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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2026-02-25 |
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-Feb-24, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70108
PMID:41732956
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研究论文 | 本研究通过分析牙周肉芽组织中的细菌组和细胞谱,探索其生物学本质和转化潜力 | 首次结合16S rRNA测序、单细胞测序和组织学评估,比较了不同来源牙周肉芽组织的细菌组和细胞特征,揭示了骨缺损来源组织具有更健康的微生物组和更高比例的间充质干细胞 | 样本量有限(49例患者),且未来需要更多转化研究来验证牙周肉芽组织作为间充质干细胞替代来源的潜力 | 探索牙周肉芽组织的生物学本质和转化潜力,特别是作为牙周再生中MSCs的替代来源 | 牙周肉芽组织样本,包括来自骨缺损、拔牙窝和牙根表面的组织,以及作为对照的牙周袋壁组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 16S rRNA测序, 单细胞测序, 组织学评估 | NA | 基因组数据, 单细胞数据, 图像数据 | 49例严重牙周炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1922 | 2026-02-25 |
ETV2-ECSCR-mTOR pathways regulate reprogramming to the endothelial lineage
2026-Feb-23, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf075
PMID:41652899
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研究论文 | 本文揭示了ETV2通过调控ECSCR和mTORC1通路在细胞重编程为内皮谱系中的作用机制 | 首次将ECSCR鉴定为ETV2的直接转录靶点,并发现其通过mTORC1通路负反馈调节ETV2介导的内皮重编程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类细胞中的验证及临床应用潜力尚未充分探索 | 探究ETV2在细胞重编程为内皮谱系中的下游调控机制 | 小鼠胚胎体分化、胚胎成纤维细胞重编程模型及发育中的小鼠胚胎 | 细胞重编程与再生医学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, 凝胶迁移实验, 转录分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 使用转基因小鼠和基因敲除小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1923 | 2026-02-25 |
Oncolytic Zika virus therapy leverages CCR2+ monocytes to boost anti-glioblastoma T cell responses
2026-Feb-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag037
PMID:41729934
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研究论文 | 本研究探讨了溶瘤寨卡病毒如何通过激活CCR2+单核细胞来增强抗胶质母细胞瘤的CD8+ T细胞反应 | 揭示了溶瘤寨卡病毒通过激活CCR2+单核细胞来增强抗肿瘤CD8+ T细胞反应的新机制,强调了单核细胞-T细胞相互作用在克服胶质母细胞瘤免疫抑制中的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 探究溶瘤寨卡病毒在胶质母细胞瘤治疗中通过单核细胞驱动疗效的机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型中的CCR2+单核细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1924 | 2026-02-25 |
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-Feb-23, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00647.2025
PMID:41730286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了环氧化酶-2(COX-2)在出生后小鼠动脉导管平滑肌细胞中的上调,并探讨了其在动脉导管解剖性闭合中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术识别出生后动脉导管平滑肌细胞的独特转录组特征,并发现COX-2在出生后上调是驱动动脉导管解剖性闭合的关键分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;COX-2抑制剂对动脉导管闭合的影响仅在早期出生后阶段评估,长期效应未知 | 阐明出生后动脉导管解剖性闭合的分子机制 | 小鼠动脉导管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1925 | 2026-02-25 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,构建了家蚕翅盘发育的时空单细胞图谱,揭示了20-羟基蜕皮酮驱动的发育重编程机制 | 首次构建家蚕翅盘发育的时空单细胞图谱,识别了12种主要细胞类型及其发育转变,并提出了五阶段基因转变模型来描述命运逐步解析过程 | 研究主要基于家蚕模型,其结论在其他昆虫中的普适性有待验证,且激素处理效果的长期影响未详细探讨 | 揭示昆虫翅发育的时空逻辑和激素驱动的器官发生机制 | 家蚕翅盘细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1926 | 2026-02-25 |
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Feb-23, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01068-4
PMID:41731121
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻与老年小鼠疫苗接种后淋巴结变化,揭示了树突状细胞迁移缺陷是老年免疫衰退的关键机制,并提出口服酵母来源纳米颗粒可改善此缺陷以增强疫苗效果 | 首次通过单细胞RNA测序揭示老年树突状细胞迁移缺陷的基因特征,并创新性地利用口服酵母纳米颗粒靶向增强肠道树突状细胞CCR7表达来改善疫苗反应 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类中验证;纳米颗粒的长期安全性未评估 | 探究年龄相关免疫衰退中树突状细胞的作用机制,并开发改善老年疫苗效能的策略 | 年轻与老年小鼠的淋巴结树突状细胞及肠道免疫系统 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻与老年小鼠群体(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1927 | 2026-02-25 |
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady2977
PMID:41706855
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研究论文 | 本研究通过构建区域特异性脑类器官(皮质、纹状体和中脑)并整合人类小胶质细胞,揭示了小胶质细胞在人类大脑中的区域特异性多样性及其对携带SCN2A突变的过度兴奋神经元的反应 | 开发了包含人类小胶质细胞的区域特异性脑类器官和组装体模型,首次在体外模拟了皮质下区域的神经免疫相互作用,并发现了小胶质细胞对SCN2A突变介导的神经元过度活动的特异性反应 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全复制体内大脑环境的复杂性,且样本规模有限 | 探究人类小胶质细胞在大脑不同区域的特性及其在神经回路发育和功能中的作用,特别是在神经精神疾病相关电路中的角色 | 人类小胶质细胞、区域特异性脑类器官(皮质、纹状体和midbrain)以及midbrain-striatal组装体 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序、化学遗传学、钙信号成像 | 脑类器官模型、组装体模型 | 单细胞转录组数据、钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1928 | 2026-02-25 |
RIPK3 Orchestrates Scar-Associated Macrophage Dysfunction to Drive Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519404
PMID:41709822
|
研究论文 | 本文揭示了RIPK3在特发性肺纤维化中通过调控疤痕相关巨噬细胞的免疫代谢功能,而非依赖其经典的坏死性凋亡作用,来驱动纤维化的新机制 | 发现了RIPK3在肺纤维化中独立于坏死性凋亡的全新免疫代谢功能,并明确了其通过AKT-mTOR通路调控精氨酸-多胺代谢轴的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接验证尚需进一步开展 | 探究RIPK3在肺纤维化中的非经典功能及其分子机制 | 特发性肺纤维化患者样本、小鼠模型、巨噬细胞(特别是疤痕相关巨噬细胞亚群) | 分子生物学与免疫学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、体外细胞分化与功能分析 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 特发性肺纤维化患者和小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1929 | 2026-02-25 |
3D "emboli" culture models epithelial breast cancer cell oxidative mitochondrial metabolism with relevance for lung metastasis
2026-Feb-18, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0587
PMID:41706033
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研究论文 | 本研究比较了乳腺癌细胞在两种三维培养模型(mammosphere培养和'emboli'培养)中的表现,重点关注其对线粒体氧化代谢的偏好及其与肺转移的相关性 | 开发并验证了'emboli'培养模型,该模型能特异性富集上皮特征,模拟乳腺癌细胞的线粒体氧化代谢,并与肺转移能力增强相关 | 研究仅使用了三种乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468),可能无法代表所有乳腺癌亚型 | 比较不同三维培养模型在模拟乳腺癌生物学特性方面的适用性,特别是针对肺转移的研究 | 乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468) | 细胞生物学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢通量分析、电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、代谢数据、图像数据 | 三种乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1930 | 2026-02-25 |
A method to unravel complexity in human peripheral blood B-cell subsets through multiomic cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-seq) analyses
2026-Feb-12, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf088
PMID:41679729
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研究论文 | 本文开发了一种基于CITE-seq的多组学方法,用于识别和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是IgM+IgDlow/- B细胞 | 结合CITE-seq技术,通过同时分析转录组和表面蛋白表达,克服了仅依赖转录组scRNA-seq在识别B细胞亚群时的局限性,实现了更准确的细胞分类 | 方法依赖于人类外周血IgM+IgDlow/- B细胞作为替代模型,可能无法完全反映小鼠脾脏BDL亚群的特性,且稀有细胞亚群的获取和分析仍具挑战性 | 开发一种多组学策略,以更准确地分类和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是那些与自身免疫疾病相关的稀有亚群 | 人类外周血中的B细胞亚群,重点关注IgM+IgDlow/- B细胞 | 单细胞多组学 | 自身免疫疾病 | CITE-seq, scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1931 | 2026-02-25 |
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf301
PMID:41220068
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研究论文 | 本文介绍了一种结合优化寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的方法,用于人类B细胞反应性的多重蛋白质基因组分析 | 开发了一种结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新方法,用于并行分析不同抗原特异性的B细胞,并提高了染色灵敏度以检测低频率抗原反应性细胞 | 未明确说明样本量或技术验证的局限性 | 旨在通过并行分析不同抗原特异性的B细胞,推进对体液反应中克隆型角色的理解 | 人类B细胞,特别是针对SARS-CoV-2和登革热抗原的反应性细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞测序,流式细胞术,寡核苷酸标记抗原组装 | NA | 单细胞测序数据,流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1932 | 2026-02-25 |
Peptide-driven identification of TCRs reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf287
PMID:41241821
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法,用于从人类血液中识别抗原特异性T细胞受体,并应用于结核病研究 | 开发了PDI-TCR方法,通过比较非重叠肽池的反应,能够区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | 研究中使用的PDI-TCR参数特定于结核分枝杆菌,但方法可适应其他抗原系统 | 研究抗原特异性T细胞的动态和表型,特别是在结核病背景下 | 结核病患者和结核分枝杆菌致敏的健康个体的CD4 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序、TCR测序、体外扩增 | NA | 序列数据 | 结核病患者和健康个体的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1933 | 2026-02-25 |
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-Feb-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69330
PMID:41729799
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研究论文 | 本文提出了一种从拟南芥多种组织中高效分离高质量原生质体的方法,适用于单细胞分析 | 开发了一种针对拟南芥地上和地下组织的稳健、可重复的原生质体分离协议,优化了酶消化和纯化步骤以提高产量和细胞类型代表性 | 未明确提及具体样本数量或实验验证的局限性,可能仅适用于拟南芥特定组织 | 优化植物单细胞RNA测序中的原生质体分离技术,以支持细胞异质性研究 | 拟南芥的叶片、茎、花和根组织 | 植物生物学 | NA | 原生质体分离、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1934 | 2026-02-25 |
Single-cell analysis identifies ATC-like cells driving progression in relapsed follicular thyroid carcinoma
2026-Feb-04, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag012
PMID:41631714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了复发性滤泡性甲状腺癌中具有间变性甲状腺癌分子特征的ATC样细胞群及其驱动肿瘤进展的机制 | 首次在复发性滤泡性甲状腺癌中鉴定出具有间变性甲状腺癌分子特征的独特细胞群,并发现UBE2C作为其特异性标志物,揭示了该细胞群通过调控代谢通路促进肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限,且主要基于单细胞转录组数据,需要更多功能实验和临床样本验证 | 阐明滤泡性甲状腺癌进展及向间变性甲状腺癌转化的细胞和分子机制 | 甲状腺癌组织,包括乳头状甲状腺癌、滤泡亚型乳头状甲状腺癌、复发性滤泡性甲状腺癌和间变性甲状腺癌 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46739个细胞,来自PTC、FVPTC、RFTC和ATC组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1935 | 2026-02-25 |
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag052
PMID:41619788
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研究论文 | 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法,通过优化Moran's I来构建低维特征空间投影 | 提出了一种无需参数调优的算法,能最大化空间依赖性度量Moran's I,有效抑制非空间变异并优于主成分分析预处理 | NA | 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 | 多变量空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计降维算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1936 | 2026-02-25 |
Inference of marker genes of subtle cell state changes via iLR: iterative logistic regression
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag051
PMID:41627891
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研究论文 | 本文提出了一种名为迭代逻辑回归(iLR)的方法,用于从单细胞RNA测序数据中识别小规模信息性标记基因,特别适用于细胞状态间的细微差异 | iLR通过迭代应用逻辑回归并结合帕累托前沿优化,在平衡基因集大小与分类性能方面具有创新性,能够跨器官和物种(如小鼠到人类)推断信息性基因 | NA | 开发一种高效的方法来识别单细胞RNA测序数据中的小规模标记基因集,以区分细胞状态的细微变化,如疾病或治疗诱导的差异 | 单细胞RNA测序数据,包括神经元细胞亚型(健康与自闭症谱系障碍患者)和肿瘤微环境中的细胞类型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1937 | 2026-02-25 |
Insights into speckled eggs provided by single-cell transcriptomics in high-yield laying hens
2026-Feb-02, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106581
PMID:41687261
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了高产蛋鸡中斑点蛋壳形成的分子特征和细胞异质性 | 首次在高产蛋鸡中应用单细胞RNA测序技术,构建了子宫组织的单细胞分辨率图谱,并识别了与斑点蛋壳相关的细胞类型特异性表达模式和信号通路变化 | 研究样本量有限,且主要关注转录组层面,未深入探讨表观遗传或蛋白质组学的变化 | 探究斑点蛋壳形成的分子机制和细胞基础 | 高产蛋鸡的子宫组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 根据蛋壳斑点率分为两组的高产蛋鸡子宫组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1938 | 2026-02-25 |
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003859
PMID:41159285
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析,揭示了结肠癌恶性转化过程中上皮细胞的代谢通路失调及细胞通讯变化 | 首次从单细胞层面构建了结肠癌进展中上皮细胞的分化轨迹,并识别了脂肪酸和胆汁酸代谢通路在早期恶性转化中的关键作用,以及乳酰化相关基因作为潜在干预靶点 | 研究基于转录组数据,缺乏蛋白质或代谢物水平的验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究结肠癌从正常组织到腺瘤再到癌变的恶性转化过程中,代谢通路和细胞通讯的动态变化 | 正常、息肉和肿瘤结肠组织中的上皮细胞及其他基质细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、AUCell、细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 包括正常、息肉和肿瘤结肠组织的单细胞样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1939 | 2026-02-25 |
Research on the mechanism of compound mylabris capsules regulating ferroptosis in lung adenocarcinoma based on bioinformatics and experimental validation
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003735
PMID:41186509
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡在肺腺癌中的抗肿瘤机制 | 首次报道复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡缓解肺腺癌,并利用单细胞RNA测序数据分析和多种机器学习算法筛选关键基因 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊调控肺腺癌细胞铁死亡的机制并鉴定其活性成分 | 肺腺癌细胞系A549和H1650 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | Lasso回归,Boruta,RFE算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1940 | 2026-02-25 |
Unveiling gastric stem cell dynamics in gastric atrophy and carcinogenesis: revisiting mechanisms and advancing experimental models - a narrative review
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003733
PMID:41186567
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综述 | 本文全面评估了胃干细胞在萎缩性胃炎和癌前病变进展中的动态作用,并探讨了实验模型的优化方向 | 重新审视了胃干细胞在癌变过程中的耗竭与扩张范式,强调了慢性炎症下胃干细胞的克隆扩增和区域癌化效应,并提出了整合幽门螺杆菌感染模型与无他莫昔芬谱系追踪等改进实验方法 | 依赖多化学致癌物模型可能限制转化相关性,而他莫昔芬依赖的谱系追踪系统易受混杂效应影响 | 阐明胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的机制,并推动实验模型的进展 | 胃干细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 谱系追踪、空间转录组学、类器官系统 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |