单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 19661 - 19680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19661 | 2024-08-05 |
Comparative single-cell analysis of the adult heart and coronary vasculature
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09968-7
PMID:36401619
|
研究论文 | 本文使用单细胞转录组学方法探讨了脊椎动物心脏和冠状血管的差异 | 整合不同物种的多种数据集，识别心脏的种特异性差异和相似性 | 数据整合可能受限于原始研究聚焦的组织类型 | 比较脊椎动物心脏的结构和功能差异 | 常见的几种脊椎动物心脏，包括猕猴、小鼠和斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个物种的心脏数据集，包括猕猴、小鼠和斑马鱼 |
| 19662 | 2024-08-08 |
The complement receptor C3AR constitutes a novel therapeutic target in NPM1-mutated AML
2023-04-11, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007682
PMID:36383712
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研究论文 | 本文通过流式细胞术筛选和单细胞RNA测序，发现补体受体C3AR在NPM1突变的急性髓系白血病细胞中特异性表达，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现补体受体C3AR在NPM1突变的急性髓系白血病细胞中特异性表达，并验证了其作为治疗靶点的有效性 | NA | 旨在识别NPM1突变急性髓系白血病细胞表面特异性表达的蛋白质，以开发基于抗体的治疗方法 | NPM1突变的急性髓系白血病细胞和正常骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞表面标记 | 涉及362个细胞表面标记的筛选，以及NPM1突变AML细胞和正常骨髓细胞的比较 |
| 19663 | 2024-08-05 |
Biomimetic nanoparticles drive the mechanism understanding of shear-wave elasticity stiffness in triple negative breast cancers to predict clinical treatment
2023-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.10.025
PMID:36382024
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研究论文 | 该研究探讨了生物仿生纳米颗粒如何驱动三阴性乳腺癌的剪切波弹性刚度机制理解，以预测临床治疗效果 | 研究首次展示了通过调节肿瘤微环境中的成纤维细胞（CAFs）功能来影响三阴性乳腺癌中的剪切波弹性刚度 | NA | 阐明三阴性乳腺癌中CAF功能与剪切波弹性刚度之间的关系 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞和相应的肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | PLGA纳米颗粒 | 肿瘤模型（MDA-MB-231和E0771） | 单细胞测序 | NA |
| 19664 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Inflammation and Antitumor Immunity
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1031
PMID:36399325
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综述 | 本文探讨了肿瘤相关成纤维细胞在炎症和抗肿瘤免疫中的角色 | 揭示了不同类型的肿瘤相关成纤维细胞（CAF）在肿瘤微环境中的功能及其在肿瘤促进性炎症和抑制免疫反应中的双重作用 | 研究主要依赖于最近的单细胞测序分析，可能缺乏更广泛的临床验证 | 探索肿瘤相关成纤维细胞在肿瘤炎症和免疫反应中的作用 | 肿瘤相关成纤维细胞及其在不同人类癌症中的表型和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 19665 | 2024-08-05 |
Dynamic cellular and molecular characteristics of spermatogenesis in the viviparous marine teleost Sebastes schlegelii†
2023-02-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac203
PMID:36401879
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研究论文 | 本研究探讨了海洋活胎鱼Sebastes schlegelii的精子发生的动态细胞和分子特征 | 该研究结合了细胞组织学和单细胞RNA测序技术，填补了关于活胎鱼精子发生动态变化的研究空白 | 本研究未提及样本的具体数量或外部验证的结果 | 揭示活胎鱼的精子发生过程中的细胞和分子动态变化 | 重点研究海洋鱼类Sebastes schlegelii的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19666 | 2024-08-08 |
Construction of a novel immune-related prognostic-predicting model of gastric cancer
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147032
PMID:36403868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据识别出274个差异表达的免疫相关基因，并构建了一个用于预测胃癌预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出胃癌中的差异表达免疫相关基因，并构建了一个新的免疫相关预后预测模型 | NA | 研究胃癌的预后预测模型 | 胃癌患者的预后 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 274个差异表达的免疫相关基因，TCGA-GC训练队列和GSE66229外部数据集 |
| 19667 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of fibrosis and angiogenesis in endometriosis revealed by single-cell RNA-sequencing
2023-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2022.166602
PMID:36400338
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜在分泌期的细胞异质性 | 首次在没有激素药物干扰的情况下，通过单细胞RNA测序技术研究了异位和非异位子宫内膜的细胞异质性 | NA | 探索子宫内膜异位症中纤维化、血管生成和慢性炎症的细胞异质性 | 异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜的细胞特性 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19668 | 2024-08-08 |
Combinatorial perturbation sequencing on single cells using microwell-based droplet random pairing
2023-Jan-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114913
PMID:36395729
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于微孔滴随机配对技术的单细胞组合扰动测序方法（CP-seq），用于组合药物治疗的研究 | CP-seq技术利用寡核苷酸条码标记药物，通过微流控滴操作实现细胞与药物的随机配对，从而完成组合药物处理和细胞条码标记 | NA | 开发一种高通量且全面的组合扰动筛选技术，以减少药物抗性和疾病复发 | 单细胞的转录组和药物条码 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 微孔利用率达到83% |
| 19669 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals correct developmental dynamics and high-quality midbrain cell types by improved hESC differentiation
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.016
PMID:36400027
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组技术揭示了改进的人胚胎干细胞分化过程中的发育动态和高质量的中脑细胞类型。 | 该研究识别了在人胚胎干细胞分化为中脑多巴胺神经元过程中重要的发育因素，提供了新的分子定义细胞类型的应用前景。 | 研究中没有提到具体的样本数量和可能的实验室条件限制。 | 探索人胚胎干细胞分化为功能性中脑多巴胺神经元的发育机制。 | 人胚胎干细胞及其分化产生的中脑多巴胺神经元。 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 19670 | 2024-08-08 |
A set-theoretic definition of cell types with an algebraic structure on gene regulatory networks and application in annotation of RNA-seq data
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.015
PMID:36400029
|
研究论文 | 本文提出了一种基于集合论的细胞类型定义方法，并将其应用于RNA-seq数据的注释 | 开发了一种新的细胞身份表示方法，能够在不同数据集间进行比较并保留重要的生物学语义 | NA | 旨在改进RNA-seq数据的注释方法，更准确地捕捉细胞类型的普遍特征 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 集合论框架 | RNA-seq数据 | NA |
| 19671 | 2024-08-08 |
scAWMV: an adaptively weighted multi-view learning framework for the integrative analysis of parallel scRNA-seq and scATAC-seq data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac739
PMID:36383176
|
研究论文 | 提出了一种自适应加权多视角学习框架scAWMV，用于整合来自同一细胞的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | scAWMV方法考虑了多组学数据中不同模态的重要性差异以及scRNA-seq和scATAC-seq数据中特征的生物学联系 | NA | 提高揭示细胞异质性的能力 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 多视角学习 | 多组学数据 | 四个真实数据集 |
| 19672 | 2024-08-08 |
An optimized FACS-free single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) method for plant science research
2023-Jan, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2022.111535
PMID:36400127
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研究论文 | 本文开发了一种无需荧光激活细胞分选（FACS）的单核RNA测序（snRNA-seq）方法，用于植物科学研究 | 该方法不依赖于FACS，能够使用冷冻样本，减少偏倚的细胞覆盖和解离诱导的转录伪影，并能区分表皮细胞的不同层次 | NA | 克服植物中单细胞RNA测序（scRNA-seq）由于原生质体分离困难而带来的限制 | 成熟拟南芥植物组织的基因表达调控机制 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | 来自同一批次叶片材料的原生质体和单核RNA测序数据 |
| 19673 | 2024-08-08 |
Astragaloside IV as a novel CXCR4 antagonist alleviates osteoarthritis in the knee of monosodium iodoacetate-induced rats
2023-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2022.154506
PMID:36403512
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研究论文 | 研究探讨了黄芪甲苷IV作为新型CXCR4拮抗剂在单碘乙酸诱导的骨质疏松模型大鼠中减轻膝关节骨质疏松的作用。 | 黄芪甲苷IV被鉴定为一种新型CXCR4拮抗剂，通过阻断Akt信号通路减少CXCL12诱导的ADAMTS4,5过度表达。 | 研究主要集中在动物模型和体外细胞实验，需要进一步的人体临床试验验证其效果。 | 探索黄芪甲苷IV作为CXCR4拮抗剂在骨质疏松治疗中的潜在应用。 | 黄芪甲苷IV对CXCR4信号通路的影响及其在骨质疏松治疗中的作用。 | NA | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 钙响应评估, 批量RNA测序, 蛋白质印迹分析 | NA | RNA序列, 蛋白质 | 包括骨质疏松患者和单碘乙酸诱导的骨质疏松模型大鼠 |
| 19674 | 2024-08-08 |
Relative infectivity of the SARS-CoV-2 Omicron variant in human alveolar cells
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105571
PMID:36406862
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研究论文 | 本文通过整合人肺泡类器官和单细胞转录组测序技术，评估了SARS-CoV-2变种（包括GR、Alpha、Delta和Omicron）对人类肺泡细胞的相对感染性 | 首次在多病毒共感染条件下测量了Omicron变种的相对感染性，并提供了新的实验程序用于监测新兴病毒变种 | NA | 比较不同SARS-CoV-2变种的感染性，为公共卫生提供关键信息 | SARS-CoV-2的GR、Alpha、Delta和Omicron变种 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 涉及四种高传染性SARS-CoV-2变种 |
| 19675 | 2024-08-08 |
Somatic mutations of activating signalling, transcription factor, and tumour suppressor are a precondition for leukaemia transformation in myelodysplastic syndromes
2022-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17613
PMID:36380727
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研究论文 | 本文通过配对自控测序技术，包括靶向、全外显子和单细胞RNA测序，分析了72名从骨髓增生异常综合征（MDS）转变为急性髓系白血病（AML）的患者，以寻找与AML转化相关的突变（TRMs）。 | 首次通过配对自控测序技术，结合靶向、全外显子和单细胞RNA测序，系统地分析了MDS向AML转化过程中的相关突变。 | 研究仅限于一小部分基因，且样本量相对较小。 | 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的生物学机制。 | 72名从骨髓增生异常综合征转变为急性髓系白血病的患者。 | 数字病理学 | 白血病 | 靶向测序、全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 72名患者 |
| 19676 | 2024-08-08 |
Glucagon-like Peptide-1 receptor Tie2+ cells are essential for the cardioprotective actions of liraglutide in mice with experimental myocardial infarction
2022-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2022.101641
PMID:36396031
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研究论文 | 本文研究了胰高血糖素样肽-1受体（GLP-1R）在心肌梗死小鼠模型中的心脏保护作用，特别是GLP-1R在Tie2+细胞中的表达及其对liraglutide治疗反应的影响 | 首次揭示了小鼠Tie2+内皮细胞GLP-1R作为GLP-1R激动剂心脏保护作用的关键靶点，并强调了心脏GLP-1R表达的物种特异性差异 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类心脏中GLP-1R的作用机制 | 探讨GLP-1R在心肌梗死中的心脏保护作用及其在不同细胞类型中的表达 | 小鼠和人类心脏细胞中的GLP-1R表达及其在心肌梗死中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光激活细胞分选，RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 小鼠和人类心脏细胞样本 |
| 19677 | 2024-08-08 |
Dual-Stream Subspace Clustering Network for revealing gene targets in Alzheimer's disease
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106305
PMID:36401971
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研究论文 | 本文提出了一种基于卷积神经网络的新型基因聚类方法——双流子空间聚类网络（DS-SCNet），用于从大规模单细胞RNA-seq数据中准确识别重要基因簇 | DS-SCNet能够在大规模单细胞RNA-seq数据中准确识别重要基因簇，并在模拟数据集上优于主流基因聚类方法 | NA | 揭示阿尔茨海默病中的基因靶点 | 单细胞RNA-seq数据中的基因簇 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | CNN | 基因表达数据 | 分析了包含10,850个基因的单细胞RNA-seq数据，来自6673个细胞 |
| 19678 | 2024-08-08 |
Integrative analysis of multiomics data identifies selenium-related gene ALAD associating with keshan disease
2022-11-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本文通过综合分析多组学数据，发现与克山病相关的硒相关基因ALAD，并探讨其在克山病发病机制中的作用 | 首次证明硒相关基因ALAD对维持正常线粒体活性至关重要，为克山病的硒缺乏假说提供了强有力的分子证据 | NA | 探究克山病的分子机制及硒相关基因ALAD的作用 | 克山病患者及对照组的多组学数据 | 数字病理学 | 克山病 | 全外显子测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 68名克山病患者和100名对照组 |
| 19679 | 2024-08-08 |
Characteristics of lymphocyte subset alterations in COVID-19 patients with different levels of disease severity
2022-11-19, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-022-01926-8
PMID:36403042
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研究论文 | 本研究探讨了不同严重程度的COVID-19患者淋巴细胞亚群的变化特征 | 首次详细分析了COVID-19患者中淋巴细胞亚群的变化及其与疾病严重程度的关系 | 研究样本主要集中在武汉火神山医院，可能存在地域性偏差 | 探究COVID-19患者淋巴细胞亚群的变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的淋巴细胞亚群及其与疾病严重程度的关系 | NA | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 548名住院COVID-19患者和125名住院COVID-19患者的淋巴细胞亚群 |
| 19680 | 2024-08-08 |
A Myb enhancer-guided analysis of basophil and mast cell differentiation
2022-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34906-1
PMID:36400777
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研究论文 | 本文通过分析Myb基因的-68增强子，揭示了其在嗜碱性粒细胞和肥大细胞分化中的作用 | 首次识别了Myb基因的-68增强子，并展示了其如何标记嗜碱性粒细胞和肥大细胞，以及如何通过单细胞RNA测序揭示这些细胞的分化轨迹 | NA | 深入理解MYB表达在细胞系相关方式中的调控机制 | Myb基因的-68增强子在嗜碱性粒细胞和肥大细胞分化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |