单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2025-10-06 |
Partial Reprogramming in Senescent Schwann Cells Enhances Peripheral Nerve Regeneration via Restoration of Stress Granule Homeostasis
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511019
PMID:40899516
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示部分重编程通过恢复衰老雪旺细胞中应激颗粒稳态来增强周围神经再生的机制 | 首次发现部分重编程可通过恢复应激颗粒稳态来逆转衰老雪旺细胞的功能障碍，揭示Runx2细胞群在年龄相关神经再生缺陷中的关键作用 | 研究主要聚焦于雪旺细胞，其他神经细胞类型在部分重编程中的作用尚未完全探索 | 探究部分重编程对衰老个体周围神经再生的影响及分子机制 | 年轻和老年大鼠的雪旺细胞及坐骨神经损伤模型 | 单细胞转录组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年大鼠的雪旺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1942 | 2025-10-06 |
Enhancer Reprogramming Reveals the Tumorigenic Role of PTPRZ1 in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509344
PMID:40899632
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肺鳞状细胞癌中增强子重编程的机制，并确定了PTPRZ1-MDK轴作为关键致癌通路 | 首次整合单细胞表观基因组和空间转录组学技术，系统识别了肺鳞癌中3,447个肿瘤特异性致癌增强子，并发现PTPRZ1-MDK信号轴的关键作用 | 样本量相对有限（59对匹配样本），研究主要聚焦于肺鳞癌，未涵盖其他肺癌亚型 | 识别肺鳞状细胞癌的新型致癌驱动因子和表观遗传脆弱性 | 59对匹配的肺鳞癌肿瘤组织和癌旁正常组织 | 表观遗传学 | 肺癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 多组学整合分析 | 基因组学数据, 表观基因组学数据, 转录组学数据, 空间转录组数据 | 59对匹配的肺鳞癌肿瘤和正常组织样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 1943 | 2025-10-06 |
Inhibiting SLC38A2 lowers blood pressure in rodent models of hypertension
2025-Sep-03, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt5947
PMID:40901922
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抑制剂实验发现SLC38A2是血压调节的关键因子，并验证其抑制剂在高血压动物模型中的降压效果 | 首次发现SLC38A2通过调节内皮细胞谷氨酰胺摄取和NO信号通路调控血压，并在人群队列中验证其基因变异与高血压风险相关 | 研究主要基于啮齿类动物模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索SLC38A2在血压调节中的作用机制及其作为高血压治疗靶点的潜力 | 基因敲除小鼠、高血压小鼠和大鼠模型、中国和欧洲人群队列 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、抑制剂干预 | NA | 基因表达数据、血压测量数据、临床队列数据 | 多种啮齿类动物模型和两个独立人群队列（中国队列和英国生物银行欧洲队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1944 | 2025-10-06 |
ScisTree2 enables large-scale inference of cell lineage trees and genotype calling using efficient local search
2025-Sep-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280542.125
PMID:40903391
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研究论文 | 介绍ScisTree2这一基于高效局部搜索方法的大规模细胞谱系树推断和基因型调用工具 | 首个能够处理数万细胞或更多数据集的基于模型的细胞谱系树推断和基因型调用方法 | NA | 开发能够从大规模单细胞数据中准确推断细胞谱系树和基因型的方法 | 多细胞生物中的细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 无限位点模型 | 单细胞测序数据 | 数万细胞或更多 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1945 | 2025-10-06 |
Accurately Predicting Cell Type Abundance from Spatial Histology Image Through HPCell
2025-Sep-03, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00757-9
PMID:40903657
|
研究论文 | 提出HPCell深度学习框架，直接从H&E染色组织学图像预测细胞类型丰度 | 首个直接从组织学图像估计细胞类型丰度的深度学习方法，结合病理基础模块、超图模块和Transformer模块 | 未提及具体性能限制或适用范围限制 | 开发从空间组织学图像准确预测细胞类型丰度的计算方法 | 空间转录组学数据集和H&E染色全切片图像 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | Transformer, 超图神经网络 | 组织学图像, 空间转录组数据 | 多个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1946 | 2025-10-06 |
Applications of single-cell transcriptomics: updated insights in endometrial cancer
2025-Sep-03, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04032-7
PMID:40903692
|
综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌研究中的应用进展 | 系统整合单细胞转录组学在揭示子宫内膜癌肿瘤微环境异质性和细胞间相互作用的最新发现 | NA | 总结单细胞转录组学在子宫内膜癌研究中的应用价值 | 子宫内膜癌肿瘤微环境中的上皮细胞、基质细胞、内皮细胞和免疫细胞 | 单细胞组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1947 | 2025-10-06 |
GPC2-Targeted CAR T Cells Engineered with NFAT-Inducible Membrane-Tethered IL15/IL21 Exhibit Enhanced Activity against Neuroblastoma
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0975
PMID:40569285
|
研究论文 | 本研究开发了NFAT诱导型膜锚定IL15/IL21增强的GPC2靶向CAR-T细胞，用于治疗高负荷神经母细胞瘤 | 首次采用NFAT诱导型膜锚定IL15/IL21细胞因子表达系统增强CAR-T细胞功能，相比传统组成型表达具有更好的安全性和有效性 | 研究仅在小鼠模型中进行，需要进一步临床验证；样本量有限 | 优化CAR-T细胞治疗策略，提高对高负荷神经母细胞瘤的疗效并降低毒性 | 神经母细胞瘤小鼠模型和工程化CAR-T细胞 | 免疫治疗 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，CAR-T细胞工程，动物模型实验 | CAR-T细胞治疗模型 | 基因表达数据，动物实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1948 | 2025-10-06 |
PIEZO1 Overexpression in Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia Arteriovenous Malformations
2025-Sep-02, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PIEZO1在遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中过度表达，并通过基因和药理学方法验证其抑制作用 | 首次揭示PIEZO1在ALK1缺陷型动静脉畸形中的关键作用，并证明其抑制可减轻血管畸形形成 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索ALK1变异导致的信号通路改变及动静脉畸形形成机制 | ALK1基因敲除小鼠视网膜内皮细胞和人类2型遗传性出血性毛细血管扩张症病变组织 | 单细胞测序 | 遗传性出血性毛细血管扩张症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1949 | 2025-10-06 |
Early immune response to Coccidioides is characterized by robust neutrophil and fibrotic macrophage recruitment and differentiation
2025-Sep-02, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00442-25
PMID:40704794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠模型中早期对球孢子菌的免疫反应，揭示了中性粒细胞和巨噬细胞的募集与分化特征 | 首次发现炎症性PD-L1中性粒细胞和真菌接触依赖性促纤维化Spp1巨噬细胞在早期免疫应答中的关键作用 | 使用高剂量减毒菌株的小鼠模型可能无法完全模拟人类自然感染过程 | 阐明球孢子菌病早期免疫应答机制及宿主-病原体相互作用 | 小鼠肺部免疫细胞 | 免疫学 | 球孢子菌病（山谷热） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1950 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of bronchoalveolar lavage during early SARS-CoV-2 infection
2025-Sep-02, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02715-24
PMID:40742121
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究SARS-CoV-2感染早期支气管肺泡灌洗液的免疫反应特征 | 首次在非人灵长类动物模型中利用单细胞RNA测序技术揭示SARS-CoV-2感染早期（0-3天）支气管肺泡灌洗液的免疫细胞动态变化和信号通路激活 | 研究样本量有限，仅使用非人灵长类动物模型，未涉及人类样本验证 | 探究SARS-CoV-2感染早期的免疫应答机制和疾病进展规律 | 恒河猴支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 恒河猴感染后0-3天的支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1951 | 2025-10-06 |
Tumor-Specific MHC-II Activates CD4+ and CD8+ T Cells in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma to Boost Immunotherapy Efficacy
2025-Sep-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4383
PMID:40540325
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和T细胞受体测序，发现肿瘤特异性MHC-II是头颈鳞状细胞癌新辅助免疫治疗反应的优越预测标志物 | 首次发现肿瘤特异性MHC-II通过激活CD4+和CD8+T细胞、诱导趋化因子CCL5来增强PD-1阻断疗效的新机制 | 研究基于II期临床试验前的活检样本，样本量有限且需要更大规模验证 | 探索头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应的生物标志物和机制 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤活检样本 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | II期临床试验前的HNSCC活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1952 | 2025-10-06 |
Tumor-associated Schwann cell remodeling under metabolic stress via lactate sensing orchestrates pancreatic ductal adenocarcinoma development
2025-Sep-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.07.008
PMID:40803319
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸驱动的肿瘤相关雪旺细胞重塑在糖尿病胰腺导管腺癌免疫抑制中的关键作用 | 发现乳酸-METTL16-CTCF轴将代谢应激与表观转录组重编程和免疫逃逸联系起来 | 回顾性分析可能受限于样本选择和临床数据完整性 | 探索糖尿病促进胰腺癌发展的分子机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)和肿瘤相关雪旺细胞(TASCs) | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1953 | 2025-10-06 |
Characterizing Stroke Clots Using Single-Cell Sequencing
2025-Sep-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.041738
PMID:40878981
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析缺血性卒中患者的血栓样本，揭示不同病因血栓中的免疫细胞组成和基因表达差异 | 首次在卒中血栓中应用单细胞RNA测序技术，比较心房颤动和颈动脉粥样硬化两种病因血栓的免疫细胞特征和基因表达谱 | 样本量较小（仅10个血栓样本），需要更大规模研究验证发现 | 探索卒中血栓的细胞组成和基因表达特征，识别潜在的生物标志物和疾病机制 | 大血管闭塞性卒中患者的血栓样本 | 单细胞测序 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，多标记基因组注释分析，全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | 10个卒中患者血栓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1954 | 2025-10-06 |
Podocyte-Specific Deletion of STAT3 in KLF4-Related Experimental Podocytopathy
2025-Sep-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000841
PMID:40880189
|
研究论文 | 本研究通过构建特异性敲除STAT3和KLF4的小鼠模型，证明抑制足细胞特异性STAT3信号可抵消KLF4缺失的有害影响 | 首次在足细胞特异性KLF4缺失模型中验证STAT3信号通路的关键作用，并利用人类肾脏活检数据验证临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探究STAT3信号在KLF4相关实验性足细胞病中的特异性作用机制 | 基因工程小鼠模型和人类肾脏活检样本 | 分子生物学 | 局灶节段性肾小球硬化症 | 基因敲除技术,单细胞RNA测序,批量RNA测序,细胞类型比例反卷积分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理学数据 | 基因工程小鼠模型和人类肾脏活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1955 | 2025-10-06 |
Upregulation of EMP3 in acute myeloid leukemia: a study based on data mining, RT-qPCR and immunohistochemistry
2025-Sep-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03368-4
PMID:40890490
|
研究论文 | 通过数据挖掘、RT-qPCR和免疫组化研究EMP3在急性髓系白血病中的上调表达及其临床意义 | 首次系统评估EMP3在AML中的表达模式，通过多组学方法揭示其与预后的关联及潜在分子机制 | 研究主要基于公共数据集和有限样本验证，需要更大规模的前瞻性研究确认临床价值 | 阐明EMP3在急性髓系白血病中的表达特征和临床预后意义 | 急性髓系白血病患者样本和健康供体对照 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 数据挖掘, RT-qPCR, 免疫组化, WGCNA, 单细胞RNA测序, 免疫浸润评估, 通路富集分析 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 未明确具体样本数量，包含公共数据集和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1956 | 2025-10-06 |
Machine learning analysis reveals tumor heterogeneity and stromal-immune niches in breast cancer
2025-Sep-02, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-01967-7
PMID:40897851
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq反卷积分析，揭示乳腺癌肿瘤异质性和基质-免疫微环境特征 | 首次系统识别了低级别肿瘤中富集的CXCR4+成纤维细胞、IGKC+髓系细胞和CLU+内皮细胞等亚型，并发现其与免疫治疗反应性降低的悖论关系 | 未明确说明样本来源和具体样本量，缺乏对治疗反应性的直接实验验证 | 解析乳腺癌肿瘤异质性和肿瘤微环境特征 | 乳腺癌(BRCA)样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq反卷积 | 机器学习分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1957 | 2025-10-06 |
Clustering Single-Cell RNA-Seq Data with Low-Rank Matrix Factorization and Local Graph Regularization
2025-Sep-02, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00762-y
PMID:40897868
|
研究论文 | 提出一种结合低秩矩阵分解与局部图正则化的单细胞RNA测序数据聚类算法LRMGC | 采用三分解策略获取对齐核心矩阵，应用Schatten p-范数增强抗噪能力，通过局部流形正则化保持高维数据的子空间结构 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩矩阵分解, 图正则化 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1958 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing and artificial intelligence for multitargeted drug design for combating resistance in liver cancer
2025-Sep-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00952-3
PMID:40897921
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和人工智能技术进行肝细胞癌多靶点药物设计以克服耐药性 | 首次结合单细胞RNA测序与图神经网络(GNN)预测药物-基因相互作用，识别肝细胞癌潜在治疗靶点和候选药物 | 研究主要基于计算预测，缺乏实验验证；单细胞测序样本量有限 | 开发基于单细胞测序和人工智能的多靶点药物设计方法以克服肝细胞癌耐药性 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞和免疫细胞 | 生物信息学, 计算药物发现 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 图神经网络 | GNN (图神经网络), PCA, UMAP, t-SNE | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1959 | 2025-10-06 |
SLC16A3 as an immunosuppressive Kupffer cell marker predicts poor prognosis in HBV-positive hepatocellular carcinoma
2025-Sep-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06861-0
PMID:40898206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组数据分析发现SLC16A3作为库普弗细胞标志物可预测HBV阳性肝细胞癌的不良预后 | 首次揭示SLC16A3在HBV阳性肝癌中作为免疫抑制性库普弗细胞标志物的作用及其与预后的关联 | 研究样本来源多样，可能存在批次效应；机制研究仍需进一步深入 | 探索影响HBV阳性肝细胞癌患者的潜在分子靶点 | 肝细胞癌患者组织样本、肝癌细胞系 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞测序,转录组测序,免疫组化染色,细胞系实验 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 多个外部验证数据集和验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1960 | 2025-10-06 |
SemiLT: A Multianchor Transfer Learning Method for Cross-Modality Cell Label Annotation from scRNA-seq to scATAC-seq
2025-Sep-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507846
PMID:40898317
|
研究论文 | 提出一种多锚点迁移学习方法SemiLT，用于从单细胞RNA测序到单细胞ATAC测序的跨模态细胞标签注释 | 开发了多锚点迁移学习方法，解决了现有方法忽略scRNA-seq和scATAC-seq之间时间差异的问题，显著改善了模态间的批次效应 | NA | 提高从scRNA-seq到scATAC-seq的跨模态细胞类型注释准确性 | 人类骨髓造血细胞、外周血单个核细胞(PBMC) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 迁移学习 | 单细胞测序数据 | 多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |