蝾螈的脾脏和再生肢体进行实验 |
| 19750 | 2024-08-08 |
Tetramer-aided sorting and single-cell RNA sequencing facilitate transcriptional profiling of antigen-specific CD8+ T cells
2023-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2022.101559
PMID:36279715
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研究论文 | 本研究探讨了使用四聚体辅助流式细胞术分选抗原特异性CD8+ T细胞进行单细胞分析的可行性，并识别出一个与癌症免疫治疗反应预测相关的抗原特异性反应（ASR）基因特征 | 本研究首次识别出一个具有预测价值的抗原特异性反应（ASR）基因特征，该特征与肺癌患者接受抗PD-L1、抗VEGF和化疗联合治疗的无进展生存期显著相关 | 研究仅使用了HLA-A*02:01限制性的人巨细胞病毒（CMV）pp65肽特异性CD8+ T细胞作为模型，可能限制了结果的普遍性 | 验证使用四聚体辅助流式细胞术分选抗原特异性CD8+ T细胞进行单细胞分析的方法，并识别与癌症免疫治疗反应相关的基因特征 | 抗原特异性CD8+ T细胞的频率和基因表达谱 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及肺癌患者接受抗PD-L1、抗VEGF和化疗联合治疗的样本 |
| 19751 | 2024-08-08 |
Applications of Transcriptomics in the Research of Antibody-Mediated Rejection in Kidney Transplantation: Progress and Perspectives
2022-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2022.2131357
PMID:36259540
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研究论文 | 本文探讨了转录组学方法在肾移植中抗体介导排斥反应研究中的应用及其进展和展望 | 引入单细胞RNA测序技术，提供高分辨率的免疫细胞转录组图谱，以揭示抗体介导排斥反应的发病机制 | 传统的批量转录组方法仅反映平均基因表达，忽略了单个细胞间的转录组异质性 | 改进抗体介导排斥反应的临床诊断标准，并探索新的治疗策略 | 肾移植中的抗体介导排斥反应 | 转录组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及移植肾活检样本 |
| 19752 | 2024-08-08 |
IL-13/IL-4 signaling contributes to fibrotic progression of the myeloproliferative neoplasms
2022-12-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017326
PMID:36283106
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研究论文 | 本文研究了IL-13/IL-4信号通路在骨髓增生性肿瘤纤维化进展中的作用 | 首次揭示了IL-13在骨髓纤维化中的作用，并提出抑制IL-13/IL-4信号通路可能是一种新的治疗策略 | NA | 探讨IL-13/IL-4信号通路在骨髓纤维化进展中的作用及潜在的治疗策略 | 骨髓纤维化小鼠模型及患者样本 | NA | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 骨髓纤维化小鼠及患者样本 |
| 19753 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing unveils the communications between malignant T and myeloid cells contributing to tumor growth and immunosuppression in cutaneous T-cell lymphoma
2022-12-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215972
PMID:36265653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞间的相互作用，这些作用促进了肿瘤生长和免疫抑制。 | 首次展示了皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞的相互作用及其对肿瘤微环境的影响，并提出了新的治疗策略。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞共培养实验，未来需要更多的临床试验来验证这些发现。 | 揭示皮肤T细胞淋巴瘤中恶性T细胞与髓系细胞的相互作用，并探索新的治疗策略。 | 皮肤T细胞淋巴瘤患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及皮肤T细胞淋巴瘤患者和健康对照者的样本 |
| 19754 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of ferroptosis and establish a risk signature in cholangiocarcinoma
2022-Dec-15, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2022.09.008
PMID:36284715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序技术，揭示了胆管癌中铁死亡的特征，并建立了一个风险标志物 | 首次通过scRNA-seq技术分析胆管癌中的免疫微环境和细胞异质性，并发现了与铁死亡相关的细胞间通信 | 研究依赖于公共数据库中的scRNA-seq数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索胆管癌中铁死亡的特征及其与免疫细胞的关系，并建立一个预测胆管癌预后的风险标志物 | 胆管癌中的铁死亡特征及免疫细胞的浸润情况 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 21个细胞集群 |
| 19755 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analyses reveal microglia types associated with proliferative retinopathy
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.160940
PMID:36264636
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其特征 | 首次全面绘制了正常和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠视网膜中所有微胶质细胞群体的图谱，并揭示了几种独特的与增生性视网膜病变相关的微胶质细胞类型及其相关标记物、信号通路和调控元件 | 研究仅限于小鼠模型，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于人类 | 探究与新生血管化相关的微胶质细胞的异质性，并描述其转录组特征和代谢途径 | 微胶质细胞及其在增生性视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 正常空气和氧诱导的增生性视网膜病变小鼠的视网膜样本 |
| 19756 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis dissected the osteo-immunology microenvironment and revealed key regulators in osteoporosis
2022-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109302
PMID:36257255
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松症中的骨免疫微环境，并揭示了关键的调控因子 | 发现了新的巨噬细胞亚型和差异表达基因，并识别了与骨代谢相关的新基因ZFP36L1和DEFA3，以及RETN-CAP1在骨免疫细胞相互作用中的新作用 | NA | 揭示骨质疏松症中骨免疫微环境的关键调控因子和可能的基因靶点及信号通路 | 骨质疏松症中的骨免疫微环境 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 19,102个细胞和4097个动态基因 |
| 19757 | 2024-08-08 |
The role of lung macrophages in acute respiratory distress syndrome
2022-Dec, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-022-01645-4
PMID:36264361
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综述 | 本文综述了肺泡巨噬细胞在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的作用，从解剖位置和细胞起源两个维度进行探讨 | 利用单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学等新技术，更深入地理解肺部巨噬细胞的发展过程、分类和功能 | 不同研究组对治疗反应的差异性和单核/巨噬细胞基因表达的巨大动态变化 | 探讨肺泡巨噬细胞在ARDS中的功能及治疗靶点 | 肺泡巨噬细胞及其在ARDS中的作用 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、命运图谱、代谢组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19758 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes from turtle livers reveal sensitivity of hepatic immune cells to bacteria-infection
2022-Dec, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2022.10.033
PMID:36273515
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了中国软壳龟肝脏的细胞组成，并探讨了细菌感染对肝脏免疫细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下全面展示了软壳龟肝脏的免疫景观，并揭示了细菌感染对肝脏免疫细胞数量的影响 | NA | 研究肝脏免疫细胞对细菌感染的响应 | 中国软壳龟的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9938个细胞，来自两个个体（未感染和细菌感染）的肝脏组织 |
| 19759 | 2024-08-08 |
Screening target genes for the treatment of PCOS via analysis of single-cell sequencing data
2022-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2022.2136401
PMID:36286390
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞测序数据，筛选出治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的目标基因 | 采用新的生物信息学方法，通过单细胞测序数据分析，筛选出可能的PCOS治疗目标基因 | NA | 识别与PCOS发病机制相关的目标基因，并开发有效的治疗药物 | 多囊卵巢综合征（PCOS）及其相关基因和治疗药物 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 34个卵母细胞 |
| 19760 | 2024-08-08 |
Consecutive BNT162b2 mRNA vaccination induces short-term epigenetic memory in innate immune cells
2022-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163347
PMID:36282593
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研究论文 | 本研究探讨了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传记忆效应 | 首次揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫细胞的表观遗传变化及其短暂性 | 研究仅关注了接种后4周内的表观遗传变化，未探讨更长时间的影响 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后先天免疫反应的表观遗传调控及其持久性 | 先天免疫细胞，特别是单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 质谱流式细胞术、RNA-Seq、ATAC-Seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |