单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 19561 - 19580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19561 | 2024-08-07 |
Low-density lipoprotein receptor promotes crosstalk between cell stemness and tumor immune microenvironment in breast cancer: a large data-based multi-omics study
2023-11-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04699-y
PMID:38037058
|
研究论文 | 本研究通过大规模多组学数据分析，探讨了低密度脂蛋白受体（LDLR）在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的作用 | 首次揭示了LDLR在乳腺癌细胞干性和肿瘤免疫微环境交互作用中的关键作用 | 主要依赖于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证 | 识别破坏乳腺癌细胞干性和免疫微环境之间通信的潜在靶点 | 乳腺癌细胞的干性和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | Lasso回归分析, Cox生存回归模型 | RNA序列数据, 蛋白质数据 | 3132名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 19562 | 2024-08-07 |
The construction of a testis transcriptional cell atlas from embryo to adult reveals various somatic cells and their molecular roles
2023-11-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04722-2
PMID:38012716
|
研究论文 | 本文构建了一个从胚胎到成年的睾丸转录细胞图谱，揭示了各种体细胞及其分子作用 | 通过整合单细胞RNA测序数据，构建了跨五个发育阶段的睾丸转录细胞图谱，并使用多种分析技术进行了全面分析 | NA | 更好地理解睾丸从胚胎到成年的发育变化 | 睾丸中的体细胞和生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过26,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19563 | 2024-08-04 |
Talniflumate abrogates mucin immune suppressive barrier improving efficacy of gemcitabine and nab-paclitaxel treatment in pancreatic cancer
2023-11-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04733-z
PMID:37996891
|
研究论文 | 本研究探讨了talniflumate如何克服粘蛋白的免疫抑制屏障，从而增强吉西他滨和纳米紫杉醇在胰腺癌治疗中的疗效 | 本研究揭示了GCNT3作为粘蛋白表达的主要调节因子，并提出其作为talniflumate作用的可行靶点 | 研究中使用的样本量较小，仅分析了43个胰腺管内乳头状粘液瘤（IPMN），且主要集中于特定的粘蛋白通路 | 研究旨在识别肿瘤微环境中的免疫抑制机制，并提高对胰腺癌的治疗效果 | 研究对象包括低级和高级胰腺管内乳头状粘液瘤，胰腺癌类器官及T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 小鼠同种异体模型 | 基因表达数据 | 43个胰腺管内乳头状粘液瘤样本（12个低级，31个高级） | NA | NA | NA | NA |
| 19564 | 2024-08-07 |
Correction: iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Oct-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05523-6
PMID:37858060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19565 | 2024-08-07 |
iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Aug-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05432-8
PMID:37608264
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研究论文 | 本文开发了iDESC方法，用于在包含多个受试者的单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性的差异表达基因 | iDESC采用零膨胀负二项混合模型，同时考虑了受试者效应和数据中的脱落事件，提高了差异表达分析的准确性和稳健性 | NA | 开发和评估一种新的方法，用于在单细胞RNA测序数据中进行差异表达分析，特别是在考虑多个受试者效应和数据脱落事件的情况下 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项混合模型 | RNA测序数据 | 多个受试者 | NA | NA | NA | NA |
| 19566 | 2024-08-04 |
Debiased personalized gene coexpression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277363.122
PMID:37295843
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研究论文 | 本文提出了一种名为Dozer的方法，用于修正来自scRNA-seq数据集的基因-基因相关性估计。 | Dozer能够消除来自低稀疏表达基因的相关性估计偏差，并能准确量化个体间的网络级变异。 | 尽管Dozer在多种情况下表现出鲁棒性，但仍可能受到技术限制和数据噪声的影响。 | 本研究旨在估计个性化的基因共表达网络，以便在单细胞RNA-seq数据中量化表达变异。 | 研究对象包括来自不同个体的人诱导多能干细胞和阿尔茨海默病后人类组织提取的少突胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 普瓦松测量模型 | 基因表达数据 | 涉及不同个体的多条人诱导多能干细胞系和人类组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19567 | 2024-08-04 |
Evaluation of zero counts to better understand the discrepancies between bulk and single-cell RNA-Seq platforms
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.09.035
PMID:37841335
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研究论文 | 文章探讨了批量RNA测序与单细胞RNA测序之间的差异以及零计数的影响 | 发现RNA完整性、基因长度及转录本数量对零计数的影响，为跨平台表达偏移修正开发新方法提供了基础 | 仅通过四组配对数据分析，样本量或数据丰富性可能有限 | 旨在理解批量与单细胞RNA测序在表达测量上的差异 | 研究对象为测序平台的技术和生物因素以及基因和生物通路 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 四组配对数据集，每组含多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19568 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing provides novel insights to pathologic pathways in abdominal aortic aneurysm
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1172080
PMID:37288252
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review | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤发病机制研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了无偏见的、全局性的转录组特征视图，有助于识别腹主动脉瘤形成的关键通路 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在腹主动脉瘤分析中的应用趋势和未来潜力 | 腹主动脉瘤的发病机制 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19569 | 2024-08-04 |
Exercise potentially prevents colorectal cancer liver metastases by suppressing tumor epithelial cell stemness via RPS4X downregulation
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26604
PMID:38439884
|
研究论文 | 本研究探讨了运动通过下调RPS4X抑制结直肠癌肝转移的机制 | 研究首次揭示了运动通过调节RPS4X表达来抑制结直肠癌的干性和转移风险 | 该研究主要依赖于生物信息学分析和实验验证，临床数据的验证尚未充分 | 研究运动对结直肠癌肝转移的影响及其机制 | 重点研究结直肠癌的上皮细胞及其干性标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析、肿瘤微阵列、细胞/动物实验 | NA | 基因表达数据 | 19331个样本，涉及多种癌症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19570 | 2024-08-07 |
Liver-restricted Type I IFN Signature Precedes Liver Damage in Chronic Hepatitis B Patients Stopping Antiviral Therapy
2024-Mar-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300569
PMID:38294274
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研究论文 | 本研究追踪了停止抗病毒治疗的慢性乙型肝炎患者肝脏中的免疫成分和激活状态，使用流式细胞术和单细胞RNA测序分析，发现I型干扰素信号在肝脏损伤前出现。 | 首次揭示了I型干扰素信号在慢性乙型肝炎患者肝脏损伤前的出现，并确认了MIF在炎症反应中的作用。 | 研究样本量未明确提及，且仅限于慢性乙型肝炎患者，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后，肝脏损伤前的早期免疫激活事件。 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏免疫反应。 | NA | 乙型肝炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19571 | 2024-08-07 |
CD169+ classical monocyte as an important participant in Graves' ophthalmopathy through CXCL12-CXCR4 axis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109213
PMID:38439953
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台分析，探讨了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的作用及其通过CXCL12-CXCR4轴的机制 | 首次揭示了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的临床意义及其分化为CD169巨噬细胞促进炎症、脂肪生成和纤维化的作用 | 需要进一步研究针对循环中单核细胞和CXCL12-CXCR4轴的治疗策略 | 探究Graves眼病的病理机制及其潜在的治疗靶点 | Graves病和Graves眼病患者 | NA | Graves眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Graves病和Graves眼病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 19572 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling implicates the psychological stress-induced disruption of spermatogenesis
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102158
PMID:38439912
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了心理压力对大鼠精子发生的影响，揭示了心理压力导致的细胞和分子层面的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了心理压力对精子发生的细胞和分子机制的影响 | 研究仅限于大鼠模型，未来需要进一步在其他物种中验证这些发现 | 揭示心理压力如何通过细胞和分子机制影响精子发生 | 心理压力对大鼠精子发生的影响 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,744个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19573 | 2024-08-07 |
Baf-mediated transcriptional regulation of teashirt is essential for the development of neural progenitor cell lineages
2024-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01169-3
PMID:38374207
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研究论文 | 研究通过遗传学方法破坏果蝇神经系统中的进化保守屏障自整合因子（Baf），利用单细胞RNA测序技术揭示了Baf敲降引起的转录组变化，特别是I型神经母细胞中的变化，并发现Baf与转录因子teashirt（tsh）共同作用于异染色质锚定至内核膜的过程，从而调控神经前体细胞谱系的发育 | 首次揭示了Baf介导的teashirt转录调控是一种新的分子机制，用于调节神经前体细胞谱系的发育 | NA | 探索异染色质锚定至内核膜的细胞类型特异性或上下文依赖性程序化调控对神经细胞发育的影响 | 果蝇神经系统中的Baf因子及其对神经前体细胞谱系发育的影响 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 果蝇神经系统中的I型神经母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19574 | 2024-08-04 |
A novel variable neighborhood search approach for cell clustering for spatial transcriptomics
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.109
PMID:38440167
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研究论文 | 本文提出了一种新的基于可变邻域搜索的细胞聚类方法，结合基因表达和空间坐标进行细胞聚类 | 引入了基于可变邻域搜索的模型，超越了传统细胞类型聚类，能够在空间域中进行聚类 | NA | 研究细胞聚类的方法，特别是在空间转录组学领域 | 细胞聚类，基于基因表达和空间坐标的信息 | 数字病理学 | NA | 可变邻域搜索 | NA | 基因表达矩阵和空间坐标 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19575 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers of renal ischemia-reperfusion injury by bioinformatics analysis and single-cell sequencing analysis combined with in vivo validation
2023-12, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2023.101928
PMID:37704087
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研究论文 | 本文研究了与肾缺血再灌注损伤相关的中心基因和通路 | 本研究识别了cyp1a1和pdk4作为肾缺血的潜在生物标志物，并展示了其良好的诊断价值 | 未提及该研究的局限性 | 探索肾缺血再灌注损伤的生物标志物 | 小鼠肾缺血样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞分析、qRT-PCR | NA | 转录组表达数据 | 小鼠肾缺血样本的转录组数据，共发现157个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 19576 | 2024-08-07 |
Single Cell Transcriptomes of In Vitro Bradyzoite Infected Cells Reveals Toxoplasma gondii Stage Dependent Host Cell Alterations
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.848693
PMID:35372115
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了体外感染布氏锥虫的宿主细胞转录组变化 | 揭示了布氏锥虫感染阶段依赖的宿主细胞转录组变化，并发现了宿主细胞中c-Myc和NF-κB信号通路及能量代谢途径的上调 | 未提及 | 旨在理解宿主细胞与布氏锥虫在转录组层面的相互作用 | 体外感染布氏锥虫的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 19577 | 2024-08-07 |
RNA-Scoop: interactive visualization of transcripts in single-cell transcriptomes
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab105
PMID:34859209
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研究论文 | 本文介绍了RNA-Scoop，一个用于分析单细胞转录组中转录本使用情况的交互式细胞簇和转录组可视化工具 | RNA-Scoop允许用户检查不同簇之间的差异转录本表达，并研究特定转录本表达机制在细胞组中的变化 | NA | 开发一个工具来分析单细胞转录组中的转录本使用情况 | 单细胞转录组中的转录本使用情况 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19578 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals epithelial cells driving brain metastasis in lung adenocarcinoma
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109258
PMID:38433899
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌脑转移的上皮细胞角色 | 发现了一种与脑转移相关的上皮细胞群体，这些细胞在脑转移中发挥重要作用 | 缺乏直接证据证明脑转移病灶与淋巴结转移病灶之间的关联 | 阐明肺腺癌脑转移的细胞起源及其驱动因素 | 主要研究肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 涉及的样本包括初级肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19579 | 2024-08-04 |
Targeting ERBB2 and PIK3R1 as a therapeutic strategy for dilated cardiomyopathy: A single-cell sequencing and mendelian randomization analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e25572
PMID:38434379
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研究论文 | 这篇文章探讨了靶向ERBB2和PIK3R1作为扩张型心肌病的治疗策略。 | 文章创新地结合了单细胞测序和孟德尔随机化分析来识别药物可治疗的基因。 | 文章未能找到ERBB2的药物激动剂，并且对PIK3R1和心力衰竭的因果关系的探讨有限。 | 本研究旨在识别并验证扩张型心肌病中药物可治疗的基因，并分析其与心力衰竭的因果关系。 | 研究对象是扩张型心肌病中与心力衰竭相关的基因。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 四个微阵列表达谱数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19580 | 2024-08-07 |
Bioinformatics analysis of MMP14+ myeloid cells affecting endothelial-mesenchymal transformation and immune microenvironment in glioma
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26859
PMID:38434278
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了MMP14+髓系细胞在胶质瘤中影响内皮间质转化和免疫微环境的作用 | 识别MMP14为独立的预后标志物，并发现其通过CCL信号通路介导免疫抑制，为胶质瘤治疗提供了新的策略 | NA | 探讨MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的作用及其对治疗策略的影响 | MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的功能及其对内皮间质转化和免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 收集了六个批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |