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当前共找到 34750 篇文献，本页显示第 1921 - 1940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2025-12-05 |
Identification of Novel Lactylation-Related Biomarkers for COPD Diagnosis Through Machine Learning and Experimental Validation
2025-Aug-18, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13082006
PMID:40868258
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研究论文 | 本研究通过机器学习筛选和实验验证，鉴定出CBR1和PRDX1作为与乳酸化相关的慢性阻塞性肺疾病诊断生物标志物 | 首次将乳酸化修饰与COPD诊断生物标志物发现相结合，并采用多算法集成筛选与单细胞转录组学分析进行验证 | 研究主要基于公共数据集和体外CSE诱导模型，需要在更大临床队列和体内模型中进一步验证 | 鉴定COPD中临床相关的乳酸化相关生物标志物并探究其在疾病发病机制中的潜在作用 | 慢性阻塞性肺疾病患者基因表达数据、香烟烟雾提取物诱导的COPD细胞模型 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光 | LASSO回归、支持向量机递归特征消除、加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自GSE21359和GSE76925数据集的COPD患者样本，以及GSE173896单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1922 | 2025-12-05 |
Eed controls craniofacial osteoblast differentiation and mesenchymal proliferation from the neural crest
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.584903
PMID:38558995
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研究论文 | 本研究揭示了PRC2复合物核心亚基Eed在神经嵴诱导后对颅面成骨细胞分化和间充质细胞增殖的关键调控作用 | 首次结合小鼠遗传学、单细胞RNA测序和表观遗传分析，系统阐明了Eed在神经嵴细胞迁移后阶段通过表观遗传调控转录因子程序驱动颅面发育的分子机制 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段，对出生后颅面维持和成年疾病关联的探讨有限 | 探究PRC2复合物在神经嵴诱导后对颅面发育的调控机制 | 小鼠胚胎神经嵴细胞、颅面间充质细胞、原代颅面细胞培养物 | 发育生物学 | 先天性颅面畸形 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1923 | 2025-12-05 |
Linear structure unfolding : application to mouse brain in spatial transcriptomics
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC58623.2025.11251850
PMID:41335925
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学中分析细长弯曲形状或点云的方法，通过展开线性结构来研究细胞或转录本类型沿主轴的分布 | 结合k-means聚类和旅行商问题优化自动计算形状的中心线，实现沿中心线或垂直方向的细胞或转录本空间分布分析 | NA | 解决空间转录组学中特定形状区域（如细长弯曲结构）的计算分析问题 | 小鼠大脑组织中的细胞或RNA分子点云 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | k-means聚类，旅行商问题优化 | 图像，点云数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1924 | 2025-12-05 |
Single-cell resolution uncovers neighboring cell subtypes that share steroidogenic capacity during fetal testis development
2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2501392122
PMID:40460128
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术揭示了小鼠胎儿睾丸发育过程中类固醇生成细胞（如胎儿Leydig细胞）的异质性及其在雄激素生产中的协同作用 | 通过单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序，首次发现胎儿Leydig细胞在类固醇生成基因表达上存在不同步性和不完整性，并揭示了邻近细胞类型间的合作机制 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类或其他物种；且主要关注胎儿发育阶段，成年期变化未探讨 | 探究胎儿睾丸发育过程中单个及集体类固醇生成细胞对雄激素生产的贡献 | 小鼠胎儿睾丸中的类固醇生成细胞（包括胎儿Leydig细胞和其他间质细胞类型） | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1925 | 2025-12-05 |
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701
PMID:39976545
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研究论文 | 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用，使其从膜上移位，从而促进突变p53介导的突变KRAS过度激活的分子机制 | 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常，从而解释突变p53与KRAS致癌协同作用的具体通路 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大规模；GAP17-1膜移位的确切结构机制有待进一步解析 | 探究突变p53与KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 | 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片 | NA | 基因表达数据、组织病理数据 | 多种胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型（iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*）、临床前与临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1926 | 2025-12-05 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646238
PMID:40236180
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Lloki的新框架，用于整合不同平台的空间转录组学数据，无需共享基因面板 | Lloki通过特征对齐和批次对齐任务，利用最优传输引导的特征传播和scGPT单细胞基础模型，实现了跨平台ST数据的统一集成，克服了基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性等挑战 | NA | 开发一个跨平台空间转录组学数据整合框架，以促进组织结构和细胞相互作用的深入理解 | 小鼠脑样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT | 空间转录组学数据，单细胞RNA测序数据 | 小鼠脑样本来自五种不同技术，以及五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1927 | 2025-12-05 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了巨细胞病毒感染期间，脾脏TNF-α信号通路如何通过调控NF-κB信号促进NK细胞从固有免疫向适应性免疫的转变 | 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路，分别调控NK细胞的效应功能和适应性前体细胞分化，阐明了组织特异性信号在NK细胞免疫记忆形成中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的验证尚需进一步研究；对TNF-α信号与其他细胞因子网络的相互作用探讨有限 | 探究病毒感染过程中NK细胞在脾脏微环境获得适应性免疫特征的分子机制 | 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，纵向追踪 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1928 | 2025-12-05 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638195
PMID:40027720
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研究论文 | 本文提出了一种名为SIID的算法，用于整合不同空间转录组学平台的数据，通过联合非负矩阵分解模型实现基因表达的插补和细胞类型特异性表达的解卷积 | 首次提出能够同时处理空间转录组数据插补和解卷积的联合模型，通过空间对齐和联合非负矩阵分解，有效整合不同分辨率和技术特点的平台数据 | 算法性能依赖于配对数据集的质量和空间对齐的准确性，在技术平台差异过大时可能效果受限 | 开发能够整合不同空间转录组学平台数据的算法，实现基因表达插补和细胞类型解卷积 | 空间转录组学数据，特别是来自不同技术平台（如10x Genomics Visium和Xenium）的配对数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 结肠癌 | 空间转录组学技术 | 联合非负矩阵分解模型 | 空间基因表达数据 | 人类乳腺癌和结肠癌组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium（全转录组，多细胞分辨率）, 10x Xenium（靶向数百个基因，亚细胞分辨率） |
| 1929 | 2025-12-05 |
Immunological and Prognostic Profiling of Triple-Negative Breast Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing of T-Cell Exhaustion
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338251401265
PMID:41325182
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序分析三阴性乳腺癌中的T细胞耗竭特征，构建风险评分模型并评估其与患者预后及免疫治疗响应的关系 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，系统分析三阴性乳腺癌中T细胞耗竭的免疫学特征，并构建基于TEX相关基因的风险评分模型用于预后评估 | 研究仅基于公开数据集GSE161529，缺乏独立验证队列和实验验证，样本量相对有限 | 评估T细胞耗竭特征对三阴性乳腺癌患者免疫治疗响应的影响，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，生物信息学分析 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 12,477个高质量细胞，来自GSE161529数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1930 | 2025-12-05 |
Infiltration of CXCL9+ macrophages confers a favorable prognosis in breast cancer: Insights from an integrated single-cell RNA and bulk RNA sequencing study
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337175
PMID:41325308
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序，揭示了CXCL9+巨噬细胞在乳腺癌中的浸润与患者良好预后相关，并构建了基于相关基因的生存风险模型 | 首次通过单细胞和bulk RNA测序整合分析，识别出CXCL9+巨噬细胞作为乳腺癌预后良好的关键细胞亚群，并验证了其通过CXCL9/10/11-CXCR3轴激活T细胞和NK细胞的抑制肿瘤机制 | 研究主要基于测序数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证；样本来源和数量未具体说明，可能影响结论的普适性 | 探究乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性，识别与生存预后相关的关键细胞类型，并开发免疫治疗新靶点 | 乳腺癌肿瘤组织中的免疫细胞（特别是巨噬细胞亚群）及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, 体外细胞实验 | 反卷积算法, 生存风险模型 | RNA测序数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1931 | 2025-12-05 |
Integrated multi-omics analysis reveals necroptosis-related biomarker BIRC3 for early diagnosis and therapeutic targeting in preeclampsia
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337546
PMID:41325315
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了坏死性凋亡相关基因BIRC3作为先兆子痫早期诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次将坏死性凋亡与先兆子痫发病机制联系起来，并通过多组学验证确定了BIRC3作为新型诊断标志物 | 研究主要基于公共数据集，缺乏实验验证；样本量有限且依赖于现有数据库 | 识别先兆子痫的坏死性凋亡相关生物标志物，并通过虚拟筛选寻找潜在天然化合物 | 先兆子痫患者胎盘组织及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，机器学习，分子对接 | 随机森林 | 基因表达数据 | 多个公共数据集（GSE66273、GSE44711、GSE173193） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1932 | 2025-12-05 |
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335152
PMID:41325391
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据，探索了脂肪来源干细胞（ADSCs）成脂分化过程中的关键基因及其调控网络 | 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据，系统揭示了ADSC成脂分化早期和晚期的阶段特异性转录调控因子，并构建了ceRNA网络 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于qPCR，缺乏功能验证和体内实验 | 阐明ADSC成脂分化的全局和阶段特异性转录调控网络，为脂肪组织稳态和脂肪移植提供候选调控靶点 | 脂肪来源干细胞（ADSCs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1933 | 2025-12-05 |
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S548160
PMID:41328289
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研究论文 | 本研究通过综合转录组学、孟德尔随机化和机器学习分析，探讨了内质网应激相关基因DNAJB1在慢性阻塞性肺疾病中的风险作用和临床价值 | 首次将DNAJB1识别为COPD的风险基因，并利用单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法构建了一个包含九个关键基因的诊断标志物组合 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和具体数据细节未明确说明 | 识别与COPD发病和进展相关的遗传变异和新型生物标志物，以改善临床预后 | 慢性阻塞性肺疾病患者及相关基因数据 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、微阵列数据分析 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞测序数据、微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1934 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA-seq combined with bulk RNA-seq explores shared gene signatures between thyroid and breast cancers
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1609189
PMID:41328437
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据，探索了甲状腺癌和乳腺癌之间的共享基因特征和潜在治疗靶点 | 结合单细胞和bulk转录组数据，应用细胞反卷积和WGCNA分析，首次系统性地识别了两种癌症共有的关键基因模块和信号通路 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，缺乏功能实验验证这些基因在癌症发生发展中的具体机制 | 识别乳腺癌和甲状腺癌共有的关键基因和共享治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, 免疫组化 | 机器学习方法 | 转录组数据, 单细胞数据 | 未明确指定样本数量，但包括两种癌症患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1935 | 2025-12-05 |
Potential marker genes for psoriasis revealed based on single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1634874
PMID:41328434
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，识别了与银屑病风险相关的七个候选基因，并探讨了它们在CD4+ T细胞中的表达及免疫通路中的作用 | 首次结合单细胞转录组数据与孟德尔随机化分析来识别银屑病的遗传标记基因，并聚焦于CD4+ T细胞中的表达 | 研究依赖于公开数据库数据，样本量相对有限，且未进行实验验证 | 探究银屑病的分子机制，识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 银屑病患者和健康对照的皮肤样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | Seurat包用于数据处理 | 单细胞转录组数据 | 174个皮肤样本（92个来自银屑病患者，82个来自健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1936 | 2025-12-05 |
Neuronal types in the mouse amygdala and their transcriptional response to fear conditioning
2023-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01469-3
PMID:37884748
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了成年小鼠杏仁核在恐惧学习和记忆巩固过程中的细胞类型分类，并识别出130种神经元类型及其空间分布 | 首次在恐惧学习背景下，利用单细胞转录组学构建了小鼠杏仁核的详细细胞类型图谱，并揭示了特定神经元亚群在恐惧记忆编码和检索中的转录响应 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；单细胞测序技术可能无法捕获所有低丰度转录本 | 探究杏仁核在恐惧学习和记忆巩固过程中的神经元类型及其转录响应机制 | 成年小鼠杏仁核的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括天真和恐惧条件化的小鼠样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1937 | 2025-12-05 |
High-Salt Diet Causes Defective Oocyte Maturation and Embryonic Development to Impair Female Fertility in Mice
2023-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202300401
PMID:37863820
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研究论文 | 本研究探讨高盐饮食对小鼠卵母细胞成熟、胚胎发育及雌性生育力的影响及其机制 | 首次揭示高盐饮食通过破坏卵母细胞自噬、凋亡水平和线粒体功能，导致卵母细胞减数分裂停滞、受精失败和早期胚胎发育缺陷，从而损害雌性生育力 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他哺乳动物中验证；机制研究主要基于转录组数据，需进一步实验验证 | 探究高盐饮食对雌性生殖细胞发育及生育力的影响机制 | C57BL/6雌性小鼠的卵母细胞、胚胎及生育力指标 | 生殖生物学 | 生育力障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6雌性小鼠（对照组与高盐饮食组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1938 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1939 | 2025-12-04 |
Unraveling the therapeutic potential of triptolide in glioma: Orchestrating apoptosis and immune landscape remodeling
2026-Jan-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.150039
PMID:41205732
|
研究论文 | 本研究探讨了雷公藤甲素在胶质瘤中的治疗潜力，通过诱导细胞凋亡和重塑肿瘤免疫微环境发挥双重抗肿瘤作用 | 整合转录组学、免疫浸润分析和单细胞RNA测序，揭示了雷公藤甲素通过调控关键基因（如BCL2L11、CASP3、IL6、TGF-β1）同时促进胶质瘤细胞凋亡和抑制M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于公共数据集GSE147352和体外实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 阐明雷公藤甲素在胶质瘤治疗中的作用机制，探索其作为胶质瘤免疫治疗候选药物的潜力 | 胶质瘤细胞及肿瘤免疫微环境，特别是巨噬细胞极化状态 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学、qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 基于公共数据集GSE147352，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1940 | 2025-12-04 |
From genes to lifestyle: A multi-dimensional framework for Alzheimer's disease prevention and therapy
2026-Jan, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2025.102947
PMID:41271115
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病预防和治疗的基因-细胞-网络-生活方式多维框架 | 提出了从单一靶点治疗转向整合基因、细胞、网络和生活方式的多维精准医学范式 | NA | 探讨阿尔茨海默病的多组学整合机制及预防治疗策略 | 阿尔茨海默病相关的基因、细胞类型和调控网络 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、遗传关联研究、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |