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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2025-11-25 |
Comprehensive multi-omics analysis identifies transferrin receptor as a therapeutic target in esophageal cancer
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148121
PMID:41067362
|
研究论文 | 通过多组学方法鉴定转铁蛋白受体(TFRC)作为食管癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、转录组分析和基因组关联研究,系统揭示TFRC在食管癌免疫逃逸中的关键作用机制 | NA | 识别食管癌的新型生物标志物并探索其在疾病进展中的作用 | 食管癌样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因表达数量性状位点分析,全基因组关联研究,多重免疫荧光检测 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1922 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals oocyte-granulosa crosstalk and regulatory networks driving chicken primordial follicle assembly
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148357
PMID:41109371
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鸡原始卵泡组装过程中卵母细胞与颗粒细胞的相互作用及调控网络 | 首次构建鸡生殖细胞和颗粒细胞的单细胞转录组图谱,揭示原始卵泡组装过程中的细胞异质性和双向调控机制 | 研究局限于鸡模型,调控机制在其它物种中的普适性需要进一步验证 | 解析鸡原始卵泡组装的分子调控机制 | 鸡卵巢生殖细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, Pseudotime轨迹分析, CellChat | 单细胞转录组数据 | 鸡卵巢关键发育阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1923 | 2025-11-25 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
|
综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类系统及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统整合了基于基因表达谱、免疫组化和深度学习图像分析的CMS分类方法,并探讨了单细胞测序解决肿瘤内异质性的新策略 | 肿瘤内异质性和技术障碍限制了临床应用的广泛采纳 | 评估CMS分类在结直肠癌预后预测和治疗指导中的价值 | 结直肠癌分子亚型及其临床特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析,免疫组化,单细胞RNA测序,深度学习 | 深度学习 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1924 | 2025-11-25 |
Adipose-derived mesenchymal stem cell therapy modulates mitochondrial function to attenuate acetaminophen-induced liver injury by DDIT4/PGC-1α axis
2025-Nov-24, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04815-3
PMID:41276869
|
研究论文 | 本研究探讨脂肪来源间充质干细胞通过DDIT4/PGC-1α轴调节线粒体功能缓解对乙酰氨基酚诱导肝损伤的机制 | 首次揭示AMSCs通过DDIT4介导的PGC-1α上调诱导线粒体生物发生和线粒体自噬,从而恢复线粒体功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究间充质干细胞治疗对乙酰氨基酚诱导肝损伤的线粒体功能调节机制 | 对乙酰氨基酚诱导肝损伤小鼠模型、肝细胞特异性DDIT4敲除小鼠、AILI患者肝组织样本 | 细胞治疗 | 药物性肝损伤 | RNA-Seq, snRNA-Seq, 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | 小鼠模型和患者肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1925 | 2025-11-25 |
PBMCpedia: a harmonized PBMC scRNA-seq database with unified mapping and enhanced celltype annotation
2025-Nov-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1245
PMID:41277528
|
研究论文 | 本研究构建了一个统一处理与注释的PBMC单细胞RNA测序数据库PBMCpedia | 通过标准化流程统一处理24项公开研究的519个样本,提供跨疾病、细胞类型、性别和年龄组的元数据感知比较 | 仅包含公开可用数据,未涉及新样本采集 | 解决PBMC单细胞转录组研究中数据整合困难的问题 | 外周血单个核细胞(PBMC) | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病,传染病,神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体/B细胞受体谱数据,表面蛋白测量数据 | 519个样本(超过430万个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1926 | 2025-11-25 |
Single-cell transcriptome profiling reveals immunological fitness of HIV long-term non-progressors
2025-Nov-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01597-25
PMID:41277843
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HIV长期不进展者的免疫适应性特征 | 首次在单细胞水平系统比较HIV长期不进展者、典型进展者和健康捐赠者的免疫细胞转录组差异 | 样本量较小(仅12名参与者),仅分析外周血单个核细胞 | 研究HIV长期不进展者的免疫学特征与非进展机制 | HIV长期不进展者、典型进展者和健康捐赠者的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | 单细胞转录组数据 | 12名个体(4名LTNP、4名TP、4名HD) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1927 | 2025-11-25 |
Cmss1 limits FMDV infection by enhancing antigen presentation and CD8+ T cell responses
2025-Nov-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01249-25
PMID:41277842
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了树突状细胞在口蹄疫病毒感染中的作用,并发现Cmss1通过增强抗原呈递和CD8+ T细胞反应限制病毒感染 | 首次开发了缺乏I型干扰素受体的小鼠感染模型,通过单细胞RNA测序绘制了FMDV感染小鼠脾脏DC的高分辨率图谱,并鉴定出Cmss1作为新的宿主因子 | 研究主要使用小鼠模型,结果在猪等自然宿主中的适用性需要进一步验证 | 探究树突状细胞在口蹄疫病毒感染中的作用机制,寻找抗病毒治疗新靶点 | 缺乏I型干扰素受体的C57BL/6小鼠、树突状细胞、FMDV病毒 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序、基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 感染FMDV的小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1928 | 2025-11-25 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2025-Nov-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术,探索宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络及苦参碱的治疗潜力 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术系统揭示宫颈癌代谢-免疫相互作用网络,并发现苦参碱通过调控钙信号通路和炎症相关基因发挥抗肿瘤作用 | 苦参碱的确切作用机制尚未完全明确,研究结果主要基于生物信息学分析和初步体外实验 | 探索宫颈癌的分子机制及苦参碱的治疗潜力,为宫颈癌治疗提供新的研究方向 | 宫颈癌组织样本及相关基因数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,空间转录组,生物信息学分析,分子对接 | CIBERSORT算法,ESTIMATE算法 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 从TCGA数据库筛选758个差异基因,其中453个与宫颈癌靶点重叠,发现20个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | NA |
| 1929 | 2025-11-25 |
Azvudine remodels the local immunosuppressive microenvironment and exhibits sustained anti-tumor effects in combination with anti-PD-1 therapies
2025-Nov-24, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-025-1164-0
PMID:41284146
|
研究论文 | 本研究探讨阿兹夫定单用或联合抗PD-1疗法对肿瘤微环境的免疫调节作用及抗肿瘤效果 | 首次揭示阿兹夫定通过诱导免疫原性细胞死亡和重塑免疫抑制微环境增强抗PD-1疗法的协同抗肿瘤作用 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型,需进一步临床验证在不同肿瘤类型中的转化潜力 | 评估阿兹夫定在肿瘤免疫治疗中的免疫调节机制和联合治疗潜力 | 免疫健全小鼠建立的同系肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫学检测 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 免疫健全小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1930 | 2025-11-25 |
Prognostic and Immunological Significance of TIPARP in Pancreatic Cancer
2025-Nov-24, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09546-2
PMID:41284141
|
研究论文 | 本研究探讨了TIPARP在胰腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 首次系统揭示TIPARP在胰腺癌中的独立预后价值、免疫调节功能及其通过PI3K-Akt信号通路促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证主要在体外进行,缺乏体内动物模型验证 | 阐明TIPARP在胰腺癌中的临床意义和生物学功能 | 胰腺导管腺癌(PAAD)患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫浸润分析,孟德尔随机化分析,体外功能实验,通路富集分析 | 列线图(nomogram) | 基因表达数据,临床数据,单细胞转录组数据 | TCGA-PAAD数据库178例,GTEx数据库171例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1931 | 2025-11-25 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
|
研究论文 | 本研究揭示了LRP12通过激活AKT/mTOR信号通路和诱导M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展的机制 | 首次发现LRP12作为炎症相关基因在胃癌中的预后价值,并阐明其通过AKT/mTOR信号和M2巨噬细胞极化双重机制促进肿瘤进展 | 研究主要基于实验模型验证,临床转化价值仍需进一步人群研究确认 | 鉴定胃癌炎症相关生物标志物并探索其调控肿瘤免疫微环境的机制 | 胃癌细胞系、公共数据集、内部患者队列、异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞转录组学、多重免疫荧光/免疫组化、Western blotting、细胞增殖和侵袭实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质印迹数据、免疫组化图像 | 公共数据集与内部队列整合分析,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1932 | 2025-11-25 |
Metabolic reprogramming and mitochondrial dysfunction underlie β gonia arrest and niche cell dysfunction in sterile triploid oysters
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09202-5
PMID:41276684
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序技术,揭示了三倍体牡蛎不育的分子机制,重点关注β精原细胞停滞和生态位细胞功能障碍 | 首次构建了不育三倍体牡蛎性腺的空间分辨分子图谱,揭示了SOHLH2沉默驱动的线粒体功能障碍和NOTCH-Hes1a-CCNA2信号介导的生态位细胞G期阻滞 | 由于牡蛎性腺缺乏明确结构边界,细胞类型鉴定具有挑战性 | 阐明三倍体牡蛎不育的分子基础 | 雌性三倍体太平洋牡蛎的性腺组织 | 空间转录组学 | 不育症 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1933 | 2025-11-25 |
Integrated multi-omics analysis identifies key biomarkers associated with post-translational modifications and RNA methylation in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04074-x
PMID:41276708
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研究论文 | 通过整合多组学数据分析,识别与透明细胞肾细胞癌中翻译后修饰和RNA甲基化相关的关键生物标志物 | 首次系统整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,结合20种PTM类型和4种RNA甲基化模式,识别ccRCC中的关键生物标志物和分子亚型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明ccRCC肿瘤发生机制和肿瘤微环境动态,为诊断和治疗提供新见解 | 透明细胞肾细胞癌 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM,随机森林,SHAP | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE16449,GSE46699,GSE53000,GSE53757,GSE66272) | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1934 | 2025-11-25 |
Prediction of prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma and immune microenvironment infiltration based on single-cell sequencing and RNA-Seq integration
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04094-7
PMID:41276703
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-Seq数据,识别肝细胞癌的预后生物标志物并探索其在免疫微环境浸润中的作用 | 首次构建肝细胞癌单细胞转录组图谱,整合多组学数据识别T细胞相关预后基因,建立风险分层模型 | 样本量相对有限(8个肿瘤样本和7个正常组织样本),需要更大规模验证 | 识别肝细胞癌预后生物标志物并探索免疫微环境浸润特征 | 肝细胞癌患者组织样本中的T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 | 15个组织样本(8个肿瘤,7个正常),包含53,477个细胞,其中12,333个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1935 | 2025-11-25 |
Influenza virus and Staphylococcus aureus super-infection disrupts spatially coordinated cellular immunity in the mouse lung
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09268-1
PMID:41276707
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了流感病毒与金黄色葡萄球菌超级感染如何破坏小鼠肺部免疫细胞的空间协调 | 首次采用空间转录组学平台系统表征超级感染期间免疫细胞的协调机制,填补了传统研究对免疫细胞空间背景认识的空白 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究流感病毒与细菌超级感染对肺部免疫细胞空间分布和功能协调的影响机制 | 小鼠肺部组织及其中免疫细胞(中性粒细胞、间质巨噬细胞、CD4 T细胞、B细胞、树突状细胞) | 空间转录组学 | 肺部感染 | 空间转录组学、免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 超级感染组、单纯流感感染组和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染组的小鼠肺部样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1936 | 2025-11-25 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性及功能特征 | 首次在结肠癌中系统鉴定SPP1+巨噬细胞亚型,揭示其通过代谢重编程和基质互作促进肿瘤进展的新机制 | 样本量较小(仅3例患者),缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞亚群的功能异质性 | 结肠癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析、转录因子网络分析、细胞通讯分析、计算机模拟基因敲除 | 单细胞转录组数据 | 3例结肠癌患者的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1937 | 2025-11-25 |
Machine learning multiomics Deciphers GRHL2 associated tumor microenvironment evolution guiding precision therapeutics in breast cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04120-8
PMID:41276739
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据全面解析GRHL2在乳腺癌中的预后和免疫学意义 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据系统揭示GRHL2在乳腺癌肿瘤微环境演变中的作用 | GRHL2在乳腺癌中的具体分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明GRHL2在乳腺癌预后和免疫调节中的功能 | 乳腺癌患者的多组学数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | CoxBoost回归,InferCNV | RNA测序数据 | 多个队列的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1938 | 2025-11-25 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
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研究论文 | 本研究开发了一种多酶纳米催化剂系统,通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 首次设计单原子纳米酶Co-SAE表面修饰胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin,同时靶向胰腺腺泡细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于实验模型验证,尚未进行临床试验 | 开发新型纳米催化疗法治疗急性胰腺炎 | 胰腺腺泡细胞和急性胰腺炎动物模型 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、生化指标 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1939 | 2025-11-25 |
Midkine-Mediated Microglia Activation after Renal Injury Promotes Cognitive Impairment Following Ischemic Renal Injury
2025-Nov-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507832
PMID:41276912
|
研究论文 | 本研究探讨了肾脏损伤后上调的midkine通过激活小胶质细胞导致认知功能障碍的机制 | 首次揭示了MDK-LRP1轴在肾脏缺血损伤后认知功能障碍中的关键介导作用 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索缺血性肾损伤后认知功能障碍的分子机制 | 小鼠模型中的肾脏组织和海马体 | 神经科学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,配体-受体相互作用分析,shRNA腺病毒 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1940 | 2025-11-25 |
Sympathovagal crosstalk: Y2-receptor blockade enhances vagal effects which in turn reduce NPY levels via muscarinic receptor activation
2025-Nov-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf180
PMID:41052902
|
研究论文 | 本研究通过体内外实验揭示了迷走神经刺激通过M2受体机制降低神经肽Y水平,且Y2受体阻断可增强迷走神经效应 | 首次在体内证实迷走神经激活通过突触前交感M2受体机制降低间质NPY水平,并发现Y2受体阻断可增强迷走神经效应 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体验证 | 探究迷走神经刺激降低神经肽Y的机制及Y2受体阻断对自主神经平衡的调节作用 | 大鼠星状神经节细胞、猪模型 | 神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、场刺激、实时间质NPY水平检测 | 动物模型 | 基因表达数据、电生理数据、血流动力学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |