单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 19201 - 19220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19201 | 2024-08-08 |
Transcriptional and mutational signatures of the Drosophila ageing germline
2023-03, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-022-01958-x
PMID:36635344
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研究论文 | 研究探讨了果蝇衰老生殖细胞的转录和突变特征 | 发现老年果蝇的早期生殖细胞与年轻果蝇在进入精子发生时具有相似的突变负荷，但老年果蝇在精子发生过程中清除突变的能力较弱，且突变可能在精子发生过程中增加 | NA | 探索衰老生殖细胞的转录和突变特征 | 年轻和老年雄性果蝇的睾丸 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序，基因组测序（DNA测序） | NA | 基因表达数据，突变数据 | 年轻和老年雄性果蝇的睾丸及体细胞 |
| 19202 | 2024-08-05 |
Hyperprogression of cutaneous T cell lymphoma after anti-PD-1 treatment
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164793
PMID:36649072
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研究论文 | 本研究探讨了在抗PD-1治疗后皮肤T细胞淋巴瘤患者的超进展现象 | 本研究提供了PD-1作为肿瘤抑制因子在恶性T细胞中的作用的新证据 | 样本仅来自单个患者，缺乏大规模临床验证 | 揭示抗PD-1治疗导致T细胞恶性肿瘤超进展的机制 | 来自一名晚期皮肤T细胞淋巴瘤患者的原发恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、全基因组测序、全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 1名患者的恶性T细胞 |
| 19203 | 2024-08-08 |
Skin programming of inflammatory responses to Staphylococcus aureus is compartmentalized according to epidermal keratinocyte differentiation status
2023-02-22, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljac088
PMID:36637891
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研究论文 | 本文探讨了表皮角质形成细胞分化状态对金黄色葡萄球菌炎症反应的皮肤编程的影响 | 首次详细研究了角质形成细胞分化状态与皮肤微生物群之间的相互作用，并探讨了这些相互作用如何影响抗菌反应 | 研究主要集中在体外模型上，可能与体内实际情况存在差异 | 验证皮肤微生物群是否参与调节角质形成细胞分化并影响抗菌反应 | 表皮模型在共生菌（表皮葡萄球菌）和病原菌（金黄色葡萄球菌）挑战下的反应 | NA | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6391个角质形成细胞，来自对照组（2044个细胞）、表皮葡萄球菌挑战组（2028个细胞）和金黄色葡萄球菌挑战组（2319个细胞） |
| 19204 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis identifies Versican(+) myofibroblast as a hallmark for thoracic aortic aneurysm marked by activation of PI3K-AKT signaling pathway
2023-02-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.12.086
PMID:36621113
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出Versican阳性肌成纤维细胞作为胸主动脉瘤的标志，并发现PI3K-AKT信号通路的激活与此相关 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出Versican阳性肌成纤维细胞作为胸主动脉瘤的典型细胞标志，并揭示了PI3K-AKT信号通路的激活在其中的作用 | 研究样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究胸主动脉瘤的分子机制，并寻找新的预防和治疗方法 | 胸主动脉瘤的细胞类型及其分子机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共使用了3个对照组和8个胸主动脉瘤样本，涉及48,128个胸主动脉细胞 |
| 19205 | 2024-08-05 |
Robust single-cell matching and multimodal analysis using shared and distinct features
2023-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01709-7
PMID:36624212
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MARIO的细胞匹配算法，用于多模态数据分析 | 该算法同时考虑了共享特征和独特特征，能够避免亚优匹配 | 该研究中没有具体提及算法在其他细胞类型匹配上的表现 | 旨在提高单细胞数据在多种实验来源下的对齐能力 | 主要研究对象为单细胞蛋白质组和多模态方法的数据 | 数字病理 | COVID-19 | 单细胞蛋白质组学 | NA | 多模态数据，包括空间技术 | 通过对COVID-19肺部尸检的组织巨噬细胞和支气管肺泡灌洗液中恢复的巨噬细胞进行匹配 |
| 19206 | 2024-08-05 |
SP1 impacts the primordial to primary follicle transition by regulating cholesterol metabolism in granulosa cells
2023-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201274RR
PMID:36624701
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子SP1在卵巢原始到初级卵泡转变中的作用 | 该研究首次揭示了SP1通过调控胆固醇代谢在卵细胞中的重要性 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表其他物种的生物学机制 | 探索SP1在调控卵巢原始到初级卵泡转变中的作用 | 主要研究卵巢中颗粒细胞的胆固醇代谢和原始卵泡转变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 研究使用了小鼠样本 |
| 19207 | 2024-08-05 |
Nupr1 Negatively Regulates Endothelial to Hematopoietic Transition in the Aorta-Gonad-Mesonephros Region
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202203813
PMID:36638254
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研究论文 | 本研究揭示了Nupr1作为内皮到造血转变过程的负调节因子 | 首次识别出Nupr1为EHT过程的负调节因子 | 研究中未探讨Nupr1在其他组织或不同发育阶段的作用 | 探讨Nupr1在内皮到造血转变中的作用 | 小鼠胚胎中的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 涉及中期妊娠小鼠胚胎的内皮细胞 |
| 19208 | 2024-08-08 |
The clinical application of 68Ga-PSMA PET/CT and regulating mechanism of PSMA expression in patients with brain metastases of lung cancer
2023-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2023.101616
PMID:36621073
|
研究论文 | 本研究探讨了68Ga-PSMA PET/CT在肺癌脑转移患者中的临床应用及其PSMA表达调控机制 | 首次报道了68Ga-PSMA PET/CT在肺癌脑转移患者中的应用及PSMA表达的调控机制 | 研究样本量较小，仅涉及七名患者 | 评估68Ga-PSMA PET/CT在肺癌脑转移中的应用及探索PSMA表达的调控机制 | 肺癌脑转移患者及其PSMA表达 | 数字病理学 | 肺癌 | 68Ga-PSMA PET/CT, 免疫组织化学染色, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 七名接受手术治疗的肺癌脑转移患者 |
| 19209 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome
2023-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201848
PMID:36622347
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19210 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identifies a population of human liver-type ILC1s
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111937
PMID:36640314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，鉴定出一种具有独特转录、表型和功能特征的人类肝脏型I型固有淋巴细胞（ILC1s）。 | 本研究首次发现并描述了肝脏型ILC1s，其特征与传统的和肝脏驻留的NK细胞以及其他已知的人类ILC1亚群不同。 | NA | 鉴定和分类一种新型的人类跨组织ILC1s。 | 肝脏型I型固有淋巴细胞（ILC1s）及其在不同组织中的分布和功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肝脏、扁桃体和肠道组织中的细胞样本 |
| 19211 | 2024-08-08 |
Cardiac progenitors instruct second heart field fate through Wnts
2023-01-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2217687120
PMID:36649430
|
研究论文 | 本文研究了心脏前体细胞（CPCs）通过Wnt信号通路自我调节第二心脏场（SHF）发育的机制 | 首次揭示了CPCs通过Wnt信号通路自我调节SHF发育的机制，并通过遗传操作和scRNA-seq分析验证了这一发现 | NA | 探究Wnt信号通路在第二心脏场发育中的来源及其对心脏前体细胞命运决定的影响 | 心脏前体细胞（CPCs）和第二心脏场（SHF）的发育 | NA | 先天性心脏病 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
| 19212 | 2024-08-05 |
High cardiomyocyte diversity in human early prenatal heart development
2023-Jan-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105857
PMID:36624836
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研究论文 | 本文研究了人类早期妊娠中心肌细胞的多样性 | 识别出八种类型的发育中心肌细胞，数量是之前识别的两倍，并揭示了其高异质性和独特的依赖于位置的发展特性 | NA | 揭示人类早期妊娠阶段中心肌细胞的特征和异质性 | 人类妊娠6.5-7周的中心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 19213 | 2024-08-05 |
scDCCA: deep contrastive clustering for single-cell RNA-seq data based on auto-encoder network
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac625
PMID:36631401
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研究论文 | 提出了一种新的深度对比聚类算法scDCCA，用于单细胞RNA测序数据 | scDCCA结合了去噪自动编码器和双重对比学习模块，以更好地提取细胞特征并实现细胞聚类 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和疾病 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 去噪自动编码器 | 深度对比聚类 | RNA-seq数据 | 14个真实数据集 |
| 19214 | 2024-08-08 |
Structure-preserved dimension reduction using joint triplets sampling for multi-batch integration of single-cell transcriptomic data
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac608
PMID:36627114
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研究论文 | 本文开发了一种新的结构保留降维（SPDR）方法，通过联合三元组采样来处理多批次单细胞转录组数据的整合问题 | SPDR方法通过考虑批次内和批次间的三元组采样，能够同时去除批次效应并保留数据的固有结构 | NA | 开发一种能够同时去除批次效应并保留数据固有结构的降维方法 | 多批次单细胞转录组数据 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 19215 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomics reveals pro-inflammatory fibroblast involved in lymphocyte recruitment through CXCL8 and CXCL10
2023-01-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81525
PMID:36648332
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研究论文 | 该文章研究了人类口腔黏膜中的细胞组成及其在健康与慢性炎症中的动态变化 | 通过将单细胞RNA测序与空间转录组学结合，揭示了与淋巴细胞招募相关的致炎成纤维细胞 | 缺乏对其他组织或疾病状态的比较，可能影响对广泛应用的理解 | 旨在通过空间转录组学了解口腔慢性疾病的病理机制 | 研究对象为人类口腔黏膜中的特定细胞类型及其空间分布 | 数字病理学 | 口腔慢性炎症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，高分辨率多重荧光杂交 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 19216 | 2024-08-05 |
Lineage-specific regulatory changes in hypertrophic cardiomyopathy unraveled by single-nucleus RNA-seq and spatial transcriptomics
2023-Jan-17, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00490-3
PMID:36646705
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研究论文 | 本研究深入阐明了肥厚型心肌病中特定谱系的病理心脏重塑变化 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，发现了肥厚型心肌病中基因表达、亚群组成和细胞间通讯的谱系特异性变化 | 本研究的样本可能受限于数量和来源，未来需要更广泛的患者组进行验证 | 分析肥厚型心肌病中与心脏重塑相关的谱系特异性表观调控变化 | 来自肥厚型心肌病患者与健康供体的心脏组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 | NA | 组织样本 | 涉及55,122个细胞核，来源于肥厚型心肌病和健康条件的组织样本 |
| 19217 | 2024-08-05 |
Renal interstitial cells promote nephron regeneration by secreting prostaglandin E2
2023-01-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81438
PMID:36645741
|
研究论文 | 本研究揭示肾间质细胞通过分泌前列腺素E2促进肾小管再生的机制 | 首次明确肾间质细胞在肾单位再生中提供原发干细胞的微环境 | 尚未探索其他类型细胞在肾单位再生中的潜在作用 | 探究肾间质细胞与肾单位再生之间的关系 | 肾间质细胞与肾原性干细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 转基因斑马鱼 | NA | NA |
| 19218 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unveils heterogeneity and establishes a novel signature for prognosis and tumor immune microenvironment in ovarian cancer
2023-Jan-16, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-022-01074-1
PMID:36642706
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研究论文 | 这项研究通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq分析卵巢癌的异质性，并建立了一种新的预后标志物和肿瘤免疫微环境。 | 研究首次提供了基于卵巢癌细胞异质性的七基因预后模型，能够有效预测患者的预后并识别其免疫微环境状态。 | 本研究主要依赖于TCGA和GEO数据集，可能限制了模型的普遍适用性。 | 研究旨在探讨卵巢癌细胞的异质性和建立预后模型。 | 研究对象为卵巢癌患者及其肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 使用TCGA和GEO数据集中的样本，具体样本大小未明确说明 |
| 19219 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2023-01-16, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05566-w
PMID:36646679
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研究论文 | 本研究揭示了SERPINE2作为晚期肾细胞癌转移的靶标 | 通过单细胞RNA测序和多组学集成，全面分析了肾细胞癌的转录组和肿瘤微环境 | 该研究可能尚未充分揭示所有肾细胞癌进展的机理 | 识别晚期肾细胞癌转移的新靶标 | 来自八个肾细胞癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA测序 (RNA-seq) | NA | 组织样本 | 八个组织样本来自407名肾细胞癌患者的微阵列 |
| 19220 | 2024-08-08 |
EREG is the core onco-immunological biomarker of cuproptosis and mediates the cross-talk between VEGF and CD99 signaling in glioblastoma
2023-01-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03883-4
PMID:36647156
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研究论文 | 本研究通过整合大量RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了铜死亡激活评分模型（CuAS），并验证了EREG作为核心肿瘤免疫生物标志物在胶质母细胞瘤中的作用 | 首次提出铜死亡（cuproptosis）作为一种新的铜诱导细胞死亡形式，并构建了CuAS模型来评估其对胶质母细胞瘤的预后和治疗潜力 | 需要进一步的临床试验来验证CuAS模型在实际治疗中的效果 | 探索铜死亡在胶质母细胞瘤治疗中的应用潜力 | 胶质母细胞瘤细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Chinese Glioma Genome Atlas两个队列的数据 |