单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 19561 - 19580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19561 | 2024-08-08 |
Dysfunction of CCR1+ decidual macrophages is a potential risk factor in the occurrence of unexplained recurrent pregnancy loss
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1045532
PMID:36532057
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和临床样本的功能实验，发现CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的作用 | 首次揭示了CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的关键作用，并阐明了其免疫抑制和迁移调控特性 | NA | 探讨不明原因反复流产的潜在风险因素 | CCR1+基质巨噬细胞及其在不明原因反复流产中的作用 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 涉及正常早期妊娠和不明原因反复流产患者的基质样本 |
| 19562 | 2024-08-08 |
Aberrant metabolic processes promote the immunosuppressive microenvironment in multiple myeloma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1077768
PMID:36532059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤骨髓中免疫细胞的动态特征，并探讨了异常代谢过程对免疫抑制微环境的影响。 | 发现异常代谢过程与多发性骨髓瘤患者免疫抑制微环境的关联，并提出PIM激酶作为潜在的免疫治疗策略。 | NA | 探讨多发性骨髓瘤中免疫细胞功能障碍的分子机制及其与异常代谢过程的关系。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫细胞及其代谢特征。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19563 | 2024-08-08 |
SFRP4+IGFBP5hi NKT cells induced neural-like cell differentiation to contribute to adenomyosis pain
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.945504
PMID:36532077
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本，发现SFRP4+NKT细胞和大量未分化的多能干细胞在疼痛组中，并揭示了SFRP4+NKT细胞中IGFBP5高表达促进多能干细胞向神经样细胞分化的机制。 | 首次发现SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞能够促进多能干细胞向神经样细胞分化，从而参与子宫内膜异位症疼痛的发生。 | NA | 探讨SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞在子宫内膜异位症疼痛中的作用及其机制。 | 子宫内膜异位症患者的组织细胞样本。 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本 |
| 19564 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the Müller subtypes and inner blood-retinal barrier regulatory network in early diabetic retinopathy
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1048634
PMID:36533134
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠视网膜中的35,910个细胞，重点关注糖尿病视网膜病变中构成大鼠血视网膜屏障的主要细胞的退化以及Müller细胞的两个亚群的新定义。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的Müller亚型及其调控网络。 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 阐明糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的细胞退化及其调控关系。 | 健康和糖尿病大鼠视网膜中的细胞。 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 35,910个细胞 |
| 19565 | 2024-08-08 |
State-of-the-art analytical methods of viral infections in human lung organoids
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0276115
PMID:36538516
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研究论文 | 本文提供了一套详细的实验操作指南，用于研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染过程及其影响 | 本文介绍了多种先进的分析方法，包括蛋白质提取、RNA提取、单细胞RNA测序等，以评估病毒感染的影响和宿主因子的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染特性和宿主反应 | 人肺泡样类器官和SARS-CoV-2病毒 | 数字病理学 | COVID-19 | qPCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交 | NA | 蛋白质, RNA, 细胞 | 基于不同供体的人肺泡样类器官 |
| 19566 | 2024-08-08 |
Sci-Seq of Human Fetal Salivary Tissue Introduces Human Transcriptional Paradigms and a Novel Cell Population
2022, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2022.887057
PMID:36540608
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研究论文 | 本研究通过分析人类胎儿唾液腺的单细胞测序数据，识别了发育分支点、新型干细胞样群体及关键信号通路 | 发现了先前未描述的来源于SD并表达高水平干细胞样功能基因的干细胞样细胞群体 | NA | 探索人类唾液腺发育的新型人类特异性发育范式，并为开发转化性人类疗法奠定基础 | 人类胎儿唾液腺的发育及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 19567 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell type-specific immune regulation associated with anti-NMDA receptor encephalitis in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1075675
PMID:36544777
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控机制 | 首次通过单细胞转录组测序技术，详细描述了抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的转录特征和免疫反应 | NA | 探究抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的特异性免疫调控机制 | 抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 129,217个细胞 |
| 19568 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of WGCNA and machine learning identified diagnostic biomarkers in dilated cardiomyopathy with heart failure
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1089915
PMID:36544902
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研究论文 | 本研究通过综合分析WGCNA和机器学习方法，识别出扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法结合，从多个基因表达数据集中识别出与扩张型心肌病合并心力衰竭高度相关的驱动基因，并构建了有效的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的基因表达数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探索扩张型心肌病合并心力衰竭的特定诊断生物标志物及其机制 | 扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物和发病机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | WGCNA, 单细胞RNA测序 | 随机森林, 梯度提升机, 神经网络, 极限梯度提升, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 训练组包括GSE29819和GSE21610数据集，测试组为GSE17800数据集，单细胞RNA测序数据为GSE95140 |
| 19569 | 2024-08-05 |
TSPAN4 and migrasomes in atherosclerosis regression correlated to myocardial infarction and pan-cancer progression
2023-12, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2022.2155337
PMID:36513632
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研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在动脉粥样硬化逆转和癌症进展中的作用 | 揭示了TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的关键角色 | 关于TSPAN4对迁移体的生理功能了解较少 | 研究TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的作用 | 聚焦于巨噬细胞中的TSPAN4表达及其在动脉粥样硬化中的相关性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，GEO 数据集，TCGA 数据库 | MI小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 19570 | 2024-08-08 |
CT Radiomics to Predict Macrotrabecular-Massive Subtype and Immune Status in Hepatocellular Carcinoma
2023-04, Radiology
IF:12.1Q1
DOI:10.1148/radiol.221291
PMID:36511807
|
研究论文 | 本研究构建了一个CT放射组学模型，用于预测肝细胞癌中的大梁状-大量型亚型及其免疫状态 | 利用放射组学方法非侵入性地识别肝细胞癌的大梁状-大量型亚型，并研究其潜在的免疫浸润模式 | 研究基于回顾性和前瞻性数据集，且样本来自三个学术医学中心，可能存在一定的地域和样本选择偏倚 | 构建CT放射组学模型以预测肝细胞癌的大梁状-大量型亚型，并探讨其免疫浸润模式 | 肝细胞癌患者及其肿瘤亚型和免疫状态 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | CT放射组学 | 机器学习模型 | 图像 | 365名接受切除手术的肝细胞癌成年患者，以及58名接受化疗栓塞和抗血管生成治疗的晚期肝细胞癌成年患者 |
| 19571 | 2024-08-08 |
Dissociation and flow cytometric isolation of murine intestinal epithelial cells for multi-omic profiling
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101936
PMID:36520632
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研究论文 | 本文介绍了一种使用乙二胺四乙酸和TrypLE Express分离高存活率的小鼠肠上皮细胞的逐步协议，这些细胞可用于多组学分析，包括单细胞RNA测序 | 提出了一种新的方法来分离高存活率的肠上皮细胞，适用于多组学分析 | NA | 开发一种新的分离技术，以提高肠上皮细胞的存活率并进行多组学分析 | 小鼠肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 19572 | 2024-08-08 |
ACTA2 Expression Predicts Survival and Is Associated with Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Gastric Cancer
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1897
PMID:36508166
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研究论文 | 本研究旨在识别预测胃癌患者总体生存率和免疫检查点抑制剂（ICI）反应的生物标志物 | 发现肿瘤ACTA2表达与胃癌患者的生存率和ICI反应相关，特别是在α-SMA阳性癌症相关成纤维细胞（CAF）中的ACTA2表达与ICI反应有关 | 研究为回顾性分析，且样本量有限 | 识别预测胃癌患者总体生存率和免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | 胃癌患者的肿瘤ACTA2表达与生存率和ICI反应的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、数字空间分析 | NA | mRNA序列数据 | 发现队列567名患者，验证队列974名患者，ICI治疗患者108名 |
| 19573 | 2024-08-05 |
Recent advances in the molecular understanding of medulloblastoma
2023-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15691
PMID:36520034
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综述 | 本文总结了关于髓母细胞瘤的最新基因组学研究进展 | 介绍了SHH亚组和4组亚组中涉及的新突变及其相关通路 | 未探讨临床应用或疗法 | 阐明髓母细胞瘤的分子机制 | 髓母细胞瘤的四个分子亚组及其突变 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 测序分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 19574 | 2024-08-05 |
Active eosinophils regulate host defence and immune responses in colitis
2023-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05628-7
PMID:36509106
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研究论文 | 本文对小鼠嗜酸性粒细胞进行了全面的单细胞转录组分析 | 揭示了嗜酸性粒细胞的活性和基态群体的转录组与空间定位差异 | 研究中的样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探索嗜酸性粒细胞在肠道炎症中的作用 | 小鼠嗜酸性粒细胞及其在肠道中的功能 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本及小规模人类炎症性肠病患者样本 |
| 19575 | 2024-08-08 |
NF-κB drives epithelial-mesenchymal mechanisms of lung fibrosis in a translational lung cell model
2023-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154719
PMID:36520540
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研究论文 | 研究探讨了在特发性肺纤维化进展阶段，肺上皮细胞和肺间质细胞在共培养模型中的相互作用及其对纤维化的影响 | 首次揭示了NF-κB信号通路在肺上皮细胞和肺纤维细胞共培养模型中的活性，及其在纤维化过程中的潜在介导作用 | NA | 研究肺上皮细胞和肺间质细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及NF-κB信号通路的角色 | 人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养样本 |
| 19576 | 2024-08-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Decodes Wharton's Jelly-Derived Mesenchymal Stem Cells Heterogeneity and a Subpopulation with Wound Repair Signatures
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204786
PMID:36504438
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研究论文 | 本研究系统分析了脐带胶（WJ-MSCs）来源的间充质干细胞的高度异质性 | 通过单细胞转录组学分析，识别出四种WJ-MSC亚群及其独特的愈合特性 | 尚未提及具体的局限性 | 探索WJ-MSC的异质性，建立精准的MSC亚型分类 | 脐带胶来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 19577 | 2024-08-08 |
Manf Enhances the Pyroptosis Inhibition of Bone Marrow-derived Mesenchymal Stem Cells to Relieve Cerebral Infarction Injury
2023-02-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过构建大脑中动脉闭塞（MCAO）动物模型，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）比较假手术组和MCAO组的差异表达基因（DEGs），探讨脑梗死中潜在的细胞死亡相关通路，并通过慢病毒将Manf转染到骨髓间充质干细胞（BMSCs）中，评估其对MANF含量、凋亡、细胞焦亡、脑梗死体积和神经功能的影响。 | 本研究首次通过基因修饰的细胞疗法，特别是通过转染Manf到BMSCs中，显著增加了MANF的表达和分泌，从而有效抑制了凋亡和细胞焦亡相关分子的表达，减少了脑梗死体积，改善了神经功能。 | 研究主要集中在动物模型上，尚未在临床试验中验证其疗效和安全性。 | 探讨基因修饰的细胞疗法在脑梗死治疗中的潜在机制和疗效。 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其转染Manf后的效果。 | 细胞生物学 | 脑梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多个细胞集群和动物模型 |
| 19578 | 2024-08-08 |
Immune response and homeostasis mechanism following administration of BBIBP-CorV SARS-CoV-2 inactivated vaccine
2023-Jan-30, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2022.100359
PMID:36506806
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术，分析了BBIBP-CorV灭活疫苗接种后的免疫反应和稳态机制 | 发现灭活疫苗不仅诱导了预期的体液免疫，还引发了多种全面的免疫反应，包括单核细胞和T细胞的激活，以及细胞间通信的增强 | NA | 旨在全面理解BBIBP-CorV灭活疫苗引发的系统性免疫反应，以促进更好的疫苗接种策略和新疫苗的设计 | BBIBP-CorV灭活疫苗接种后的免疫反应和稳态机制 | 疫苗学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19579 | 2024-08-05 |
Improving the performance of single-cell RNA-seq data mining based on relative expression orderings
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac556
PMID:36528803
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研究论文 | 本文构建了一种新的特征矩阵，称为delta rank matrix (DRM)，用于分析单细胞RNA测序数据 | 首次将基因层面的特征转化为相互作用/边缘层面的特征以进行单细胞RNA测序数据分析 | NA | 提升单细胞RNA测序数据挖掘的性能 | 单细胞RNA测序数据及相应的基因交互网络 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 多种单细胞RNA-seq数据集 |
| 19580 | 2024-08-08 |
RefTM: reference-guided topic modeling of single-cell chromatin accessibility data
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac540
PMID:36513377
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RefTM的参考引导主题模型，用于分析单细胞染色质可及性数据 | RefTM模型不仅利用现有的大量染色质可及性和注释的scCAS数据，还利用单细胞数据分析的主题模型，同时建模参考数据和目标scCAS数据之间的共享生物学变异、scCAS数据的独特生物学变异以及其他已知协变量引起的变异 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞染色质可及性数据，以更好地识别细胞类型并揭示调控机制 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞染色质可及性测序（scCAS） | 主题模型 | 单细胞数据 | 数千个单细胞 |