单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
19701	2024-08-08	Sympathectomy Ameliorates CFA-Induced Mechanical Allodynia via Modulating Phenotype of Macrophages in Sensory Ganglion in Mice 2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S388322 PMID:36386581	研究论文	本研究探讨了交感神经系统在诱发性炎症疼痛中的作用，特别是其对三叉神经节巨噬细胞表型的影响	首次研究了交感神经系统对三叉神经节巨噬细胞的调节作用，并探讨了其在诱发性炎症疼痛中的机制	研究仅限于小鼠模型，且未探讨交感神经系统在人类疼痛中的作用	研究交感神经系统在口腔面部炎症疼痛中的作用及其对三叉神经节巨噬细胞的影响	交感神经系统、三叉神经节巨噬细胞、诱发性炎症疼痛	NA	NA	免疫组织化学、液相色谱、单细胞RNA测序	NA	细胞	雄性C57BL/6小鼠
19702	2024-08-08	Macrophage-Specific Cathepsin as a Marker Correlated with Prognosis and Tumor Microenvironmental Characteristics of Clear Cell Renal Cell Carcinoma 2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S375250 PMID:36386587	研究论文	本文研究了巨噬细胞特异性半胱氨酸蛋白酶Z（CTSZ）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的表达模式及其与预后和肿瘤微环境特征的关系	首次揭示了巨噬细胞特异性CTSZ在ccRCC中的表达与肿瘤微环境特征及患者预后的关联	NA	探讨CTSZ在ccRCC中的表达及其与预后和肿瘤微环境特征的关系	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的CTSZ表达	数字病理学	肾细胞癌	免疫组织化学、双标记免疫荧光、单细胞测序、多组学数据分析	NA	组织样本、单细胞测序数据	两个独立的抗PD-1治疗临床试验的数据
19703	2024-08-08	Influence of single-cell RNA sequencing data integration on the performance of differential gene expression analysis 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1009316 PMID:36386846	研究论文	本文评估了六种单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析性能的影响	本文选择了仅返回完整表达矩阵的数据整合方法，并评估了它们在两个具有相同生物学研究设计的单细胞数据集上的表现	大多数测试的方法在整合后改变了数据分布，这对使用参数方法进行分析产生了负面影响	研究单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析的影响	六种数据整合方法在两个单细胞RNA测序数据集上的表现	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两个单细胞RNA测序数据集
19704	2024-08-08	The Mechanisms of Systemic Inflammatory and Immunosuppressive Acute-on-Chronic Liver Failure and Application Prospect of Single-Cell Sequencing 2022, Journal of immunology research IF:3.5Q2 DOI:10.1155/2022/5091275 PMID:36387424	研究论文	本文探讨了急性-慢性肝衰竭（ACLF）的系统性炎症和免疫抑制机制，并介绍了单细胞测序技术在该领域的应用前景	文章介绍了单细胞RNA测序技术在研究ACLF中的潜在应用，以深入理解ACLF的单细胞基因表达	NA	研究ACLF的炎症和免疫抑制机制，并探索单细胞测序技术的应用	ACLF患者的系统性炎症和免疫抑制过程，以及单细胞测序技术	NA	肝病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
19705	2024-08-08	Integrated analysis of fibroblasts molecular features in papillary thyroid cancer combining single-cell and bulk RNA sequencing technology 2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2022.1019072 PMID:36387901	研究论文	本研究通过结合单细胞和批量RNA测序技术，对乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞分子特征进行了综合分析	首次在甲状腺癌中对成纤维细胞进行了详细的研究，并建立了一个纤维化评分模型用于预测甲状腺癌患者的预后	研究主要基于TCGA数据集和单一的临床队列，可能需要更多样本和不同来源的数据以验证结果的普遍性	探索乳头状甲状腺癌中成纤维细胞的分子特征及其在癌症微环境中的作用	乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞及其相关基因表达和预后价值	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序和批量RNA测序	NA	RNA测序数据	使用了TCGA数据集和临床组织样本进行验证
19706	2024-08-08	Single-cell RNA-seq reveals the communications between extracellular matrix-related components and Schwann cells contributing to the earlobe keloid formation 2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2022.1000324 PMID:36388926	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了耳垂瘢痕疙瘩形成过程中细胞外基质相关成分与施万细胞之间的相互作用	首次通过单细胞RNA测序构建了耳垂瘢痕疙瘩的细胞图谱，并发现了施万细胞与细胞外基质相关细胞群之间的强相互作用	研究主要集中在耳垂瘢痕疙瘩，其他部位瘢痕疙瘩的研究较少	探索耳垂瘢痕疙瘩形成的分子机制	耳垂瘢痕疙瘩样本及其邻近正常皮肤样本	数字病理学	皮肤纤维化疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	31,379个细胞
19707	2024-08-08	A scoping review on the significance of programmed death-ligand 1-inhibiting microRNAs in non-small cell lung treatment: A single-cell RNA sequencing-based study 2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2022.1027758 PMID:36388933	综述	本研究旨在系统回顾PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌抑制中的重要性及其潜在机制	通过单细胞RNA测序技术，探讨了PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌中的作用及其对免疫反应的影响	需要进一步的研究将这一方法转化为临床实践	系统回顾PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌抑制中的重要性及其潜在机制	PD-L1抑制性微RNAs在非小细胞肺癌中的作用	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及多种PD-L1抑制性微RNAs的表达
19708	2024-08-08	Single-cell atlas of murine adrenal glands reveals immune-adrenal crosstalk during systemic Candida albicans infection 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.966814 PMID:36389688	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了系统性白色念珠菌感染后小鼠肾上腺转录组的变化	首次报道了系统性白色念珠菌感染下肾上腺应激反应的详细变化，揭示了免疫细胞与肾上腺细胞之间的相互作用	NA	探讨系统性白色念珠菌感染下小鼠肾上腺微环境的改变及其对免疫-肾上腺细胞通讯的影响	小鼠肾上腺细胞及其在系统性白色念珠菌感染后的转录组变化	数字病理学	念珠菌病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	16021个细胞
19709	2024-08-08	Identification of a novel sepsis prognosis model and analysis of possible drug application prospects: Based on scRNA-seq and RNA-seq data 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.888891 PMID:36389695	研究论文	本研究通过分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转录组RNA-seq数据，识别出71个差异表达基因（DEGs），并构建了一个以CCL5、HBD、IFR2BP2、LTB和WFDC1为标志的预后模型，用于预测脓毒症的预后和指导临床药物使用	首次基于scRNA-seq和RNA-seq数据构建脓毒症预后模型，并通过多种分析方法验证了模型的稳定性和预测能力	NA	开发和验证一种新的脓毒症预后模型，并探索其在临床药物应用中的潜力	脓毒症的预后预测和药物应用	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组RNA-seq	LASSO回归分析，Cox回归分析	基因表达数据	71个差异表达基因
19710	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing reveals TCR+ macrophages in HPV-related head and neck squamous cell carcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1030222 PMID:36389736	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术构建了来自18名HPV阳性和8名HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的4,388个高质量巨噬细胞的单细胞图谱，揭示了HPV相关头颈鳞状细胞癌中TCR阳性巨噬细胞的存在	首次在HPV相关头颈鳞状细胞癌中发现具有TCR和CD3特异性标志的巨噬细胞亚群，这些巨噬细胞可能参与TCR信号通路和吞噬作用的调控	NA	探讨HPV感染对头颈鳞状细胞癌中巨噬细胞浸润率、功能和分化的影响，并揭示TCR阳性巨噬细胞在头颈鳞状细胞癌微环境中的作用	HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的巨噬细胞	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	4,388个高质量巨噬细胞来自18名HPV阳性和8名HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者
19711	2024-08-08	Single-cell mechanistic studies of radiation-mediated bystander effects 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.849341 PMID:36389749	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了辐射后不同时间点的肠道组织，揭示了辐射诱导的旁观者效应的细胞和分子机制	研究首次详细探讨了辐射特定免疫细胞在细胞间通信中的作用，特别是CD8+ T细胞在辐射后的持久性和其在铁死亡中的作用	研究主要集中在小鼠肠道组织，可能需要进一步在其他组织类型中验证结果	阐明放射治疗如何诱导旁观者效应	辐射后的肠道组织及其免疫细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	辐射后不同时间点的肠道组织及健康肠道组织
19712	2024-08-08	Construction of a B cell-related gene pairs signature for predicting prognosis and immunotherapeutic response in non-small cell lung cancer 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.989968 PMID:36389757	研究论文	本研究旨在探索B细胞标记基因的表达谱，并构建与非小细胞肺癌（NSCLC）患者预后和免疫治疗效率相关的B细胞相关基因对（BRGPs）签名	首次构建了B细胞相关基因对签名，用于预测非小细胞肺癌患者的预后和免疫治疗反应	NA	探索B细胞在抗肿瘤免疫和肿瘤发展中的作用，并构建相关的基因对签名	非小细胞肺癌患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	Lasso-Cox回归模型	基因表达数据	使用了TCGA和GEO数据库的数据
19713	2024-08-08	Identify the immune characteristics and immunotherapy value of CD93 in the pan-cancer based on the public data sets 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.907182 PMID:36389798	研究论文	本研究系统分析了CD93在33种癌症中的肿瘤免疫治疗特性，利用公共数据库和多种免疫荧光染色技术检测CD93水平及其在癌细胞和基质细胞中的共表达情况	首次全面探讨了CD93在多种癌症中的免疫特性及其在肿瘤免疫治疗中的潜在价值	研究主要依赖公共数据库和现有数据，未涉及体内实验验证	探讨CD93在泛癌中的免疫特性及其在免疫治疗中的应用价值	CD93在33种癌症中的表达及其与免疫治疗的关系	数字病理学	泛癌	免疫荧光染色、单细胞测序	NA	mRNA、蛋白质	涉及33种癌症的样本
19714	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing uncovers compound kushen injection synergistically improves the efficacy of chemotherapy by modulating the tumor environment of breast cancer 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.965342 PMID:36389835	研究论文	本研究探讨了复方苦参注射液（CKI）联合化疗对三阴性乳腺癌（TNBC）肿瘤微环境（TME）的调控作用	CKI联合化疗能显著增强化疗的抗癌活性，并通过激活抗肿瘤免疫反应提高治疗效果	NA	探索CKI联合化疗对TNBC肿瘤微环境的调控作用	三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	使用BALB/c小鼠建立的TNBC模型
19715	2024-08-08	Identification of diagnostic genes for both Alzheimer's disease and Metabolic syndrome by the machine learning algorithm 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1037318 PMID:36405716	研究论文	本研究通过机器学习算法识别阿尔茨海默病和代谢综合征的共同诊断基因	首次使用机器学习方法识别在阿尔茨海默病和代谢综合征中具有共同诊断作用的基因，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关系	NA	旨在识别对阿尔茨海默病和代谢综合征具有共同诊断作用的基因	阿尔茨海默病和代谢综合征的共同诊断基因	机器学习	阿尔茨海默病, 代谢综合征	WGCNA, RF, LASSO, XGBoost, CIBERSORT, scRNA-seq, ssGSEA	机器学习模型	微阵列数据, 单细胞RNA测序数据	阿尔茨海默病数据集（GSE63060和GSE63061合并），代谢综合征数据集（GSE98895），以及阿尔茨海默病患者和正常个体的外周血单个核细胞单细胞RNA测序数据
19716	2024-08-08	Pan-cancer analysis identifies migrasome-related genes as a potential immunotherapeutic target: A bulk omics research and single cell sequencing validation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.994828 PMID:36405728	研究论文	本研究通过泛癌分析和单细胞测序验证，探讨了migrasome相关基因作为潜在免疫治疗靶点的可能性	首次进行了migrasome的泛癌分析，并发现其在肿瘤发展和免疫逃逸中的重要作用	NA	探究migrasome在肿瘤免疫和肿瘤微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力	migrasome相关基因在33种癌症类型中的表达、预后、遗传变异和药物敏感性	数字病理学	NA	免疫组织化学(IHC), 单细胞转录组测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据, 拷贝数变异原始数据, 甲基化数据	33种癌症类型的基因数据, 114例结直肠癌的免疫组织化学验证
19717	2024-08-08	Identifying hub genes of calcific aortic valve disease and revealing the immune infiltration landscape based on multiple WGCNA and single-cell sequence analysis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1035285 PMID:36405745	研究论文	本研究通过生物信息学分析，结合加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞测序技术，鉴定了钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键基因，并揭示了免疫细胞浸润的特征	本研究首次结合WGCNA和单细胞测序技术，鉴定了CAVD中的关键基因S100A8和S100A9，并分析了这些基因在不同表达水平下的免疫细胞浸润差异	NA	旨在确定关键基因和免疫细胞浸润在CAVD进展中的作用	钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键基因和免疫细胞浸润	数字病理学	心血管疾病	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	从GEO数据库获取454个差异表达基因，基于六种不同的人类主动脉瓣叶进行单细胞RNA测序
19718	2024-08-08	Integrating bulk and single-cell sequencing reveals the phenotype-associated cell subpopulations in sepsis-induced acute lung injury 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.981784 PMID:36405762	研究论文	本研究通过整合批量和单细胞测序数据，揭示了败血症诱导的急性肺损伤中与表型相关的细胞亚群	首次提供了败血症肺损伤中单细胞水平的细胞变化视图，并通过Scissors方法整合批量和单细胞数据，识别了与败血症肺损伤表型最相关的细胞亚群	NA	系统阐明败血症损伤肺组织中主要构成细胞的转录组变化	败血症和对照小鼠的肺组织样本	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序	NA	细胞数据	25044个细胞，包括11317个免疫细胞和13727个非免疫细胞
19719	2024-08-08	Identification of Glucose Metabolism-Related Genes in the Progression from Nonalcoholic Fatty Liver Disease to Hepatocellular Carcinoma 2022, Genetics research IF:1.4Q4 DOI:10.1155/2022/8566342 PMID:36407083	研究论文	本研究通过加权基因共表达网络分析，基于多组学数据识别出两个共表达模块，用于区分非酒精性脂肪肝病亚型，并构建了肝细胞癌患者的预后模型	首次发现葡萄糖代谢途径在非酒精性脂肪肝病向肝细胞癌进展中的重要作用，并识别出三个可能的免疫治疗靶点	NA	探索非酒精性脂肪肝病与肝细胞癌之间的分子联系，并识别潜在的治疗靶点	非酒精性脂肪肝病患者的肝组织及肝细胞癌细胞	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	19例非酒精性脂肪肝病患者肝组织
19720	2024-08-08	Intercellular communication analysis of the human retinal pigment epithelial and choroidal cells predicts pathways associated with aging, cellular senescence and age-related macular degeneration 2022, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.3389/fnagi.2022.1016293 PMID:36408112	研究论文	研究分析了人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯，预测了与衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性相关的通路	通过应用CellChat和scDiffCom分析公开的scRNA-seq数据集，识别了与衰老和细胞衰老相关的细胞间通讯通路，并发现这些通路的信号强度在具有高衰老评分的细胞亚群中增强	研究依赖于公开的scRNA-seq和微阵列数据集，可能存在数据质量和样本代表性的限制	探讨视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞间的细胞间通讯在衰老、细胞衰老及年龄相关性黄斑变性中的作用	人视网膜色素上皮细胞和脉络膜细胞	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	scRNA-seq, 微阵列	CellChat, scDiffCom	scRNA-seq数据, 微阵列数据	三个健康人和三个AMD患者的样本