单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 19621 - 19640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19621 | 2024-08-08 |
Development of a polyamine gene expression score for predicting prognosis and treatment response in clear cell renal cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1048204
PMID:36505496
|
研究论文 | 本研究旨在揭示多胺代谢相关基因（PMRGs）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的表达与预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 开发了多胺基因表达评分（PGES），用于准确预测患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 揭示多胺代谢相关基因在透明细胞肾细胞癌中的表达与预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的多胺代谢相关基因表达 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序分析 | Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 777名ccRCC患者 |
| 19622 | 2024-08-08 |
Identification of two robust subclasses of sepsis with both prognostic and therapeutic values based on machine learning analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040286
PMID:36505503
|
研究论文 | 本研究基于机器学习分析，识别出两种具有预后和治疗价值的脓毒症亚型 | 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和K均值聚类分析，成功分类出两种脓毒症亚型，并验证了其临床相关性 | NA | 开发优化的脓毒症分类方法，以促进个性化治疗和临床结果预测 | 1936名患者（脓毒症样本1692例，正常样本244例）的数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），K均值聚类分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | K均值聚类 | 基因表达数据 | 1936名患者 |
| 19623 | 2024-08-08 |
A machine learning framework for scRNA-seq UMI threshold optimization and accurate classification of cell types
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.982019
PMID:36506328
|
研究论文 | 本文开发了一种机器学习框架，用于优化scRNA-seq UMI阈值并准确分类细胞类型 | 提出了一种新的机器学习框架，能够系统地评估最低UMI阈值，并准确分类细胞，提高了细胞回收率 | NA | 解决scRNA-seq技术中由于UMI阈值设置过高导致的细胞丢失问题 | scRNA-seq数据中的细胞类型分类 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 机器学习框架 | scRNA-seq数据 | 乳腺癌患者数据集及两个外部数据集 |
| 19624 | 2024-08-08 |
Mechanism of action of paclitaxel for treating glioblastoma based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1076958
PMID:36506527
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据和网络药理学方法研究紫杉醇治疗胶质母细胞瘤的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学分析紫杉醇对胶质母细胞瘤的作用机制 | NA | 探究紫杉醇治疗胶质母细胞瘤的生物活性、机制及癌细胞杀伤效应 | 紫杉醇的作用机制及其对胶质母细胞瘤的影响 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24个细胞簇 |
| 19625 | 2024-08-08 |
IL-33 induces NF-κB activation in ILC2 that can be suppressed by in vivo and ex vivo 17β-estradiol
2022, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2022.1062412
PMID:36506643
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研究论文 | 研究IL-33诱导的ILC2中NF-κB活化及其被17β-雌二醇抑制的机制 | 首次揭示了雌激素对ILC2的抑制作用及其在过敏性疾病治疗中的潜在价值 | 研究主要集中在动物模型上，需要进一步的人体研究验证 | 探讨卵巢激素波动对哮喘疾病进展和症状加重的机制 | ILC2细胞和NF-κB信号通路 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了雌性和雄性BALB/c小鼠以及卵巢切除的雌性小鼠 |
| 19626 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Paraspeckles Expression in Osteosarcoma Tissues
2022, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351221140101
PMID:36507075
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析方法，研究了骨肉瘤组织中paraspeckles及相关基因的表达情况 | 首次揭示了paraspeckles及相关基因在骨肉瘤细胞中的表达模式 | 样本量较小，仅涉及6个骨肉瘤肿瘤组织 | 探讨paraspeckles及相关基因在骨肉瘤进展中的作用 | 骨肉瘤组织中的paraspeckles及相关基因表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个骨肉瘤肿瘤组织 |
| 19627 | 2024-08-08 |
Interaction between human leukocyte antigen (HLA-C) and killer cell Ig-like receptors (KIR2DL) inhibits the cytotoxicity of natural killer cells in patients with hepatoblastoma
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.947729
PMID:36507493
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了肝母细胞瘤患儿的免疫微环境，发现KIR2DL在NK细胞中的高表达与HLA-C的相互作用抑制了NK细胞的细胞毒性，可能导致肿瘤免疫逃逸。 | 首次揭示了HLA-C与KIR2DL在肝母细胞瘤中的相互作用及其对NK细胞功能的抑制作用，并提出了通过阻断这种相互作用来增强NK细胞毒性作为新的治疗策略。 | 研究样本量较小，仅包括两名肝母细胞瘤患儿和一名健康儿童，可能影响结果的普遍性。 | 探讨肝母细胞瘤患儿的免疫微环境特征及其与疾病发展的关系。 | 两名肝母细胞瘤患儿和一名健康儿童的外周血和肿瘤组织。 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 3名儿童（2名肝母细胞瘤患儿和1名健康儿童） |
| 19628 | 2024-08-08 |
The Infiltration of Neutrophil Granulocytes Due to Loss of PTEN Was Associated with Poor Response to Immunotherapy in Renal Cell Carcinoma
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S388990
PMID:36510494
|
研究论文 | 本文探讨了PTEN缺失与肾细胞癌中中性粒细胞浸润及免疫治疗反应不佳之间的关系。 | 首次揭示了PTEN状态与肾透明细胞癌中中性粒细胞浸润的关系，并提出了PTEN低表达作为抗PD-1免疫治疗抵抗的候选因素。 | NA | 研究PTEN在肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系。 | 肾透明细胞癌患者及其实验室细胞系。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | CRISPR-Cas9, 免疫印迹, qRT-PCR, RNA测序, 免疫组化染色 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 多个肾透明细胞癌数据集, 包括批量RNA测序和单细胞RNA测序数据 |
| 19629 | 2024-08-08 |
Development of a Cancer-Associated Fibroblast-Related Prognostic Model in Breast Cancer via Bulk and Single-Cell RNA Sequencing
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/2955359
PMID:36510567
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序技术，开发了一个与癌症相关成纤维细胞相关的乳腺癌预后模型。 | 本文创新性地利用单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，结合多种生物信息学工具，构建了一个包含五个基因的预后模型，该模型与癌症相关成纤维细胞相关。 | NA | 开发一个与癌症相关成纤维细胞相关的乳腺癌预后模型。 | 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)的乳腺癌单细胞RNA测序数据集GSE176078，包含28个细胞集群。 |
| 19630 | 2024-08-08 |
Analysis of the key ligand receptor CADM1_CADM1 in the regulation of thyroid cancer based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.969914
PMID:36523593
|
研究论文 | 本研究分析了关键配体受体CADM1_CADM1在甲状腺癌中的调控作用，基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 首次发现CADM1_CADM1在甲状腺癌进展中的重要作用，并提供了一种新的潜在预后和治疗配体-受体对 | 由于对甲状腺癌中配体-受体对的了解有限，针对这些配体-受体对的治疗方法仍面临挑战 | 研究甲状腺癌中配体-受体对的作用，以寻找新的预后和治疗靶点 | 甲状腺癌中的CADM1_CADM1配体-受体对 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 65311个单细胞RNA测序样本来自7名不同阶段的甲状腺癌患者，以及包含487个肿瘤样本和58个癌旁样本的批量RNA测序数据集 |
| 19631 | 2024-08-08 |
A high-efficiency differential expression method for cancer heterogeneity using large-scale single-cell RNA-sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1063130
PMID:36523772
|
研究论文 | 本文提出了一种高效稳健的差异表达检测方法HEART，用于分析大规模单细胞RNA测序数据，以研究结直肠癌的异质性 | HEART方法能够检测多种来源的差异表达基因，不仅限于平均表达水平的变化，具有高准确性和计算效率 | NA | 研究结直肠癌的异质性及其对癌症治疗效果的影响 | 结直肠癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 统计组合测试 | 单细胞RNA测序数据 | 多个模拟数据集和实际数据集，包括PBMC68K数据集和人类脑单细胞数据集 |
| 19632 | 2024-08-08 |
Combined proteomics and single cell RNA-sequencing analysis to identify biomarkers of disease diagnosis and disease exacerbation for systemic lupus erythematosus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.969509
PMID:36524113
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研究论文 | 本研究通过结合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，识别系统性红斑狼疮（SLE）的疾病诊断和疾病加重的生物标志物。 | 本研究首次通过机器学习管道和实验验证，确定了两种生物标志物组合，能够准确区分SLE患者与健康对照组，并区分活动性和非活动性SLE。 | NA | 旨在发现和验证系统性红斑狼疮的疾病诊断和活动监测的生物标志物。 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞（PBMC）。 | 蛋白质组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），酶联免疫吸附试验（ELISA） | 机器学习 | 蛋白质组数据，单细胞RNA测序数据 | 包括活动性SLE、非活动性SLE、类风湿关节炎（RA）患者和健康对照（HC）的外周血单个核细胞（PBMC）样本。 |
| 19633 | 2024-08-08 |
Machine learning-based identification of SOX10 as an immune regulator of macrophage in gliomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1007461
PMID:36524115
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研究论文 | 本研究利用机器学习方法识别SOX10作为胶质瘤中巨噬细胞的免疫调节因子 | 发现SOX10在胶质瘤中具有显著的免疫特征和基因组特征，且其高表达与免疫治疗效果相关 | NA | 探索SOX10在胶质瘤中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 胶质瘤中的SOX10及其对巨噬细胞的影响 | 机器学习 | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 涉及低级别胶质瘤（LGG）、高级别胶质瘤（HGG）及泛癌组 |
| 19634 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing in asthma research
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.988573
PMID:36524132
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review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在哮喘研究中的重要性及其近年来的研究成果 | scRNA-seq技术有助于探索哮喘的异质性，识别稀有细胞类型和特定细胞亚群，阐明细胞分化的关键过程，并理解预测免疫功能的调控基因网络 | NA | 旨在为哮喘的发病机制、药物开发和治疗提供新思路 | 哮喘的免疫发病机制 | digital pathology | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 19635 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive role of SPP1-CD44 in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma assessed by single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04498-w
PMID:36469154
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了分泌磷蛋白1（SPP1）及其在肝内胆管癌（ICC）肿瘤微环境中通过CD44的免疫抑制作用。 | 首次揭示了SPP1通过CD44在肝内胆管癌肿瘤微环境中对T细胞增殖的抑制作用，并识别了免疫抑制细胞因子TGFβ-3作为CD44的诱导因子。 | 研究基于已发表的转录组数据，可能受限于样本量和数据来源的多样性。 | 旨在阐明SPP1在肝内胆管癌中的生物学功能及其免疫抑制作用。 | 研究对象包括9名患者的肝内胆管癌及其邻近肝组织的细胞。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 62,770个细胞 |
| 19636 | 2024-08-08 |
FLG Deficiency in Mice Alters the Early-Life CD4+ T-Cell Response to Skin Commensal Bacteria
2023-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.10.019
PMID:36496196
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研究论文 | 研究FLG缺陷小鼠在早期生活中对皮肤共生细菌的CD4+ T细胞反应的改变 | 首次揭示了FLG缺陷小鼠在新生儿期皮肤屏障功能微小差异伴随的共生菌特异性CD4反应的偏斜，及其对皮肤免疫稳态的持久影响 | NA | 探讨FLG缺陷是否影响新生儿皮肤屏障功能，并改变共生菌特异性T细胞的质量和功能影响 | FLG缺陷小鼠和野生型小鼠的新生儿皮肤屏障和早期皮肤免疫反应 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6 Flg小鼠和野生型小鼠的新生儿 |
| 19637 | 2024-08-05 |
Testing for Phylogenetic Signal in Single-Cell RNA-Seq Data
2023-04, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0357
PMID:36475926
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研究论文 | 本文首次证明单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据包含足够的进化信号，可用于系统发育分析。 | 首次展示了单细胞RNA测序数据在重建细胞之间的系统发育关系方面的应用潜力。 | 尚需进一步研究以完善和改进这些方法，以全面捕捉癌症中的体细胞进化动态。 | 探讨如何利用单细胞RNA测序数据进行系统发育分析。 | 单细胞RNA测序数据及其在肿瘤细胞中的表达水平和单核苷酸变异(SNV)。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 19638 | 2024-08-08 |
HTNV infection induces activation and deficiency of CD8+MAIT cells in HFRS patients
2023-03-08, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxac111
PMID:36480318
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研究论文 | 研究探讨了汉坦病毒（HTNV）感染对HFRS患者CD8+MAIT细胞的影响 | 首次鉴定了MAIT细胞的基因表达谱，并揭示了HTNV感染期间MAIT细胞激活的分子机制 | NA | 探索HTNV感染期间MAIT细胞的作用和表型 | HFRS患者的CD8+MAIT细胞 | NA | 出血热伴肾综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | HFRS患者的CD8+MAIT细胞 |
| 19639 | 2024-08-05 |
TNFα/TNFR1 signal induces excessive senescence of decidua stromal cells in recurrent pregnancy loss
2023-02, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2022.103776
PMID:36495656
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研究论文 | 本文研究了肿瘤坏死因子α（TNFα）在复发性妊娠损失（RPL）中的作用，尤其是它如何诱导决策基质细胞的过度衰老。 | 本文揭示了TNFα/TNFR1信号通路在RPL患者子宫内膜决策细胞中的作用及其机制，这是以前未被探讨的。 | 目前的研究可能未涵盖所有影响决策细胞衰老的因素，且样本量相对较小。 | 研究TNFα如何通过TNFR1信号通路诱导RPL患者决策细胞的过度衰老。 | 研究对象为复发性妊娠损失患者的决策细胞及正常对照组细胞。 | 数字病理学 | 复发性妊娠损失 | 单细胞测序 | 体外决策化模型 | 细胞 | 6个复发性妊娠损失样本和5个正常对照样本 |
| 19640 | 2024-08-05 |
Genetics in non-alcoholic fatty liver disease: The role of risk alleles through the lens of immune response
2023-02, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2022.0318
PMID:36472053
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综述 | 这篇文章从免疫系统的视角总结了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的遗传学最新进展 | 强调了基因组技术的新应用，包括单细胞测序和基因表达遗传学，以阐明NAFLD/NASH风险等位基因在调节免疫系统细胞中的潜在作用 | NA | 研究NAFLD和NASH相关风险变异在调节免疫驱动的肝病严重性中的潜在作用 | NAFLD和NASH的遗传学及其与免疫反应的关系 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |