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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1921 | 2025-10-06 |
Predictive model for proliferative diabetic retinopathy using single-cell transcriptomics
2025-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110536
PMID:40701535
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据开发了增殖性糖尿病视网膜病变的预测模型 | 首次整合PDR患者纤维血管膜和健康供体视网膜的单细胞转录组数据,并开发了基于机器学习的预测模型 | 样本量相对较小,仅包含9个PDR患者的纤维血管膜样本 | 探索增殖性糖尿病视网膜病变的细胞和分子机制,并开发预测工具 | PDR患者的纤维血管膜和健康供体的视网膜组织 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,GO和KEGG富集分析 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 9个PDR患者的纤维血管膜样本和健康供体视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1922 | 2025-10-06 |
CXCR4+ monocytes promote neovascularization in wet age-related macular degeneration
2025-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110550
PMID:40713972
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研究论文 | 本研究通过整合分析方法揭示了湿性年龄相关性黄斑变性中CXCR4+单核细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴促进病理性血管生成的新机制 | 首次发现MMP2+内皮细胞具有血管生成和干细胞样双重特性,并鉴定CXCR4+单核细胞为病理性血管生成的关键介质,确立RUNX3为促血管生成单核细胞分化的主要调控因子 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征,机制研究主要依赖实验模型 | 阐明湿性年龄相关性黄斑变性中趋化因子信号在血管生成中的作用并鉴定关键单核细胞亚群 | 湿性年龄相关性黄斑变性相关的血管生成和炎症过程 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | bulk RNA测序, 单细胞转录组学, 多重免疫组织化学, 体内模型 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1923 | 2025-10-06 |
Multimodal profiling of oral squamous cell carcinoma identifies genomic alterations and expression programs associated with betel quid chewing
2025-Oct, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101218
PMID:40784158
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研究论文 | 通过多组学方法研究槟榔咀嚼与口腔鳞状细胞癌的基因组改变和表达程序关联 | 首次通过整合外显子组测序、单细胞转录组和空间转录组学系统揭示槟榔相关口腔癌的独特基因组特征和肿瘤微环境变化 | 研究样本仅包含男性患者,缺乏女性患者数据;样本量相对有限 | 阐明槟榔咀嚼导致口腔鳞状细胞癌的详细分子机制 | 261例男性口腔鳞状细胞癌患者(129例习惯性槟榔咀嚼者,132例非槟榔使用者) | 癌症基因组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 外显子组测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间表达数据 | 261例肿瘤-正常组织配对样本 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1924 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals that RNA pseudouridylation-related gene NHP2 promotes the progression of uveal melanoma and validated in vivo and in vitro
2025-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110578
PMID:40812391
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现RNA假尿苷化相关基因NHP2促进葡萄膜黑色素瘤进展,并在体内外实验中验证其功能 | 首次揭示RNA假尿苷化相关基因NHP2在葡萄膜黑色素瘤中的关键作用及其分子机制 | NA | 探究RNA假尿苷化相关基因在葡萄膜黑色素瘤进展中的作用机制 | 葡萄膜黑色素瘤组织和细胞系 | 单细胞测序 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组化,Western blotting,基因敲低,基因过表达,CCK-8,集落形成,Edu,划痕愈合,Transwell,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1925 | 2025-10-06 |
Antioxidant functionalized double-net/TA dynamic hydrogel promotes cartilage regeneration through stabilization of chondrocyte phenotype
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102203
PMID:40893359
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研究论文 | 本研究开发了一种具有抗氧化功能的双网络/单宁酸动态水凝胶,通过稳定软骨细胞表型促进软骨再生 | 首次揭示软骨细胞在扩增过程中代谢模式从糖酵解向氧化磷酸化的转变,并基于此设计具有抗氧化功能的DN-TA水凝胶系统 | 研究主要基于小鼠皮下植入模型,临床转化效果需要进一步验证 | 探索代谢调控对软骨细胞表型稳定性的影响,开发促进软骨再生的组织工程策略 | 软骨细胞 | 组织工程 | 软骨缺损 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | P3代软骨细胞 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1926 | 2025-10-06 |
MIG-6 Plays a Critical Role as a PGR Mediator in Maintaining Epithelial and Stromal Cells for Uterine Receptivity
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501455R
PMID:40905903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了MIG-6作为孕酮受体关键介质在维持子宫容受性中的细胞特异性作用机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示MIG-6缺陷对子宫内膜上皮和基质细胞基因表达的特异性影响,并发现LRP2在子宫内膜异位症不孕患者中的表达异常 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究MIG-6缺陷如何破坏子宫细胞群体特异性功能从而导致子宫内膜容受性异常 | 子宫特异性Mig-6基因敲除小鼠的子宫内膜细胞 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mig-6基因敲除小鼠和对照小鼠的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1927 | 2025-10-06 |
Vascular Normalization Augments the Antitumor Efficacy of Combined HDAC Inhibitor with Immunotherapy in Solid Tumors
2025-Sep-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1033
PMID:40452600
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶抑制剂联合抗血管生成治疗可增强免疫疗法在实体瘤中的抗肿瘤疗效 | 首次发现HDAC抑制剂通过增强CD8+T细胞染色质可及性提升其抗肿瘤能力,但同时会诱导巨噬细胞产生VEGFA导致血管异常化,提出三联疗法克服此限制 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证 | 探索优化实体瘤免疫治疗的联合用药策略 | 实体瘤患者样本和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1928 | 2025-10-06 |
A multiomic analysis of Waldenström macroglobulinemia defines distinct disease subtypes
2025-Sep-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028164
PMID:40332467
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研究论文 | 通过对华氏巨球蛋白血症进行单细胞多组学分析,定义了两种不同的疾病亚型 | 首次通过单细胞多组学技术识别出华氏巨球蛋白血症的两种分子亚型,并揭示了其不同的分化能力和分子特征 | 研究样本数量有限,需要更大规模的研究验证亚型分类的普适性 | 解析华氏巨球蛋白血症的分子异质性并定义疾病亚型 | MYD88突变的华氏巨球蛋白血症患者 | 单细胞多组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,全基因组测序,批量RNA测序 | 伪时间轨迹分析,层次聚类 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,基因组数据 | 一系列MYD88突变WM患者及第二组验证患者 | NA | 单细胞多组学,单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,全基因组测序,批量RNA测序 | NA | NA |
1929 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Sep-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70351
PMID:40904198
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术揭示了小麦发育种子中基因表达的空间组织模式 | 首次在小麦种子发育关键期实现亚细胞分辨率的空间转录组分析,发现胚乳中四个同心圆状基因表达区域,并识别出亚基因组偏向表达的关键基因 | 研究仅针对14 DPA(花后天数)的小麦种子,未覆盖整个种子发育过程 | 探索小麦发育种子中基因表达的空间组织模式及其功能意义 | 小麦(Triticum aestivum)发育中的种子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过4,000,000个空间分辨的转录本 | STOmics | 空间转录组学 | STOmics空间转录组平台 | STOmics空间转录组平台 |
1930 | 2025-10-06 |
CHIP ahoy: charting a decade of discovery in clonal hematopoiesis
2025-Sep-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283896
PMID:40905074
