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当前共找到 40973 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2026-06-07 |
Remodeling of non-coding RNA regulatory networks: Decoding the pathological mechanisms and new therapeutic paradigms of cardiovascular diseases
2026-03, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2025.12.007
PMID:41447890
|
综述 | 系统总结非编码RNA在心血管疾病中的表达谱、多层次调控机制及诊疗应用，并提出跨尺度分析框架 | 提出跨尺度分析框架整合网络拓扑、时空梯度和能量约束等原理，并强调单细胞多组学、空间转录组学等技术在ncRNA靶向治疗中的创新应用 | ncRNA疗法实际应用受限于递送效率低、功能冗余及微环境依赖性等挑战 | 解析非编码RNA在心血管疾病中的病理机制并探索新的治疗范式 | 微RNA、长链非编码RNA、环状RNA、小核仁RNA等非编码RNA在多种心血管疾病中的表达和功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1942 | 2026-06-07 |
Evaluating the toxicological effects of PET-MPs exposure on atherosclerosis through integrated network toxicology analysis and experimental validation
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04963-6
PMID:41540215
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研究论文 | 通过整合网络毒理学分析与实验验证，评估聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料暴露对动脉粥样硬化的毒性效应 | 首次结合网络毒理学、单细胞RNA测序数据分析和分子对接技术，系统揭示PET-MPs诱导动脉粥样硬化的潜在毒理机制，并通过细胞实验验证炎症反应的关键作用 | 未提及 | 阐明聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料暴露导致动脉粥样硬化的毒理机制 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料与动脉粥样硬化相关靶点及信号通路 | 生物信息学 | 动脉粥样硬化 | 网络毒理学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序、分子对接、细胞实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质结构数据 | 41个潜在靶点，4个核心靶点（CCL5、CTSB、PPARG、TNF） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1943 | 2026-06-07 |
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512597
PMID:41580978
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研究论文 | 整合全外显子组测序、成像质谱流式与空间转录组学，揭示了有无致癌物暴露的两种小鼠肺腺癌前病变模型中分子与免疫演化的空间特征 | 首次在空间单细胞水平系统比较遗传工程模型与致癌物诱导模型的肺腺癌演化差异，揭示突变负荷、免疫浸润及细胞状态的空间动态变化 | 未提及 | 研究肺腺癌前病变向侵袭性肿瘤演化过程中的空间分子特征与免疫响应变化 | 两种小鼠肺腺癌模型（基因工程模型129S4 K和致癌物诱导模型129S4 U）的癌前病变及肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 全外显子组测序、成像质谱流式、空间转录组学 | NA | 基因序列、图像、空间转录组数据 | 141只小鼠，共284个成像质谱流式感兴趣区域（超过140万个空间单细胞）及156个病变区域的51531个空间转录组斑点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1944 | 2026-06-07 |
Phf6 truncating mutation drives leukemogenesis via disrupted epigenetic regulation in mice
2026-Mar, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02828-8
PMID:41588055
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研究论文 | 通过构建敲入截短Phf6突变的小鼠模型，揭示了Phf6截短突变通过破坏表观遗传调控驱动白血病发生的机制 | 首次证明Phf6截短突变具有功能获得效应，而非传统认为的功能缺失突变，并发现KAT6B乙酰转移酶是其关键下游靶点 | 未明确说明局限性 | 阐明Phf6截短突变在白血病发生中的具体作用机制 | 表达患者来源截短Phf6突变的转基因小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | CNN | 图像 | 转基因小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 1945 | 2026-06-07 |
Targeting LUM-mediated inflammatory cell communication and fibroblast apoptosis with SFI in Heart Failure
2026-Mar, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100399
PMID:41621719
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、批量转录组学和机器学习整合分析，揭示LUM介导的心衰炎症细胞通讯及参附注射液的心肌保护机制 | 首次发现LUM是心衰中连接凋亡、炎症和细胞通讯的关键成纤维细胞特异性枢纽基因，并阐明参附注射液通过调控LUM/p38/p53信号轴发挥心脏保护作用 | 未明确说明 | 探究参附注射液对心衰心脏微环境的分子机制，特别是LUM介导的炎症细胞通讯和成纤维细胞凋亡的调控作用 | 心衰小鼠模型及心脏组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 机器学习 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1946 | 2026-06-07 |
Decoding the Cellular Heterogeneity and Malignant Progression of Human Penile Squamous Cell Carcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503894
PMID:41637545
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析阴茎鳞状细胞癌的细胞异质性和恶性进展机制 | 首次构建阴茎鳞状细胞癌的全面单细胞图谱，鉴定出与上皮间质转化相关的SEMA3C恶性细胞亚群和促进血管生成及细胞外基质重构的POSTN周细胞亚群 | 样本量较小（9个肿瘤样本和6个相邻正常样本），缺乏独立验证队列，机制验证不足 | 从单细胞层面解析阴茎鳞状细胞癌肿瘤微环境的细胞异质性和恶性进展机制 | 阴茎鳞状细胞癌患者组织样本（肿瘤组织和相邻正常组织） | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 9个肿瘤样本和6个相邻正常样本，共计66421个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1947 | 2026-06-07 |
Integrated transcriptomic analysis reveals mitochondrial dysregulation and macrophage heterogeneity associated with MTHFD2 in glioblastoma
2026-Mar, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 综合转录组分析揭示MTHFD2相关的线粒体失调和巨噬细胞异质性在胶质母细胞瘤中的作用 | 首次通过整合转录组和单细胞分析，发现MTHFD2在肿瘤相关巨噬细胞中高表达，并定义了一个与肿瘤进展相关的终末分化巨噬细胞亚群 | 未提供具体局限性信息 | 探究胶质母细胞瘤中线粒体基因改变及其细胞特异性，特别是MTHFD2在巨噬细胞中的作用 | 胶质母细胞瘤患者组织样本（TCGA-GBM、GSE66354数据集）及巨噬细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM和GSE66354数据集（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1948 | 2026-06-07 |
Targeting MAFB potentiates immune checkpoint inhibitor efficacy by reprogramming tumor-associated macrophages to an M1-like phenotype in colorectal cancer
2026-03, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.02.006
PMID:41692233
|
research paper | 该研究通过分析结直肠癌患者的单细胞RNA-seq数据，发现MAFB在M2样肿瘤相关巨噬细胞中高表达，并证明靶向MAFB可增强免疫检查点抑制剂疗效，通过将巨噬细胞重编程为M1样表型 | 首次揭示MAFB作为M2样肿瘤相关巨噬细胞的关键转录调控因子，通过直接激活Il4ra、Il10和Arg1表达维持M2极化，且靶向MAFB能增强结直肠癌中免疫检查点抑制剂的疗效 | NA | 鉴定结直肠癌中M2样肿瘤相关巨噬细胞的转录调控因子，并探索通过重编程肿瘤微环境克服免疫检查点抑制剂耐药性的策略 | 结直肠癌患者肿瘤相关巨噬细胞 | machine learning | colorectal cancer | single-cell RNA-seq | NA | gene expression data | 结直肠癌患者样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1949 | 2026-06-07 |
The RNA-binding protein SRSF3 controls epicardial formation by regulating splicing and proliferation
2026-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204918
PMID:41601313
|
研究论文 | 本研究揭示RNA结合蛋白SRSF3通过调控剪接和增殖控制心外膜形成 | 首次发现SRSF3在胚胎心外膜形成中的关键作用，并揭示嵌合重组对胚胎表型分析的显著混杂效应 | 未明确说明 | 阐明控制心外膜形成的分子机制 | 小鼠胚胎原心外膜和心外膜细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、内源性irCLIP | NA | 基因表达数据、RNA结合数据 | 小鼠胚胎样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1950 | 2026-06-07 |
Conversion of Transplanted Mature Hepatocytes into Afp+ Reprogrammed Cells for Liver Regeneration After Injury
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517126
PMID:41609487
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研究论文 | 通过整合序列移植、谱系追踪、单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，揭示移植的成熟肝细胞转化为Afp阳性重编程细胞，实现肝脏再生 | 首次发现移植的成熟肝细胞具有可塑性，能转化为Afp+重编程细胞，并阐明其受PPARγ通路和TNF-α/AP-1信号调控的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肝细胞转化机制尚需验证 | 阐明移植成熟肝细胞介导肝脏再生的分子基础 | 移植的成熟肝细胞及其衍生的Afp+重编程细胞 | 机器学习 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观组数据 | 小鼠模型中的序列移植实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Chromium单细胞ATAC测序 |
