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当前共找到 39582 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2026-04-30 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adl1988
PMID:40997217
|
研究论文 | 本研究结合全基因组表观组图谱、表观基因组编辑、表型及单细胞RNA测序CRISPR筛选，发现了一类对机械微环境响应的基因组增强子，并探究其如何通过表观遗传调控影响细胞功能及疾病相关基因 | 首次鉴定出对细胞外基质软硬度响应的“机械增强子”，并通过表观遗传编辑重编程细胞对机械微环境的响应 | 未提及具体局限性 | 探究机械微环境如何通过表观遗传状态调控转录，并识别响应机械信号的基因组增强子 | 肺成纤维细胞（来自健康及纤维化供体） | 表观遗传学、单细胞组学 | 纤维化疾病 | 全基因组表观组学、表观基因组编辑、单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | 表观组数据、单细胞转录组数据 | 健康及纤维化供体的肺成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1942 | 2026-04-30 |
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2025-12, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287463
PMID:39639676
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体 | 首次利用CRISPR-Cas9标记的类器官模型结合单细胞RNA测序，系统绘制人类小肠肠内分泌细胞图谱，并揭示不同细胞亚型的激素、营养感应机制及转录因子的差异表达 | 未提及具体局限性，但类器官模型可能无法完全模拟体内微环境 | 利用单细胞RNA测序绘制人类小肠肠内分泌细胞图谱，比较不同细胞类型的分子特征 | 人类十二指肠和回肠类器官来源的肠内分泌细胞（EECs） | 单细胞转录组学 | 糖尿病、肥胖、肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR-Cas9 | 细胞类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 人类十二指肠和回肠类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞RNA测序平台 |
| 1943 | 2026-04-30 |
Spatial Dynamics of Tumor Cell Plasticity in Lung Adenocarcinoma Revealed by Region-Specific Single Cell Transcriptomics
2025-12, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70101
PMID:41454525
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研究论文 | 通过区域特异性单细胞转录组学揭示肺腺癌中肿瘤细胞可塑性的空间动态 | 首次在单个肺腺癌肿瘤的不同区域（核心、核心旁、边缘）进行单细胞RNA测序，系统刻画了EMT和干性特征的空间异质性，并发现与预后相关的生物标志物PCBP1和PA2G4 | 样本仅来自单个肺腺癌患者，可能限制了结论的普适性；EMT与干性之间的相关性较弱（R=0.17），需进一步验证 | 研究肺腺癌中肿瘤细胞可塑性（EMT和干性）的空间分布及其与预后的关联 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本（10个肿瘤片段来自3个区域） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1例肺腺癌患者的10个肿瘤片段（核心、核心旁、边缘各若干个） | BGI | 单细胞RNA测序 | SURFSeq 5000 | BGI SURFSeq 5000测序平台进行单细胞RNA测序 |
| 1944 | 2026-04-30 |
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01961-4
PMID:41291215
|
research paper | 本研究通过单细胞测序和转录组分析揭示了单核细胞/巨噬细胞衍生的NLRP3通过NOD样受体通路促进强直性脊柱炎的发病和进展 | 首次通过单细胞测序分析强直性脊柱炎患者骨髓样本，明确单核细胞-巨噬细胞-炎症性巨噬细胞分化轨迹，并识别NLRP3的核心作用及上游调控因子 | 未提及具体局限性 | 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 | 从强直性脊柱炎患者和骨折对照患者收集的骨髓样本 | machine learning | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序, 转录组分析 | NA | 单细胞数据, 转录组数据 | 强直性脊柱炎患者与骨折对照患者的骨髓样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1945 | 2026-04-30 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示HIV感染早期后结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与失调 | 首次纵向研究HIV感染前后Mtb特异性CD4 T细胞的单细胞RNA测序，揭示早期感染后Th1/Th17细胞优先耗竭及转录调控异常 | 未提及具体局限性 | 评估HIV感染对Mtb特异性CD4 T细胞频率和功能的影响 | HIV阳性与阴性个体中的Mtb特异性CD4 T细胞 | 单细胞转录组学 | 结核病、HIV感染 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 部分个体在HIV感染前后进行纵向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1946 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA-sequencing of BCG naïve and recurrent non-muscle invasive bladder cancer reveals a CD6/ALCAM-mediated immune-suppressive pathway
2025-Sep-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01093-3
PMID:41006678
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BCG初治和复发性非肌层浸润性膀胱癌，揭示CD6/ALCAM介导的免疫抑制通路 | 首次发现CD6/ALCAM信号通路与BCG耐药性之间的关联，并指出该通路可作为增强BCG疗效的潜在治疗靶点 | 未明确说明局限性，样本量可能有限，且需进一步验证CD6/ALCAM信号在其他队列中的普适性 | 探究BCG治疗抵抗背后的免疫机制，以改善复发非肌层浸润性膀胱癌的治疗效果 | BCG初治和复发性非肌层浸润性膀胱癌患者的肿瘤组织 | 单细胞组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全外显子测序 | NA | 基因表达数据、外显子变异数据 | 多个NMIBC患者样本（具体数量未提供），包括BCG治疗前后 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq |
| 1947 | 2026-04-30 |
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115222
PMID:40113007
|
研究论文 | 通过开放数据方法重新定义脊髓损伤后巨噬细胞表型 | 利用三种公开单细胞RNA测序数据集进行跨数据集比较，采用无偏分析方法识别出脊髓损伤后四种保守的巨噬细胞群体 | 未提及具体局限性，但可能包括样本仅限于年轻雌性小鼠，且仅分析损伤后7天的时间点 | 利用公开单细胞RNA测序数据重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的异质性 | 脊髓损伤后7天的年轻雌性小鼠 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat分析流程、SingleR跨数据集比较工具 | 基因表达数据 | 三个独立研究团队的数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1948 | 2026-04-30 |
SlideCNA: spatial copy number alteration detection from Slide-seq-like spatial transcriptomics data
2025-May-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03573-y
PMID:40317049
|
研究论文 | SlideCNA是一种从Slide-seq类空间转录组数据中检测空间拷贝数变异（CNA）的计算工具 | 利用表达感知的空间分箱方法克服数据稀疏性，从近单细胞分辨率的空间转录组数据中提取拷贝数变异信号，实现空间亚克隆检测 | 未提及具体局限性 | 开发从稀疏空间转录组数据中检测拷贝数变异的方法，以揭示实体瘤的遗传空间异质性 | 模拟数据和真实Slide-seq数据（转移性乳腺癌样本） | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, RNA-seq | 分箱算法 | 空间基因表达数据 | 模拟数据和真实乳腺癌数据 | 未指定平台公司 | 空间转录组学（Slide-seq类） | Slide-seq | 近单细胞分辨率的空间转录组数据 |
| 1949 | 2026-04-30 |
Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia
2025-05, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70051
PMID:40346907
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞，揭示前列腺癌与良性前列腺增生的转录组学差异 | 首次利用单细胞转录组学方法系统比较前列腺癌与良性前列腺增生患者外周血单核细胞的免疫细胞亚群及基因表达差异，发现CD14+单核细胞、NK细胞和γδT细胞在前列腺癌中显著升高，并鉴定出多个潜在生物标志物 | 样本量较小，仅包含4例前列腺癌和3例良性前列腺增生患者，且未进行功能验证 | 探究前列腺癌与良性前列腺增生在外周血单核细胞水平的分子差异，寻找区分两种疾病的潜在生物标志物 | 4例前列腺癌患者和3例良性前列腺增生患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例外周血样本（4例前列腺癌，3例良性前列腺增生） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1950 | 2026-04-30 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
|
综述 | 本文更新并扩展了关于心脏病分子和细胞神经生物学的基础，重点讨论了心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经损伤，通过空间转录组学和新型成像技术发现治疗心脏自主神经功能障碍的分子靶点 | 文中强调了尚未解答的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏病的分子和细胞神经心脏学机制及治疗潜力 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1951 | 2026-04-30 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理模型的计算库 | 首次利用单神经元转录组数据构建心脏内在神经系统神经元电生理模型计算库，通过循环阈值选择离子通道组合，结合被动电学特性约束模型参数，成功预测了与实验观察一致的神经元相位和强直反应分布 | 未明确提及 | 构建心脏内在神经系统神经元电生理多尺度计算模型，研究其在心脏调节和病理中的功能作用 | 心脏内在神经系统（ICNS）神经元 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞转录组数据中的ICNS神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1952 | 2026-04-30 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
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研究论文 | 通过跨物种分析胸腺模拟细胞，揭示其演化古老起源及保守与物种特异性特征 | 首次对人类儿童胸腺模拟细胞进行单细胞RNA测序，并与小鼠和斑马鱼数据整合，发现保守的演化特征和物种特异性适应 | 未明确说明局限性 | 探究胸腺模拟细胞的跨物种保守性与物种特异性，及其在自身免疫中的潜在作用 | 人类儿童、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类儿童捐献者（具体数量未说明），小鼠和斑马鱼样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1953 | 2026-04-30 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
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研究论文 | 通过基因组规模代谢模型分析上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 结合时间序列转录组、蛋白质组和单细胞转录组数据，利用基因组规模代谢模型揭示了EMT过程中糖酵解和谷氨酰胺代谢的时序依赖性，并验证了烯醇酶3的亚型特异性依赖 | 未提及 | 阐明上皮-间质转化（EMT）过程中的代谢网络重编程及其动态依赖性 | TGF-β刺激的细胞培养模型中的EMT过程 | 机器学习 | 肺腺癌 | 基因组规模代谢建模 | 基因组规模代谢模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 多个公共EMT时间序列转录组、蛋白质组和单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1954 | 2026-04-30 |
Spatial and temporal expression analysis of BMP signal modifiers, Smoc1 and Smoc2, from postnatal to adult developmental stages in the mouse testis
2024-12, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119383
PMID:39510490
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research paper | 研究小鼠睾丸从出生后到成年发育阶段中BMP信号调节因子Smoc1和Smoc2的时空表达 | 首次分析了Smoc1和Smoc2在出生后睾丸中的时空表达模式，揭示其在雄性生殖细胞和支持细胞中的差异表达 | 未探讨Smoc1和Smoc2在生殖过程中的具体功能机制 | 阐明Smoc1和Smoc2在小鼠睾丸发育和精子发生中的表达动态 | 小鼠（新生、幼年和成年）的睾丸组织 | machine learning | NA | RNA原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠睾丸样本，涵盖新生、幼年和成年阶段 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 1955 | 2026-04-30 |
Expression of ABC transporters in the Drosophila testis stem cell niche: Comparison of two approaches
2024-12, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119386
PMID:39638273
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研究论文 | 研究了果蝇睾丸干细胞微环境中ABC转运蛋白的表达，并比较了两种方法的结果 | 首次在果蝇睾丸这一干细胞微环境模型中系统筛选ABC转运蛋白的表达，并对比增强子/基因陷阱筛选与单细胞测序两种方法的相关性 | 两种方法结果相关性较弱，提示单一技术可能不足以准确反映基因表达 | 探讨ABC转运蛋白在果蝇睾丸干细胞微环境中的表达模式 | 果蝇睾丸干细胞微环境 | 机器学习 | NA | 增强子/基因陷阱筛选、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1956 | 2026-04-30 |
Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.19.590370
PMID:38895328
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了酵母和细菌中单细胞核糖体含量的异质性及其对生长法则的影响 | 首次在单细胞水平上研究生长法则，发现单细胞核糖体含量与生长速率并不紧密相关，挑战了传统群体平均水平下的生长法则模型 | 仅研究了两种微生物，可能不适用于所有物种；未深入探讨引起单细胞核糖体含量变异的分子机制 | 探究单细胞水平的核糖体含量异质性及其与生长速率的关系，评估生长法则在单细胞层面的适用性 | 酿酒酵母（真核单细胞生物）与细菌（原核生物）中的单细胞 | 机器学习和生物信息学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | 来自多种条件、重复和物种的数千个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1957 | 2026-04-30 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532947
PMID:36993595
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研究论文 | mosna是一个Python包，用于分析空间组学数据并整合临床数据，以揭示与免疫治疗反应和癌症生存相关的细胞相互作用模式 | 开发了一个与所有空间组学方法兼容的Python包，能够整合多种算法并利用临床数据构建准确的空间网络，无缝训练机器学习模型并识别最具预测力的变量 | NA | 使空间组学数据与临床或生物数据的集成分析更加易于进行，从而获得对细胞相互作用模式或组织结构的生物学洞察 | 空间组学数据产生的数据集，包括亚细胞分辨转录组学（MERFISH、seqFISH）、蛋白质组学（CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光）以及基于斑点的空间转录组学（10x Visium） | 计算机视觉 | 癌症 | 空间组学 | 机器学习 | 模态数据（空间组学数据与临床数据） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1958 | 2026-04-30 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了PERCEPTION计算流程，利用单细胞转录组数据预测癌症患者治疗反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量与单细胞表达谱构建个性化治疗反应模型，并成功在多个临床试验中验证 | NA | 开发基于单细胞转录组的精准肿瘤学计算工具，实现患者分层与治疗优化 | 培养细胞、患者肿瘤来源的原代细胞、多发性骨髓瘤和乳腺癌临床试验样本、肺癌患者 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤, 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 大规模细胞系药物筛选数据及多个临床队列 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1959 | 2026-04-30 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 该研究揭示肿瘤细胞PD-L1通过与髓系细胞PD-1结合，激活SHP2抑制I型干扰素信号通路，从而削弱细胞毒性T淋巴细胞向肺转移灶的募集，促进肿瘤免疫逃逸 | 首次发现肿瘤PD-L1并非直接抑制T细胞活性，而是通过髓系PD-1介导的SHP2-IFN-I-STAT1-CXCL9信号轴调控CTL募集，并证实该机制在肺转移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅显示相关性，未完全验证机制；未阐明其他肿瘤模型或器官转移中的普适性 | 阐明肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中通过髓系细胞介导的分子机制 | 肿瘤细胞（PD-L1）、髓系细胞（PD-1）、细胞毒性T淋巴细胞、小鼠肺转移模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（未明确具体数量）；人癌症患者样本（数量未指定） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1960 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |