单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 19221 - 19240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
19221 2024-08-04
Characterization of macrophages in ischemia-reperfusion injury-induced acute kidney injury based on single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq analysis
2024-Mar-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和总体RNA测序分析来表征缺血再灌注损伤引起的急性肾损伤中的巨噬细胞 识别了在缺血再灌注肾损伤中参与的巨噬细胞亚型及相关的中心基因,提出了四个新的生物标志物和潜在的治疗靶点 本研究的局限性在于对巨噬细胞功能机制的理解仍不清晰,针对巨噬细胞的策略在急性肾损伤中的效果存在争议 探讨缺血再灌注损伤中巨噬细胞的作用及其相关基因 本研究的研究对象为参与缺血再灌注引起的急性肾损伤的巨噬细胞亚型及其相关基因 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA-seq和总体RNA-seq NA 基因表达数据 包含正常样本和缺血再灌注后3天的样本 NA NA NA NA
19222 2024-08-07
Prognostic implication of UBE2C + CD8 + T cell in neoadjuvant immune checkpoint blockade plus chemotherapy for locally advanced esophageal cancer
2024-Mar-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究旨在探讨免疫检查点抑制剂(ICBs)联合化疗作为新辅助治疗在局部晚期食管癌患者中的早期和中期疗效,并发现与主要病理反应(MPR)相关的免疫预测因子。 本研究首次揭示了UBE2C+CD8+T细胞作为局部晚期食管癌患者接受新辅助ICBs联合化疗后的不良预后因子。 研究为回顾性分析,样本量相对较小,且仅限于特定时间段内的患者。 研究新辅助ICBs联合化疗在局部晚期食管癌中的疗效及免疫预测因子。 局部晚期食管癌患者。 免疫学 食管癌 Bulk-RNA seq, scRNA seq, 多重免疫荧光 NA RNA序列数据, 免疫荧光图像 76名患者 NA NA NA NA
19223 2024-08-04
eSVD-DE: cohort-wide differential expression in single-cell RNA-seq data using exponential-family embeddings
2024-Mar-15, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了eSVD-DE,一种针对单细胞RNA测序数据的大规模人群差异表达检测的新方法 提出了一种新的矩阵分解方法,能够在去除混杂变量影响的同时进行差异基因测试 在较大的数据集中,可能仍然存在一些人类变异的影响 旨在更准确地识别单细胞RNA测序数据中群体级的差异表达基因 对大量案例和对照个体的单细胞RNA测序数据进行分析 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 层次模型 基因表达数据 使用了多个生物系统的已发布数据集 NA NA NA NA
19224 2024-08-07
Profiling Cell Heterogeneity and Fructose Transporter Expression in the Rat Nephron by Integrating Single-Cell and Microdissected Tubule Segment Transcriptomes
2024-Mar-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序和微切割管状段转录组数据,研究了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达 首次揭示了大鼠近端小管各亚段中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式,并发现S3段是果糖重吸收的主要部位 研究仅基于公开数据库的数据,未进行实验验证 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式 大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了公开数据库中的大鼠肾脏转录组和蛋白质组数据 NA NA NA NA
19225 2024-08-04
eSVD-DE: Cohort-wide differential expression in single-cell RNA-seq data using exponential-family embeddings
2024-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种新方法eSVD-DE,用于在单细胞RNA-seq数据中分析 cohort-wide 差异表达基因 eSVD-DE通过矩阵分解汇集基因信息,并引入层次模型以准确测试病例和对照个体的后验均值分布差异 本研究在处理人类变异带来的混杂协变量时可能仍然面临一些挑战 旨在开发一套新方法,分析大规模聚类中单细胞RNA-seq数据的差异表达基因 研究对象为大量病例和对照个体的单细胞RNA-seq数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 层次模型 基因表达数据 多个生物系统的已发布数据集 NA NA NA NA
19226 2024-08-04
Adipose tissue macrophage heterogeneity in the single-cell genomics era
2024-Feb, Molecules and cells IF:3.7Q2
研究论文 文章讨论了在单细胞基因组学时代脂肪组织巨噬细胞的异质性 提出了单细胞转录组技术能够揭示脂肪组织巨噬细胞的高度异质性 需要进一步研究以更好地理解ATMs和肥胖对其影响的复杂性 探讨肥胖及其引发的炎症如何影响脂肪组织巨噬细胞 主要研究脂肪组织巨噬细胞(ATMs)的异质性及其特征 数字病理 2型糖尿病 单细胞转录组技术 NA 基因组数据 NA NA NA NA NA
19227 2024-08-04
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2024-Jan-11, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究开发了一种基于LOOPSeq技术的合成长读取单细胞测序技术,以分析人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 本研究的创新点在于应用LOOPSeq技术实现精确的长读取单细胞转录组测序,并识别出特定于肝癌细胞的突变mRNA亚型 本研究的局限性未具体提到,故为NA 本研究旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白表达谱的复杂性 本研究对象为来自个体的447个肝细胞癌和良性肝脏转录组 数字病理学 肝癌 长读取测序 NA 转录组 447个转录组样本 NA NA NA NA
19228 2024-08-07
Stiffness-dependent MSC homing and differentiation into CAFs - implications for breast cancer invasion
2024-01-01, Journal of cell science IF:3.3Q3
研究论文 研究探讨了肿瘤微环境中癌细胞与间充质干细胞(MSCs)在不同硬度基质下的相互作用如何影响三阴性乳腺癌(TNBC)的侵袭性 首次展示了在预转移阶段,MSCs向癌症相关成纤维细胞(CAFs)的分化如何促进TNBC的侵袭和转移 NA 研究肿瘤微环境中细胞异质性和细胞外基质(ECM)硬化对乳腺癌侵袭性的影响 三阴性乳腺癌(TNBC)中的间充质干细胞(MSCs)和癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列 涉及高侵袭性三阴性乳腺癌(TNBC)的原发肿瘤、次级部位和循环肿瘤细胞簇中的亚群细胞 NA NA NA NA
19229 2024-08-07
Profiling cellular heterogeneity and fructose transporter expression in the rat nephron by integrating single-cell and microdissected tubule segment transcriptomes
2023-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和微切割的肾小管片段转录组数据,分析了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达。 首次揭示了肾小管近端不同亚段细胞中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式,并发现S3段是果糖重吸收的主要部位。 研究主要基于公开数据库的数据,未进行实验验证。 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式。 大鼠肾单位中的细胞和果糖转运蛋白。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了公开数据库中的大鼠和人类肾脏转录组和蛋白质组数据。 NA NA NA NA
19230 2024-08-05
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种基于 LOOPseq 技术的合成长读单细胞测序技术,分析了人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 提出了 LOOPseq 单细胞测序技术,识别出特异性强的肝细胞癌突变 mRNA 亚型及新融合转录本 没有提到具体的限制 旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白质表达的复杂性与多样性 分析了来自个体的 447 份肝细胞癌与良性肝组织的转录组 数字病理学 肝癌 长读单细胞测序 NA 转录组 447 份转录组样本 NA NA NA NA
19231 2024-08-05
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Aug-17, Research square
研究论文 本文探讨了细胞间通信如何影响视网膜神经节细胞的存活 首次揭示了μ阿片受体(Oprm1)作为视网膜神经节细胞的神经保护因子的作用 未提及具体的临床应用或人类数据 研究细胞间信号在视网膜神经节细胞存活中的贡献 视网膜神经节细胞及其与其他视网膜细胞的相互作用 数字病理 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
19232 2024-08-05
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了细胞间通信如何促进视网膜神经节细胞的生存 发现Oprm1作为一种神经保护因子并通过细胞间相互作用促进高生存率视网膜神经节细胞的存活 研究的局限性在于可能未能完全揭示所有相关的细胞间相互作用 研究细胞间通信在神经元存活中的作用 研究对象为视网膜神经节细胞和其他视网膜细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了多种视网膜细胞亚群体的样本,通过细胞间交互分析来归纳 NA NA NA NA
19233 2024-08-05
Immunologic barriers in liver transplantation: a single-cell analysis of the role of mesenchymal stem cells
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究分析了可能指示肝移植排斥或耐受的生物标志物及其机制 首次探讨了免疫抑制剂与间充质干细胞联合治疗对肝移植耐受性的影响 研究仅在特定的动物模型中进行,可能无法完全外推至临床 研究肝移植耐受的生物标志物和相关机制 Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠模型 数字病理 NA 单细胞测序 NA 细胞 Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠 NA NA NA NA
19234 2024-08-07
Comprehensive analyses for the coagulation and macrophage-related genes to reveal their joint roles in the prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过综合分析凝血和巨噬细胞相关基因,揭示它们在肺腺癌患者预后和免疫治疗中的联合作用 构建了一个风险评分模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗临床结果 NA 探索与凝血过程和肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的肺腺癌新型生物标志物 肺腺癌患者的凝血和巨噬细胞相关基因 数字病理学 肺腺癌 加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞RNA测序(scRNA-seq) 风险评分模型 RNA-seq数据 涉及33个凝血和巨噬细胞相关基因,其中19个用于构建风险评分模型,最终包含10个与生存相关的基因 NA NA NA NA
19235 2024-08-07
Distinct regulatory machineries underlying divergent chromatin landscapes distinguish innate lymphoid cells from T helper cells
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过综合分析294个批量RNA测序结果,利用scRNA-seq算法,探讨了先天淋巴细胞(ILCs)与T辅助细胞(Th细胞)在染色质景观和转录调控机制上的差异 发现了区分ILCs和Th细胞的两个基因集,以及区分不同免疫反应的三个基因集;通过染色质可及性分析,揭示了ILCs和Th细胞在转录调控上的差异 NA 探讨先天淋巴细胞与T辅助细胞在转录调控和染色质景观上的主要区别 先天淋巴细胞(ILCs)和T辅助细胞(Th细胞) 免疫学 NA RNA测序(RNA-seq) scRNA-seq算法 RNA序列 294个批量RNA测序结果 NA NA NA NA
19236 2024-08-07
The mosquito effect: regulatory and effector T cells acquire cytoplasmic material from tumor cells through intercellular transfer
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文介绍了一种新的肿瘤小鼠模型,其中肿瘤细胞表达可溶性超亮荧光蛋白ZsGreen,用于检测和测量肿瘤细胞向浸润免疫细胞的细胞质转移 首次提出并命名了肿瘤浸润T细胞的“蚊子效应”,即T细胞通过细胞间转移从肿瘤细胞获取细胞质材料的现象 由于缺乏强有力的模型,免疫系统中这种转移的功能影响和分子机制仍大多未知 研究肿瘤细胞与免疫细胞间的细胞质转移现象及其对T细胞功能的影响 肿瘤细胞、T调节细胞、效应CD8 T细胞及髓系细胞 免疫学 肿瘤 scRNA-seq NA 荧光蛋白ZsGreen 小鼠模型 NA NA NA NA
19237 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing demonstrates the molecular and cellular reprogramming of metastatic lung adenocarcinoma
2020-05-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术分析了转移性肺腺癌的分子和细胞重编程特征 首次对转移性肺腺癌进行了大规模的单细胞转录组分析,揭示了癌症细胞亚型及其在转移阶段的主导作用,以及肿瘤微环境中基质和免疫细胞的动态变化 NA 深入理解转移性肺腺癌的分子和细胞动态变化,并发现潜在的诊断和治疗靶点 转移性肺腺癌及其微环境中的细胞和分子特征 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 44名患者的208,506个细胞 NA NA NA NA
19238 2024-08-07
The pelvic organs receive no parasympathetic innervation
2024-Mar-15, eLife IF:6.4Q1
research paper 本研究使用单细胞RNA测序技术,发现小鼠盆腔神经节由四种不同于交感和副交感神经元的神经元组成,这些神经元与交感神经元有亲缘关系,但不与副交感神经元相关。研究还表明,脊髓腰段节前神经元在盆腔神经节中与去甲肾上腺素能和胆碱能细胞形成突触,这两种细胞均作为交感神经的传递介质。因此,盆腔器官不接受来自副交感或典型交感神经元的神经支配,而是接受来自交感神经链末端分支的神经支配,负责其特有的功能。 本研究首次揭示了盆腔神经节中的神经元类型及其与交感和副交感神经元的关系,并证明了盆腔器官不接受副交感神经的神经支配。 NA 探讨盆腔器官的自主神经支配机制 小鼠盆腔神经节中的神经元类型及其功能 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 NA NA NA NA NA
19239 2024-08-04
Development of a novel lncRNA-derived immune gene score using machine learning-based ensembles for predicting the survival of HCC
2024-Feb-09, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本文开发了一种新型的lncRNA衍生免疫基因评分模型,用于预测肝细胞癌(HCC)患者的生存率 提出了一种基于机器学习的集成方法来建立lncRNA和免疫基因评分模型 研究中使用的单细胞测序数据可能无法完全代表患者体内的真实免疫环境 开发一个准确的预测模型以评估肝细胞癌患者的生存期 肝细胞癌患者的mRNA和lncRNA表达谱 机器学习 肝癌 单细胞测序 NA mRNA和lncRNA表达数据 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集进行模型验证 NA NA NA NA
19240 2024-08-04
Identification and validation of Golgi apparatus-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2024-Feb-01, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究旨在探讨高尔基体相关基因在乳腺癌预后和免疫治疗反应评估中的预测价值 识别并验证了一种由394个高尔基体相关基因组成的预后风险特征,可以有效区分乳腺癌患者的高风险和低风险组 未提及具体的研究局限性 研究乳腺癌中高尔基体相关基因的预测价值 乳腺癌患者的数据和样本 数字病理学 乳腺癌 qPCR和单细胞测序 Cox回归分析 转录组数据和临床数据 涉及394个与乳腺癌预后显著相关的高尔基体相关基因 NA NA NA NA
回到顶部