| 1951 | 2026-06-07 |
SM3DD with segmented PCA: a comprehensive method for interpreting 3D spatial transcriptomics
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqag007
PMID:41608733
|
研究论文 | 开发了一种名为SM3DD的细胞分割/注释无关方法，用于分析三维空间转录组数据，并比较正常肺组织与SARS-CoV-2患者肺组织 | 提出了一种完全无需细胞分割或注释的标准化最小三维距离分析方法，并结合分段主成分分析解读空间转录组数据 | 标题和摘要中未明确提及本文的局限性 | 开发并验证一种解释三维空间转录组数据的综合方法，以揭示疾病相关的生物学通路 | 16名临床正常个体和18名死于急性呼吸窘迫综合征的SARS-CoV-2患者的肺组织 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 34个肺组织样本（16个正常，18个SARS-CoV-2患者） | 布鲁克空间生物学 | 空间转录组学 | CosMx空间分子成像仪 | CosMx空间分子成像仪（布鲁克空间生物学，美国）用于确定RNA空间坐标 |
| 1952 | 2026-06-07 |
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.034
PMID:41611568
|
综述 | 系统总结了截至2025年9月的77种空间转录组技术和594种分析工具，并开发了SpatialToolDB平台以支持技术和方法选择 | 首次全面整合空间转录组技术、分析工具和相关数据库，创建了动态更新的SpatialToolDB平台，便于研究者进行方法比较和工具选择 | 未提及具体局限性 | 为空间转录组技术选择和分析策略提供数据驱动的指导，支持多样化的生物学和转化研究应用 | 空间转录组技术平台和分析工具 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 594个分析工具，77种技术 | 10x Genomics, Visium, 等 | 空间转录组学 | 10x Visium, 等 | 涵盖多种空间转录组平台，包括但不限于10x Visium，具体平台因技术而异 |
| 1953 | 2026-06-07 |
Activated CD38+ mast cells promote gastric cancer progression by suppressing CD8+ T cell cytotoxic activity through adenosine metabolism
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116863
PMID:41579372
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研究论文 | 通过对幽门螺杆菌感染相关胃癌进展四个典型阶段的21个胃粘膜进行单细胞RNA测序，揭示了激活的CD38+肥大细胞通过腺苷代谢抑制CD8+ T细胞细胞毒性活性从而促进胃癌进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统描绘了幽门螺杆菌感染下胃癌进展过程中胃粘膜微环境的动态变化，并鉴定出激活的肥大细胞通过CD38和COX2上调增加腺苷和前列腺素E分泌，进而抑制CD8+ T细胞杀伤功能的新机制 | NA | 阐明幽门螺杆菌感染相关胃癌进展过程中胃粘膜微环境的动态变化及免疫细胞相互作用机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌进展四个典型阶段的胃粘膜组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21个胃粘膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1954 | 2026-06-07 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
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研究论文 | 系统评估了10种基于Seurat的DGE方法在单细胞转录组数据中识别衰老细胞的表现 | 首次全面评估了Seurat包中多种差异表达（DGE）分析方法在衰老细胞识别场景下的性能 | 研究未考虑真实数据中的批次效应等技术噪声，且仅基于模拟和有限真实数据集 | 评估统计差异分析方法在单细胞转录组数据识别衰老细胞中的性能 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集的差异表达分析结果 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数值（基因表达矩阵） | 模拟数据集包含多个样本规模，真实数据集未明确说明具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | Seurat | 基于Seurat包实现的10种DGE方法（Wilcox, Wilcox-limma, bimod, roc, t, negbinom, Poisson, LR, MAST, DESeq2） |
| 1955 | 2026-06-07 |
RORγt+ dendritic cells are a distinct lymphoid-derived lineage
2026-Feb-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aed7439
PMID:41591258
|
研究论文 | 本文鉴定RORγt+树突状细胞为一种独特的淋巴来源细胞谱系，可维护肠道免疫耐受 | 首次揭示RORγt DC源自淋巴祖细胞，并发现其发育依赖特定的增强子和转录因子调控网络 | 研究仅限于小鼠模型，人类中是否存在类似谱系尚待验证 | 阐明耐受性树突状细胞谱系的建立机制，以防止对共生菌和食物抗原的不适当免疫反应 | 小鼠RORγt+树突状细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓和前体细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1956 | 2026-06-07 |
PM2.5 impairs gliovascular coupling via endothelial AHR-mitochondrial signaling in mice
2026-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141275
PMID:41621300
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研究论文 | 该研究揭示PM2.5通过内皮AHR-线粒体信号通路损害小鼠胶质血管耦合的机制 | 首次证明内皮AHR作为PM2.5的关键传感器，通过线粒体应激和Parkin依赖性线粒体自噬导致血管收缩和脑灌注减少，并利用空间转录组学揭示了区域和细胞特异性损伤，弥补了常规RNA测序的不足 | 该研究基于动物模型，可能无法完全模拟人类长期暴露于PM2.5的复杂情况；未涉及人类样本验证 | 探究PM2.5污染导致神经血管功能障碍的细胞机制 | 小鼠（通过吸入和气管滴注模型暴露于PM2.5） | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学、高分辨率成像、体外检测 | NA | 图像、文本、基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1957 | 2026-06-07 |
Breast Cancer Brain Metastases: Current Understanding and Future Directions
2026-Feb-05, Current oncology reports
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s11912-026-01753-y
PMID:41642399
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综述 | 综述乳腺癌脑转移的最新进展，包括转移机制、肿瘤微环境相互作用、受体不一致性、诊断创新及治疗策略 | 整合了JAK-STAT信号、同源重组缺陷、神经元拟态等新机制，并强调受体不一致性对系统治疗的影响以及液体活检、空间转录组学等新兴诊断工具的应用 | 机器学习外部验证有限，前瞻性试验证据不足 | 阐明乳腺癌脑转移的精准管理策略并确定未来研究优先方向 | 乳腺癌脑转移的分子机制、诊断方法和治疗策略 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像， 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1958 | 2026-06-07 |
Integrative metabolomic and single-cell transcriptomic analysis of recurrent condyloma acuminatum in humans
2026-Feb-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37989-8
PMID:41639275
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研究论文 | 结合代谢组学和单细胞转录组学分析复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 首次整合代谢组学与单细胞RNA测序，揭示复发尖锐湿疣中角质细胞、M2巨噬细胞和树突状细胞中代谢基因失调及精氨酸-多胺通路改变的协同作用 | NA | 探究尖锐湿疣复发的分子和免疫机制 | 人类尖锐湿疣复发患者的病变组织 | 单细胞转录组学 | 尖锐湿疣 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据，单细胞转录组数据 | 人类复发尖锐湿疣病变组织和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1959 | 2026-06-07 |
STransfer: a transfer learning-enhanced graph convolutional network for clustering spatial transcriptomics data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag049
PMID:41601194
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的图卷积网络STransfer，用于空间转录组数据聚类 | 结合图卷积网络与正点互信息分别建模局部和全局空间依赖，利用注意力机制融合多图特征，并引入跨切片知识迁移提升未标记切片聚类精度 | 未明确提及局限性（摘要中仅聚焦方法优势与实验验证） | 提升空间转录组多切片数据集的聚类准确性并降低人工标注成本 | 空间转录组组织切片数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1960 | 2026-06-07 |
Inference of marker genes of subtle cell state changes via iLR: iterative logistic regression
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag051
PMID:41627891
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研究论文 | 提出迭代逻辑回归（iLR）方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别微小细胞状态变化的标记基因 | 结合帕累托前沿优化平衡基因集大小和分类性能，能识别跨器官、跨物种的转录特征 | 仅在模拟数据和特定疾病数据集上验证，实际临床适用性需进一步测试 | 开发一种能从复杂单细胞数据中推断可解释转录特征的方法 | 神经元亚型（健康vs自闭症患者）、不同肿瘤微环境中的细胞类型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍， 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |