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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1921 | 2025-10-06 |
CHIP ahoy: charting a decade of discovery in clonal hematopoiesis
2025-Sep-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283896
PMID:40905074
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综述 | 回顾克隆性造血领域十年来的研究进展,涵盖检测技术、驱动基因、临床意义及治疗策略 | 系统总结单细胞测序和计算模型在检测低频变异方面的突破,揭示遗传与获得性因素的复杂相互作用 | 不同测序方法在准确性、成本和低频变异检测能力方面存在差异 | 探索克隆性造血的生物学机制、临床意义及精准治疗策略 | 造血干细胞及其年龄相关突变 | 血液病学 | 髓系恶性肿瘤 | 下一代测序, 单细胞测序, 计算建模 | 风险分层模型 | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1922 | 2025-10-06 |
Decoding Xylem Development in Flowering Plants: Insights From Single-Cell Transcriptomics
2025-Sep-04, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70169
PMID:40905378
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综述 | 本文总结了单细胞转录组测序技术在解码开花植物木质部发育中的应用进展 | 整合原位转录组分析技术以提供更准确的细胞类型注释,并支持当前最佳的木质部发育谱系工作模型 | 存在跨研究比较的技术挑战,包括生物信息学流程不一致、原生质体效率变异和可能错误注释的标记基因使用 | 研究开花植物木质部发育过程 | 单子叶植物和双子叶植物的初生和次生木质部 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 激光显微切割 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1923 | 2025-10-06 |
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Sep-04, European journal of epidemiology
IF:7.7Q1
DOI:10.1007/s10654-025-01284-z
PMID:40906027
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研究论文 | 通过前瞻性队列研究探讨血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险的关联 | 首次联合分析代谢风险评分与生活方式因素对结直肠癌风险的交互作用,并利用单细胞RNA测序识别结直肠癌进展中的代谢相关基因和通路 | 观察性研究设计无法确定因果关系,研究人群仅限于英国生物银行参与者 | 评估代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险的关联及其与生活方式因素的联合效应 | 英国生物银行中的82,514名参与者 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | LASSO-COX, 随机森林, Cox回归, 单细胞RNA测序 | COX回归模型, 随机森林 | 血浆代谢物数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据 | 82,514名参与者,其中1,151例结直肠癌病例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1924 | 2025-10-06 |
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Sep-04, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70025
PMID:40906332
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研究论文 | 本研究揭示了HLA-A*02:01呈递青霉素修饰的半胱氨酸化肽段激活T细胞的分子机制 | 首次发现青霉素优先修饰HLA-A*02:01免疫肽组中的半胱氨酸残基,并通过二硫键介导的肽段修饰机制激活T细胞 | 研究仅针对单一HLA等位基因和单个过敏患者,样本规模有限 | 阐明β-内酰胺抗生素引发T细胞介导过敏反应的分子机制 | 青霉素修饰的HLA肽段复合物和药物特异性T细胞受体 | 免疫学 | 药物过敏反应 | 免疫肽组学、单细胞测序、报告细胞系检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞测序数据 | 1例青霉素过敏患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1925 | 2025-10-06 |
Immune cell quantification of in situ inflammation partitions human lupus nephritis into mechanistic subtypes
2025-Sep-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192669
PMID:40906524
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研究论文 | 通过免疫细胞定量分析将人类狼疮性肾炎分为机制亚型 | 使用高维共聚焦显微镜、空间转录组学和计算机视觉技术量化免疫细胞群体并定位其在肾脏结构中的分布 | 样本量相对有限(54例活检组织),仅分析了狼疮性肾炎和肾移植排斥反应 | 解析人类狼疮性肾炎的免疫炎症机制和异质性 | 狼疮性肾炎和肾移植排斥反应的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 高维共聚焦显微镜, 空间转录组学, 计算机视觉 | 计算机视觉技术 | 图像, 空间转录组数据 | 54例去标识化肾脏活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1926 | 2025-10-06 |
Activated αβ T and reduced mucosa-associated invariant T cells in LGI1- and CASPR2-encephalitis
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf096
PMID:40094812
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析LGI1和CASPR2自身免疫性脑炎患者的免疫细胞特征 | 首次在未治疗患者队列中证实鞘内抗原特异性浆细胞扩增,并发现黏膜相关恒定T细胞在疾病中的减少 | 样本量相对有限(15例患者),需要进一步验证 | 探究LGI1和CASPR2自身免疫性脑炎的免疫发病机制 | LGI1-AIE(9例)和CASPR2-AIE(6例)患者及其对照组的脑脊液和血液样本 | 免疫学 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 重组人单克隆抗体 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 15例患者(9例LGI1-AIE,6例CASPR2-AIE),33例对照(15例多发性硬化,18例特发性颅内高压) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1927 | 2025-10-06 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统分析胶质母细胞瘤基因型与免疫表型的关系 | 建立人鼠分析平台,系统揭示三种胶质母细胞瘤亚型的基因型与免疫表型关系 | 基于小鼠模型的研究,需进一步验证人类临床样本 | 解析胶质母细胞瘤基因型与免疫表型的关系 | 基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1928 | 2025-10-06 |
Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer
2025-Sep-03, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70178
PMID:40899323
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研究论文 | 通过整合基因组学、表观基因组学及单细胞转录组学分析,揭示细胞衰老与肿瘤发生之间的反向转录特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较正常衰老、细胞衰老和癌症的特征,发现衰老相关核心调控模块并揭示细胞衰老作为天然抗肿瘤屏障的作用 | 研究主要基于转录组数据,对表观遗传调控机制的具体作用需要进一步实验验证 | 解析衰老、细胞衰老与癌症之间的相互作用机制 | 17种组织中的细胞衰老过程与肿瘤发生过程 | 生物信息学 | 癌症 | 基因组学, 表观基因组学, 单细胞转录组学, 批量转录组学 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | 17种组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1929 | 2025-10-06 |
Partial Reprogramming in Senescent Schwann Cells Enhances Peripheral Nerve Regeneration via Restoration of Stress Granule Homeostasis
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511019
PMID:40899516
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示部分重编程通过恢复衰老雪旺细胞中应激颗粒稳态来增强周围神经再生的机制 | 首次发现部分重编程可通过恢复应激颗粒稳态来逆转衰老雪旺细胞的功能障碍,揭示Runx2细胞群在年龄相关神经再生缺陷中的关键作用 | 研究主要聚焦于雪旺细胞,其他神经细胞类型在部分重编程中的作用尚未完全探索 | 探究部分重编程对衰老个体周围神经再生的影响及分子机制 | 年轻和老年大鼠的雪旺细胞及坐骨神经损伤模型 | 单细胞转录组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年大鼠的雪旺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1930 | 2025-10-06 |
Enhancer Reprogramming Reveals the Tumorigenic Role of PTPRZ1 in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509344
PMID:40899632
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肺鳞状细胞癌中增强子重编程的机制,并确定了PTPRZ1-MDK轴作为关键致癌通路 | 首次整合单细胞表观基因组和空间转录组学技术,系统识别了肺鳞癌中3,447个肿瘤特异性致癌增强子,并发现PTPRZ1-MDK信号轴的关键作用 | 样本量相对有限(59对匹配样本),研究主要聚焦于肺鳞癌,未涵盖其他肺癌亚型 | 识别肺鳞状细胞癌的新型致癌驱动因子和表观遗传脆弱性 | 59对匹配的肺鳞癌肿瘤组织和癌旁正常组织 | 表观遗传学 | 肺癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 多组学整合分析 | 基因组学数据, 表观基因组学数据, 转录组学数据, 空间转录组数据 | 59对匹配的肺鳞癌肿瘤和正常组织样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
1931 | 2025-10-06 |
Inhibiting SLC38A2 lowers blood pressure in rodent models of hypertension
2025-Sep-03, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt5947
PMID:40901922
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抑制剂实验发现SLC38A2是血压调节的关键因子,并验证其抑制剂在高血压动物模型中的降压效果 | 首次发现SLC38A2通过调节内皮细胞谷氨酰胺摄取和NO信号通路调控血压,并在人群队列中验证其基因变异与高血压风险相关 | 研究主要基于啮齿类动物模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索SLC38A2在血压调节中的作用机制及其作为高血压治疗靶点的潜力 | 基因敲除小鼠、高血压小鼠和大鼠模型、中国和欧洲人群队列 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、抑制剂干预 | NA | 基因表达数据、血压测量数据、临床队列数据 | 多种啮齿类动物模型和两个独立人群队列(中国队列和英国生物银行欧洲队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1932 | 2025-10-06 |
ScisTree2 enables large-scale inference of cell lineage trees and genotype calling using efficient local search
2025-Sep-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280542.125
PMID:40903391
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研究论文 | 介绍ScisTree2这一基于高效局部搜索方法的大规模细胞谱系树推断和基因型调用工具 | 首个能够处理数万细胞或更多数据集的基于模型的细胞谱系树推断和基因型调用方法 | NA | 开发能够从大规模单细胞数据中准确推断细胞谱系树和基因型的方法 | 多细胞生物中的细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 无限位点模型 | 单细胞测序数据 | 数万细胞或更多 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1933 | 2025-10-06 |
Accurately Predicting Cell Type Abundance from Spatial Histology Image Through HPCell
2025-Sep-03, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00757-9
PMID:40903657
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研究论文 | 提出HPCell深度学习框架,直接从H&E染色组织学图像预测细胞类型丰度 | 首个直接从组织学图像估计细胞类型丰度的深度学习方法,结合病理基础模块、超图模块和Transformer模块 | 未提及具体性能限制或适用范围限制 | 开发从空间组织学图像准确预测细胞类型丰度的计算方法 | 空间转录组学数据集和H&E染色全切片图像 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | Transformer, 超图神经网络 | 组织学图像, 空间转录组数据 | 多个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1934 | 2025-10-06 |
Applications of single-cell transcriptomics: updated insights in endometrial cancer
2025-Sep-03, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04032-7
PMID:40903692
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在子宫内膜癌研究中的应用进展 | 系统整合单细胞转录组学在揭示子宫内膜癌肿瘤微环境异质性和细胞间相互作用的最新发现 | NA | 总结单细胞转录组学在子宫内膜癌研究中的应用价值 | 子宫内膜癌肿瘤微环境中的上皮细胞、基质细胞、内皮细胞和免疫细胞 | 单细胞组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1935 | 2025-10-06 |
GPC2-Targeted CAR T Cells Engineered with NFAT-Inducible Membrane-Tethered IL15/IL21 Exhibit Enhanced Activity against Neuroblastoma
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0975
PMID:40569285
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研究论文 | 本研究开发了NFAT诱导型膜锚定IL15/IL21增强的GPC2靶向CAR-T细胞,用于治疗高负荷神经母细胞瘤 | 首次采用NFAT诱导型膜锚定IL15/IL21细胞因子表达系统增强CAR-T细胞功能,相比传统组成型表达具有更好的安全性和有效性 | 研究仅在小鼠模型中进行,需要进一步临床验证;样本量有限 | 优化CAR-T细胞治疗策略,提高对高负荷神经母细胞瘤的疗效并降低毒性 | 神经母细胞瘤小鼠模型和工程化CAR-T细胞 | 免疫治疗 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞工程,动物模型实验 | CAR-T细胞治疗模型 | 基因表达数据,动物实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1936 | 2025-10-06 |
PIEZO1 Overexpression in Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia Arteriovenous Malformations
2025-Sep-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PIEZO1在遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形中过度表达,并通过基因和药理学方法验证其抑制作用 | 首次揭示PIEZO1在ALK1缺陷型动静脉畸形中的关键作用,并证明其抑制可减轻血管畸形形成 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索ALK1变异导致的信号通路改变及动静脉畸形形成机制 | ALK1基因敲除小鼠视网膜内皮细胞和人类2型遗传性出血性毛细血管扩张症病变组织 | 单细胞测序 | 遗传性出血性毛细血管扩张症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1937 | 2025-10-06 |
Early immune response to Coccidioides is characterized by robust neutrophil and fibrotic macrophage recruitment and differentiation
2025-Sep-02, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00442-25
PMID:40704794
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠模型中早期对球孢子菌的免疫反应,揭示了中性粒细胞和巨噬细胞的募集与分化特征 | 首次发现炎症性PD-L1中性粒细胞和真菌接触依赖性促纤维化Spp1巨噬细胞在早期免疫应答中的关键作用 | 使用高剂量减毒菌株的小鼠模型可能无法完全模拟人类自然感染过程 | 阐明球孢子菌病早期免疫应答机制及宿主-病原体相互作用 | 小鼠肺部免疫细胞 | 免疫学 | 球孢子菌病(山谷热) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1938 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of bronchoalveolar lavage during early SARS-CoV-2 infection
2025-Sep-02, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02715-24
PMID:40742121
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究SARS-CoV-2感染早期支气管肺泡灌洗液的免疫反应特征 | 首次在非人灵长类动物模型中利用单细胞RNA测序技术揭示SARS-CoV-2感染早期(0-3天)支气管肺泡灌洗液的免疫细胞动态变化和信号通路激活 | 研究样本量有限,仅使用非人灵长类动物模型,未涉及人类样本验证 | 探究SARS-CoV-2感染早期的免疫应答机制和疾病进展规律 | 恒河猴支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 恒河猴感染后0-3天的支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1939 | 2025-10-06 |
Tumor-Specific MHC-II Activates CD4+ and CD8+ T Cells in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma to Boost Immunotherapy Efficacy
2025-Sep-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4383
PMID:40540325
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和T细胞受体测序,发现肿瘤特异性MHC-II是头颈鳞状细胞癌新辅助免疫治疗反应的优越预测标志物 | 首次发现肿瘤特异性MHC-II通过激活CD4+和CD8+T细胞、诱导趋化因子CCL5来增强PD-1阻断疗效的新机制 | 研究基于II期临床试验前的活检样本,样本量有限且需要更大规模验证 | 探索头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应的生物标志物和机制 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤活检样本 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | II期临床试验前的HNSCC活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1940 | 2025-10-06 |
Tumor-associated Schwann cell remodeling under metabolic stress via lactate sensing orchestrates pancreatic ductal adenocarcinoma development
2025-Sep-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.07.008
PMID:40803319
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸驱动的肿瘤相关雪旺细胞重塑在糖尿病胰腺导管腺癌免疫抑制中的关键作用 | 发现乳酸-METTL16-CTCF轴将代谢应激与表观转录组重编程和免疫逃逸联系起来 | 回顾性分析可能受限于样本选择和临床数据完整性 | 探索糖尿病促进胰腺癌发展的分子机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)和肿瘤相关雪旺细胞(TASCs) | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |