单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 19301 - 19320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19301 | 2024-08-08 |
Characterizing Macrophages Diversity in COVID-19 Patients Using Deep Learning
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122264
PMID:36553530
|
研究论文 | 本研究利用深度学习技术分析了COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，以识别与疾病严重程度相关的分子状态 | 本研究首次使用图卷积神经网络模型来预测COVID-19感染的严重程度，并展示了高预测准确率 | NA | 旨在通过计算方法识别与COVID-19感染严重程度相关的分子状态，以理解关键免疫反应的差异 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 12个支气管肺泡灌洗液样本，包含63,734个细胞，每个细胞有23,916个基因 |
| 19302 | 2024-08-08 |
The Sum of Two Halves May Be Different from the Whole-Effects of Splitting Sequencing Samples Across Lanes
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122265
PMID:36553532
|
研究论文 | 本文探讨了将样本分批进行高通量测序（HTS）时，跨测序道分割样本对结果的影响 | 系统性地分析了测序设计中被忽略的变异来源，并展示了这种分割对批量和单细胞测序数据分析的定性和定量影响 | 文章未详细说明解决这些问题的具体方法或技术 | 研究测序设计中的变异来源及其对结果稳健性和可重复性的影响 | 批量mRNA测序、批量ChIP测序和单细胞测序数据 | 高通量测序 | NA | 高通量测序（HTS） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 19303 | 2024-08-08 |
Colon-Targeted eNAMPT-Specific Peptide Systems for Treatment of DSS-Induced Acute and Chronic Colitis in Mouse
2022-Nov-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox11122376
PMID:36552583
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了NAMPT和CYBB在结肠炎患者和鼠模型中的表达上调，并开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽能够靶向结肠并抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，有效减轻DSS诱导的急性和慢性结肠炎。 | 开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽具有结肠靶向性并能抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，为结肠炎治疗提供了新的候选药物。 | NA | 研究NAMPT在炎症巨噬细胞中的作用及其在结肠炎治疗中的潜在应用。 | NAMPT和CYBB在结肠炎中的表达及新型重组TK肽rCT-NAMPT的开发与应用。 | NA | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 19304 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies Master Regulators Affected by Panobinostat in Neuroblastoma Cells
2022-11-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122240
PMID:36553506
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了泛HDAC抑制剂panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的作用，并识别了受其影响的转录调控因子。 | 利用单细胞测序技术在神经母细胞瘤细胞中研究panobinostat的作用，具有前所未有的分辨率。 | NA | 探究panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的分子机制和基因调控网络。 | 神经母细胞瘤细胞和panobinostat的作用。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19305 | 2024-08-08 |
A Dual-Channel Microfluidic Chip for Single Tobacco Protoplast Isolation and Dynamic Capture
2022-Nov-29, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi13122109
PMID:36557407
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研究论文 | 本研究设计了一种基于PDMS的双通道微流控芯片，用于单个烟草原生质体的分离和动态捕获 | 本研究提供了一种新的高吞吐量单原生质体研究策略，并为单细胞捕获机制奠定了理论基础 | NA | 研究单个原生质体的分离和捕获，以满足基因功能验证、亚细胞定位和单细胞测序的需求 | 烟草原生质体和聚苯乙烯微球 | 微流控技术 | NA | 微流控芯片 | NA | NA | 单个烟草原生质体的捕获效率为83.33%，入口流速为0.75 μL/min |
| 19306 | 2024-08-08 |
Advances in Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in Poultry Science
2022-11-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122211
PMID:36553479
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review | 本文综述了单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用潜力 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用报道较少 | 探讨单细胞测序技术在禽类科学中的应用及其创新 | 单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因、表型和细胞生物学机制 | 单个细胞 |
| 19307 | 2024-08-08 |
Microglia-specific transcriptional repression of interferon-regulated genes after prolonged stress in mice
2022-Nov, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100495
PMID:36532375
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研究论文 | 研究探讨了小鼠在长期轻度压力下，小胶质细胞特异性的表观基因组变化及其对干扰素调节基因的转录抑制作用 | 首次揭示了小胶质细胞在长期压力下对干扰素调节基因的转录抑制，且这一现象与干扰素的产生无关，而是可能与Activating Transcription Factor 3 (ATF3)的增加有关 | NA | 探究长期压力下小胶质细胞的表观基因组变化及其对神经炎症的影响 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 12周暴露于轻度压力的小鼠 |
| 19308 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic, transcriptomic, and metabolomic characterization of human atherosclerosis
2022-Nov, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4852
PMID:36544681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、转录组学和代谢组学分析，深入探讨了人类动脉粥样硬化的细胞间相互作用和关键基因 | 本研究首次综合分析了单细胞测序数据、主动脉转录组和代谢组数据，揭示了动脉粥样硬化的关键基因和信号通路 | NA | 深入理解动脉粥样硬化斑块形成的细胞间连接和关键中心基因 | 人类动脉粥样硬化的细胞类型、亚型分化轨迹、相互作用网络和重要转录因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 涉及多种细胞类型，包括T细胞、单核细胞、平滑肌细胞、内皮细胞、B细胞、成纤维细胞、浆细胞、肥大细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞 |
| 19309 | 2024-08-08 |
Intermittent protein restriction protects islet β cells and improves glucose homeostasis in diabetic mice
2022-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.12.024
PMID:36546138
|
研究论文 | 本研究探讨了间歇性蛋白质限制（IPR）在糖尿病控制中的有效性 | IPR不仅显著降低了糖尿病小鼠的高血糖，还改善了胰岛β细胞的数量、增殖和功能，并减少了肝脏中的葡萄糖产生 | NA | 探索间歇性蛋白质限制在糖尿病治疗中的效果 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了链脲佐菌素处理和瘦素受体缺陷的db/db小鼠模型 |
| 19310 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γδ T cells
2022-02-26, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.11.013
PMID:36546093
|
研究论文 | 本文通过结合转录组和染色质分析，构建了小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的单细胞转录组和染色质可及性图谱 | 首次揭示了γδ T1和γδ T17细胞在这些组织中的异质性，并推断了其潜在的调控机制，同时发现了具有未成熟特性的新型Gzma γδ T细胞亚群 | NA | 解析小鼠γδ T细胞的异质性及其在不同组织中的功能 | 小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的转录组和染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的样本 |
| 19311 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/8422339
PMID:36530957
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其在预后和免疫治疗反应中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析鉴定了ccRCC细胞中的不同分化状态和分化相关基因（DRGs），并结合机器学习构建了预后风险模型 | NA | 研究ccRCC细胞的分化状态对预后和免疫治疗反应的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 涉及83种化合物或抑制剂的响应差异分析 |
| 19312 | 2024-08-08 |
A mitochondria-related signature for predicting immune microenvironment and therapeutic response in osteosarcoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1085065
PMID:36531021
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研究论文 | 本文构建了一个与线粒体相关的特征，用于预测骨肉瘤中的免疫微环境和治疗反应 | 首次在骨肉瘤中建立了一个与线粒体相关的特征，用于综合评估线粒体在骨肉瘤中的致病和调节作用 | NA | 开发一个与线粒体相关的特征，以预测骨肉瘤中的免疫微环境、化疗药物和预后 | 骨肉瘤患者的线粒体相关特征及其在免疫微环境和治疗反应中的预测价值 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的骨肉瘤样本的转录组数据和临床信息 |
| 19313 | 2024-08-08 |
The new ceRNA crosstalk between mRNAs and miRNAs in intervertebral disc degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1083983
PMID:36531954
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研究论文 | 本研究旨在从多维度转录组学角度揭示椎间盘退变的发病分子机制 | 本研究通过分析公共数据库中的转录组数据，发现了与椎间盘退变相关的新的竞争性内源RNA（ceRNA）网络，并识别了关键基因 | NA | 揭示椎间盘退变的发病分子机制，寻找有效的诊断生物标志物和新的治疗策略 | 椎间盘退变相关的mRNA和microRNA表达谱 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及两个批量数据集（GSE67567和GSE167199）和一个单细胞RNA测序数据集（GSE199866） |
| 19314 | 2024-08-08 |
Junctional adhesion molecule-A is dispensable for myeloid cell recruitment and diversification in the tumor microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003975
PMID:36531986
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研究论文 | 研究探讨了连接粘附分子-A（JAM-A）在肿瘤微环境中对骨髓细胞招募和多样化的作用 | 发现肿瘤可以绕过JAM-A对骨髓细胞招募和重编程的需求 | NA | 探究JAM-A在肿瘤微环境中对骨髓细胞功能的影响 | 连接粘附分子-A（JAM-A）及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用骨髓特异性JAM-A缺陷小鼠进行研究 |
| 19315 | 2024-08-08 |
Krebs von den lungen-6 as a clinical marker for hypersensitivity pneumonitis: A meta-analysis and bioinformatics analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1041098
PMID:36532009
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meta-analysis | 本研究通过meta分析和生物信息学分析探讨了Krebs von den lungen-6（KL-6）在不同类型超敏性肺炎（HP）中的浓度变化 | 本研究首次通过meta分析和生物信息学分析综合评估了KL-6在HP患者和健康对照中的表达差异 | NA | 阐明KL-6在不同类型超敏性肺炎中的浓度变化 | 超敏性肺炎患者和健康对照的KL-6浓度 | NA | 超敏性肺炎 | meta分析, 生物信息学分析 | NA | mRNA表达数据 | 20项研究 |
| 19316 | 2024-08-08 |
Dysfunction of CCR1+ decidual macrophages is a potential risk factor in the occurrence of unexplained recurrent pregnancy loss
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1045532
PMID:36532057
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和临床样本的功能实验，发现CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的作用 | 首次揭示了CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的关键作用，并阐明了其免疫抑制和迁移调控特性 | NA | 探讨不明原因反复流产的潜在风险因素 | CCR1+基质巨噬细胞及其在不明原因反复流产中的作用 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 涉及正常早期妊娠和不明原因反复流产患者的基质样本 |
| 19317 | 2024-08-08 |
Aberrant metabolic processes promote the immunosuppressive microenvironment in multiple myeloma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1077768
PMID:36532059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤骨髓中免疫细胞的动态特征，并探讨了异常代谢过程对免疫抑制微环境的影响。 | 发现异常代谢过程与多发性骨髓瘤患者免疫抑制微环境的关联，并提出PIM激酶作为潜在的免疫治疗策略。 | NA | 探讨多发性骨髓瘤中免疫细胞功能障碍的分子机制及其与异常代谢过程的关系。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫细胞及其代谢特征。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19318 | 2024-08-08 |
SFRP4+IGFBP5hi NKT cells induced neural-like cell differentiation to contribute to adenomyosis pain
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.945504
PMID:36532077
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本，发现SFRP4+NKT细胞和大量未分化的多能干细胞在疼痛组中，并揭示了SFRP4+NKT细胞中IGFBP5高表达促进多能干细胞向神经样细胞分化的机制。 | 首次发现SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞能够促进多能干细胞向神经样细胞分化，从而参与子宫内膜异位症疼痛的发生。 | NA | 探讨SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞在子宫内膜异位症疼痛中的作用及其机制。 | 子宫内膜异位症患者的组织细胞样本。 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本 |
| 19319 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the Müller subtypes and inner blood-retinal barrier regulatory network in early diabetic retinopathy
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1048634
PMID:36533134
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠视网膜中的35,910个细胞，重点关注糖尿病视网膜病变中构成大鼠血视网膜屏障的主要细胞的退化以及Müller细胞的两个亚群的新定义。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的Müller亚型及其调控网络。 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 阐明糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的细胞退化及其调控关系。 | 健康和糖尿病大鼠视网膜中的细胞。 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 35,910个细胞 |
| 19320 | 2024-08-08 |
State-of-the-art analytical methods of viral infections in human lung organoids
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0276115
PMID:36538516
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研究论文 | 本文提供了一套详细的实验操作指南，用于研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染过程及其影响 | 本文介绍了多种先进的分析方法，包括蛋白质提取、RNA提取、单细胞RNA测序等，以评估病毒感染的影响和宿主因子的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染特性和宿主反应 | 人肺泡样类器官和SARS-CoV-2病毒 | 数字病理学 | COVID-19 | qPCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交 | NA | 蛋白质, RNA, 细胞 | 基于不同供体的人肺泡样类器官 |