单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 19221 - 19240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19221 | 2024-08-08 |
SOX4 is a novel phenotypic regulator of endothelial cells in atherosclerosis revealed by single-cell analysis
2023-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2022.02.017
PMID:36585108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了动脉粥样硬化中的内皮细胞转录组，揭示了SOX4作为内皮细胞功能障碍的新型表型调节因子 | 发现SOX4是内皮细胞在动脉粥样硬化中的新型表型调节因子，并揭示了高血脂相关细胞因子和振荡血流作为SOX4的内源性诱导因素 | NA | 探究动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组特征，识别内皮细胞功能障碍的新型调节因子，并提供动脉粥样硬化进展的机制性见解 | 动脉粥样硬化中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用西方饮食喂养的载脂蛋白E缺陷（ApoE-/-）小鼠的主动脉细胞，以及人冠状动脉和肾动脉的动脉粥样硬化组织 |
| 19222 | 2024-08-08 |
Multiplex immunofluorescence and single-cell transcriptomic profiling reveal the spatial cell interaction networks in the non-small cell lung cancer microenvironment
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1155
PMID:36588094
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研究论文 | 本文通过多重免疫荧光技术和单细胞转录组测序，揭示了非小细胞肺癌微环境中细胞间的空间相互作用网络 | 首次利用多重免疫荧光技术同时检测多个标记物，并结合单细胞RNA测序技术，分析了肿瘤微环境中细胞的空间位置和相互作用 | 研究样本仅限于553例非小细胞肺癌病例，可能无法完全代表所有非小细胞肺癌患者的情况 | 研究非小细胞肺癌微环境中细胞的空间相互作用网络 | 非小细胞肺癌肿瘤切片中的细胞标记物和细胞间的空间关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫荧光技术，单细胞RNA测序 | StarDist深度学习模型 | 图像，转录组数据 | 553例非小细胞肺癌肿瘤切片，4例非小细胞肺癌单细胞RNA测序样本 |
| 19223 | 2024-08-08 |
Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols
2022-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09014-5
PMID:36581800
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研究论文 | 本文评估了四种基于板的全长转录单细胞mRNA测序协议的性能 | 首次对四种不同板基单细胞RNA测序协议进行性能评估，特别是针对高基因检测灵敏度、样本间重复性和最小操作时间 | 仅评估了四种特定的板基单细胞RNA测序协议，未涉及其他类型的测序技术 | 评估不同单细胞mRNA测序协议在临床应用中的性能 | 四种基于板的单细胞RNA测序协议 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 19224 | 2024-08-08 |
Lack of evidence for increased transcriptional noise in aged tissues
2022-12-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80380
PMID:36576247
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研究论文 | 本文通过开发新的计算工具和分析方法，研究了衰老组织中转录噪音的变化，并发现转录噪音的增加并非衰老的普遍特征 | 开发了新的计算工具和方法来量化衰老相关的转录噪音，并分析了细胞类型特异性的转录噪音变化 | 研究仅限于分析已有的单细胞RNA测序数据集，可能未能涵盖所有类型的组织和细胞 | 探究衰老组织中转录噪音的变化是否为衰老的基本特征 | 衰老组织中的转录噪音变化及细胞类型特异性的转录噪音变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 七个衰老数据集 |
| 19225 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing revealed the liver heterogeneity between egg-laying duck and ceased-laying duck
2022-Dec-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09089-0
PMID:36577943
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了产蛋期和停蛋期鸭肝脏细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了产蛋期和停蛋期鸭肝脏细胞的异质性，并发现了与产蛋和停蛋相关的特定基因表达模式 | NA | 探究产蛋期和停蛋期鸭肝脏的分子机制 | 产蛋期和停蛋期鸭的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20,000个单细胞 |
| 19226 | 2024-08-08 |
Dissecting the fate of Foxl2-expressing cells in fetal ovary using lineage tracing and single-cell transcriptomics
2022-Dec-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00492-1
PMID:36575161
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学分析了胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞的命运 | 首次揭示了Foxl2表达细胞在XX性腺中具有多能性，并且theca-interstitial细胞来源于不同的前体细胞 | NA | 研究胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞在性分化后的命运 | 胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19227 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies murine heart molecular features at embryonic and neonatal stages
2022-12-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35691-7
PMID:36575170
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research paper | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了小鼠心脏在胚胎早期到新生儿晚期的转录特征 | 首次全面捕捉了小鼠心脏发育过程中各阶段的转录组变化，填补了以往研究的空白 | NA | 研究小鼠心脏在胚胎和新生儿阶段的分子特征 | 小鼠心脏的转录组特征 | digital pathology | NA | single-cell sequencing | NA | transcriptomic data | 涉及小鼠心脏从早期胚胎到晚期新生儿的多个阶段 |
| 19228 | 2024-08-08 |
Non-negative low-rank representation based on dictionary learning for single-cell RNA-sequencing data analysis
2022-Dec-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09027-0
PMID:36564711
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研究论文 | 本文提出了一种基于字典学习的非负低秩表示方法（DLNLRR），用于单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别 | DLNLRR方法能够在优化过程中更新字典，实现字典学习和低秩表示学习的同时进行，并且不依赖于谱聚类算法，可以直接基于低秩矩阵进行聚类 | NA | 有效且准确地从大量细胞混合物中识别细胞集群 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示 | 数据矩阵 | 大量真实单细胞数据集 |
| 19229 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and key signaling pathways associated with vascular remodeling and calcification in young and old primate aortas based on single-cell analysis
2022-12-23, Aging
DOI:10.18632/aging.204442
PMID:36566020
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析年轻和老年猴主动脉中血管内皮细胞和平滑肌细胞的异质性，并识别与血管重塑和钙化相关的关键信号通路 | 识别了与血管重塑和钙化相关的新型内皮细胞亚群，并分析了随年龄变化的细胞通讯及相关的信号通路 | NA | 旨在理解血管壁细胞异质性及细胞亚群间通讯变化在衰老过程中的作用，以预防与年龄相关的心血管疾病 | 年轻和老年猴的主动脉 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 年轻和老年猴的主动脉样本 |
| 19230 | 2024-08-08 |
Distance covariance entropy reveals primed states and bifurcation dynamics in single-cell RNA-Seq data
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105709
PMID:36578319
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DICE的计算方法，用于分析单细胞RNA-Seq数据中的表达协变熵模式，以揭示细胞命运转变中的启动状态和分支动态 | DICE方法能够仅使用单细胞RNA-Seq数据预测多能启动状态及其调控因子，并在后续验证中使用单细胞表观基因组数据 | NA | 研究细胞命运转变过程，特别是启动状态和分支动态 | 单细胞RNA-Seq数据中的细胞命运转变 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-Seq数据 | NA |
| 19231 | 2024-08-08 |
Downregulation of the Protein C Signaling System Is Associated with COVID-19 Hypercoagulability-A Single-Cell Transcriptomics Analysis
2022-12-09, Viruses
DOI:10.3390/v14122753
PMID:36560757
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了COVID-19患者肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮中蛋白C信号系统的表达变化，发现蛋白C及其下游信号级联成分在COVID-19患者中下调，可能与COVID-19的高凝状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析了COVID-19患者中蛋白C信号系统的表达变化，揭示了蛋白C在COVID-19高凝状态中的潜在机制作用。 | 研究样本仅来自COVID-19 Cell Atlas数据库，可能存在样本选择偏倚；未详细说明数据分析的具体方法和统计学意义。 | 探索COVID-19相关凝血病中蛋白C信号网络的潜在表达变化。 | COVID-19患者的肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 19232 | 2024-08-08 |
Isolation of Nuclei from Flash-frozen Liver Tissue for Single-cell Multiomics
2022-12-09, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64792
PMID:36571404
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研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻保存的肝脏组织中分离细胞核的稳健且可重复的协议 | 该方法能够产生高质量的细胞核，适用于下游单细胞组学方法，如单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq）以及多模态组学（联合RNA-seq和ATAC-seq） | NA | 研究肝脏在健康和疾病状态下的单细胞分辨率特征 | 从健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物冷冻肝脏样本中分离的细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq） | NA | 细胞核 | 涉及健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物的冷冻肝脏样本 |
| 19233 | 2024-08-08 |
Improved Macrophage Enrichment from Mouse Skeletal Muscle
2022-Dec-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4561
PMID:36561115
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研究论文 | 本文详细描述了一种从年轻和老年小鼠骨骼肌中分离CD45/CD11b巨噬细胞富集细胞的优化方法 | 提出了一种新的方法来高效分离骨骼肌中的巨噬细胞，具有足够的纯度和产量，适用于各种下游分析 | NA | 研究骨骼肌中巨噬细胞的功能及其在骨骼肌老化中的作用 | 小鼠骨骼肌中的巨噬细胞 | NA | NA | 流式细胞术分析，荧光激活细胞分选(FACS)，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的骨骼肌巨噬细胞 |
| 19234 | 2024-08-08 |
Multicenter dose-escalation Phase I trial of mitomycin C pressurized intraperitoneal aerosolized chemotherapy in combination with systemic chemotherapy for appendiceal and colorectal peritoneal metastases: rationale and design
2022-Dec, Pleura and peritoneum
IF:1.4Q3
DOI:10.1515/pp-2022-0116
PMID:36560966
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research paper | 本研究旨在进行一项多中心剂量递增的I期试验，评估米托蒽醌加压腹腔内气雾化疗（MMC-PIPAC）与系统化疗（FOLFIRI）联合治疗阑尾癌或结直肠癌腹膜转移的效果 | MMC-PIPAC是一种治疗腹膜转移的微创方法，本研究将探索其与系统化疗联合使用的推荐剂量和安全性 | NA | 确定MMC-PIPAC与FOLFIRI联合使用的推荐剂量，并评估其早期疗效信号 | 阑尾癌或结直肠癌腹膜转移患者 | NA | colorectal cancer | PIPAC | NA | blood and tissue specimens | 21名可评估患者 |
| 19235 | 2024-08-08 |
Characteristic analysis of skin keratinocytes in patients with type 2 diabetes based on the single-cell levels
2022-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002323
PMID:36583863
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研究论文 | 本研究旨在探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞在单细胞水平的转录特征，为揭示病理条件下角质形成细胞的病理机制提供实验数据 | 本研究首次在单细胞水平上分析了2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征，并筛选出一系列差异表达基因 | 研究样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者，可能影响结果的普遍性和可靠性 | 探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征 | 2型糖尿病患者的皮肤角质形成细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者的皮肤组织样本 |
| 19236 | 2024-08-08 |
Resolving the gene expression maps of human first-trimester chorionic villi with spatial transcriptome
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1060298
PMID:36561369
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研究论文 | 本研究使用改进的Stereo-seq方法，对两名孕妇早期绒毛膜绒毛的空间转录组进行了分析，揭示了绒毛膜绒毛中主要细胞类型的基因表达模式及其空间定位。 | 本研究首次使用PFA固定的人类绒毛膜绒毛样本进行空间转录组分析，显著改善了组织形态和RNA信号的特异性。 | 研究样本仅来自两名孕妇，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在通过空间转录组技术解析人类早期绒毛膜绒毛的基因表达图谱，以深入理解胎盘的结构和功能。 | 人类早期绒毛膜绒毛的基因表达及其空间分布。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | 两名孕妇的绒毛膜绒毛样本 |
| 19237 | 2024-08-08 |
Inflammatory role of microglia in brain injury caused by subarachnoid hemorrhage
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.956185
PMID:36561497
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的炎症作用及其最新进展 | 探讨了微胶质细胞通过TLR4、CaSR和TREM-1等受体介导的信号通路在脑水肿、神经元凋亡和血脑屏障破坏中的双重作用 | NA | 探讨微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的病理机制 | 微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的作用 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19238 | 2024-08-08 |
Case report: Clinical and single-cell transcriptome sequencing analysis of a mixed gangliocytoma-adenoma presenting as acromegaly
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1088803
PMID:36568175
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病例报告 | 本文报告了一例混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA）表现为肢端肥大症的28岁男性患者的临床和单细胞转录组测序分析 | 本病例报告详细描述了MGA手术和放疗后的唯一临床和分子报告，并通过单细胞转录组测序分析揭示了肿瘤内异质性 | NA | 增强对MGA诊断和治疗的理解，并通过单细胞转录组测序分析提供对后续基础研究的支持 | 混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA） | NA | 神经节细胞瘤-腺瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 临床数据、病理学数据、超微结构数据、单细胞转录组数据 | 一例28岁男性患者 |
| 19239 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell RNA sequencing and prognostic model revealed the carcinogenicity and clinical significance of FAM83D in ovarian cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1055648
PMID:36568230
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和预后模型，探讨了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义 | 首次通过单细胞RNA测序和预后模型整合分析，揭示了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义，并发现了miR-138-5p对FAM83D致癌作用的调控 | NA | 探讨FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义 | FAM83D在卵巢癌中的作用及其与miR-138-5p的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso-Cox回归分析 | 细胞 | 正常卵巢和高级别浆液性卵巢癌组织中的细胞 |
| 19240 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses reveal a prognostic signature of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1028469
PMID:36568368
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的预后标志 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了基于4个基因的预后标志 | 研究样本来源于公共数据库，可能存在一定的数据偏差；预后标志的临床应用需要进一步的临床试验验证 | 识别头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨其在分子特征、免疫特征及免疫治疗和化疗中的潜在作用 | 头颈鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 样本来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库，具体数量未详细说明 |