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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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19681 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Macrophages Induce Inflammation by Efferocytosis of Apoptotic Prostate Cancer Cells via HIF-1α Stabilization
2022-Nov-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11233712
PMID:36496973
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了骨髓巨噬细胞通过吞噬凋亡的前列腺癌细胞,通过HIF-1α稳定化促进炎症反应的分子机制 | 首次阐明了骨髓巨噬细胞在吞噬凋亡的前列腺癌细胞过程中,HIF-1α的稳定化及其对炎症反应的促进作用 | NA | 探究骨髓巨噬细胞吞噬凋亡的前列腺癌细胞后,HIF-1α稳定化对炎症反应的影响及其分子机制 | 骨髓巨噬细胞、凋亡的前列腺癌细胞、HIF-1α | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
19682 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes and runx2b-/- mutants reveal the genetic signatures of intermuscular bone formation in zebrafish
2022-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwac152
PMID:36478733
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和runx2b-/-突变体揭示了斑马鱼肌肉间骨形成的遗传特征 | 首次通过单细胞转录组学分析定义了18种不同的细胞类型,并揭示了肌肉间骨来源于肌腱,以及肌腱-成骨细胞系在肌肉间骨形成中的核心作用 | NA | 探究斑马鱼肌肉间骨形成的分子基础 | 斑马鱼的肌肉间骨 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | CRISPR-Cas9 | 转录组 | NA |
19683 | 2024-08-08 |
Identification of Small Airway Epithelium-Related Hub Genes in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2022, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S377026
PMID:36475041
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研究论文 | 本研究通过微阵列数据和单细胞RNA测序数据,识别与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的小气道上皮细胞的关键基因 | 首次识别出可能在COPD过程中发挥抗氧化作用的关键基因,并通过单细胞转录组分析揭示了这些基因在COPD中的表达和分布 | NA | 识别与COPD进展相关的小气道上皮细胞的关键基因 | 小气道上皮细胞和COPD患者 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 微阵列分析,加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞RNA测序,实时定量PCR(RT-qPCR) | NA | 基因表达数据 | 34名健康非吸烟者和33名COPD患者的小气道上皮细胞样本,以及单细胞RNA测序数据 |
19684 | 2024-08-08 |
scAnalyzeR: A Comprehensive Software Package With Graphical User Interface for Single-Cell RNA Sequencing Analysis and its Application on Liver Cancer
2022 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338221142729
PMID:36476060
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研究论文 | 开发了一个名为scAnalyzeR的单细胞RNA测序分析软件包,具有图形用户界面,用于分析和可视化单细胞RNA测序数据,并应用于肝癌研究 | scAnalyzeR提供了一个交互式和用户友好的图形界面,简化了单细胞RNA测序数据分析的复杂性,并支持多种技术平台和模型生物的数据输入 | NA | 开发一个易于使用的单细胞RNA测序分析工具,并展示其在癌症研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据和肝癌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
19685 | 2024-08-08 |
Myeloid cell reprogramming alleviates immunosuppression and promotes clearance of metastatic lesions
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1039993
PMID:36479083
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研究论文 | 研究通过静脉注射无药物的聚合物纳米颗粒(NPs)来重编程骨髓细胞,以减轻免疫抑制并促进清除转移性病变 | 使用无药物的聚合物纳米颗粒重编程骨髓细胞,改变其表型和功能,从而影响肿瘤微环境 | 研究仅在4T1小鼠模型中进行,需要进一步在其他模型和临床试验中验证 | 探索通过纳米颗粒重编程骨髓细胞以减轻免疫抑制并促进肿瘤清除的方法 | 骨髓细胞、纳米颗粒、转移性乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了4T1小鼠模型,具体样本数量未明确 |
19686 | 2024-08-08 |
Identification of immune cell function in breast cancer by integrating multiple single-cell data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1058239
PMID:36479102
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研究论文 | 本研究通过整合两个公开的乳腺癌单细胞RNA测序数据集,探讨了肿瘤微环境中不同类型免疫细胞的功能 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,全面评估了细胞间的异质性,并揭示了不同细胞类型的基因表达状态 | 由于样本大小和测序深度的影响,不同细胞类型在乳腺癌中的基因特异性无法完全揭示 | 旨在识别对乳腺癌免疫微环境至关重要的细胞类型特异性基因,以促进乳腺癌治疗 | 研究对象包括乳腺癌中的B细胞、T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 整合了两个公开的乳腺癌scRNA-seq数据集 |
19687 | 2024-08-08 |
Optimization of chondrocyte isolation from human articular cartilage to preserve the chondrocyte transcriptome
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.1046127
PMID:36479429
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研究论文 | 本文优化了从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序,以最大限度地保留软骨细胞的转录组 | 研究引入了在低氧条件下立即处理软骨组织和使用不同浓度的胶原酶II以及Actinomycin D来稳定转录组的方法 | NA | 优化从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序,以保留软骨细胞的转录组 | 人类关节软骨中的软骨细胞 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自骨关节炎患者的软骨组织 |
19688 | 2024-08-08 |
Anesthesia and developing brain: What have we learned from recent studies
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1017578
PMID:36479527
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综述 | 本文综述了近年来关于麻醉对发育中大脑影响的研究进展,提供了保护不成熟大脑的有用建议和潜在治疗靶点 | 结合单细胞测序技术筛选非人灵长类动物中的差异基因表达,并在啮齿类动物中进行验证 | 啮齿类模型中的机制是否具有临床相关性仍不明确,且使用非人灵长类动物模型的研究机构较少 | 探讨麻醉对发育中大脑的神经毒性影响及其机制,并寻找新的解决方案 | 发育中的大脑 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
19689 | 2024-08-08 |
Immune and non-immune cell subtypes identify novel targets for prognostic and therapeutic strategy: A study based on intratumoral heterogenicity analysis of multicenter scRNA-seq datasets in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1046121
PMID:36483553
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研究论文 | 本研究基于多中心单细胞RNA测序数据集,分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性,识别了免疫和非免疫细胞亚型,并揭示了潜在的预后和治疗靶点 | 利用单细胞RNA测序技术,系统分析了肺腺癌的多中心数据集,识别了15种主要细胞类型和57个细胞亚群,并发现了多种潜在的生物标志物 | NA | 旨在通过分析肺腺癌的肿瘤内异质性,识别新的预后和治疗靶点,以改善临床治疗效果 | 肺腺癌中的免疫和非免疫细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 多中心数据集 |
19690 | 2024-08-05 |
Microglial INPP5D limits plaque formation and glial reactivity in the PSAPP mouse model of Alzheimer's disease
2023-06, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.12821
PMID:36448627
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研究论文 | 该文章研究了微小胶质细胞中INPP5D基因在阿尔茨海默病小鼠模型中的作用 | 文章揭示了INPP5D的条件性下调如何增加斑块负担及微小胶质细胞的招募,并鉴定了CST7作为新的斑块标记物 | 文章未提及研究的局限性 | 探讨INPP5D在阿尔茨海默病小鼠模型中的功能与影响 | 使用APPKM670/671NL /PSEN1Δexon9(PSAPP)小鼠模型和Inpp5d基因敲除小鼠进行研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | PSAPP小鼠 | 组织样本 | 实验涉及3个月大和6个月大小鼠 |
19691 | 2024-08-05 |
Early fate bias in neuroepithelial progenitors of hippocampal neurogenesis
2023-04, Hippocampus
IF:2.4Q3
DOI:10.1002/hipo.23482
PMID:36468233
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研究论文 | 本研究报道了小鼠海马发育过程中神经上皮祖细胞的命运偏倚和基因表达程序 | 揭示了早期神经上皮干细胞向海马特定神经前体细胞或非神经细胞命运的限制 | 缺乏对早期命运限制机制的深入研究 | 探究早期神经上皮干细胞与后生神经发生细胞之间的克隆关系 | 小鼠海马中的神经上皮干细胞及其克隆相关细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 数千个克隆相关细胞 |
19692 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq analysis of diabetic wound macrophages in STZ-induced mice
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-022-00707-w
PMID:36445632
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研究论文 | 本研究对糖尿病伤口中的巨噬细胞进行了单细胞RNA测序分析 | 识别了一种先前未描述的巨噬细胞群体,并分析了其基因表达和可能的功能 | 仅在STZ诱导的糖尿病小鼠模型中进行,可能无法完全代表人类情况 | 研究糖尿病慢性伤口中巨噬细胞的异质性及其在伤口愈合中的作用 | 糖尿病慢性伤口中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | CD45+免疫细胞,来自17个细胞群体 |
19693 | 2024-08-05 |
Experimental validation of in silico analysis estimated the reverse effect of upregulated hsa-miR-106a-5p and hsa-miR-223-3p on SLC4A4 gene expression in Iranian patients with colorectal adenocarcinoma by RT-qPCR
2023-03, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5499
PMID:36468451
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研究论文 | 本研究利用计算分析和实验技术研究了结肠直肠癌中共表达基因及其相关miRNA网络 | 首次确认了SLC4A4作为结肠直肠癌的下调核心基因,并识别出hsa-miR-223-3p和hsa-miR-106a-5p作为其特定的核心miRNA | 需要进一步的实验数据来支持本研究的结果和验证精确的分子通路 | 研究结肠直腸癌中的共表达基因及其miRNA网络 | 伊朗结肠直肠腺癌患者的组织样本及其相关的miRNA | 数字病理学 | 结肠癌 | RT-qPCR | 加权基因共表达网络算法 | 转录组数据 | 从结肠直肠癌患者提取的癌症和相邻正常组织样本 |
19694 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Arabidopsis Leaf Tissues Identifies Multiple Specialized Cell Types: Idioblast Myrosin Cells and Potential Glucosinolate-Producing Cells
2023-Mar-01, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcac167
PMID:36440710
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了拟南芥叶片组织的转录组,识别并验证了多种特化细胞类型,包括芥子细胞和潜在的硫代葡萄糖苷合成细胞 | 本研究通过使用单细胞转录组数据和β-葡萄糖醛酸酶启动子分析,发现了新的特异性报告基因,用于芥子细胞和潜在硫代葡萄糖苷合成细胞的鉴定 | 不同植物发育阶段和细胞类型注释方法的差异限制了研究间的比较 | 旨在通过单细胞转录组分析,深入了解拟南芥叶片中硫代葡萄糖苷-芥子酶防御系统相关细胞类型的表达特征 | 拟南芥叶片组织中的特化细胞类型,特别是芥子细胞和硫代葡萄糖苷合成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 扩展的拟南芥叶片组织中的多个细胞类型 |
19695 | 2024-08-08 |
Single-cell discovery of the scene and potential immunotherapeutic target in hypopharyngeal tumor environment
2023-03, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-022-00567-x
PMID:36460803
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研究论文 | 本文构建了首个喉下癌的单细胞转录组图谱,并探索了其潜在机制 | 首次构建了喉下癌的单细胞转录组图谱,并识别了七种细胞类型,包括上皮细胞和髓系细胞 | NA | 研究喉下癌的细胞通信机制及其潜在的免疫治疗靶点 | 喉下癌及其癌旁组织的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 喉下癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 17,599个细胞 |
19696 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
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meta-analysis | 开发了一个专门用于人类癌症的单细胞RNA测序数据库IMMUcan scDB并进行了元分析 | 提供了一个集成化、可公开访问的数据库,涵盖56种不同癌症类型的144个数据集,并具有详细的临床和生物信息注释 | 数据异质性和研究之间的变异性可能对结果造成影响 | 探讨与肿瘤微环境相关的单细胞RNA测序数据并进行元分析 | 涉及56种不同癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 144个数据集 |
19697 | 2024-08-08 |
Development of a personalized dendritic cell vaccine and single-cell RNA sequencing-guided assessment of its cell type composition
2023-02, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2022.10.013
PMID:36443171
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研究论文 | 本文研究了一种个性化树突状细胞疫苗的细胞类型组成,并通过单细胞RNA测序技术进行评估 | 首次通过单细胞转录组分析方法,详细研究了DC疫苗CUD-002的细胞类型组成,并确认了其安全性 | NA | 旨在评估和解决基于树突状细胞的免疫治疗产品在制造过程中细胞类型异质性的监管考虑 | 个性化树突状细胞疫苗CUD-002的细胞类型组成及其安全性 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
19698 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Circulating Epithelial Cells in Breast Cancer at Single-Cell Resolution: Identifying Tumor and Hybrid Cells
2023-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200206
PMID:36449636
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析非转移性乳腺癌患者中CD45阴性和CD45阳性循环上皮细胞(CECs)的异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别出乳腺癌中的肿瘤细胞和杂交细胞,并发现CD45 CECs中存在大量拷贝数异常,与肿瘤分级正相关 | 需要进一步研究以确定哪些循环肿瘤和杂交细胞亚群对乳腺癌转移有贡献 | 研究循环肿瘤细胞和杂交细胞在乳腺癌中的异质性及其在转移中的作用 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 |
19699 | 2024-08-08 |
Single-cell genomics illustrates heterogeneous phenotypes of myocardial fibroblasts under ischemic insults
2023-02-01, Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire
DOI:10.1139/bcb-2022-0229
PMID:36458696
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组学研究,揭示了心肌纤维母细胞在缺血损伤下的表型异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了心肌纤维母细胞在缺血和再灌注条件下的表型异质性 | NA | 探索心肌纤维母细胞在心肌梗死区域的再生/修复反应 | 心肌纤维母细胞的表型异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从心肌梗死区域的Yucatan小型猪中分离的心肌纤维母细胞 |
19700 | 2024-08-08 |
Molecular Dissection of Somatic Skeletal Disease in Neurofibromatosis Type 1
2023-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4755
PMID:36459048
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了神经纤维瘤病1型(NF1)患者来源的假关节样本中的骨基质细胞(BSCs),揭示了NF1相关骨骼疾病的发病机制。 | 首次应用时间序列单细胞RNA测序技术研究NF1患者的骨基质细胞,揭示了Clec11a-Itga11-Wnt信号通路在NF1相关骨骼疾病中的作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面,缺乏对NF1患者骨骼疾病的临床治疗效果的直接评估。 | 探讨NF1患者骨骼疾病的发病机制。 | NF1患者的骨基质细胞和假关节样本。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 患者匹配的控制组和假关节来源的初级骨基质细胞 |