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综述 | 回顾克隆性造血领域十年来的研究进展,涵盖检测技术、驱动基因、临床意义及治疗策略 | 系统总结单细胞测序和计算模型在检测低频变异方面的突破,揭示遗传与获得性因素的复杂相互作用 | 不同测序方法在准确性、成本和低频变异检测能力方面存在差异 | 探索克隆性造血的生物学机制、临床意义及精准治疗策略 | 造血干细胞及其年龄相关突变 | 血液病学 | 髓系恶性肿瘤 | 下一代测序, 单细胞测序, 计算建模 | 风险分层模型 | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1931 | 2025-10-06 |
Decoding Xylem Development in Flowering Plants: Insights From Single-Cell Transcriptomics
2025-Sep-04, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70169
PMID:40905378
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综述 | 本文总结了单细胞转录组测序技术在解码开花植物木质部发育中的应用进展 | 整合原位转录组分析技术以提供更准确的细胞类型注释,并支持当前最佳的木质部发育谱系工作模型 | 存在跨研究比较的技术挑战,包括生物信息学流程不一致、原生质体效率变异和可能错误注释的标记基因使用 | 研究开花植物木质部发育过程 | 单子叶植物和双子叶植物的初生和次生木质部 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 激光显微切割 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1932 | 2025-10-06 |
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Sep-04, European journal of epidemiology
IF:7.7Q1
DOI:10.1007/s10654-025-01284-z
PMID:40906027
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研究论文 | 通过前瞻性队列研究探讨血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险的关联 | 首次联合分析代谢风险评分与生活方式因素对结直肠癌风险的交互作用,并利用单细胞RNA测序识别结直肠癌进展中的代谢相关基因和通路 | 观察性研究设计无法确定因果关系,研究人群仅限于英国生物银行参与者 | 评估代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险的关联及其与生活方式因素的联合效应 | 英国生物银行中的82,514名参与者 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | LASSO-COX, 随机森林, Cox回归, 单细胞RNA测序 | COX回归模型, 随机森林 | 血浆代谢物数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据 | 82,514名参与者,其中1,151例结直肠癌病例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1933 | 2025-10-06 |
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Sep-04, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70025
PMID:40906332
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研究论文 | 本研究揭示了HLA-A*02:01呈递青霉素修饰的半胱氨酸化肽段激活T细胞的分子机制 | 首次发现青霉素优先修饰HLA-A*02:01免疫肽组中的半胱氨酸残基,并通过二硫键介导的肽段修饰机制激活T细胞 | 研究仅针对单一HLA等位基因和单个过敏患者,样本规模有限 | 阐明β-内酰胺抗生素引发T细胞介导过敏反应的分子机制 | 青霉素修饰的HLA肽段复合物和药物特异性T细胞受体 | 免疫学 | 药物过敏反应 | 免疫肽组学、单细胞测序、报告细胞系检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞测序数据 | 1例青霉素过敏患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1934 | 2025-10-06 |
Immune cell quantification of in situ inflammation partitions human lupus nephritis into mechanistic subtypes
2025-Sep-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192669
PMID:40906524
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研究论文 | 通过免疫细胞定量分析将人类狼疮性肾炎分为机制亚型 | 使用高维共聚焦显微镜、空间转录组学和计算机视觉技术量化免疫细胞群体并定位其在肾脏结构中的分布 | 样本量相对有限(54例活检组织),仅分析了狼疮性肾炎和肾移植排斥反应 | 解析人类狼疮性肾炎的免疫炎症机制和异质性 | 狼疮性肾炎和肾移植排斥反应的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 高维共聚焦显微镜, 空间转录组学, 计算机视觉 | 计算机视觉技术 | 图像, 空间转录组数据 | 54例去标识化肾脏活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1935 | 2025-10-06 |
Activated αβ T and reduced mucosa-associated invariant T cells in LGI1- and CASPR2-encephalitis
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf096
PMID:40094812
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析LGI1和CASPR2自身免疫性脑炎患者的免疫细胞特征 | 首次在未治疗患者队列中证实鞘内抗原特异性浆细胞扩增,并发现黏膜相关恒定T细胞在疾病中的减少 | 样本量相对有限(15例患者),需要进一步验证 | 探究LGI1和CASPR2自身免疫性脑炎的免疫发病机制 | LGI1-AIE(9例)和CASPR2-AIE(6例)患者及其对照组的脑脊液和血液样本 | 免疫学 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 重组人单克隆抗体 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 15例患者(9例LGI1-AIE,6例CASPR2-AIE),33例对照(15例多发性硬化,18例特发性颅内高压) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1936 | 2025-10-06 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统分析胶质母细胞瘤基因型与免疫表型的关系 | 建立人鼠分析平台,系统揭示三种胶质母细胞瘤亚型的基因型与免疫表型关系 | 基于小鼠模型的研究,需进一步验证人类临床样本 | 解析胶质母细胞瘤基因型与免疫表型的关系 | 基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1937 | 2025-10-06 |
Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer
2025-Sep-03, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70178
PMID:40899323
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研究论文 | 通过整合基因组学、表观基因组学及单细胞转录组学分析,揭示细胞衰老与肿瘤发生之间的反向转录特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较正常衰老、细胞衰老和癌症的特征,发现衰老相关核心调控模块并揭示细胞衰老作为天然抗肿瘤屏障的作用 | 研究主要基于转录组数据,对表观遗传调控机制的具体作用需要进一步实验验证 | 解析衰老、细胞衰老与癌症之间的相互作用机制 | 17种组织中的细胞衰老过程与肿瘤发生过程 | 生物信息学 | 癌症 | 基因组学, 表观基因组学, 单细胞转录组学, 批量转录组学 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | 17种组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1938 | 2025-10-06 |
Partial Reprogramming in Senescent Schwann Cells Enhances Peripheral Nerve Regeneration via Restoration of Stress Granule Homeostasis
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511019
PMID:40899516
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示部分重编程通过恢复衰老雪旺细胞中应激颗粒稳态来增强周围神经再生的机制 | 首次发现部分重编程可通过恢复应激颗粒稳态来逆转衰老雪旺细胞的功能障碍,揭示Runx2细胞群在年龄相关神经再生缺陷中的关键作用 | 研究主要聚焦于雪旺细胞,其他神经细胞类型在部分重编程中的作用尚未完全探索 | 探究部分重编程对衰老个体周围神经再生的影响及分子机制 | 年轻和老年大鼠的雪旺细胞及坐骨神经损伤模型 | 单细胞转录组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年大鼠的雪旺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1939 | 2025-10-06 |
Enhancer Reprogramming Reveals the Tumorigenic Role of PTPRZ1 in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509344
PMID:40899632
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肺鳞状细胞癌中增强子重编程的机制,并确定了PTPRZ1-MDK轴作为关键致癌通路 | 首次整合单细胞表观基因组和空间转录组学技术,系统识别了肺鳞癌中3,447个肿瘤特异性致癌增强子,并发现PTPRZ1-MDK信号轴的关键作用 | 样本量相对有限(59对匹配样本),研究主要聚焦于肺鳞癌,未涵盖其他肺癌亚型 | 识别肺鳞状细胞癌的新型致癌驱动因子和表观遗传脆弱性 | 59对匹配的肺鳞癌肿瘤组织和癌旁正常组织 | 表观遗传学 | 肺癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 多组学整合分析 | 基因组学数据, 表观基因组学数据, 转录组学数据, 空间转录组数据 | 59对匹配的肺鳞癌肿瘤和正常组织样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
1940 | 2025-10-06 |
Inhibiting SLC38A2 lowers blood pressure in rodent models of hypertension
2025-Sep-03, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt5947
PMID:40901922
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抑制剂实验发现SLC38A2是血压调节的关键因子,并验证其抑制剂在高血压动物模型中的降压效果 | 首次发现SLC38A2通过调节内皮细胞谷氨酰胺摄取和NO信号通路调控血压,并在人群队列中验证其基因变异与高血压风险相关 | 研究主要基于啮齿类动物模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索SLC38A2在血压调节中的作用机制及其作为高血压治疗靶点的潜力 | 基因敲除小鼠、高血压小鼠和大鼠模型、中国和欧洲人群队列 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、抑制剂干预 | NA | 基因表达数据、血压测量数据、临床队列数据 | 多种啮齿类动物模型和两个独立人群队列(中国队列和英国生物银行欧洲队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |