单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 19321 - 19340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19321 | 2024-08-08 |
Sci-Seq of Human Fetal Salivary Tissue Introduces Human Transcriptional Paradigms and a Novel Cell Population
2022, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2022.887057
PMID:36540608
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研究论文 | 本研究通过分析人类胎儿唾液腺的单细胞测序数据，识别了发育分支点、新型干细胞样群体及关键信号通路 | 发现了先前未描述的来源于SD并表达高水平干细胞样功能基因的干细胞样细胞群体 | NA | 探索人类唾液腺发育的新型人类特异性发育范式，并为开发转化性人类疗法奠定基础 | 人类胎儿唾液腺的发育及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 19322 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell type-specific immune regulation associated with anti-NMDA receptor encephalitis in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1075675
PMID:36544777
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控机制 | 首次通过单细胞转录组测序技术，详细描述了抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的转录特征和免疫反应 | NA | 探究抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的特异性免疫调控机制 | 抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 129,217个细胞 |
| 19323 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of WGCNA and machine learning identified diagnostic biomarkers in dilated cardiomyopathy with heart failure
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1089915
PMID:36544902
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研究论文 | 本研究通过综合分析WGCNA和机器学习方法，识别出扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法结合，从多个基因表达数据集中识别出与扩张型心肌病合并心力衰竭高度相关的驱动基因，并构建了有效的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的基因表达数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探索扩张型心肌病合并心力衰竭的特定诊断生物标志物及其机制 | 扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物和发病机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | WGCNA, 单细胞RNA测序 | 随机森林, 梯度提升机, 神经网络, 极限梯度提升, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 训练组包括GSE29819和GSE21610数据集，测试组为GSE17800数据集，单细胞RNA测序数据为GSE95140 |
| 19324 | 2024-08-05 |
TSPAN4 and migrasomes in atherosclerosis regression correlated to myocardial infarction and pan-cancer progression
2023-12, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2022.2155337
PMID:36513632
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研究论文 | 本文探讨了TSPAN4在动脉粥样硬化逆转和癌症进展中的作用 | 揭示了TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的关键角色 | 关于TSPAN4对迁移体的生理功能了解较少 | 研究TSPAN4在动脉粥样硬化和癌症进展中的作用 | 聚焦于巨噬细胞中的TSPAN4表达及其在动脉粥样硬化中的相关性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，GEO 数据集，TCGA 数据库 | MI小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 19325 | 2024-08-08 |
CT Radiomics to Predict Macrotrabecular-Massive Subtype and Immune Status in Hepatocellular Carcinoma
2023-04, Radiology
IF:12.1Q1
DOI:10.1148/radiol.221291
PMID:36511807
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研究论文 | 本研究构建了一个CT放射组学模型，用于预测肝细胞癌中的大梁状-大量型亚型及其免疫状态 | 利用放射组学方法非侵入性地识别肝细胞癌的大梁状-大量型亚型，并研究其潜在的免疫浸润模式 | 研究基于回顾性和前瞻性数据集，且样本来自三个学术医学中心，可能存在一定的地域和样本选择偏倚 | 构建CT放射组学模型以预测肝细胞癌的大梁状-大量型亚型，并探讨其免疫浸润模式 | 肝细胞癌患者及其肿瘤亚型和免疫状态 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | CT放射组学 | 机器学习模型 | 图像 | 365名接受切除手术的肝细胞癌成年患者，以及58名接受化疗栓塞和抗血管生成治疗的晚期肝细胞癌成年患者 |
| 19326 | 2024-08-08 |
Dissociation and flow cytometric isolation of murine intestinal epithelial cells for multi-omic profiling
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101936
PMID:36520632
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研究论文 | 本文介绍了一种使用乙二胺四乙酸和TrypLE Express分离高存活率的小鼠肠上皮细胞的逐步协议，这些细胞可用于多组学分析，包括单细胞RNA测序 | 提出了一种新的方法来分离高存活率的肠上皮细胞，适用于多组学分析 | NA | 开发一种新的分离技术，以提高肠上皮细胞的存活率并进行多组学分析 | 小鼠肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 19327 | 2024-08-08 |
ACTA2 Expression Predicts Survival and Is Associated with Response to Immune Checkpoint Inhibitors in Gastric Cancer
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1897
PMID:36508166
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研究论文 | 本研究旨在识别预测胃癌患者总体生存率和免疫检查点抑制剂（ICI）反应的生物标志物 | 发现肿瘤ACTA2表达与胃癌患者的生存率和ICI反应相关，特别是在α-SMA阳性癌症相关成纤维细胞（CAF）中的ACTA2表达与ICI反应有关 | 研究为回顾性分析，且样本量有限 | 识别预测胃癌患者总体生存率和免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | 胃癌患者的肿瘤ACTA2表达与生存率和ICI反应的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、数字空间分析 | NA | mRNA序列数据 | 发现队列567名患者，验证队列974名患者，ICI治疗患者108名 |
| 19328 | 2024-08-05 |
Recent advances in the molecular understanding of medulloblastoma
2023-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15691
PMID:36520034
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综述 | 本文总结了关于髓母细胞瘤的最新基因组学研究进展 | 介绍了SHH亚组和4组亚组中涉及的新突变及其相关通路 | 未探讨临床应用或疗法 | 阐明髓母细胞瘤的分子机制 | 髓母细胞瘤的四个分子亚组及其突变 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 测序分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 19329 | 2024-08-05 |
Active eosinophils regulate host defence and immune responses in colitis
2023-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05628-7
PMID:36509106
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研究论文 | 本文对小鼠嗜酸性粒细胞进行了全面的单细胞转录组分析 | 揭示了嗜酸性粒细胞的活性和基态群体的转录组与空间定位差异 | 研究中的样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探索嗜酸性粒细胞在肠道炎症中的作用 | 小鼠嗜酸性粒细胞及其在肠道中的功能 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本及小规模人类炎症性肠病患者样本 |
| 19330 | 2024-08-08 |
NF-κB drives epithelial-mesenchymal mechanisms of lung fibrosis in a translational lung cell model
2023-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154719
PMID:36520540
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研究论文 | 研究探讨了在特发性肺纤维化进展阶段，肺上皮细胞和肺间质细胞在共培养模型中的相互作用及其对纤维化的影响 | 首次揭示了NF-κB信号通路在肺上皮细胞和肺纤维细胞共培养模型中的活性，及其在纤维化过程中的潜在介导作用 | NA | 研究肺上皮细胞和肺间质细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及NF-κB信号通路的角色 | 人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养样本 |
| 19331 | 2024-08-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Decodes Wharton's Jelly-Derived Mesenchymal Stem Cells Heterogeneity and a Subpopulation with Wound Repair Signatures
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204786
PMID:36504438
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研究论文 | 本研究系统分析了脐带胶（WJ-MSCs）来源的间充质干细胞的高度异质性 | 通过单细胞转录组学分析，识别出四种WJ-MSC亚群及其独特的愈合特性 | 尚未提及具体的局限性 | 探索WJ-MSC的异质性，建立精准的MSC亚型分类 | 脐带胶来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 19332 | 2024-08-08 |
Manf Enhances the Pyroptosis Inhibition of Bone Marrow-derived Mesenchymal Stem Cells to Relieve Cerebral Infarction Injury
2023-02-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过构建大脑中动脉闭塞（MCAO）动物模型，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）比较假手术组和MCAO组的差异表达基因（DEGs），探讨脑梗死中潜在的细胞死亡相关通路，并通过慢病毒将Manf转染到骨髓间充质干细胞（BMSCs）中，评估其对MANF含量、凋亡、细胞焦亡、脑梗死体积和神经功能的影响。 | 本研究首次通过基因修饰的细胞疗法，特别是通过转染Manf到BMSCs中，显著增加了MANF的表达和分泌，从而有效抑制了凋亡和细胞焦亡相关分子的表达，减少了脑梗死体积，改善了神经功能。 | 研究主要集中在动物模型上，尚未在临床试验中验证其疗效和安全性。 | 探讨基因修饰的细胞疗法在脑梗死治疗中的潜在机制和疗效。 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其转染Manf后的效果。 | 细胞生物学 | 脑梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多个细胞集群和动物模型 |
| 19333 | 2024-08-08 |
Immune response and homeostasis mechanism following administration of BBIBP-CorV SARS-CoV-2 inactivated vaccine
2023-Jan-30, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2022.100359
PMID:36506806
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术，分析了BBIBP-CorV灭活疫苗接种后的免疫反应和稳态机制 | 发现灭活疫苗不仅诱导了预期的体液免疫，还引发了多种全面的免疫反应，包括单核细胞和T细胞的激活，以及细胞间通信的增强 | NA | 旨在全面理解BBIBP-CorV灭活疫苗引发的系统性免疫反应，以促进更好的疫苗接种策略和新疫苗的设计 | BBIBP-CorV灭活疫苗接种后的免疫反应和稳态机制 | 疫苗学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19334 | 2024-08-05 |
Improving the performance of single-cell RNA-seq data mining based on relative expression orderings
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac556
PMID:36528803
|
研究论文 | 本文构建了一种新的特征矩阵，称为delta rank matrix (DRM)，用于分析单细胞RNA测序数据 | 首次将基因层面的特征转化为相互作用/边缘层面的特征以进行单细胞RNA测序数据分析 | NA | 提升单细胞RNA测序数据挖掘的性能 | 单细胞RNA测序数据及相应的基因交互网络 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 多种单细胞RNA-seq数据集 |
| 19335 | 2024-08-08 |
RefTM: reference-guided topic modeling of single-cell chromatin accessibility data
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac540
PMID:36513377
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RefTM的参考引导主题模型，用于分析单细胞染色质可及性数据 | RefTM模型不仅利用现有的大量染色质可及性和注释的scCAS数据，还利用单细胞数据分析的主题模型，同时建模参考数据和目标scCAS数据之间的共享生物学变异、scCAS数据的独特生物学变异以及其他已知协变量引起的变异 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞染色质可及性数据，以更好地识别细胞类型并揭示调控机制 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞染色质可及性测序（scCAS） | 主题模型 | 单细胞数据 | 数千个单细胞 |
| 19336 | 2024-08-08 |
Direct Reprogramming Improves Cardiac Function and Reverses Fibrosis in Chronic Myocardial Infarction
2023-01-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了通过直接重编程技术改善慢性心肌梗死后的心脏功能并逆转纤维化的效果 | 首次证明了在体内通过心脏重编程修复慢性心肌梗死并减少纤维化的能力 | 尚未确定该技术在临床应用中的安全性和有效性 | 探索通过心脏重编程技术修复慢性心肌梗死的可能性 | 慢性心肌梗死后的心脏功能和纤维化 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 直接重编程技术 | NA | 基因表达数据 | 使用转基因小鼠模型进行实验 |
| 19337 | 2024-08-05 |
What has single-cell transcriptomics taught us about long non-coding RNAs in the ventricular-subventricular zone?
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.11.011
PMID:36525965
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研究论文 | 这篇文章分析了单细胞转录组学如何揭示心室-旁脑室区中的长非编码RNA的作用 | 通过对单细胞RNA-seq数据的汇总，发现了与神经干细胞激活和分化相关的长非编码RNA | 大多数长非编码RNA的功能尚未被深入研究 | 探究长非编码RNA在心室-旁脑室区的功能及其在神经发育和病理中的作用 | 心室-旁脑室区中的长非编码RNA | 数字病理学 | 脑病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 通过汇总当前的单细胞RNA-seq数据分析 |
| 19338 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic and spatial landscapes of the developing human pancreas
2023-01-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.11.009
PMID:36513063
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研究论文 | 本文展示了正在发育的人类胰腺中各种细胞类型的详细转录组分析以及其空间基因模式 | 整合了单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了不同发育时间点的时空基因级联 | 尚未提及具体的局限性 | 理解人类胰腺发育的过程以及如何生成功能性β细胞 | 发育中的人类胰腺细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19339 | 2024-08-05 |
Benchmarking and integration of methods for deconvoluting spatial transcriptomic data
2023-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac805
PMID:36515467
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研究论文 | 本文对14种去卷积方法进行了全面评估，探讨其在空间转录组数据分析中的表现. | 提出了一种新的集成学习去卷积方法EnDecon，通过整合多个个体方法以实现更精准的去卷积. | 本文未涉及不同类型细胞的具体生物学机制分析. | 研究空间转录组数据的去卷积方法的评估与整合. | 对四个数据集上的去卷积方法进行评估和比较. | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 集成学习 | 基因表达数据 | 四个数据集 |
| 19340 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell transcriptome analysis of CD34 + enriched leukemic stem cells revealed intra- and inter-patient transcriptional heterogeneity in pediatric acute myeloid leukemia
2023-Jan, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-022-05021-4
PMID:36527458
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析儿童急性髓性白血病中CD34+富集白血病干细胞的转录异质性 | 首次揭示了儿童急性髓性白血病白血病干细胞的患者间和患者内转录异质性 | 样本量有限，结果需要在更大队列中验证 | 探索儿童急性髓性白血病中白血病干细胞的转录异质性 | CD34+富集的白血病干细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 28029个急性髓性白血病单细胞 |