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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2025-10-06 |
Characterizing Stroke Clots Using Single-Cell Sequencing
2025-Sep-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.041738
PMID:40878981
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析缺血性卒中患者的血栓样本，揭示不同病因血栓中的免疫细胞组成和基因表达差异 | 首次在卒中血栓中应用单细胞RNA测序技术，比较心房颤动和颈动脉粥样硬化两种病因血栓的免疫细胞特征和基因表达谱 | 样本量较小（仅10个血栓样本），需要更大规模研究验证发现 | 探索卒中血栓的细胞组成和基因表达特征，识别潜在的生物标志物和疾病机制 | 大血管闭塞性卒中患者的血栓样本 | 单细胞测序 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，多标记基因组注释分析，全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | 10个卒中患者血栓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1942 | 2025-10-06 |
Podocyte-Specific Deletion of STAT3 in KLF4-Related Experimental Podocytopathy
2025-Sep-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000841
PMID:40880189
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研究论文 | 本研究通过构建特异性敲除STAT3和KLF4的小鼠模型，证明抑制足细胞特异性STAT3信号可抵消KLF4缺失的有害影响 | 首次在足细胞特异性KLF4缺失模型中验证STAT3信号通路的关键作用，并利用人类肾脏活检数据验证临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探究STAT3信号在KLF4相关实验性足细胞病中的特异性作用机制 | 基因工程小鼠模型和人类肾脏活检样本 | 分子生物学 | 局灶节段性肾小球硬化症 | 基因敲除技术,单细胞RNA测序,批量RNA测序,细胞类型比例反卷积分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理学数据 | 基因工程小鼠模型和人类肾脏活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1943 | 2025-10-06 |
Upregulation of EMP3 in acute myeloid leukemia: a study based on data mining, RT-qPCR and immunohistochemistry
2025-Sep-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03368-4
PMID:40890490
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研究论文 | 通过数据挖掘、RT-qPCR和免疫组化研究EMP3在急性髓系白血病中的上调表达及其临床意义 | 首次系统评估EMP3在AML中的表达模式，通过多组学方法揭示其与预后的关联及潜在分子机制 | 研究主要基于公共数据集和有限样本验证，需要更大规模的前瞻性研究确认临床价值 | 阐明EMP3在急性髓系白血病中的表达特征和临床预后意义 | 急性髓系白血病患者样本和健康供体对照 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 数据挖掘, RT-qPCR, 免疫组化, WGCNA, 单细胞RNA测序, 免疫浸润评估, 通路富集分析 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 未明确具体样本数量，包含公共数据集和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1944 | 2025-10-06 |
Machine learning analysis reveals tumor heterogeneity and stromal-immune niches in breast cancer
2025-Sep-02, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-01967-7
PMID:40897851
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq反卷积分析，揭示乳腺癌肿瘤异质性和基质-免疫微环境特征 | 首次系统识别了低级别肿瘤中富集的CXCR4+成纤维细胞、IGKC+髓系细胞和CLU+内皮细胞等亚型，并发现其与免疫治疗反应性降低的悖论关系 | 未明确说明样本来源和具体样本量，缺乏对治疗反应性的直接实验验证 | 解析乳腺癌肿瘤异质性和肿瘤微环境特征 | 乳腺癌(BRCA)样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq反卷积 | 机器学习分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1945 | 2025-10-06 |
Clustering Single-Cell RNA-Seq Data with Low-Rank Matrix Factorization and Local Graph Regularization
2025-Sep-02, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00762-y
PMID:40897868
|
研究论文 | 提出一种结合低秩矩阵分解与局部图正则化的单细胞RNA测序数据聚类算法LRMGC | 采用三分解策略获取对齐核心矩阵，应用Schatten p-范数增强抗噪能力，通过局部流形正则化保持高维数据的子空间结构 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩矩阵分解, 图正则化 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1946 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing and artificial intelligence for multitargeted drug design for combating resistance in liver cancer
2025-Sep-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00952-3
PMID:40897921
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和人工智能技术进行肝细胞癌多靶点药物设计以克服耐药性 | 首次结合单细胞RNA测序与图神经网络(GNN)预测药物-基因相互作用，识别肝细胞癌潜在治疗靶点和候选药物 | 研究主要基于计算预测，缺乏实验验证；单细胞测序样本量有限 | 开发基于单细胞测序和人工智能的多靶点药物设计方法以克服肝细胞癌耐药性 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞和免疫细胞 | 生物信息学, 计算药物发现 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 图神经网络 | GNN (图神经网络), PCA, UMAP, t-SNE | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1947 | 2025-10-06 |
SLC16A3 as an immunosuppressive Kupffer cell marker predicts poor prognosis in HBV-positive hepatocellular carcinoma
2025-Sep-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06861-0
PMID:40898206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组数据分析发现SLC16A3作为库普弗细胞标志物可预测HBV阳性肝细胞癌的不良预后 | 首次揭示SLC16A3在HBV阳性肝癌中作为免疫抑制性库普弗细胞标志物的作用及其与预后的关联 | 研究样本来源多样，可能存在批次效应；机制研究仍需进一步深入 | 探索影响HBV阳性肝细胞癌患者的潜在分子靶点 | 肝细胞癌患者组织样本、肝癌细胞系 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞测序,转录组测序,免疫组化染色,细胞系实验 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 多个外部验证数据集和验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1948 | 2025-10-06 |
SemiLT: A Multianchor Transfer Learning Method for Cross-Modality Cell Label Annotation from scRNA-seq to scATAC-seq
2025-Sep-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507846
PMID:40898317
|
研究论文 | 提出一种多锚点迁移学习方法SemiLT，用于从单细胞RNA测序到单细胞ATAC测序的跨模态细胞标签注释 | 开发了多锚点迁移学习方法，解决了现有方法忽略scRNA-seq和scATAC-seq之间时间差异的问题，显著改善了模态间的批次效应 | NA | 提高从scRNA-seq到scATAC-seq的跨模态细胞类型注释准确性 | 人类骨髓造血细胞、外周血单个核细胞(PBMC) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 迁移学习 | 单细胞测序数据 | 多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1949 | 2025-10-06 |
BACH1 recruits STAT3 to enhance leukemia inhibitory factor receptor activity and augments the self-renewal capacity of mouse embryonic stem cells
2025-Sep-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04578-x
PMID:40898328
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子BACH1通过招募STAT3增强白血病抑制因子受体活性，从而维持小鼠胚胎干细胞自我更新能力的新机制 | 首次发现BACH1通过招募STAT3至Lifr增强子区域，激活LIFR-STAT3信号通路来维持胚胎干细胞自我更新能力 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎干细胞，在人类干细胞中的适用性尚需验证 | 探究BACH1调控Lifr增强子及其对小鼠胚胎干细胞多能性影响的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 干细胞生物学 | NA | RNA测序,染色质免疫沉淀,共免疫沉淀,荧光素酶报告基因分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | RNA-seq,scRNA-seq,ChIP,co-IP | NA | NA |
| 1950 | 2025-10-06 |
Evaluating the causal effect of circulating proteome on the risk of Juvenile idiopathic arthritis: an omics pipeline study
2025-Sep-02, Pediatric rheumatology online journal
DOI:10.1186/s12969-025-01140-0
PMID:40898345
|
研究论文 | 通过整合组学方法评估循环蛋白质组对幼年特发性关节炎风险的因果效应 | 首次应用整合组学流程识别ERAP2作为JIA的候选致病蛋白，并验证其在全身型幼年特发性关节炎中的特异性表达 | 样本来源相对单一，主要基于重庆医科大学附属儿童医院的队列数据 | 探索循环蛋白质组与幼年特发性关节炎风险的因果关系 | 幼年特发性关节炎患者，特别是全身型幼年特发性关节炎患者 | 生物信息学 | 幼年特发性关节炎 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析 | ROC分析, 孟德尔随机化 | 基因组数据, 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 1951 | 2025-10-06 |
Multi-level validation of high expression of PLAUR, FOSL2, and SLC11A1 in aortic dissection and their clinical implications
2025-Sep-02, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115428
PMID:40902395
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别了主动脉夹层中关键的巨噬细胞亚群及其特征基因 | 首次在主动脉夹层中鉴定出AD-associated macrophages (AD-mac)亚群，并整合多种计算工具和机器学习算法系统分析其功能特征 | 研究样本量相对有限，需要在更大队列中验证发现 | 解析主动脉夹层中巨噬细胞异质性及其在疾病发生发展中的作用机制 | 人类主动脉夹层患者组织样本和小鼠主动脉夹层模型 | 生物信息学 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest, Boruta, Decision Tree | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 人类AD患者组织和小鼠AD模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1952 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing uncovers cellular heterogeneity of granulosa cells and provides a signature for follicular development in chicken
2025-Sep, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105430
PMID:40516295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鸡颗粒细胞的异质性，并构建了卵泡发育过程中颗粒细胞的发育轨迹 | 首次在鸡中应用单细胞RNA测序技术系统解析颗粒细胞异质性，识别了四种颗粒细胞类型及其分化轨迹 | 研究仅针对鸡这一物种，结果在其他禽类中的普适性有待验证 | 探究鸡卵泡发育过程中颗粒细胞的异质性和功能分化 | 鸡的颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞调控网络推断和聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 两个发育阶段的颗粒细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1953 | 2025-10-06 |
Comprehensive identification of crucial biomarkers and therapeutic targets in cholestasis via integrated single-cell RNA and transcriptome sequencing analysis
2025-Sep, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10146-8
PMID:40523982
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组测序分析，全面鉴定胆汁淤积症的关键生物标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞测序和转录组数据分析胆汁淤积症的细胞通讯网络，鉴定出IL32、CRIP2、ANXA2和VWF等关键基因作为新型生物标志物和治疗靶点 | 样本量相对有限（13例患者和10例对照），需要在更大队列中验证研究结果 | 探索胆汁淤积症的分子机制并识别关键生物标志物和治疗靶点 | 胆汁淤积性肝病（CLD）患者和对照组的肝组织样本 | 生物信息学 | 胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, Lasso回归分析, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Lasso回归模型 | 单细胞测序数据, 转录组数据 | 13例胆汁淤积性肝病患者和10例对照 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1954 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveals specific Trem2 positive B cell subtype niche after myocardial infarction in mice
2025-Sep, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10144-w
PMID:40523981
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序技术揭示了小鼠心肌梗死后具有Breg特征的Trem2阳性B细胞亚型及其作用机制 | 首次鉴定出心肌梗死后具有调节性B细胞特征的Trem2阳性B细胞亚型，并发现Apoe通过其受体促进Spp1表达的机制 | 仅比较了心肌梗死不同时间点与稳态条件下梗死区域的免疫细胞变化，未涉及其他区域 | 表征小鼠心肌梗死后B细胞亚型并鉴定潜在治疗靶点 | 心肌梗死小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因集富集分析, SCENIC分析, Monocle 2, NichNet分析 | NA | RNA测序数据 | 来自GEO数据库的scRNA-seq数据(GSE163129)和bulk RNA-seq数据(GSE19322) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1955 | 2025-10-06 |
Elucidation of novel diagnostic biomarkers and therapeutic targets in colorectal carcinoma: an integrative approach leveraging multi-omics, computational biology, and single-cell sequencing technologies
2025-Sep, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10141-z
PMID:40560225
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研究论文 | 通过整合多组学、计算生物学和单细胞测序技术，阐明结直肠癌的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次整合全球疾病负担数据库、转录组学、蛋白质组学和单细胞测序技术，系统揭示VEGFA、ICAM1和IL6R在结直肠癌进展中的关键作用，并通过分子对接和动态模拟为靶向药物开发提供理论基础 | 研究结果需要进一步验证，临床转化潜力尚待探索 | 研究结直肠癌的发病机制、诊断方法和潜在治疗靶点 | 结直肠癌 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞测序、转录组学、蛋白质组学、分子对接、动态模拟 | NA | 多组学数据、流行病学数据、分子数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1956 | 2025-10-06 |
Exploration of shared diagnostic genes and mechanisms between crohn's disease and ischemic stroke by integrated comprehensive bioinformatics analysis and machine learning
2025-Sep, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10145-9
PMID:40588645
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研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法探索克罗恩病与缺血性卒中之间的共享诊断基因和机制 | 首次整合多种生物信息学分析和机器学习算法系统鉴定CD-IS共病的共享诊断生物标志物和机制 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 识别克罗恩病与缺血性卒中共病的共享诊断基因和潜在机制 | 克罗恩病和缺血性卒中患者基因表达数据 | 生物信息学 | 克罗恩病,缺血性卒中 | 差异表达分析,WGCNA,机器学习,单细胞RNA测序,CIBERSORT,孟德尔随机化,分子对接 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1957 | 2025-10-06 |
M694I variant of MEFV drives pathogenesis of familial Mediterranean fever through enhanced Th17 cell differentiation
2025-Sep-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf336
PMID:40613718
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建MEFV M694I突变小鼠模型，揭示了该突变通过增强Th17细胞分化促进家族性地中海热发病的机制 | 首次利用基因敲入小鼠模型系统阐明MEFV M694I突变通过特异性增强Th17细胞分化驱动家族性地中海热发病的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究MEFV M694I突变在家族性地中海热发病机制中的作用 | MEFV M694I基因敲入小鼠的脾细胞和血清样本 | 免疫学 | 家族性地中海热 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞因子阵列分析 | 基因敲入小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据, 细胞因子数据 | 未明确样本数量，使用基因敲入小鼠模型进行研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat和fgsea软件包进行单细胞RNA测序数据分析 |
| 1958 | 2025-10-06 |
Ontogeny-specific induction of the KMT2A::AFF1-fusion drives development of a distinct CD24 positive pre-leukemic state
2025-Sep, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02665-9
PMID:40646135
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研究论文 | 本研究通过新型小鼠KMT2A::AFF1融合基因模型揭示了胚胎期特异性诱导产生的CD24阳性前白血病状态 | 建立了可精确诱导致癌融合基因的小鼠模型，首次发现胚胎造血环境特异性产生的CD24PreProB前白血病干细胞群体 | 研究基于小鼠模型，人类直接相关性需进一步验证；未涉及临床治疗干预效果评估 | 探究KMT2A::AFF1融合基因在胚胎期诱导前白血病形成的机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞（HSPCs）、CD24PreProB细胞亚群、人类KMT2A::AFF1患者样本 | 血液肿瘤学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序 | 小鼠基因工程模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1959 | 2025-10-06 |
IQGAP1 participates in bone marrow-derived macrophage recruitment and involves in liver inflammation/fibrosis
2025-Sep, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-025-02573-6
PMID:40682669
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研究论文 | 本研究探讨了IQGAP1在S1P诱导的骨髓源性巨噬细胞迁移及肝脏炎症/纤维化中的作用机制 | 首次揭示S1P通过S1PR2/3-HuR/miR-455-5p轴调控IQGAP1表达，进而影响巨噬细胞迁移和肝脏纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步开展 | 阐明IQGAP1在肝脏炎症和纤维化过程中的分子机制 | 骨髓源性巨噬细胞和肝纤维化小鼠模型 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, RT-qPCR, western blot, Boyden小室迁移实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞迁移数据 | 小鼠肝纤维化模型（CCl4、BDL、MCDHF饮食诱导） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1960 | 2025-10-06 |
GraphCellNet: A deep learning method for integrated single-cell and spatial transcriptomic analysis with applications in development and disease
2025-Sep, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-025-02575-4
PMID:40690004
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研究论文 | 提出一种结合单细胞和空间转录组分析的深度学习方法GraphCellNet，用于细胞类型解卷积和空间域识别 | 采用Kolmogorov-Arnold网络层增强非线性特征表示和上下文整合，解决细胞边界模糊和高异质性问题 | NA | 开发集成单细胞和空间转录组分析的计算方法，提升组织结构和功能的理解 | 心肌梗死、果蝇发育、人类心脏发育 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图神经网络, KAN | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |