单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 19521 - 19540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19521 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq analysis of diabetic wound macrophages in STZ-induced mice
2023-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1007/s12079-022-00707-w
PMID:36445632
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研究论文 | 本研究对糖尿病伤口中的巨噬细胞进行了单细胞RNA测序分析 | 识别了一种先前未描述的巨噬细胞群体，并分析了其基因表达和可能的功能 | 仅在STZ诱导的糖尿病小鼠模型中进行，可能无法完全代表人类情况 | 研究糖尿病慢性伤口中巨噬细胞的异质性及其在伤口愈合中的作用 | 糖尿病慢性伤口中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | CD45+免疫细胞，来自17个细胞群体 |
| 19522 | 2024-08-05 |
Experimental validation of in silico analysis estimated the reverse effect of upregulated hsa-miR-106a-5p and hsa-miR-223-3p on SLC4A4 gene expression in Iranian patients with colorectal adenocarcinoma by RT-qPCR
2023-03, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5499
PMID:36468451
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研究论文 | 本研究利用计算分析和实验技术研究了结肠直肠癌中共表达基因及其相关miRNA网络 | 首次确认了SLC4A4作为结肠直肠癌的下调核心基因，并识别出hsa-miR-223-3p和hsa-miR-106a-5p作为其特定的核心miRNA | 需要进一步的实验数据来支持本研究的结果和验证精确的分子通路 | 研究结肠直腸癌中的共表达基因及其miRNA网络 | 伊朗结肠直肠腺癌患者的组织样本及其相关的miRNA | 数字病理学 | 结肠癌 | RT-qPCR | 加权基因共表达网络算法 | 转录组数据 | 从结肠直肠癌患者提取的癌症和相邻正常组织样本 |
| 19523 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Arabidopsis Leaf Tissues Identifies Multiple Specialized Cell Types: Idioblast Myrosin Cells and Potential Glucosinolate-Producing Cells
2023-Mar-01, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcac167
PMID:36440710
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了拟南芥叶片组织的转录组，识别并验证了多种特化细胞类型，包括芥子细胞和潜在的硫代葡萄糖苷合成细胞 | 本研究通过使用单细胞转录组数据和β-葡萄糖醛酸酶启动子分析，发现了新的特异性报告基因，用于芥子细胞和潜在硫代葡萄糖苷合成细胞的鉴定 | 不同植物发育阶段和细胞类型注释方法的差异限制了研究间的比较 | 旨在通过单细胞转录组分析，深入了解拟南芥叶片中硫代葡萄糖苷-芥子酶防御系统相关细胞类型的表达特征 | 拟南芥叶片组织中的特化细胞类型，特别是芥子细胞和硫代葡萄糖苷合成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 扩展的拟南芥叶片组织中的多个细胞类型 |
| 19524 | 2024-08-08 |
Single-cell discovery of the scene and potential immunotherapeutic target in hypopharyngeal tumor environment
2023-03, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-022-00567-x
PMID:36460803
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研究论文 | 本文构建了首个喉下癌的单细胞转录组图谱，并探索了其潜在机制 | 首次构建了喉下癌的单细胞转录组图谱，并识别了七种细胞类型，包括上皮细胞和髓系细胞 | NA | 研究喉下癌的细胞通信机制及其潜在的免疫治疗靶点 | 喉下癌及其癌旁组织的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 喉下癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 17,599个细胞 |
| 19525 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
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meta-analysis | 开发了一个专门用于人类癌症的单细胞RNA测序数据库IMMUcan scDB并进行了元分析 | 提供了一个集成化、可公开访问的数据库，涵盖56种不同癌症类型的144个数据集，并具有详细的临床和生物信息注释 | 数据异质性和研究之间的变异性可能对结果造成影响 | 探讨与肿瘤微环境相关的单细胞RNA测序数据并进行元分析 | 涉及56种不同癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 144个数据集 |
| 19526 | 2024-08-08 |
Development of a personalized dendritic cell vaccine and single-cell RNA sequencing-guided assessment of its cell type composition
2023-02, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2022.10.013
PMID:36443171
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研究论文 | 本文研究了一种个性化树突状细胞疫苗的细胞类型组成，并通过单细胞RNA测序技术进行评估 | 首次通过单细胞转录组分析方法，详细研究了DC疫苗CUD-002的细胞类型组成，并确认了其安全性 | NA | 旨在评估和解决基于树突状细胞的免疫治疗产品在制造过程中细胞类型异质性的监管考虑 | 个性化树突状细胞疫苗CUD-002的细胞类型组成及其安全性 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19527 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Circulating Epithelial Cells in Breast Cancer at Single-Cell Resolution: Identifying Tumor and Hybrid Cells
2023-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200206
PMID:36449636
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析非转移性乳腺癌患者中CD45阴性和CD45阳性循环上皮细胞（CECs）的异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别出乳腺癌中的肿瘤细胞和杂交细胞，并发现CD45 CECs中存在大量拷贝数异常，与肿瘤分级正相关 | 需要进一步研究以确定哪些循环肿瘤和杂交细胞亚群对乳腺癌转移有贡献 | 研究循环肿瘤细胞和杂交细胞在乳腺癌中的异质性及其在转移中的作用 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 |
| 19528 | 2024-08-08 |
Single-cell genomics illustrates heterogeneous phenotypes of myocardial fibroblasts under ischemic insults
2023-02-01, Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire
DOI:10.1139/bcb-2022-0229
PMID:36458696
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组学研究，揭示了心肌纤维母细胞在缺血损伤下的表型异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了心肌纤维母细胞在缺血和再灌注条件下的表型异质性 | NA | 探索心肌纤维母细胞在心肌梗死区域的再生/修复反应 | 心肌纤维母细胞的表型异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从心肌梗死区域的Yucatan小型猪中分离的心肌纤维母细胞 |
| 19529 | 2024-08-08 |
Molecular Dissection of Somatic Skeletal Disease in Neurofibromatosis Type 1
2023-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4755
PMID:36459048
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了神经纤维瘤病1型（NF1）患者来源的假关节样本中的骨基质细胞（BSCs），揭示了NF1相关骨骼疾病的发病机制。 | 首次应用时间序列单细胞RNA测序技术研究NF1患者的骨基质细胞，揭示了Clec11a-Itga11-Wnt信号通路在NF1相关骨骼疾病中的作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，缺乏对NF1患者骨骼疾病的临床治疗效果的直接评估。 | 探讨NF1患者骨骼疾病的发病机制。 | NF1患者的骨基质细胞和假关节样本。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 患者匹配的控制组和假关节来源的初级骨基质细胞 |
| 19530 | 2024-08-05 |
Longitudinal single-cell analysis of SARS-CoV-2-reactive B cells uncovers persistence of early-formed, antigen-specific clones
2023-01-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165299
PMID:36445762
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研究论文 | 研究了COVID-19感染和疫苗接种后B细胞克隆的持久性和演变 | 首次长期跟踪分析了特异性B细胞克隆在COVID-19患者中的持续存在与演变 | 仅针对重症COVID-19患者进行样本收集，样本代表性可能有限 | 预测新兴病毒变种的免疫反应并优化疫苗 | 重症COVID-19患者的抗原特异性B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、CITE-Seq、B细胞受体测序（BCR-Seq） | NA | 基因组数据 | 重症COVID-19患者的纵向样本 |
| 19531 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals distinct functional heterogeneity of CD34+ cells in anagen wound and diabetic wound
2023-01-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.11.080
PMID:36463761
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了正常、生长期和糖尿病伤口中的CD34细胞的表型和功能异质性 | 首次揭示了CD34细胞在不同类型伤口中的功能异质性及其对伤口愈合的影响 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证结果 | 探究CD34细胞在不同类型伤口中的功能异质性及其对伤口愈合的影响 | CD34细胞在正常、生长期和糖尿病伤口中的表型和功能 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从小鼠伤口边缘收集的CD34细胞 |
| 19532 | 2024-08-05 |
SCExecute: custom cell barcode-stratified analyses of scRNA-seq data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac768
PMID:36448703
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研究论文 | 本文介绍了SCExecute工具，用于分析条形码分层的单细胞RNA测序数据 | SCExecute支持用户自定义命令在按条形码分层的单细胞对齐文件上执行，填补了现有工具在细胞特征分析中的不足 | 该工具的效用可能受限于用户对命令行的熟悉程度和可用计算资源 | 研究如何使用现有工具对条形码分层的scRNA-seq数据进行定制的细胞水平分析 | 条形码分层的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 序列数据 | 使用了10X Genomics Chromium系统的droplet scRNA-seq数据进行示例 |
| 19533 | 2024-08-05 |
Targeting CCL5 signaling attenuates neuroinflammation after seizure
2023-01, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14006
PMID:36440924
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研究论文 | 该研究旨在探讨CCL5信号通路在癫痫后神经炎症中的作用 | 本研究首次揭示了CCL5/CCR5信号通路在癫痫模型小鼠中的重要性，并展示了通过Maraviroc干预该信号通路的有效性 | 本研究使用的小鼠模型可能无法完全模拟人类癫痫的复杂性 | 研究CCL5/CCR5信号通路在癫痫后神经炎症中的潜在靶向作用 | 癫痫小鼠模型及其海马区域的转录组特征 | 数字病理学 | 癫痫 | 10× Genomics空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 癫痫小鼠数目不明 |
| 19534 | 2024-08-05 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨了CD73生成的细胞外腺苷在胰腺炎中缓解中性粒细胞介导的组织损伤和抑制化生的作用 | 该研究首次揭示了CD73在胰腺炎中的关键作用，并提出CD73增益剂作为潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能在人类患者中存在差异 | 研究CD73在急性和慢性胰腺炎中的作用及其机制 | CD73敲除小鼠与C57BL/6小鼠（野生型） | 数字病理 | 胰腺炎 | 免疫组化和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 组织样本 | CD73小鼠和C57BL/6小鼠 |
| 19535 | 2024-08-05 |
Comprehensive visualization of cell-cell interactions in single-cell and spatial transcriptomics with NICHES
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac775
PMID:36458905
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研究论文 | NICHES是一种工具，用于在单细胞水平上探索细胞之间的外部信号传递。 | NICHES通过嵌入配体-受体信号代理，保留单细胞原始数据的保真性，能够可视化细胞簇内、细胞簇间及不同实验条件下的异质信号类型。 | NA | 研究单细胞和空间转录组数据中细胞间的相互作用。 | 主要关注细胞间的信号传递和微环境传统方法的局限性。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | NA |
| 19536 | 2024-08-05 |
Renoprotective anti-CD45RB antibody induces B cell production in systemic lupus erythematosus based on single-cell RNA-seq analysis
2023-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102949
PMID:36455384
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研究论文 | 该研究探讨了抗-CD45RB抗体在系统性红斑狼疮中的肾保护作用 | 使用单细胞RNA测序分析揭示了抗-CD45RB抗体诱导B细胞生成的机制 | 在小鼠模型中评估，可能无法完全反映人类的病理机制 | 识别系统性红斑狼疮中肾损伤的机制 | 分析了系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞及NZB/WF1小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 从GEO数据库提取的系统性红斑狼疮患者的外周血单核细胞数据 |
| 19537 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Brain Endothelium Inflammatory Networks in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2023-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200046
PMID:36446612
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组学描绘了实验性自身免疫性脑脊髓炎中大脑内皮细胞的炎症网络 | 该研究首次揭示了静脉内皮细胞在神经炎症中的重要作用，并提供了神经炎症相关细胞异质性的概貌 | 该研究主要集中在动物模型中，尚需进一步验证在人类疾病中的相关性 | 探索自身免疫性脑脊髓炎模型中的神经炎症过程及其分子机制 | 以实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠为研究对象，鉴定与神经炎症相关的内皮细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠及人类多发性硬化症脑部切片 |
| 19538 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals a high selection of IgA1- or IgG1-expressing plasma cells in patients with psoriasis
2023-Jan, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2022.11.015
PMID:36459791
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞抗原受体序列分析，探讨了银屑病患者中B细胞介导的体液免疫反应的变化 | 首次揭示了银屑病患者中IgA1和IgG1表达的浆细胞数量显著增加，并发现B细胞受体在CDR和框架区域的强选择压力 | 研究样本仅包括三名健康捐赠者和三名银屑病患者，样本量较小 | 探索银屑病对B细胞介导的体液免疫反应的影响 | 银屑病患者的B细胞及其介导的体液免疫反应 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞抗原受体序列（BCR）测序（scBCR-seq） | NA | 细胞数据 | 三名健康捐赠者和三名银屑病患者的外周血单个核细胞（PBMC） |
| 19539 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights the roles of C1QB and NKG7 in the pancreatic islet immune microenvironment in type 1 diabetes mellitus
2023-01, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106588
PMID:36464147
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨C1QB和NKG7在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中的作用机制 | 首次揭示C1QB和NKG7在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中对巨噬细胞和T淋巴细胞的关键影响 | 研究主要基于数据库数据和构建的动物模型，未来需进一步在人体样本中验证 | 探讨C1QB和NKG7在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中的作用 | C1QB和NKG7基因在1型糖尿病胰腺胰岛免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 大量胰腺胰岛样本，包括14种细胞类型 |
| 19540 | 2024-08-08 |
Naïve B cells with low differentiation improve the immune reconstitution of HIV-infected patients
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105559
PMID:36465118
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的B细胞受体（BCR）谱和B细胞亚型，发现幼稚B细胞和记忆B细胞的基因片段使用主导，且BCR谱的多样性在免疫非应答者中降低。 | 研究发现幼稚B细胞的低分化与良好的免疫状态相关，并揭示了B细胞周期中免疫特异性基因IgD细胞在免疫非应答者中的降解机制。 | NA | 理解HIV感染后B细胞介导的免疫反应在免疫重建中的作用 | HIV感染患者的B细胞亚型和BCR谱 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的外周血单个核细胞 |