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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19501 | 2024-08-07 | Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression 
          2024-Mar-18, npj aging
          
          IF:4.1Q2
          
         
          DOI:10.1038/s41514-024-00145-5
          PMID:38499592
         | 研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病(AD)患者大脑中的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了在tauopathy进展过程中,从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | NA | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 | 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19502 | 2024-08-07 | Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment 
          2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS
          
          IF:8.2Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12964-024-01538-5
          PMID:38475799
         | research paper | 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 | NA | 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | Inflammatory bowel diseases (IBD) | RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | NA | NA | NA | 
| 19503 | 2024-08-04 | Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing 
          2023-Mar, Biophysics reviews
          
          IF:2.9Q2
          
         
          DOI:10.1063/5.0091135
          PMID:38505815
         | 综述 | 本文综述了用于空间转录组学分析的深度学习方法 | 提出了利用深度学习模型解决空间转录组学特定挑战的新方法 | 目前深度学习模型尚处于初期阶段,需要进一步探索 | 研究深度学习在空间转录组学中的应用及其潜力 | 空间转录组学的数据分析方法 | 机器学习 | NA | 转录组学 | 深度学习模型 | 多模态数据,包括组织学图像和计数矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19504 | 2024-08-07 | Single-cell sequencing of diverse microorganisms 
          2024-Apr, Nature reviews. Genetics
          
         
          DOI:10.1038/s41576-024-00708-y
          PMID:38366032
         | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19505 | 2024-08-07 | Spatially Resolved Tumor Microenvironment Predicts Treatment Outcomes in Relapsed/Refractory Hodgkin Lymphoma 
          2024-Mar-20, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
          
          IF:42.1Q1
          
         
          DOI:10.1200/JCO.23.01115
          PMID:38113419
         | 研究论文 | 研究通过空间解析的肿瘤微环境(TME)生态系统,为复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤(r/r CHL)的治疗失败建立新型生物标志物 | 开发了一种新的预后模型RHL4S,利用TME生物学特性,适用于r/r CHL活检,为空间生物标志物的发展开辟了新途径 | NA | 描述空间解析的肿瘤微环境生态系统,建立与r/r CHL治疗失败相关的生物标志物 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 成像质谱流式细胞术(IMC) | NA | 图像 | 71对原发诊断和复发活检样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19506 | 2024-08-04 | ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models 
          2024-03, Cell death and differentiation
          
          IF:13.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41418-024-01258-w
          PMID:38321214
         | 研究论文 | 本研究探讨了Wolfram综合征中胰腺β细胞功能失衡的机制以及ISR抑制剂的治疗潜力 | 首次在Wolfram综合征模型中揭示ISR作为β细胞失功能的关键机制,并验证了ISR抑制剂的治疗效果 | 在研究中可能忽略了其他潜在的治疗路径或机制 | 研究Wolfram综合征模型中胰腺β细胞失功能的病因及潜在治疗方法 | WFS1缺乏的胰腺β细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠Wfs1特异性敲除模型 | 细胞数据 | 人体多能干细胞衍生的胰岛细胞(NA)和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 19507 | 2024-08-04 | Integrated analysis reveals crosstalk between pyroptosis and immune regulation in renal fibrosis 
          2024, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2024.1247382
          PMID:38343546
         | 研究论文 | 这项研究探讨了程序性焦亡在肾纤维化中的免疫微环境调节中的潜在作用 | 本研究揭示了程序性焦亡与免疫调节之间的交叉作用,并识别了五种中心调节因子作为肾纤维化的生物标志物 | 本研究的局限性在于使用的是动物模型,可能无法完全反映人类肾纤维化的复杂性 | 研究肾纤维化中程序性焦亡与免疫微环境之间的关系 | 研究对象为肾纤维化患者的样本和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包括肾纤维化和正常肾样本的27个程序性焦亡相关调节因子的评估 | NA | NA | NA | NA | 
| 19508 | 2024-08-07 | "The Good, the Bad, and the Ugly" - About Diverse Phenotypes of Hepatic Stellate Cells in the Liver 
          2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
          
          IF:7.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.002
          PMID:38216053
         | research paper | 本文探讨了肝星状细胞(HSCs)及其激活衍生物在慢性肝损伤进展中的多样性表型及其作用 | 利用遗传谱系追踪模型和单细胞转录组及蛋白质组分析技术,揭示了HSC和MF群体在健康状态及慢性肝损伤各阶段组织变形中的隐藏异质性 | NA | 识别HSC/MF轴上的不同表型,为针对特定MF表型作为慢性肝损伤潜在治疗方法奠定基础 | 肝星状细胞(HSCs)及其激活衍生物,即肌成纤维细胞(MFs) | NA | 肝病 | 遗传谱系追踪模型,单细胞转录组及蛋白质组分析 | NA | 转录组,蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19509 | 2024-08-07 | Identifying biomarkers of heterogeneity and transplantation efficacy in retinal pigment epithelial cells 
          2023-12-04, The Journal of experimental medicine
          
          IF:12.6Q1
          
         
          DOI:10.1084/jem.20230913
          PMID:37728563
         | 研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了成人RPE干细胞衍生的RPE细胞产品,评估了其在体外和体内的功能细胞整合及视觉恢复效果 | 本文首次鉴定了lncRNA(TREX)作为体内疗效的预测标记物,并通过敲低和过表达实验验证了其在细胞整合和视觉恢复中的作用 | NA | 提高视网膜色素上皮细胞移植疗法的疗效和安全性 | 视网膜色素上皮细胞的异质性和移植效果的生物标志物 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及Royal College of Surgeons大鼠 | NA | NA | NA | NA | 
| 19510 | 2024-08-05 | Tumor macrophage functional heterogeneity can inform the development of novel cancer therapies 
          2023-12, Trends in immunology
          
          IF:13.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.it.2023.10.007
          PMID:37995659
         | 研究论文 | 本文讨论了肿瘤相关巨噬细胞的功能异质性及其对癌症新疗法开发的影响 | 识别出巨噬细胞的分子亚型和功能,从而发现新的治疗靶点 | 传统治疗方法未能提供改变临床实践的突破性进展 | 提高对肿瘤微环境中巨噬细胞作用的理解,并推动新型靶向治疗的发展 | 聚焦于肿瘤微环境中的巨噬细胞功能及其潜在治疗靶点 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19511 | 2024-08-07 | A single-cell atlas of immunocytes in the spleen of a mouse model of Wiskott-Aldrich syndrome 
          2023 Nov-Dec, Cellular immunology
          
          IF:3.7Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.cellimm.2023.104783
          PMID:37944382
         | 研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型的脾脏免疫细胞进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下揭示了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的转录特征,并鉴定了与疾病病理相关的新基因 | NA | 探究Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞的免疫缺陷机制 | WAS-KO小鼠脾脏的免疫细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,269个细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 19512 | 2024-08-05 | Single-cell transcriptomics reveals subtype-specific molecular profiles in Nrf2-deficient macrophages from murine atherosclerotic aortas 
          2023, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2023.1249379
          PMID:37965327
         | 研究论文 | 本研究分析了小鼠动脉粥样硬化主动脉中缺乏Nrf2的巨噬细胞亚群的转录组 | 揭示了Nrf2缺乏导致的巨噬细胞亚型特异性转录组变化与炎症、铁稳态和细胞损伤或死亡途径之间的联系 | 仅使用了特定的小鼠模型,可能限制了结果的普遍适用性 | 研究Nrf2在小鼠动脉粥样硬化中的具体作用 | 来自小鼠动脉粥样硬化主动脉的不同Nrf2缺乏的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 实验中使用了Cdh5表达细胞中的Nrf2失活小鼠和适当的对照小鼠 | NA | NA | NA | NA | 
| 19513 | 2024-08-07 | Modeling gene expression cascades during cell state transitions 
          2024-Apr-19, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.isci.2024.109386
          PMID:38500834
         | 研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据和贝叶斯推理方法,对细胞状态转换过程中的基因表达动态变化进行建模 | 提出了一种贝叶斯推理方法来推断伪时间序列中细胞的转录动态,从而能够对基因表达的时序差异和调控基因相互作用进行分析 | NA | 研究细胞在分化或对外界刺激响应过程中的基因表达动态变化 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 贝叶斯推理模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | 
| 19514 | 2024-08-07 | Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor 
          2024-Apr, The Journal of surgical research
          
          IF:1.8Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
          PMID:38295715
         | 研究论文 | 本文研究了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素表达及通过PLXNB2受体的信号传导 | 首次在人类结直肠癌组织中发现肌成纤维细胞中血管生成素和PLXNB2受体表达上调,并探讨了其在肿瘤-基质细胞通讯中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未涉及临床样本的直接验证 | 探讨血管生成素在人类结直肠癌中的作用及其与肌成纤维细胞的通讯机制 | 结直肠癌组织及其周围的肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 配对的正常人类结肠和结直肠癌组织样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19515 | 2024-08-07 | IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects 
          2024-Apr-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
          
         
          DOI:10.4049/jimmunol.2300545
          PMID:38391297
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨IDO1抑制剂在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤细胞的影响 | 发现IDO1抑制剂不仅激活肿瘤内免疫细胞,还促进M2巨噬细胞的浸润和IL-6的分泌,进而激活JAK2/STAT3信号通路,导致肿瘤细胞在高度免疫活性下仍能存活 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类临床试验中验证这些发现 | 探究IDO1抑制剂在癌症治疗中的临床失败原因及其对肿瘤微环境的影响 | IDO1抑制剂对肿瘤内免疫细胞和肿瘤细胞的影响 | 癌症治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠结肠癌细胞CT26移植于BALB/C小鼠 | NA | NA | NA | NA | 
| 19516 | 2024-08-04 | Identification of macrophage-related genes correlated with prognosis and immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer 
          2024-Mar-30, Heliyon
          
          IF:3.4Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27170
          PMID:38500993
         | 研究论文 | 本文研究了与非小细胞肺癌预后及免疫疗效相关的巨噬细胞相关基因 | 本研究首次识别出与非小细胞肺癌患者预后和免疫疗效相关的特定巨噬细胞相关基因 | 缺乏临床验证和更大规模的样本确认 | 探索能预测非小细胞肺癌预后和药物有效性的基因标志物 | 非小细胞肺癌及其周围组织中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 19517 | 2024-08-07 | Single-cell RNA sequencing unveils the hidden powers of zebrafish kidney for generating both hematopoiesis and adaptive antiviral immunity 
          2024-Mar-18, eLife
          
          IF:6.4Q1
          
         
          DOI:10.7554/eLife.92424
          PMID:38497789
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了斑马鱼肾脏在造血和适应性抗病毒免疫中的双重功能 | 首次全面展示了斑马鱼肾脏中59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型,并揭示了其在抗病毒免疫中的多样性功能 | NA | 阐明斑马鱼肾脏在造血和免疫系统中的功能 | 斑马鱼肾脏中的造血干细胞/祖细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA | 
| 19518 | 2024-08-07 | scRNA-seq analysis discovered suppression of immunomodulatory dependent inflammatory response in PMBCs exposed to silver nanoparticles 
          2024-Mar-17, Journal of nanobiotechnology
          
          IF:10.6Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12951-024-02364-0
          PMID:38494495
         | 研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析揭示了银纳米颗粒暴露下PBMCs中免疫调节依赖性炎症反应的抑制 | 本研究首次深入分析了单细胞水平上细胞与金属离子的关联以及特定的免疫反应 | 研究主要集中在体外模型,未涉及体内模型的验证 | 探究银纳米颗粒对PBMCs的免疫毒性 | 银纳米颗粒对PBMCs的免疫反应 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19519 | 2024-08-04 | Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal a transcriptomic atlas of adult human spinal cord 
          2024-Jan-30, eLife
          
          IF:6.4Q1
          
         
          DOI:10.7554/eLife.92046
          PMID:38289829
         | 研究论文 | 该文章揭示了成人人体脊髓的转录组图谱,分类了脊髓神经元并分析了其空间分布 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组技术对成人脊髓神经元进行详细分类和空间分布研究 | 成人脊髓的细胞异质性的分子证据相对有限 | 研究成人脊髓神经元的类型和功能异质性 | 来自九名人类供体的脊髓神经元 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单核RNA测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 来自九名人类供体的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 19520 | 2024-08-07 | Opportunities and tradeoffs in single-cell transcriptomic technologies 
          2024-01, Trends in genetics : TIG
          
          IF:13.6Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.tig.2023.10.003
          PMID:37953195
         | review | 本文综述了单细胞转录组技术的最新进展及其优缺点 | 介绍了长读长测序方法在单细胞转录组分析中的应用,突破了以往全转录组表征的障碍 | 单细胞转录组分析中仍存在细胞数量与全长转录本覆盖度之间的权衡问题 | 全面概述单细胞转录组分析的可用选项,并强调每种方法的关键优缺点 | 单细胞转录组技术及其应用 | NA | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |