单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 19221 - 19240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19221 | 2024-12-15 |
Integrative multiomics analysis reveals association of gut microbiota and its metabolites with susceptibility to keloids
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1475984
PMID:39669776
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关联 | 首次通过整合粪便宏基因组、血浆代谢组和组织代谢组等多组学数据，揭示了肠道微生物及其代谢产物在瘢痕疙瘩形成中的作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定人群，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨肠道微生物及其代谢产物与瘢痕疙瘩易感性之间的关系 | 瘢痕疙瘩患者和正常瘢痕对照组的肠道微生物、血浆代谢物和组织代谢物 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 宏基因组分析、代谢组学、单细胞测序 | 随机森林模型 | 粪便宏基因组数据、血浆代谢组数据、组织代谢组数据 | 瘢痕疙瘩患者56例，正常瘢痕对照组60例，组织代谢组分析分别为35例和32例，靶向组织代谢组分析分别为41例和36例 | NA | NA | NA | NA |
| 19222 | 2024-12-15 |
Transitional cell states sculpt tissue topology during lung regeneration
2023-11-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.10.001
PMID:37922879
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研究论文 | 研究探讨了肺再生过程中过渡细胞状态在组织重塑和重组中的作用 | 发现了SFRP1和RUNX1标记的过渡状态在组织重塑和重组中的关键作用，并揭示了RUNX1是纤维母细胞状态的关键驱动因子 | NA | 揭示肺再生过程中过渡细胞状态的作用及其在组织重塑中的机制 | 肺组织中的过渡细胞状态及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 肺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个损伤模型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19223 | 2024-12-15 |
HIV-1 provirus transcription and translation in macrophages differs from pre-integrated cDNA complexes and requires E2F transcriptional programs
2022-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2022.2031583
PMID:35166645
|
研究论文 | 研究了HIV-1在巨噬细胞中的前整合cDNA复合物与整合后原病毒的转录和翻译差异，并探讨了E2F转录程序的作用 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）比较了未感染细胞、携带前整合复合物（PIC）的细胞和含有整合原病毒并产生晚期HIV蛋白的细胞的转录组，揭示了HIV-1整合过程中伴随的转录变化 | 研究主要集中在转录组水平，未深入探讨翻译和蛋白质水平的变化 | 探讨HIV-1在巨噬细胞中的转录和翻译机制及其与细胞微环境的关系 | HIV-1在巨噬细胞中的前整合cDNA复合物与整合后原病毒的转录和翻译 | 分子生物学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 19224 | 2024-12-15 |
scAllele: A versatile tool for the detection and analysis of variants in scRNA-seq
2022-Sep-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn6398
PMID:36054357
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAllele的工具，用于在单细胞RNA测序数据中检测和分析变异 | scAllele能够检测单核苷酸变异、插入、删除及其与剪接模式的等位基因连锁，并支持等位基因特异性剪接分析，这是其他方法不具备的独特功能 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中提取多层次信息并揭示新生物学见解的工具 | 单细胞RNA测序数据中的变异及其与剪接模式的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19225 | 2024-12-14 |
scSFCL:Deep clustering of scRNA-seq data with subspace feature confidence learning
2025-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出了一种基于子空间特征置信度学习的深度聚类方法scSFCL，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 通过子空间特征置信度学习结合图卷积网络和加权方法，筛选出判别性特征子集，并利用相互监督的聚类方法融合通用结构信息和特异性信息 | 未提及具体限制 | 提高单细胞RNA测序数据的深度聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19226 | 2024-12-14 |
Combined single-cell RNA sequencing and mendelian randomization to identify biomarkers associated with necrotic apoptosis in intervertebral disc degeneration
2025-Jan, The spine journal : official journal of the North American Spine Society
DOI:10.1016/j.spinee.2024.09.011
PMID:39332686
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别与椎间盘退变中坏死性凋亡相关的生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了NT5E和TMEM158作为坏死性凋亡相关生物标志物与椎间盘退变的因果关系 | 研究为回顾性队列研究，样本量和数据集的多样性可能限制了结果的普适性 | 识别与椎间盘退变中坏死性凋亡相关的生物标志物，揭示其病理机制，并为诊断和治疗提供新方向 | 椎间盘退变中的坏死性凋亡相关生物标志物 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化分析（MR） | NA | 单细胞RNA测序数据 | GSE205535数据集中包含16种不同的细胞群体，进一步注释为8种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 19227 | 2024-12-14 |
Fam3a-mediated prohormone convertase switch in α-cells regulates pancreatic GLP-1 production in an Nr4a2-Foxa2-dependent manner
2025-Jan, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.156042
PMID:39362520
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研究论文 | 研究探讨了Fam3a在α细胞中的作用及其通过Nr4a2-Foxa2依赖性机制调节胰高血糖素样肽-1（GLP-1）生成的机制 | 揭示了Fam3a在α细胞中通过Nr4a2-Foxa2依赖性途径调节胰高血糖素样肽-1（GLP-1）生成的新机制，并提出了一种重新编程α细胞胰高血糖素加工输出为GLP-1的新策略 | NA | 探讨Fam3a在α细胞功能中的作用及其调节机制 | Fam3a敲除小鼠、人胰岛单细胞RNA测序数据、αTC1.9细胞、Fam3aα-/-小鼠及其胰岛 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析、核转位实验、双荧光素酶报告基因实验 | NA | RNA | Fam3a敲除小鼠、Fam3aα-/-小鼠、αTC1.9细胞、人胰岛单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 19228 | 2024-12-14 |
LRRC45 accelerates bladder cancer development and ferroptosis inhibition via stabilizing NRF2 by competitively KEAP1 interaction
2025-Jan, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 研究揭示了LRRC45通过与KEAP1竞争性结合稳定NRF2，从而促进膀胱癌发展和抑制铁死亡的机制 | 首次揭示了LRRC45通过竞争性结合KEAP1来稳定NRF2，从而促进膀胱癌发展和抑制铁死亡 | 研究主要基于细胞实验，缺乏临床试验数据支持 | 探讨LRRC45在膀胱癌发展中的作用及其分子机制 | 膀胱癌细胞中的LRRC45及其与KEAP1和NRF2的相互作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 19229 | 2024-12-14 |
3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment
2024-Dec-13, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad998f
PMID:39668784
|
研究论文 | 本文设计并制造了一种新型3D打印PGCL@PLA/10CSPL复合支架，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 本文创新性地设计了一种具有良好生物相容性和电活性的PGCL@1PAP/10CSPL支架，并加载了从单细胞转录组数据中识别出的纤维连接蛋白1（FN1），以加速异常髓核退变 | NA | 研究目的是开发一种新型植入系统，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 研究对象是椎间盘退行性疾病及其治疗 | 生物医学工程 | 椎间盘退行性疾病 | 3D打印技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19230 | 2024-12-14 |
Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration
2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants
DOI:10.11607/jomi.10852
PMID:38498783
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研究论文 | 研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制 | 首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用，并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制 | Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用 | NA | NA | Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠牙种植体模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 19231 | 2024-12-14 |
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065
PMID:39668036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19232 | 2024-12-14 |
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005
PMID:39147277
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研究论文 | 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，尽管存在不同的免疫环境，但发现了保守的B细胞动态 | 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并发现尽管存在不同的免疫环境，B细胞动态在肠道位置间是保守的 | 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches，未涉及其他物种或其他肠道区域 | 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并研究其在不同肠道位置的保守性 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19233 | 2024-12-14 |
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01034-y
PMID:39375485
|
研究论文 | 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass，用于解析普遍的基因调控机制 | GeneCompass通过整合四种先验生物学知识，在自监督学习中增强了基因调控机制的理解，并在多个下游任务中超越了现有模型 | NA | 解析跨物种的普遍基因调控机制，推动基础生命过程研究和临床应用 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 转录组数据 | 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 19234 | 2024-12-14 |
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13607
PMID:39381961
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研究论文 | 本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用 | 首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用，以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响 | 研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系，可能无法完全代表所有骨骼肌的情况 | 探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制 | 卫星细胞（SCs）及其在骨骼肌生长和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、免疫染色、EdU掺入实验 | NA | RNA | 新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液（KO和对照组）、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19235 | 2024-12-14 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-Dec, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
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研究论文 | 研究了成年雌性和雄性小鼠中甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta的mRNA表达谱 | 首次详细分析了甘氨酸受体亚基在不同脑区和脊髓中的表达模式，并比较了雌雄小鼠在特定脑区的表达差异 | Glra4的表达水平过低，无法通过qRT-PCR检测到 | 探讨甘氨酸受体亚基在中枢神经系统中的表达模式及其在雌雄小鼠中的差异 | 甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序、定量实时PCR (qRT-PCR)、RNAscope | NA | mRNA表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 19236 | 2024-12-14 |
Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70113
PMID:39658531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境，并识别了潜在的分子治疗靶点 | 样本量较小，仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析 | 揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境，为开发新型疗法提供分子靶点 | 原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19237 | 2024-12-14 |
Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation
2024-Dec, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.240718
PMID:39665095
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研究论文 | 本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）的数据，探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用 | 引入了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法，并通过混合遗传算法（HGA）进行参数估计 | NA | 研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用 | 乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子（VEGF）以及免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 混合遗传算法（HGA） | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT） | NA | NA | NA | NA |
| 19238 | 2024-12-14 |
Single-cell transcriptomics: a new frontier in plant biotechnology research
2024-Nov-25, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03383-9
PMID:39585480
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综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在植物生物技术研究中的最新进展及其对植物发育理解的深远影响 | 单细胞转录组技术提供了前所未有的细胞分辨率，揭示了复杂的细胞过程和发育途径 | 单细胞转录组技术在植物研究中面临样本准备、细胞分离、数据复杂性和计算分析等挑战 | 探讨单细胞转录组技术在植物生物技术中的应用及其未来发展前景 | 植物细胞的基因表达、发育过程和环境响应 | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19239 | 2024-12-14 |
Expression of Anoikis-Related Genes and Potential Biomarkers in Colon Cancer Based on RNA-seq and scRNA-seq
2024-Nov, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-04957-9
PMID:38727936
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研究论文 | 本研究整合了结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据，评估了患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型 | 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估了结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型 | 研究仅基于现有数据集，未进行体外或体内实验验证 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建结肠癌风险模型 | 结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 结肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 19240 | 2024-12-14 |
Aging- and alcohol-associated spatial transcriptomic signature in mouse acute pancreatitis reveals heterogeneity of inflammation and potential pathogenic factors
2024-08, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-024-02460-6
PMID:38940937
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研究论文 | 本研究通过建立衰老酒精性急性胰腺炎小鼠模型，应用Visium空间转录组学技术，揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎空间转录组特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的炎症异质性，并识别出潜在的致病因素 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 阐明衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的空间转录组特征及其潜在机制 | 衰老和年轻小鼠的急性胰腺炎模型 | NA | 胰腺炎 | Visium空间转录组学 | NA | 转录组 | 衰老小鼠（18个月）和年轻小鼠（3个月）各一组 | NA | NA | NA | NA |