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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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19601 | 2024-08-08 |
Decoding Single-cell Landscape and Intercellular Crosstalk in the Transplanted Liver
2023-04-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004365
PMID:36413145
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研究论文 | 本研究通过建立免疫耐受的原位肝移植小鼠模型,利用单细胞RNA测序和时间飞行流式细胞术,揭示了移植肝的细胞景观和细胞间对话 | 本研究首次详细注释了移植肝的细胞景观,并确定了这些细胞在肝移植过程中的动态变化 | NA | 理解移植肝的生理恢复过程和细胞间对话 | 移植肝的细胞复杂性和细胞间对话 | NA | NA | 单细胞RNA测序,时间飞行流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
19602 | 2024-08-05 |
Identification of chondrocyte subpopulations in osteoarthritis using single-cell sequencing analysis
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147063
PMID:36427677
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序分析鉴定了骨关节炎中的软骨细胞亚群 | 研究揭示了骨关节炎中软骨细胞亚群的异质性,并识别出不同亚群的潜在功能 | 未提及具体的样本数量和临床信息 | 研究软骨细胞在骨关节炎中异质性的存在及其功能 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | K-均值聚类 | 细胞数据 | NA |
19603 | 2024-08-05 |
Transcriptional glucocorticoid effects in the brain: Finding the relevant target genes
2023-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13213
PMID:36426812
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研究论文 | 本文讨论了糖皮质激素在大脑中的转录效应及其相关靶基因 | 探讨了MR和GR受体特异性及确定转录结果的上下文因素 | 未提供有关样本大小和具体实验条件的详细信息 | 阐明糖皮质激素在大脑中的跨细胞类型转录效应 | 涉及矿物皮质激素和糖皮质激素受体的靶基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
19604 | 2024-08-05 |
Oligodendrocyte lineage cells: Advances in development, disease, and heterogeneity
2023-02, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15728
PMID:36415921
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综述 | 本综述探讨了寡突胶质细胞前体细胞的不同亚群体、其发育轨迹及在相关疾病中的应用 | 使用单细胞测序技术研究寡突胶质细胞谱系的异质性 | 未提及具体的实验数据和样本规模 | 研究寡突胶质细胞谱系细胞的发育和异质性及其在疾病中的应用 | 寡突胶质细胞谱系的不同亚群体及其发育轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞核测序 (snRNA-seq) | NA | NA | NA |
19605 | 2024-08-08 |
The dynamic cellular landscape of grafts with acute rejection after heart transplantation
2023-02, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2022.10.017
PMID:36411190
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞动态景观 | 揭示了一个新的心脏成纤维细胞亚群,该亚群可能在急性心脏排斥反应中起中介作用 | NA | 探讨心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞动态景观 | 心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠心脏移植样本 |
19606 | 2024-08-08 |
B lymphocytes ameliorate Alzheimer's disease-like neuropathology via interleukin-35
2023-Feb, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2022.11.012
PMID:36427805
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研究论文 | 本研究探讨了B淋巴细胞通过产生白细胞介素-35(IL-35)减轻阿尔茨海默病(AD)样神经病理学的作用 | 首次揭示了B淋巴细胞衍生的IL-35通过抑制前额叶皮质中的Aβ产生,对AD具有潜在治疗作用 | NA | 研究B淋巴细胞在AD病理过程中的作用及其机制 | B淋巴细胞、IL-35、Aβ病理、记忆障碍 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5×FAD小鼠模型及AD患者血液样本 |
19607 | 2024-08-08 |
Two-sample test with g-modeling and its applications
2023-01-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9603
PMID:36412978
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研究论文 | 本文提出了一种结合g-modeling密度估计和两样本Kolmogorov-Smirnov检验的新型两样本检验方法,并应用于生物统计学中的两个案例 | 本文针对观察数据非同分布但与某些同分布的未观察参数相关的情况,提出了一种新的两样本检验程序 | NA | 解决在某些应用中观察数据非同分布但与某些同分布的未观察参数相关的问题 | 两样本比较问题 | 生物统计学 | NA | g-modeling密度估计,两样本Kolmogorov-Smirnov检验 | NA | 数据 | NA |
19608 | 2024-08-08 |
Human spermatogonial stem cells and their niche in male (in)fertility: novel concepts from single-cell RNA-sequencing
2023-01-05, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac245
PMID:36409992
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类男性生殖领域中的应用,特别是关于睾丸细胞在不同发育阶段和男性不育情况下的转录变化 | 提出了关于精原细胞和体细胞亚型及其相互作用的新概念,并提供了相应的标记基因以促进其识别 | 强调了需要空间信息和其他调控层面的验证,如表观遗传或蛋白质水平 | 探讨单细胞RNA测序技术在男性不育研究中的临床应用潜力 | 人类精原干细胞及其在男性不育中的微环境 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数千个睾丸细胞覆盖人类新生儿、青春期前、青春期和成年期以及不同类型的男性不育 |
19609 | 2024-08-05 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [II]: Preparation of Single-Cell cDNA Libraries
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_9
PMID:36418728
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研究论文 | 本文章介绍了生成带条形码的单细胞RNA测序文库的方法 | 提供了用于生成基于液滴的单细胞RNA测序文库的独特方法 | NA | 探讨微头畸形研究中的单细胞RNA测序技术 | 单细胞RNA-seq文库的制备 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | NA |
19610 | 2024-08-05 |
Immune landscape of viral cancers: Insights from single-cell sequencing
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28348
PMID:36436921
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综述 | 本文总结了病毒相关癌症中单细胞测序的免疫浸润和抗肿瘤反应的关键发现 | 通过单细胞测序方法深入分析了病毒引起的肿瘤免疫微环境的变化 | 未提及具体的实验数据和样本分析 | 探索病毒性感染对肿瘤免疫微环境的影响及其为癌症治疗提供的新靶点 | 病毒相关癌症的免疫浸润和抗肿瘤反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
19611 | 2024-08-08 |
Molecular profiles of single circulating tumor cells from early breast cancer patients with different lymph node statuses
2023-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.14728
PMID:36408679
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研究论文 | 本研究利用免疫磁性纳米球捕获早期乳腺癌患者的循环肿瘤细胞(CTCs),并通过提出的bead-dd-seq方法进行单细胞RNA测序,分析CTCs的分子特征及其与淋巴结转移状态的关系 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了早期乳腺癌CTCs的分子特征,并发现了与淋巴结转移状态显著相关的两种CTCs亚型 | 研究样本量较小,仅涉及八名早期乳腺癌患者,可能影响结果的普遍性 | 解析早期乳腺癌患者循环肿瘤细胞的分子特征,以深入理解乳腺癌转移机制 | 早期乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 八名早期乳腺癌患者 |
19612 | 2024-08-08 |
Getting sweeter: new evidence for glucose transporters in specific cell types of the airway?
2023-01-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00140.2022
PMID:36409177
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在气道上皮细胞中葡萄糖转运体表达研究中的应用 | 强调了不同细胞类型中葡萄糖转运体表达的差异及其在细胞代谢和免疫功能中的作用 | 分析的研究数量有限,并非所有研究都报道了完整的葡萄糖转运体范围,且新鲜分离的细胞与体外培养的细胞之间存在差异 | 探讨气道上皮细胞中葡萄糖转运体的表达及其功能 | 气道上皮细胞中的葡萄糖转运体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
19613 | 2024-08-08 |
GeoWaVe: geometric median clustering with weighted voting for ensemble clustering of cytometry data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac751
PMID:36413065
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研究论文 | 本文介绍了一种基于几何中位数聚类和加权投票的集成聚类方法GeoWaVe,用于细胞学数据的聚类分析 | GeoWaVe方法在处理高维质谱和流式细胞学数据时表现优于图集成聚类方法,提供了一种更稳健和可重复的细胞学数据分析、可视化和解释方法 | 目前缺乏专门为细胞学数据分析设计的共识聚类算法 | 旨在克服聚类算法选择对结果的显著影响,通过共识方法直接解决不同算法之间的竞争效应 | 高维质谱和流式细胞学数据 | 生物信息学 | NA | 集成聚类 | 几何中位数聚类 | 细胞学数据 | 不同数据集 |
19614 | 2024-08-08 |
Dissociation of Cerebellar Granule Neuron Progenitors for Culture, FACS, Transcriptomics, and Molecular Biology
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_1
PMID:36418720
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研究论文 | 本文介绍了从小鼠和人类早期新生儿期分离小脑颗粒神经元前体细胞(CGNPs)的方法,并探讨了这些细胞在细胞培养、蛋白质提取、流式细胞术、代谢组分析和单细胞分辨率转录组分析中的应用。 | 本文提供了一种分离CGNPs的方法,这些细胞具有一致的、良好表征的增殖和分化时间模式,便于分析。 | NA | 研究大脑生长与神经前体细胞增殖动力学的关系,并探索这些特定细胞的分子、遗传和功能特性。 | 小脑颗粒神经元前体细胞(CGNPs) | 分子生物学 | NA | 流式细胞术(FACS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 从小鼠和人类新生儿期大脑中采集的CGNPs |
19615 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [I]: Single-Cell Droplet Encapsulation, mRNA Capture, and cDNA Synthesis
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_8
PMID:36418727
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研究论文 | 本文描述了一种基于Drop-Seq方法的单细胞RNA测序技术,用于小头症研究 | 采用纳米级液滴物理分离细胞并同时引入细胞特异性DNA条形码,提高了样本处理的高通量 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在小头症研究中的应用 | 小头症样本组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 最少150,000个细胞,最多可捕获5000个单细胞转录本 |
19616 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [III]: Computational Analysis of scRNA-seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_10
PMID:36418729
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研究论文 | 本文专注于单细胞转录组分析(scRNA-seq)数据的计算分析,特别是从Drop-Seq平台生成的大规模scRNA-seq数据中解析生物信号 | 利用scRNA-seq技术同时探索数千个单细胞的基因表达模式 | NA | 解析从大规模scRNA-seq数据中提取的生物信号 | 单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
19617 | 2024-08-08 |
scRNA-seq for Microcephaly Research [IV]: Dirichlet Regression for Single-Cell Population Differences
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2752-5_11
PMID:36418730
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研究论文 | 本文介绍了使用Dirichlet回归分析单细胞RNA测序数据中细胞组成的差异 | 首次采用Dirichlet回归方法比较不同条件下细胞组成的差异 | 仅限于分析多个生物学重复样本的情况 | 研究微头症中单细胞RNA测序数据的细胞组成变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群差异 | 生物信息学 | 微头症 | scRNA-seq | Dirichlet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 多个生物学重复样本(三个或更多) |
19618 | 2024-08-08 |
High-level of intratumoral GITR+ CD4 T cells associate with poor prognosis in gastric cancer
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105529
PMID:36419848
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了胃癌患者中GITR+ CD4 T细胞的表达模式及其与预后的关系 | 揭示了GITR+ CD4 T细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其与预后的关联,并发现Treg细胞中GITR蛋白的分布受微环境影响 | NA | 探讨GITR在胃癌中的表达模式及其对预后的影响 | 胃癌患者的GITR+ CD4 T细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
19619 | 2024-08-08 |
Expression and regulatory characteristics of peripheral blood immune cells in primary Sjögren's syndrome patients using single-cell transcriptomic
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105509
PMID:36425764
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学技术分析了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞的免疫细胞亚群表达及调控特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞中CD14单核细胞的转录因子表达及目标基因调控情况,并提出了基于表达的CD56CD16 NK细胞分类系统 | 研究样本量较小,仅包括三名患者和三名健康对照 | 探讨原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞亚群的表达及调控特性 | 原发性干燥综合征患者及健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 68,500个外周血单个核细胞,来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康对照 |
19620 | 2024-08-08 |
Neuronal cell types, projections, and spatial organization of the central amygdala
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105497
PMID:36425768
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学和远距离投射映射,对中央杏仁核(CEA)的细胞类型进行了“自下而上”的理解 | 本文识别了两种在先前研究中未被解决的主要细胞类型,并揭示了与表达相关的新型CEA子域 | NA | 研究中央杏仁核的细胞类型、投射和空间组织 | 中央杏仁核的细胞类型和电路 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涵盖了所有CEA神经元的三分之一 |