单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
19241	2024-08-08	TP53-related signature for predicting prognosis and tumor microenvironment characteristics in bladder cancer: A multi-omics study 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1057302 PMID:36568387	研究论文	本研究探讨了TP53基因突变在膀胱癌中的作用，构建了一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和肿瘤微环境特征。	本研究首次构建了基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应，并通过多种组学方法深入分析了TP53活性与肿瘤微环境的关系。	本研究主要基于多组学数据进行分析，未来需要更多的临床验证来证实该特征的可靠性和实用性。	探索TP53突变在膀胱癌中的作用，构建一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应。	膀胱癌患者，特别是TP53突变对肿瘤微环境和预后的影响。	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序、单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	具体样本数量未在摘要中明确提及
19242	2024-08-08	Autologous cord blood mononuclear cell infusion for the prevention of bronchopulmonary dysplasia in very preterm monozygotic twins: A study protocol for a randomized, placebo-controlled, double-blinded multicenter trial 2022, Frontiers in pediatrics IF:2.1Q2 DOI:10.3389/fped.2022.884366 PMID:36568414	研究论文	本研究旨在评估自体脐带血单个核细胞输注预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良的效果，并探讨其保护机制	这是首个随机、安慰剂对照、双盲的多中心试验，用于评估自体脐带血单个核细胞输注在预防同卵双胞胎早产儿支气管肺发育不良中的疗效	遗传异质性可能降低对照组和干预组之间的可比性，尤其是在小样本试验中	研究自体脐带血单个核细胞输注在预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良中的效果及其保护机制	极早产（小于32周妊娠）的同卵双胞胎新生儿	NA	新生儿疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞	60对同卵双胞胎早产新生儿
19243	2024-08-08	Pyruvate: Ferredoxin oxidoreductase is involved in IgA-related microbiota dysbiosis and intestinal inflammation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1040774 PMID:36569858	研究论文	本研究探讨了乳酸脱氢酶：铁氧还蛋白氧化还原酶（PFOR）在免疫球蛋白A（IgA）相关微生物失调和肠道炎症中的作用	首次发现PFOR作为IgA结合抗原，可能参与宿主与微生物的相互作用	NA	研究PFOR在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对宿主-微生物相互作用的影响	炎症性肠病患者、兔子模型以及PFOR蛋白	NA	炎症性肠病	16S rDNA测序、酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白质印迹、质谱分析、单细胞测序	NA	微生物群落数据、免疫球蛋白A数据、蛋白质数据	炎症性肠病患者样本、兔子模型
19244	2024-08-08	Identification of B cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic model and identify immune infiltration in osteosarcoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1026701 PMID:36569871	研究论文	本研究基于单细胞测序结果，识别B细胞标记基因，并建立预测骨肉瘤预后的模型，同时分析免疫浸润差异。	首次通过单细胞测序技术识别B细胞标记基因，并建立了一个具有良好预测性能的骨肉瘤预后模型。	NA	探讨B细胞在骨肉瘤预后和免疫浸润中的作用。	B细胞标记基因、骨肉瘤预后模型及免疫浸润差异。	数字病理学	骨肉瘤	单细胞测序	NA	基因数据	261个B细胞标记基因
19245	2024-08-08	Integrated single-cell transcriptome analysis of the tumor ecosystems underlying cervical cancer metastasis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.966291 PMID:36569924	研究论文	本研究通过单细胞测序技术分析了宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的转录组特征，揭示了宫颈癌淋巴结转移的分子机制	首次详细描述了宫颈癌淋巴结转移中上皮细胞和肿瘤微环境的转录组变化，特别是细胞周期、免疫反应相关信号通路和癌症相关成纤维细胞的作用	研究仅限于转录组分析，未涉及更深层次的分子机制或其他类型的生物标志物	探究宫颈癌淋巴结转移的分子机制	宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的单细胞转录组	数字病理学	宫颈癌	单细胞测序	NA	转录组数据	51,507个单细胞
19246	2024-08-08	Dupilumab improves clinical symptoms in children with Netherton syndrome by suppressing Th2-mediated inflammation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1054422 PMID:36569942	研究论文	本文评估了dupilumab（一种IL-4Rα拮抗剂）在Netherton综合征患儿中的临床反应，并研究了Th1/2/17通路活性和皮肤屏障缺陷蛋白LEKTI表达的变化。	首次评估了dupilumab在Netherton综合征患儿中的疗效，并详细分析了其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。	研究样本量较小，仅包括四名患儿，且未观察到LEKTI蛋白表达的显著变化。	评估dupilumab在Netherton综合征患儿中的临床效果，并探讨其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。	四名患有严重Netherton综合征的儿童。	NA	Netherton综合征	流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化分析	NA	血液，皮肤组织	4名患儿
19247	2024-08-08	The single-cell landscape of cystic echinococcosis in different stages provided insights into endothelial and immune cell heterogeneity 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1067338 PMID:36569953	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同阶段细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞，揭示了疾病进展中的免疫细胞和内皮细胞异质性	首次发现具有感染阶段特异性的SPP1+巨噬细胞，并深入探讨了其在晚期感染阶段与血管生成和免疫逃避机制的关系	NA	探究细粒棘球蚴病生态系统，特别是晚期感染阶段的血管生成和免疫逃避机制	细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞	数字病理学	寄生虫病	单细胞RNA测序	NA	转录组	45,199个细胞，来自感染1、3、6个月及未感染的野生型小鼠肝脏样本（两份重复）
19248	2024-08-08	OPA1 supports mitochondrial dynamics and immune evasion to CD8+ T cell in lung adenocarcinoma 2022, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.14543 PMID:36573240	研究论文	本研究探讨了OPA1在非小细胞肺癌细胞中线粒体融合和免疫逃逸中的作用	发现OPA1和MFN1的拷贝数扩增在肺癌组织中高度共现，并且OPA1的高表达与不良预后相关	NA	研究OPA1在非小细胞肺癌中的作用及其分子机制	OPA1在非小细胞肺癌细胞中的作用	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	多组学数据	肺癌组织样本
19249	2024-08-08	A high-efficiency PEG-Ca2+-mediated transient transformation system for broccoli protoplasts 2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2022.1081321 PMID:36578340	研究论文	本研究通过优化质粒浓度、PEG4000质量浓度和基因型选择等关键因素，建立了一种高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，并建立了高效通用的西兰花原生质体分离系统。	本研究建立了高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，能够可靠地获得高活性的原生质体，为国际前沿研究领域如单细胞测序、空间转录组学、植物体细胞杂交、基因功能分析和亚细胞定位提供了重要的技术支持。	NA	研究基因功能、亚细胞定位和植物形态发育。	西兰花原生质体。	植物学	NA	瞬时转化技术	NA	原生质体	使用三种不同基因型的西兰花子叶，原生质体产量超过5×10/mL/g，活性超过95%。
19250	2024-08-08	Mechanisms of Panax Ginseng on Treating Sepsis by RNA-Seq Technology 2022, Infection and drug resistance IF:2.9Q2 DOI:10.2147/IDR.S393654 PMID:36582454	研究论文	本研究利用网络药理学和RNA-seq技术探讨人参治疗脓毒症的潜在活性靶点和机制	通过RNA-seq分析和网络药理学方法，首次揭示了人参中的特定成分如何通过调节关键基因的表达来影响脓毒症的治疗	研究主要基于数据库分析和RNA-seq数据，未来需要更多的临床试验来验证这些发现	探索人参在治疗脓毒症中的作用机制	脓毒症患者和健康志愿者的外周血	NA	脓毒症	RNA-seq	NA	RNA	4521个与脓毒症相关的基因，86个人参活性成分及其294个活性靶点
19251	2024-08-08	Identification of PTPN22 as a potential genetic biomarker for abdominal aortic aneurysm 2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2022.1061771 PMID:36588574	研究论文	本文通过综合生物信息学和细胞模型验证，揭示了PTPN22基因作为腹主动脉瘤潜在的遗传生物标志物	首次发现PTPN22基因在腹主动脉瘤患者中的表达上调，并验证了其在细胞模型中的表达增加	研究仅限于临床样本和细胞模型，未涉及更大规模的人群验证	识别腹主动脉瘤的遗传生物标志物，以预测高风险人群	PTPN22基因及其在腹主动脉瘤中的表达	遗传学	腹主动脉瘤	综合生物信息学分析，单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自腹主动脉瘤患者的主动脉组织和外周血单个核细胞
19252	2024-08-08	Potential biomarkers and immune cell infiltration involved in aortic valve calcification identified through integrated bioinformatics analysis 2022, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2022.944551 PMID:36589450	研究论文	通过综合生物信息学分析，识别与主动脉瓣钙化相关的潜在生物标志物和免疫细胞浸润	识别了SCG2和CCL19作为主动脉瓣钙化的新型潜在生物标志物，并探讨了它们与免疫细胞类型的关系	NA	深入理解主动脉瓣钙化的发病机制，并为未来的诊断和免疫治疗提供有价值的信息	主动脉瓣钙化疾病及其潜在的生物标志物和免疫细胞浸润	数字病理学	心血管疾病	机器学习算法（LASSO和SVM-RFE），CIBERSORT算法	NA	基因表达数据，单细胞测序数据，免疫组织化学染色数据	使用了三个公开的基因表达数据集（GSE12644，GSE51472，GSE77287）和一个外部数据集（GSE83453），以及单细胞测序数据集（SRP222100）和人类临床组织样本
19253	2024-08-05	The second heart field: the first 20 years 2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s00335-022-09975-8 PMID:36550326	综述	本文回顾了第二心场（SHF）在心脏发育中的贡献和信号调控网络	文章总结了第二心场研究20年的进展，并提出了单细胞测序和精确谱系追踪的新技术应用	需要进一步研究SHF的细胞异质性及其复杂的调控网络和未确定机制	探讨第二心场在心脏发育中的作用及其临床应用	主要研究对象为第二心场及其在心脏发育中的作用	NA	先天性心脏病	单细胞测序	NA	NA	NA
19254	2024-08-05	Single-cell and spatial multi-omics in the plant sciences: Technical advances, applications, and perspectives 2023-05-08, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2022.100508 PMID:36540021	综述	本文概述了植物科学中单细胞和空间多组学的技术进展、应用和前景.	提出了将单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学结合以分析植物发育的创新方法.	没有提及具体的实验数据和案例研究来支持论点.	研究和概述单细胞和空间多组学在植物科学中的应用和未来发展.	植物组织中的转录组和代谢组.	数字病理学	NA	单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学	NA	转录组数据, 代谢组数据	NA
19255	2024-08-05	Single-cell RNA-seq of Lotus japonicus provide insights into identification and function of root cell types of legume 2023-May, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1 DOI:10.1111/jipb.13435 PMID:36537698	研究论文	该文章研究了莲池豆根部不同细胞类型的转录组及其功能	首次提供了豆科植物根尖的单细胞分辨率转录组	研究主要集中在一种豆科植物，可能无法普遍适用于所有豆科植物	探讨豆科植物根部不同细胞类型的转录组和功能	莲池豆的根尖单细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	超过22000个单细胞
19256	2024-08-05	Privacy-preserving integration of multiple institutional data for single-cell type identification with scPrivacy 2023-05, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-022-2224-4 PMID:36543995	研究论文	本研究提出了一个名为scPrivacy的原型，用于在数据隐私保护的情况下实现单细胞类型的自动识别	该研究是首个通用的自动化单细胞类型识别原型，能在保护数据隐私的前提下促进单细胞注释	该方法的有效性主要依赖于所使用的公共基准数据集	研究旨在推动在多机构数据隐私保护下的单细胞类型识别	研究对象为来自多个机构的大规模单细胞RNA-seq数据集	数字病理学	NA	RNA-seq	NA	RNA-seq数据	综合公开可用的基准数据集
19257	2024-08-08	scRNA-seq profiling of neonatal and adult thymus-derived CD4+ T cells by a T cell origin-time tracing model 2023-04-20, Journal of molecular cell biology IF:5.3Q2 DOI:10.1093/jmcb/mjac072 PMID:36542462	研究论文	本研究通过T细胞起源时间追踪模型，对新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了新生胸腺来源的调节T细胞（Treg）在免疫抑制功能上的增强特性。	首次通过单细胞RNA测序技术，详细比较了新生和成年胸腺来源CD4+ T细胞的分子特征和功能差异，特别是在免疫稳态维持方面的能力。	研究主要依赖于动物模型，且追踪时间有限，可能未能完全反映长期环境影响下的T细胞动态变化。	探讨新生和成年胸腺来源CD4+ T细胞在分子水平和功能上的差异，特别是在免疫稳态维持方面的能力。	新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞，特别是调节T细胞（Treg）。	免疫学	NA	单细胞RNA测序	T细胞起源时间追踪模型	RNA	新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞样本，追踪时间为9周和12天
19258	2024-08-05	Novel insights into Hodgkin lymphoma biology by single-cell analysis 2023-04-13, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2022017147 PMID:36548960	研究论文	通过单细胞分析对霍奇金淋巴瘤生物学的新见解	使用单细胞技术揭示了霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中细胞间相互作用和异质性的独特特点	未提及具体的限制因素	深入理解霍奇金淋巴瘤中的免疫生物学	霍奇金淋巴瘤及其肿瘤微环境	数字病理学	霍奇金淋巴瘤	单细胞RNA测序和多重成像技术	NA	血液样本、新鲜组织和福尔马林固定样本	NA
19259	2024-08-08	Single-Cell Analysis Reveals Transcriptomic Features of Drug-Tolerant Persisters and Stromal Adaptation in a Patient-Derived EGFR-Mutated Lung Adenocarcinoma Xenograft Model 2023-04, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1 DOI:10.1016/j.jtho.2022.12.003 PMID:36535627	研究论文	本研究使用患者来源的EGFR突变肺腺癌异种移植模型，通过单细胞RNA测序分析了药物耐受持久细胞（DTP）和基质适应的转录组特征。	首次在患者来源的肺腺癌异种移植模型中进行单细胞RNA测序，揭示了DTP细胞的转录组特征和基质适应的变化。	研究仅限于特定的EGFR突变肺腺癌模型，结果的普遍性有待进一步验证。	探讨靶向治疗中断后肿瘤复发的原因，特别是药物耐受持久细胞（DTP）的作用。	药物耐受持久细胞（DTP）和癌症相关成纤维细胞（CAF）的转录组特征。	数字病理学	肺腺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组	使用EGFR抑制剂erlotinib治疗5至6周的肿瘤 bearing 小鼠模型
19260	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing combined with single-cell proteomics identifies the metabolic adaptation of islet cell subpopulations to high-fat diet in mice 2023-04, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-022-05849-5 PMID:36538064	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序结合单细胞蛋白质组学，识别了小鼠胰岛细胞亚群在高脂饮食下的代谢适应性	首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，深入解析了胰岛细胞亚群在高脂饮食诱导的葡萄糖不耐受中的代谢适应机制	NA	探索肥胖进展和糖尿病发病过程中胰岛细胞亚群的组成变化及其对高脂饮食诱导的胰岛代谢适应机制	小鼠胰岛细胞亚群	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	共分析了33,999个细胞