单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 19321 - 19340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19321 | 2024-08-08 |
Non-negative low-rank representation based on dictionary learning for single-cell RNA-sequencing data analysis
2022-Dec-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09027-0
PMID:36564711
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研究论文 | 本文提出了一种基于字典学习的非负低秩表示方法（DLNLRR），用于单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别 | DLNLRR方法能够在优化过程中更新字典，实现字典学习和低秩表示学习的同时进行，并且不依赖于谱聚类算法，可以直接基于低秩矩阵进行聚类 | NA | 有效且准确地从大量细胞混合物中识别细胞集群 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示 | 数据矩阵 | 大量真实单细胞数据集 |
| 19322 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and key signaling pathways associated with vascular remodeling and calcification in young and old primate aortas based on single-cell analysis
2022-12-23, Aging
DOI:10.18632/aging.204442
PMID:36566020
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析年轻和老年猴主动脉中血管内皮细胞和平滑肌细胞的异质性，并识别与血管重塑和钙化相关的关键信号通路 | 识别了与血管重塑和钙化相关的新型内皮细胞亚群，并分析了随年龄变化的细胞通讯及相关的信号通路 | NA | 旨在理解血管壁细胞异质性及细胞亚群间通讯变化在衰老过程中的作用，以预防与年龄相关的心血管疾病 | 年轻和老年猴的主动脉 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 年轻和老年猴的主动脉样本 |
| 19323 | 2024-08-08 |
Distance covariance entropy reveals primed states and bifurcation dynamics in single-cell RNA-Seq data
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105709
PMID:36578319
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DICE的计算方法，用于分析单细胞RNA-Seq数据中的表达协变熵模式，以揭示细胞命运转变中的启动状态和分支动态 | DICE方法能够仅使用单细胞RNA-Seq数据预测多能启动状态及其调控因子，并在后续验证中使用单细胞表观基因组数据 | NA | 研究细胞命运转变过程，特别是启动状态和分支动态 | 单细胞RNA-Seq数据中的细胞命运转变 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-Seq数据 | NA |
| 19324 | 2024-08-08 |
Downregulation of the Protein C Signaling System Is Associated with COVID-19 Hypercoagulability-A Single-Cell Transcriptomics Analysis
2022-12-09, Viruses
DOI:10.3390/v14122753
PMID:36560757
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了COVID-19患者肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮中蛋白C信号系统的表达变化，发现蛋白C及其下游信号级联成分在COVID-19患者中下调，可能与COVID-19的高凝状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析了COVID-19患者中蛋白C信号系统的表达变化，揭示了蛋白C在COVID-19高凝状态中的潜在机制作用。 | 研究样本仅来自COVID-19 Cell Atlas数据库，可能存在样本选择偏倚；未详细说明数据分析的具体方法和统计学意义。 | 探索COVID-19相关凝血病中蛋白C信号网络的潜在表达变化。 | COVID-19患者的肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 19325 | 2024-08-08 |
Isolation of Nuclei from Flash-frozen Liver Tissue for Single-cell Multiomics
2022-12-09, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64792
PMID:36571404
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研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻保存的肝脏组织中分离细胞核的稳健且可重复的协议 | 该方法能够产生高质量的细胞核，适用于下游单细胞组学方法，如单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq）以及多模态组学（联合RNA-seq和ATAC-seq） | NA | 研究肝脏在健康和疾病状态下的单细胞分辨率特征 | 从健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物冷冻肝脏样本中分离的细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq） | NA | 细胞核 | 涉及健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物的冷冻肝脏样本 |
| 19326 | 2024-08-08 |
Improved Macrophage Enrichment from Mouse Skeletal Muscle
2022-Dec-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4561
PMID:36561115
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研究论文 | 本文详细描述了一种从年轻和老年小鼠骨骼肌中分离CD45/CD11b巨噬细胞富集细胞的优化方法 | 提出了一种新的方法来高效分离骨骼肌中的巨噬细胞，具有足够的纯度和产量，适用于各种下游分析 | NA | 研究骨骼肌中巨噬细胞的功能及其在骨骼肌老化中的作用 | 小鼠骨骼肌中的巨噬细胞 | NA | NA | 流式细胞术分析，荧光激活细胞分选(FACS)，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的骨骼肌巨噬细胞 |
| 19327 | 2024-08-08 |
Multicenter dose-escalation Phase I trial of mitomycin C pressurized intraperitoneal aerosolized chemotherapy in combination with systemic chemotherapy for appendiceal and colorectal peritoneal metastases: rationale and design
2022-Dec, Pleura and peritoneum
IF:1.4Q3
DOI:10.1515/pp-2022-0116
PMID:36560966
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research paper | 本研究旨在进行一项多中心剂量递增的I期试验，评估米托蒽醌加压腹腔内气雾化疗（MMC-PIPAC）与系统化疗（FOLFIRI）联合治疗阑尾癌或结直肠癌腹膜转移的效果 | MMC-PIPAC是一种治疗腹膜转移的微创方法，本研究将探索其与系统化疗联合使用的推荐剂量和安全性 | NA | 确定MMC-PIPAC与FOLFIRI联合使用的推荐剂量，并评估其早期疗效信号 | 阑尾癌或结直肠癌腹膜转移患者 | NA | colorectal cancer | PIPAC | NA | blood and tissue specimens | 21名可评估患者 |
| 19328 | 2024-08-08 |
Characteristic analysis of skin keratinocytes in patients with type 2 diabetes based on the single-cell levels
2022-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002323
PMID:36583863
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研究论文 | 本研究旨在探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞在单细胞水平的转录特征，为揭示病理条件下角质形成细胞的病理机制提供实验数据 | 本研究首次在单细胞水平上分析了2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征，并筛选出一系列差异表达基因 | 研究样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者，可能影响结果的普遍性和可靠性 | 探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征 | 2型糖尿病患者的皮肤角质形成细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者的皮肤组织样本 |
| 19329 | 2024-08-08 |
Resolving the gene expression maps of human first-trimester chorionic villi with spatial transcriptome
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1060298
PMID:36561369
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研究论文 | 本研究使用改进的Stereo-seq方法，对两名孕妇早期绒毛膜绒毛的空间转录组进行了分析，揭示了绒毛膜绒毛中主要细胞类型的基因表达模式及其空间定位。 | 本研究首次使用PFA固定的人类绒毛膜绒毛样本进行空间转录组分析，显著改善了组织形态和RNA信号的特异性。 | 研究样本仅来自两名孕妇，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在通过空间转录组技术解析人类早期绒毛膜绒毛的基因表达图谱，以深入理解胎盘的结构和功能。 | 人类早期绒毛膜绒毛的基因表达及其空间分布。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | 两名孕妇的绒毛膜绒毛样本 |
| 19330 | 2024-08-08 |
Inflammatory role of microglia in brain injury caused by subarachnoid hemorrhage
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.956185
PMID:36561497
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的炎症作用及其最新进展 | 探讨了微胶质细胞通过TLR4、CaSR和TREM-1等受体介导的信号通路在脑水肿、神经元凋亡和血脑屏障破坏中的双重作用 | NA | 探讨微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的病理机制 | 微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的作用 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19331 | 2024-08-08 |
Case report: Clinical and single-cell transcriptome sequencing analysis of a mixed gangliocytoma-adenoma presenting as acromegaly
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1088803
PMID:36568175
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病例报告 | 本文报告了一例混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA）表现为肢端肥大症的28岁男性患者的临床和单细胞转录组测序分析 | 本病例报告详细描述了MGA手术和放疗后的唯一临床和分子报告，并通过单细胞转录组测序分析揭示了肿瘤内异质性 | NA | 增强对MGA诊断和治疗的理解，并通过单细胞转录组测序分析提供对后续基础研究的支持 | 混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA） | NA | 神经节细胞瘤-腺瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 临床数据、病理学数据、超微结构数据、单细胞转录组数据 | 一例28岁男性患者 |
| 19332 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell RNA sequencing and prognostic model revealed the carcinogenicity and clinical significance of FAM83D in ovarian cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1055648
PMID:36568230
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和预后模型，探讨了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义 | 首次通过单细胞RNA测序和预后模型整合分析，揭示了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义，并发现了miR-138-5p对FAM83D致癌作用的调控 | NA | 探讨FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义 | FAM83D在卵巢癌中的作用及其与miR-138-5p的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso-Cox回归分析 | 细胞 | 正常卵巢和高级别浆液性卵巢癌组织中的细胞 |
| 19333 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses reveal a prognostic signature of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1028469
PMID:36568368
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的预后标志 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了基于4个基因的预后标志 | 研究样本来源于公共数据库，可能存在一定的数据偏差；预后标志的临床应用需要进一步的临床试验验证 | 识别头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨其在分子特征、免疫特征及免疫治疗和化疗中的潜在作用 | 头颈鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 样本来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库，具体数量未详细说明 |
| 19334 | 2024-08-08 |
TP53-related signature for predicting prognosis and tumor microenvironment characteristics in bladder cancer: A multi-omics study
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1057302
PMID:36568387
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研究论文 | 本研究探讨了TP53基因突变在膀胱癌中的作用，构建了一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和肿瘤微环境特征。 | 本研究首次构建了基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应，并通过多种组学方法深入分析了TP53活性与肿瘤微环境的关系。 | 本研究主要基于多组学数据进行分析，未来需要更多的临床验证来证实该特征的可靠性和实用性。 | 探索TP53突变在膀胱癌中的作用，构建一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应。 | 膀胱癌患者，特别是TP53突变对肿瘤微环境和预后的影响。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 19335 | 2024-08-08 |
Autologous cord blood mononuclear cell infusion for the prevention of bronchopulmonary dysplasia in very preterm monozygotic twins: A study protocol for a randomized, placebo-controlled, double-blinded multicenter trial
2022, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2022.884366
PMID:36568414
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研究论文 | 本研究旨在评估自体脐带血单个核细胞输注预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良的效果，并探讨其保护机制 | 这是首个随机、安慰剂对照、双盲的多中心试验，用于评估自体脐带血单个核细胞输注在预防同卵双胞胎早产儿支气管肺发育不良中的疗效 | 遗传异质性可能降低对照组和干预组之间的可比性，尤其是在小样本试验中 | 研究自体脐带血单个核细胞输注在预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良中的效果及其保护机制 | 极早产（小于32周妊娠）的同卵双胞胎新生儿 | NA | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 60对同卵双胞胎早产新生儿 |
| 19336 | 2024-08-08 |
Pyruvate: Ferredoxin oxidoreductase is involved in IgA-related microbiota dysbiosis and intestinal inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040774
PMID:36569858
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸脱氢酶：铁氧还蛋白氧化还原酶（PFOR）在免疫球蛋白A（IgA）相关微生物失调和肠道炎症中的作用 | 首次发现PFOR作为IgA结合抗原，可能参与宿主与微生物的相互作用 | NA | 研究PFOR在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对宿主-微生物相互作用的影响 | 炎症性肠病患者、兔子模型以及PFOR蛋白 | NA | 炎症性肠病 | 16S rDNA测序、酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白质印迹、质谱分析、单细胞测序 | NA | 微生物群落数据、免疫球蛋白A数据、蛋白质数据 | 炎症性肠病患者样本、兔子模型 |
| 19337 | 2024-08-08 |
Identification of B cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic model and identify immune infiltration in osteosarcoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1026701
PMID:36569871
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序结果，识别B细胞标记基因，并建立预测骨肉瘤预后的模型，同时分析免疫浸润差异。 | 首次通过单细胞测序技术识别B细胞标记基因，并建立了一个具有良好预测性能的骨肉瘤预后模型。 | NA | 探讨B细胞在骨肉瘤预后和免疫浸润中的作用。 | B细胞标记基因、骨肉瘤预后模型及免疫浸润差异。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 261个B细胞标记基因 |
| 19338 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptome analysis of the tumor ecosystems underlying cervical cancer metastasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.966291
PMID:36569924
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的转录组特征，揭示了宫颈癌淋巴结转移的分子机制 | 首次详细描述了宫颈癌淋巴结转移中上皮细胞和肿瘤微环境的转录组变化，特别是细胞周期、免疫反应相关信号通路和癌症相关成纤维细胞的作用 | 研究仅限于转录组分析，未涉及更深层次的分子机制或其他类型的生物标志物 | 探究宫颈癌淋巴结转移的分子机制 | 宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 51,507个单细胞 |
| 19339 | 2024-08-08 |
Dupilumab improves clinical symptoms in children with Netherton syndrome by suppressing Th2-mediated inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1054422
PMID:36569942
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研究论文 | 本文评估了dupilumab（一种IL-4Rα拮抗剂）在Netherton综合征患儿中的临床反应，并研究了Th1/2/17通路活性和皮肤屏障缺陷蛋白LEKTI表达的变化。 | 首次评估了dupilumab在Netherton综合征患儿中的疗效，并详细分析了其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 研究样本量较小，仅包括四名患儿，且未观察到LEKTI蛋白表达的显著变化。 | 评估dupilumab在Netherton综合征患儿中的临床效果，并探讨其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 四名患有严重Netherton综合征的儿童。 | NA | Netherton综合征 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 血液，皮肤组织 | 4名患儿 |
| 19340 | 2024-08-08 |
The single-cell landscape of cystic echinococcosis in different stages provided insights into endothelial and immune cell heterogeneity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1067338
PMID:36569953
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同阶段细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞，揭示了疾病进展中的免疫细胞和内皮细胞异质性 | 首次发现具有感染阶段特异性的SPP1+巨噬细胞，并深入探讨了其在晚期感染阶段与血管生成和免疫逃避机制的关系 | NA | 探究细粒棘球蚴病生态系统，特别是晚期感染阶段的血管生成和免疫逃避机制 | 细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,199个细胞，来自感染1、3、6个月及未感染的野生型小鼠肝脏样本（两份重复） |