单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
19181	2024-08-08	Obeticholic acid and 5β-cholanic acid 3 exhibit anti-tumor effects on liver cancer through CXCL16/CXCR6 pathway 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1095915 PMID:36605219	研究论文	本研究通过分析人肝细胞癌单细胞RNA测序数据，验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并探讨了obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用在此过程中的作用	首次在人体中验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并发现obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用具有显著的肿瘤抑制效果	研究主要基于单细胞RNA测序数据和动物模型，尚未在临床试验中得到验证	探讨CXCL16/CXCR6通路在肝细胞癌中的作用及潜在的免疫治疗策略	肝细胞癌及其相关细胞和分子机制	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	涉及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据
19182	2024-08-08	Necroptosis-related lncRNAs: Combination of bulk and single-cell sequencing reveals immune landscape alteration and a novel prognosis stratification approach in lung adenocarcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1010976 PMID:36605426	研究论文	本研究通过结合批量和单细胞测序技术，构建了一种基于坏死相关长非编码RNA风险评分（NecroLRS）和临床病理参数的预测模型，用于肺腺癌的预后分层和免疫微环境改变的研究	首次揭示了坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用，并提出了一种新的基于K-means聚类的分层算法，用于从单细胞角度解析坏死在肺腺癌预后中的机制	NA	探索坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用及其对免疫微环境的影响	肺腺癌患者的预后分层和免疫微环境改变	数字病理学	肺腺癌	批量测序和单细胞测序	K-means聚类	RNA	4个人类肺腺癌细胞系
19183	2024-08-08	Single-cell profiling reveals that SAA1+ epithelial cells promote distant metastasis of esophageal squamous cell carcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1099271 PMID:36605443	研究论文	本研究通过单细胞测序数据分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）中SAA1+上皮细胞的新亚群，该亚群与ESCC的远处转移密切相关。	发现了ESCC中一种新的SAA1+恶性细胞亚群，该亚群具有高度侵袭性并关联ESCC的远处转移。	NA	探索ESCC肿瘤组织的异质性及寻找具有特殊生物学功能的ESCC新亚群。	食管鳞状细胞癌（ESCC）中的SAA1+上皮细胞。	数字病理学	食管癌	单细胞测序	预测模型	基因表达数据	NA
19184	2024-08-08	NR4A2 may be a potential diagnostic biomarker for myocardial infarction: A comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1061800 PMID:36618351	研究论文	本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了NR4A2作为心肌梗死潜在诊断生物标志物的可能性	首次通过免疫浸润分析和疾病本体富集分析，确定了NR4A2在心肌梗死诊断中的重要价值	仅使用了一个数据集进行模型准确性测试，可能需要更多数据集验证	旨在预测和验证心肌梗死诊断的关键基因	心肌梗死及其诊断生物标志物	生物信息学	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	使用了GSE66360数据集，包含335个差异表达基因
19185	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing to dissect the immunological network of liver fibrosis in Schistosoma japonicum-infected mice 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.980872 PMID:36618421	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术探索日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫机制	首次应用单细胞测序技术解析日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫网络	样本量较小，仅包括一只感染小鼠和一只正常小鼠	深入理解日本血吸虫感染导致的肝纤维化机制	日本血吸虫感染小鼠的肝纤维化过程	数字病理学	肝纤维化	单细胞RNA测序	NA	RNA	1只感染小鼠和1只正常小鼠
19186	2024-08-08	Neurogenesis potential of oligodendrocyte precursor cells from oligospheres and injured spinal cord 2022, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2022.1049562 PMID:36619671	研究论文	本研究探讨了从寡球体和受损脊髓中提取的少突胶质前体细胞（OPCs）的神经发生潜力	首次发现OPCs参与寡球体的形成，并能进一步分化为类神经细胞，以及在寡球体分化过程中检测到少突胶质细胞和神经细胞的中间状态	NA	研究OPCs在受损髓鞘再生中的神经发生潜力及其机制	少突胶质前体细胞（OPCs）及其在脊髓损伤后的分化和神经发生潜力	NA	脊髓损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），生物信息学分析，免疫荧光染色，分子实验	NA	RNA	幼年和成年小鼠的脊髓损伤模型
19187	2024-08-05	The Utility of Spatial Transcriptomics for Solid Organ Transplantation 2023-07-01, Transplantation IF:5.3Q1 DOI:10.1097/TP.0000000000004466 PMID:36584371	综述	本文概述了空间转录组技术在器官移植中的应用和技术进步	强调了基于原位测序的空间转录组技术的最新进展及其在移植领域的应用	讨论了解释由该方法生成的大量数据时的重要注意事项和限制	探讨空间转录组在器官移植中的潜在作用	使用空间转录组技术的实验和分析流程	数字病理学	NA	空间转录组技术	NA	基因转录数据	NA
19188	2024-08-08	CD8+ T Cells Trigger Auricular Dermatitis and Blepharitis in Mice after Zika Virus Infection in the Absence of CD4+ T Cells 2023-06, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2022.11.020 PMID:36566875	研究论文	本研究使用T细胞缺陷的小鼠模型，展示了在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后引发耳部皮炎和眼睑炎的作用	首次揭示了在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后引发病理反应的具体机制	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的病理作用	探讨在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的保护和病理作用	CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的作用机制	免疫学	病毒性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
19189	2024-08-08	Single-cell next-generation sequencing of circulating tumor cells in patients with neuroblastoma 2023-Apr, Cancer science IF:4.5Q1 DOI:10.1111/cas.15707 PMID:36571449	研究论文	本研究通过单细胞下一代测序技术分析了神经母细胞瘤患者的循环肿瘤细胞（CTCs），以评估其在肿瘤生物学特征和转移机制中的应用	首次在单细胞水平上对神经母细胞瘤的CTCs进行下一代测序，揭示了CTCs中的基因表达模式和突变情况	样本量较小，仅包括10名初诊患者和4名复发患者	旨在通过单细胞测序技术揭示神经母细胞瘤的肿瘤生物学特征和转移机制	神经母细胞瘤患者的循环肿瘤细胞	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞下一代测序	NA	DNA和RNA	10名初诊患者和4名复发患者的CTCs
19190	2024-08-08	Inhibiting Cyclin B1-treated Pontine Infarction by Suppressing Proliferation of SPP1+ Microglia 2023-Apr, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-022-03183-w PMID:36572839	研究论文	本文通过建立大鼠急性脑桥梗死模型，利用单细胞RNA测序技术检测脑桥梗死后的细胞反应，并验证了一种针对微胶质细胞的治疗方法	首次发现并验证了SPP1+微胶质细胞在脑桥梗死中的作用，并使用Cucurbitacin E抑制其增殖以减轻神经功能缺损	NA	研究脑桥梗死的治疗方法	脑桥梗死及其相关微胶质细胞	NA	脑桥梗死	单细胞RNA测序	NA	RNA	大鼠模型
19191	2024-08-08	Molecular characterization of onychomatricoma: Spatial profiling reveals the role of onychofibroblasts in its pathogenesis 2023-04, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.14736 PMID:36579368	研究论文	本研究利用数字空间分析技术（DSP）和单细胞RNA测序，对指甲瘤（OM）的分子特征及其发病机制进行了深入研究	首次结合数字空间分析和单细胞RNA测序技术，揭示了指甲瘤中Wnt信号通路的激活及其在疾病发生中的关键作用	研究仅基于两个OM病例和正常对照指甲单位，样本量较小	探究指甲瘤的分子特征及其发病机制	指甲瘤（OM）及其正常对照指甲单位	数字病理学	NA	数字空间分析（DSP）、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	2例指甲瘤病例和正常对照指甲单位
19192	2024-08-08	Single-cell and spatial analyses reveal the association between gene expression of glutamine synthetase with the immunosuppressive phenotype of APOE+CTSZ+TAM in cancers 2023-04, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.13373 PMID:36587392	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据和单细胞通量估计分析，探讨了结直肠癌和肺癌缺氧肿瘤微环境中代谢与细胞功能之间的联系，特别是发现了一种具有免疫抑制特性的肿瘤相关巨噬细胞亚群APOE+CTSZ+TAM。	本研究首次揭示了APOE+CTSZ+TAM亚群在肿瘤样本中的高比例存在及其通过上调抗炎基因表达展现的免疫抑制特性，并发现了该亚群与调节性T细胞（Treg）之间的潜在相互作用。	NA	探讨肿瘤微环境中代谢与细胞功能之间的联系，特别是肿瘤相关巨噬细胞亚群的免疫抑制特性及其与调节性T细胞的相互作用。	结直肠癌和肺癌的肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞亚群APOE+CTSZ+TAM及其代谢特征。	数字病理学	结直肠癌，肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	结直肠癌和肺癌的肿瘤样本
19193	2024-08-08	Distinct fibroblast progenitor subpopulation expedites regenerative mucosal healing by immunomodulation 2023-03-06, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20221350 PMID:36584405	研究论文	本文识别了一种关键的成纤维细胞亚群——出生后配对相关同源盒-1+（Prx1+）细胞，这些细胞通过促进早期免疫反应加速黏膜愈合	首次发现Prx1+成纤维细胞在生理和损伤条件下表现出祖细胞特征，并能分化为具有免疫调节功能的SCA1+成纤维细胞，从而加速伤口愈合	研究主要基于小鼠模型，尚需在人类中进一步验证	探究成纤维细胞亚群在黏膜愈合中的作用机制	成纤维细胞亚群Prx1+细胞及其在黏膜愈合中的作用	NA	NA	移植和遗传消融模型、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞	小鼠模型
19194	2024-08-08	The Heterogeneous Cellular States of Glioblastoma Stem Cells Revealed by Single Cell Analysis 2023-03-02, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxac088 PMID:36583266	研究论文	本研究利用单细胞转录组测序数据，结合谱系和干细胞特性，识别并分析了胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）的细胞状态及其与患者临床结果的相关性	首次在人类肿瘤微环境中研究GSCs的细胞状态，并识别出两种不同的GSCs亚群：增殖性GSCs（pGSCs）和静止性GSCs（qGSCs），并构建了一个8基因的预后标志物	NA	揭示胶质母细胞瘤干细胞的异质性及其与肿瘤发展和临床结果的相关性	胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）及其细胞状态	数字病理学	脑癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	6个独立的胶质母细胞瘤（GBM）队列
19195	2024-08-05	WZ35 inhibits gastric cancer cell metastasis by depleting glutathione to promote cellular metabolic remodeling 2023-Feb-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2022.216044 PMID:36574880	研究论文	本研究阐明了WZ35通过耗竭谷胱甘肽来促进细胞代谢重塑，从而抑制胃癌细胞转移的机制	WZ35被鉴定为一种新的谷胱甘肽耗竭剂，并发现了在胃癌细胞转移中未被发现的谷胱甘肽耗竭环机制	NA	研究WZ35在胃癌转移中的作用机制	胃癌细胞	数字病理学	胃癌	RNA测序、单细胞测序、代谢质谱等分子实验技术	NA	NA	在体内和体外验证了WZ35的活性和生物安全性
19196	2024-08-05	Early development of esophageal squamous cell cancer: Stem cells, cellular origins and early clone evolution 2023-02-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2022.216047 PMID:36587837	综述	本综述讨论了食管鳞状细胞癌（ESCC）的早期发展，包括干细胞、细胞起源和早期克隆演化的相关内容	介绍了NOTCH1突变的扩展可能激活保守的抗癌机制，并塑造ESCC早期克隆演化的模型	本综述未提供实验数据来直接验证所讨论的假设	提供对ESCC早期发展的集中理解，以为早期肿瘤检测、干预和预防策略奠定基础	讨论食管基底层干细胞的异质性及其与ESCC细胞起源的潜在关系	数字病理学	食管癌	大规模测序和单细胞测序	转基因谱系追踪技术	组织样本	NA
19197	2024-08-05	Rapamycin improves Graves' orbitopathy by suppressing CD4+ cytotoxic T lymphocytes 2023-02-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.160377 PMID:36580373	研究论文	本研究探讨了雷帕霉素在格雷夫斯眼病中的影响	首次证明雷帕霉素通过抑制CD4+细胞毒性T淋巴细胞改善格雷夫斯眼病	可能需要进一步确认雷帕霉素在更大规模患者中的长期效果	探究雷帕霉素在格雷夫斯眼病中的治疗效果	包括小鼠模型和难治性格雷夫斯眼病患者	数字病理学	格雷夫斯眼病	RNA测序	小鼠模型	细胞数据	小鼠模型和多个难治性患者的样本
19198	2024-08-05	Nonnegative spatial factorization applied to spatial genomics 2023-02, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-022-01687-w PMID:36587187	研究论文	本文提出了基于变换高斯过程的非负空间因子分解（NSF）模型，用于空间基因组学的数据分析	NSF模型能够准确恢复真实因子，并且与传统的实值模型相比在预测性能上表现更好	并非所有基因表达模式具有空间相关性，可能影响某些观察值的结果	研究旨在提出一个可以处理空间基因组学数据的新概率维度降低模型	研究对象包括小鼠大脑和肝脏的三组空间转录组数据	数字病理学	NA	非负矩阵分解（NMF）	空间因子分解（NSF）	高维计数数据	涉及到数万个观察值
19199	2024-08-05	Single-cell transcriptomics of hepatic stellate cells uncover crucial pathways and key regulators involved in non-alcoholic steatohepatitis 2023-Feb-01, Endocrine connections IF:2.6Q3 DOI:10.1530/EC-22-0502 PMID:36562664	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析揭示了与非酒精性脂肪性肝炎相关的肝星状细胞的转录组特征及关键通路。	该研究首次评估了在NASH患者中激活的肝星状细胞的转录组变化，并识别了与其相关的主要功能通路和关键调控因子。	研究中主要集中于肝星状细胞的转录组变化，未能覆盖其他细胞类型在NASH发展中的作用。	本研究旨在识别非酒精性脂肪性肝炎发展过程中肝星状细胞的转录组标记及其功能通路。	研究对象为非酒精性脂肪性肝炎患者的激活和静息肝星状细胞。	数字病理	非酒精性脂肪性肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NASH患者与健康对照组的多个样本
19200	2024-08-08	A retro-inverso modified peptide alleviated ovalbumin-induced asthma model by affecting glycerophospholipid and purine metabolism of immune cells 2023-Feb, Pulmonary pharmacology & therapeutics IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.pupt.2022.102185 PMID:36563740	研究论文	本文研究了一种经过反向修饰的肽PD00，通过影响免疫细胞的甘油磷脂和嘌呤代谢，减轻了卵清蛋白诱导的哮喘模型中的炎症反应	PD00具有高代谢稳定性，能够显著改善哮喘模型中的气道高反应性和炎症反应	NA	旨在生成一种代谢稳定的抗CD81肽，并评估其抗炎作用及其作用机制	PD00肽及其在卵清蛋白诱导的哮喘模型中的作用	NA	哮喘	超高效液相色谱-串联质谱法，分子对接，表面等离子体共振技术	NA	代谢组学数据，单细胞转录组测序数据	实验使用了不同浓度的PD00（175和350 μg/kg）处理的小鼠，持续10天