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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19581 | 2024-08-07 | Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer 
          2023-Dec, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
          
          IF:2.8Q2
          
         
          DOI:10.1007/s12094-023-03194-6
          PMID:37247132
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃腺癌样本,揭示了恶性上皮细胞的分化轨迹及TAGLN2在胃癌腹膜转移中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了从正常黏膜到肿瘤组织再到腹膜转移的发展曲线,并验证了TAGLN2在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 研究样本数量较少,仅基于单一患者的数据 | 探索胃癌腹膜转移的分子机制并寻找潜在的治疗靶点 | 胃腺癌样本,包括原发肿瘤、邻近非肿瘤组织、腹膜转移样本及正常腹膜样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个胃腺癌样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19582 | 2024-08-05 | Constructing a full, multiple-layer interactome for SARS-CoV-2 in the context of lung disease: Linking the virus with human genes and microbes 
          2023-Jul, PLoS computational biology
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pcbi.1011222
          PMID:37410793
         | 研究论文 | 该研究构建了SARS-CoV-2在肺病背景下的完整多层互动组,连接病毒与人类基因和微生物 | 创新性地使用MLCrosstalk模型整合多个来源的数据,以构建SARS-CoV-2感染的全互动组 | 此研究的局限性在于尚未完全验证所有的基因与微生物之间的互动关系 | 研究SARS-CoV-2如何通过人类基因和微生物影响肺部疾病 | 研究对象包括SARS-CoV-2病毒、人类蛋白编码基因、微小RNA以及外源微生物 | 数字病理学 | 肺癌 | 统计建模 | MLCrosstalk | 数据整合 | 涉及多个患者样本的多种数据来源 | NA | NA | NA | NA | 
| 19583 | 2024-08-05 | Single-Cell Discovery and Multiomic Characterization of Therapeutic Targets in Multiple Myeloma 
          2023-04-14, Cancer research
          
          IF:12.5Q1
          
         
          DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1769
          PMID:36779841
         | 研究论文 | 这项研究分析了多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸样本,以发现治疗靶标。 | 研究发现了38个多发性骨髓瘤标记基因,其中11个尚未被认识为治疗靶点。 | 样本量有限可能影响结果的广泛适用性,但结果仍然展示了较高的一致性。 | 旨在开发一种识别肿瘤标记的新策略,以促进靶向癌症治疗的进展。 | 研究对象为41名多发性骨髓瘤患者的53个骨髓抽吸样本。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 41名多发性骨髓瘤患者的53个骨髓抽吸样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19584 | 2024-08-05 | Ethylnitrosourea-induced gliomas: a song in the attic? 
          2023, Aging pathobiology and therapeutics
          
         
          DOI:10.31491/apt.2023.06.111
          PMID:38487310
         | 研究论文 | 这篇文章探讨了乙基亚硝脲诱导的胶质瘤及其相关的分子机制。 | 强调了乙基亚硝脲诱导的胶质瘤模型在理解胶质瘤的发展和干预方法方面的重要性,尽管近年来转基因小鼠模型更为流行。 | 关于乙基亚硝脲诱导的胶质瘤的科学价值相对被低估,可能导致其研究受到限制。 | 旨在揭示胶质瘤发生的分子机制并寻找干预措施以减少胶质瘤的发生和生长。 | 研究对象为乙基亚硝脲诱导的胶质瘤动物模型及其细胞过程。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | 实验鼠胶质瘤模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19585 | 2024-08-07 | 18F-FDG PET Visualizes Systemic STING Agonist-Induced Lymphocyte Activation in Preclinical Models 
          2023-01, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
          
          IF:9.1Q1
          
         
          DOI:10.2967/jnumed.122.264121
          PMID:35738905
         | 研究论文 | 本研究探讨了系统性STING激动剂激活后免疫细胞的代谢变化是否可以通过PET成像技术可视化 | 揭示了STING信号传导与免疫代谢之间先前未知的联系,并提出F-FDG PET可能是一种广泛适用的方法,用于测量系统性STING激动剂的药效学效应 | NA | 研究系统性STING激动剂激活后免疫细胞的代谢变化及其在肿瘤治疗中的应用 | C57BL/6小鼠及携带前列腺或胰腺癌肿瘤的小鼠 | 数字病理学 | 前列腺癌 | F-FDG PET成像 | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术数据 | C57BL/6小鼠及携带前列腺或胰腺癌肿瘤的小鼠 | NA | NA | NA | NA | 
| 19586 | 2024-08-07 | Acute irradiation causes a long-term disturbance in the heterogeneity and gene expression profile of medullary thymic epithelial cells 
          2023, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2023.1186154
          PMID:38022666
         | 研究论文 | 研究急性辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达谱的长期影响 | 首次展示了急性全身辐射对髓质胸腺上皮细胞异质性和基因表达的长期影响 | 研究仅限于急性辐射后的短期观察,未涉及长期恢复过程的详细分析 | 探讨急性辐射后胸腺恢复过程中髓质胸腺上皮细胞亚群的频率和特性是否恢复 | 髓质胸腺上皮细胞及其在胸腺恢复中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个髓质胸腺上皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19587 | 2024-08-07 | Single-cell transcriptional profiling reveals the heterogeneity in embryonal rhabdomyosarcoma 
          2021-Aug-06, Medicine
          
          IF:1.3Q2
          
         
          DOI:10.1097/MD.0000000000026775
          PMID:34397824
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析胚胎型横纹肌肉瘤的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胚胎型横纹肌肉瘤的细胞异质性和进化轨迹 | NA | 探究胚胎型横纹肌肉瘤的异质性、起源和病因 | 胚胎型横纹肌肉瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 儿童软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个肿瘤组织细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 19588 | 2024-08-07 | Cardiac Fibroblast Diversity 
          2020-02-10, Annual review of physiology
          
          IF:15.7Q1
          
         | 综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞的多样性和功能,并介绍了通过谱系追踪和单细胞测序技术在发育、成年和疾病状态下对这些细胞异质性的新见解 | 本文通过谱系追踪和单细胞测序技术揭示了心脏成纤维细胞在不同状态下的异质性 | NA | 探讨心脏成纤维细胞的多样性,为开发治疗心脏纤维化的新疗法提供基础 | 心脏成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19589 | 2024-08-04 | Single-cell division tracing and transcriptomics reveal cell types and differentiation paths in the regenerating lung 
          2024-Mar-12, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-024-46469-4
          PMID:38472236
         | 研究论文 | 本研究结合小鼠模型和单细胞转录组学,揭示了再生肺的细胞类型和分化路径 | 首次展示了Krt13基底细胞与Krt15俱乐部细胞之间的中间细胞状态,并揭示了腺泡细胞作为积极分裂的前体细胞 | 未提及具体的样本数量和实验限制 | 理解肺上皮再生中的分子和细胞过程,以促进肺疾病的治疗方法发展 | 特定上皮细胞类型的损伤小鼠模型,细胞分裂功能标记细胞和单细胞转录组学 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19590 | 2024-08-07 | Combined IL6 and CCR2 blockade potentiates antitumor activity of NK cells in HPV-negative head and neck cancer 
          2024-Mar-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
          
          IF:11.4Q1
          
         
          DOI:10.1186/s13046-024-03002-1
          PMID:38468260
         | 研究论文 | 本研究探讨了在HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌中,联合阻断IL6和CCR2通路对NK细胞抗肿瘤活性的增强作用 | 首次展示了在HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌中,通过联合阻断IL6和CCR2通路可以有效增强NK细胞的抗肿瘤活性 | NA | 探索增强NK细胞在HPV阴性头颈部鳞状细胞癌中的抗肿瘤活性的新治疗方法 | HPV阴性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用了HPV阳性和阴性的头颈部鳞状细胞癌细胞系及同种异体小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 19591 | 2024-08-07 | Single-cell integrative analysis reveals consensus cancer cell states and clinical relevance in breast cancer 
          2024-Mar-12, Scientific data
          
          IF:5.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41597-024-03127-0
          PMID:38472225
         | 研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序数据,揭示了乳腺癌中跨患者复现的七种共识癌细胞状态及其临床相关性 | 首次系统地阐明了共识癌细胞状态的生物学功能、亚型特异性分布、潜在起源细胞及其相互关系,并揭示了肿瘤微环境中内部调节子和外部细胞成分对这些状态的贡献 | NA | 揭示乳腺癌中常见的癌细胞状态及其驱动因素,并探索其与临床结果的关联 | 乳腺癌中的癌细胞状态及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个独立数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 19592 | 2024-08-07 | Decoding gene regulatory circuitry underlying TNBC chemoresistance reveals biomarkers for therapy response and therapeutic targets 
          2024-Mar-12, NPJ precision oncology
          
          IF:6.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41698-024-00529-6
          PMID:38472332
         | 研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据,揭示了三阴性乳腺癌(TNBC)化疗耐药性的基因调控机制,并发现了潜在的治疗反应生物标志物和治疗靶点 | 本研究首次通过单细胞转录组数据和全基因组H3K27ac标记映射,揭示了TNBC化疗耐药性的表观遗传和转录因子网络 | NA | 揭示三阴性乳腺癌化疗耐药性的分子机制,并发现新的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者及其化疗耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19593 | 2024-08-04 | Single-cell RNA sequencing reveals critical modulators of extracellular matrix of penile cavernous cells in erectile dysfunction 
          2024-03-11, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41598-024-56428-0
          PMID:38467692
         | 研究论文 | 这项研究揭示了勃起功能障碍(ED)中阴茎海绵细胞外基质的关键调节因子 | 该研究首次利用单细胞RNA测序描绘了ED中阴茎海绵细胞的转录组图谱,并揭示了细胞与细胞之间的相互作用 | 该研究可能未能完全阐明所有细胞类型之间的相互作用和复杂性 | 研究ED与细胞外基质(ECM)之间的关系 | 分析ED与非ED样本中82,554个海绵单细胞的转录组特征 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 82,554个海绵单细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 19594 | 2024-08-04 | Identification of robust cellular programs using reproducible LDA that impact sex-specific disease progression in different genotypes of a mouse model of AD 
          2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.02.26.582178
          PMID:38464087
         | 研究论文 | 本文开发了一个可重复的LDA(rLDA)包,以识别影响老年痴呆症小鼠不同基因型的性别特异性疾病进展的细胞程序 | 提出了Topyfic,一个可重复的LDA包,能够更准确地推断单细胞数据中细胞程序的身份和活性 | LDA的可解释性受制于超参数选择及随机初始化导致的主题定义变异性 | 识别在单细胞RNA-seq数据分析中活跃的细胞程序 | 研究老年痴呆症小鼠模型中不同基因型的细胞类型及其状态 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LDA | 基因表达数据 | 使用了两种5xFAD小鼠模型的脑单细胞和单核数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 19595 | 2024-08-04 | Comprehensive analysis of the effects of the cuprotosis-associated gene SLC31A1 on patient prognosis and tumor microenvironment in human cancer 
          2024-Feb-29, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-23-1308
          PMID:38482443
         | 研究论文 | 本研究分析了SLC31A1基因在多种癌症中的表达与预后及肿瘤微环境的关系 | 提出SLC31A1作为癌症能量代谢相关的潜在靶点,提供新的治疗方向 | 未详细探讨不同癌症中SLC31A1的具体功能机制 | 探索SLC31A1在癌症中的生物功能及其预后价值 | 分析SLC31A1在多种癌症中的表达、突变、甲基化及免疫细胞浸润等 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、RT-qPCR、WB | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症组织的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19596 | 2024-08-04 | The integration of bulk and single-cell sequencing data revealed the function of FKBP10 in the gastric cancer microenvironment 
          2024-Feb-29, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-23-1484
          PMID:38482445
         | 研究论文 | 本研究揭示了FKBP10在胃癌微环境中的功能 | 整合了散装和单细胞测序数据,提供了FKBP10及其共表达基因在肿瘤微环境中的影响 | 未提及具体限制 | 研究FKBP10在胃癌微环境中的表达和功能 | 胃癌细胞及其微环境中的相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | qRT-PCR、单细胞和散装测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19597 | 2024-08-07 | Identification of fatty acid oxidation-related subtypes by integrated analysis of bulk- and single-cell transcriptome profiling in colorectal cancer 
          2024-Feb-29, Journal of gastrointestinal oncology
          
          IF:2.0Q3
          
         
          DOI:10.21037/jgo-23-833
          PMID:38482228
         | 研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞转录组数据,识别了结直肠癌中与脂肪酸氧化(FAO)相关的亚型。 | 本研究首次揭示了结直肠癌患者中FAO水平的基因组模式,并构建了FAO相关基因评分(GFAO_Score),有助于精准筛选患者并优化临床策略。 | NA | 研究结直肠癌中脂肪酸氧化的分子生物化学特征及其相互作用机制。 | 结直肠癌患者的脂肪酸氧化水平及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库中的结直肠癌患者。 | NA | NA | NA | NA | 
| 19598 | 2024-08-07 | Disulfidptosis-related genes of prognostic signature and immune infiltration features in hepatocellular carcinoma supported by bulk and single-cell RNA sequencing data 
          2024-Feb-29, Journal of gastrointestinal oncology
          
          IF:2.0Q3
          
         
          DOI:10.21037/jgo-23-949
          PMID:38482234
         | 研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌的癌症基因组图谱-肝细胞癌和基因表达综合数据库数据,识别与硫化物应激相关的关键基因,并探讨其在肝细胞癌预后和免疫浸润中的作用 | 首次探讨了硫化物应激相关基因在肝细胞癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | NA | 研究硫化物应激相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫治疗作用 | 肝细胞癌患者的基因表达数据和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱-肝细胞癌和基因表达综合数据库的数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 19599 | 2024-08-07 | Tumoral C2 Regulates the Tumor Microenvironment by Increasing the Ratio of M1/M2 Macrophages and Tertiary Lymphoid Structures to Improve Prognosis in Melanoma 
          2024-Feb-23, Cancers
          
          IF:4.5Q1
          
         
          DOI:10.3390/cancers16050908
          PMID:38473271
         | 研究论文 | 本研究通过多维分析转录组数据,探讨了C2在黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境的调节机制 | 首次发现C2水平的上调与黑色素瘤的良好预后相关,并能增强M1巨噬细胞的招募和极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需要进一步的人体临床试验验证 | 探究C2在黑色素瘤中的作用及其对免疫治疗效果的影响 | C2在黑色素瘤中的表达及其对肿瘤微环境和免疫细胞的影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 转录组分析、免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了C57BL/6小鼠构建的皮下肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 19600 | 2024-08-07 | Identification of bZIP Transcription Factors That Regulate the Development of Leaf Epidermal Cells in Arabidopsis thaliana by Single-Cell RNA Sequencing 
          2024-Feb-22, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
          DOI:10.3390/ijms25052553
          PMID:38473801
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了拟南芥叶片表皮细胞的转录组特征,并鉴定了两个bZIP转录因子基因在调控表皮细胞发育中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了拟南芥叶片表皮细胞中bZIP转录因子的表达模式及其在细胞发育中的调控作用 | 研究仅限于3天龄的拟南芥真叶,未涵盖其他发育阶段的叶片 | 探究拟南芥叶片表皮细胞发育的转录调控机制 | 拟南芥叶片表皮细胞中的bZIP转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3天龄的拟南芥真叶中的表皮细胞 | NA | NA | NA | NA |