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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1901 | 2025-10-06 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
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研究论文 | 本研究揭示了JAG1-NOTCH4信号通路通过感知紊乱血流促进动脉粥样硬化的机制 | 首次发现JAG1-NOTCH4通路在感知紊乱血流中的作用及其通过调节内皮细胞异质性促进动脉粥样硬化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,需要进一步验证在人类疾病中的直接相关性 | 探究紊乱血流通过JAG1-NOTCH4信号通路促进动脉粥样硬化的分子机制 | 猪和鼠的动脉组织、培养的人类冠状动脉内皮细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,光片成像 | NA | 基因表达数据,成像数据 | 多种动物模型和细胞培养体系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1902 | 2025-10-06 |
MAST: a flexible statistical framework for assessing transcriptional changes and characterizing heterogeneity in single-cell RNA sequencing data
2015-Dec-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-015-0844-5
PMID:26653891
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的灵活统计框架MAST,用于评估转录变化和表征异质性 | 针对单细胞数据特有的双峰表达分布和随机丢失问题,提出了两部分广义线性模型,并引入细胞检测率作为干扰变异源进行调整 | NA | 开发适用于单细胞RNA测序数据的统计分析框架 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1903 | 2025-10-06 |
Emerging molecular targets in deep vein thrombosis: from inflammation to coagulation
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2548735
PMID:40898418
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综述 | 本综述探讨深静脉血栓形成中连接炎症与凝血途径的新兴分子靶点 | 系统整合了连接炎症与凝血途径的多个新兴分子靶点,包括NETs、PAD4、P-selectin等,并提出单细胞RNA测序和CRISPR筛选等新技术在靶点发现中的应用前景 | 主要基于临床前研究数据,存在物种差异、脱靶效应等转化挑战,且需平衡疗效与免疫防御功能 | 探索深静脉血栓形成中炎症与凝血相互作用的分子机制及潜在治疗靶点 | 中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)、肽酰精氨酸脱亚氨酶4(PAD4)、P-选择素、高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、组织因子(TF)、补体C3和NLRP3炎性体等分子靶点 | 分子病理学 | 深静脉血栓 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1904 | 2025-10-06 |
Alternative splicing as a novel pathogenic mechanism in chronic kidney disease
2025-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111972
PMID:40614890
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综述 | 本文综述了选择性剪接作为慢性肾脏病新型致病机制的研究进展 | 首次系统阐述选择性剪接在慢性肾脏病中的致病作用,提出靶向选择性剪接的治疗策略 | 需要进一步研究选择性剪接及其调控因子在慢性肾脏病中的动态变化和功能贡献 | 阐明选择性剪接与慢性肾脏病之间的功能联系 | 肾小管上皮细胞及其选择性剪接事件 | 生物医学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | 全球超过10%人口 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1905 | 2025-10-06 |
N-glycosylation stabilized TNFAIP6 promotes ovarian cancer metastasis by activating the PI3K-AKT signaling pathway
2025-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112013
PMID:40701312
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研究论文 | 本研究揭示了N-糖基化稳定的TNFAIP6通过激活PI3K-AKT信号通路促进卵巢癌转移的分子机制 | 首次发现N-糖基化通过抑制泛素-蛋白酶体降解途径稳定TNFAIP6蛋白,并阐明其通过PI3K/AKT信号通路驱动卵巢癌转移的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,需要进一步临床验证;免疫抑制微环境与治疗抵抗的具体机制仍需深入探索 | 阐明卵巢癌转移的分子驱动机制并寻找潜在治疗靶点 | 卵巢癌细胞系、动物转移模型和临床样本数据 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq, Western blot, 免疫荧光, 慢病毒shRNA敲降/过表达, Co-IP | 动物转移模型 | 基因组数据, 蛋白质数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1906 | 2025-10-06 |
A STAT1-GBP3-STING positive feedback loop governs inflammation, oxidative stress, and DNA damage to trigger acute aortic dissection
2025-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112015
PMID:40714274
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研究论文 | 本研究揭示了STAT1-GBP3-STING正反馈环路在急性主动脉夹层中调控炎症、氧化应激和DNA损伤的分子机制 | 首次发现STAT1-GBP3-STING正反馈环路在主动脉退行性变中的关键作用,并证明STAT1抑制剂氟达拉滨可通过干预该环路改善疾病预后 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明急性主动脉夹层中炎症、氧化应激和DNA损伤相互作用的分子机制 | 小鼠主动脉夹层模型、IFN-γ刺激的血管平滑肌细胞、人类升主动脉组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序, ROS染色, ChIP-PCR, CoIP | NA | 基因组学数据, 转录组数据, 蛋白质相互作用数据 | 191个差异表达基因,小鼠主动脉夹层模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA-seq | NA | NA |
1907 | 2025-10-06 |
G protein-coupled estrogen receptor promotes human extravillous trophoblast invasion via YAP-Snail-mediated CYR61 expression
2025-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112033
PMID:40744331
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研究论文 | 本研究揭示了G蛋白偶联雌激素受体通过YAP-Snail信号轴调控CYR61表达促进人类绒毛外滋养细胞侵袭的分子机制 | 首次发现GPER-YAP-Snail-CYR61信号轴在滋养细胞侵袭中的调控作用,并证实该通路在子痫前期患者中异常 | 未明确GPER激活YAP信号的具体上游机制,缺乏动物模型验证 | 探究GPER调控CYR61表达促进滋养细胞侵袭的分子机制 | 人类绒毛外滋养细胞(HTR-8/SVneo细胞系和原代细胞) | 分子生物学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 功能缺失实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 细胞系和原代细胞,公共scRNA-seq数据库中的子痫前期患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1908 | 2025-10-06 |
The Landscape of SPP1 + Macrophages Across Tissues and Diseases: A Comprehensive Review
2025-Oct, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13952
PMID:40395129
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综述 | 全面综述SPP1+巨噬细胞在不同组织和疾病中的分布特征与功能作用 | 首次系统整合单细胞RNA测序技术揭示的SPP1+巨噬细胞跨疾病谱系功能异质性 | NA | 探讨SPP1+巨噬细胞在肿瘤与非癌性疾病中的功能特化和治疗靶向潜力 | 分泌磷蛋白1(SPP1)阳性巨噬细胞亚群 | NA | 多癌种及非癌性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1909 | 2025-10-06 |
From tissue architecture to clinical insights: Spatial transcriptomics in solid tumor studies
2025-Oct, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2025.152389
PMID:40664120
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综述 | 深入分析空间转录组学技术在实体瘤研究中的最新进展和应用前景 | 整合空间转录组学与单细胞多组学及先进计算算法,揭示肿瘤核心区、侵袭边缘和免疫微环境的分子景观 | 在技术分辨率、数据处理、样本制备和临床标准化方面仍存在挑战 | 探讨空间转录组学如何推动实体瘤研究和精准肿瘤学发展 | 实体瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 实体瘤 | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
1910 | 2025-10-06 |
Microarray and Single-Cell RNA Sequencing Reveals G-Protein Gene Expression Signatures of Spermatogonia Stem Cell
2025-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10942-4
PMID:40694278
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研究论文 | 通过微阵列和单细胞RNA测序揭示精原干细胞中G蛋白基因的表达特征 | 首次在人类睾丸单细胞水平系统分析G蛋白基因表达谱,发现精原干细胞发育过程中的关键上下调基因 | 样本量有限(仅6个人类睾丸),需要进一步功能验证实验 | 研究人类精原干细胞的发育机制 | 人类精原干细胞 | 单细胞转录组学 | 男性生殖系统疾病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫荧光标记 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,图像数据 | 6个人类睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序,微阵列分析 | NA | NA |
1911 | 2025-10-06 |
Deciphering the prognostic value and immunotherapeutic strategy of aggrephagy in melanoma: Integrating single-cell sequencing and machine learning
2025-Oct, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2025.152371
PMID:40695191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和机器学习技术,探索聚集性自噬在皮肤黑色素瘤中的预后价值和免疫治疗策略 | 首次构建聚集性自噬相关特征(ARS),结合单细胞测序和机器学习算法,在多个数据集中验证其预后预测能力,并通过体内实验验证关键基因TPX2的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;体内实验仅针对TPX2基因,其他ARS基因功能有待进一步研究 | 研究聚集性自噬在皮肤黑色素瘤中的作用,探索其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 皮肤黑色素瘤患者转录组数据和小鼠模型 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,机器学习算法,流式细胞术 | 预后预测模型 | 转录组数据 | TCGA数据库和3个独立GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1912 | 2025-10-06 |
Predictive model for proliferative diabetic retinopathy using single-cell transcriptomics
2025-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110536
PMID:40701535
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据开发了增殖性糖尿病视网膜病变的预测模型 | 首次整合PDR患者纤维血管膜和健康供体视网膜的单细胞转录组数据,并开发了基于机器学习的预测模型 | 样本量相对较小,仅包含9个PDR患者的纤维血管膜样本 | 探索增殖性糖尿病视网膜病变的细胞和分子机制,并开发预测工具 | PDR患者的纤维血管膜和健康供体的视网膜组织 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,GO和KEGG富集分析 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 9个PDR患者的纤维血管膜样本和健康供体视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1913 | 2025-10-06 |
CXCR4+ monocytes promote neovascularization in wet age-related macular degeneration
2025-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110550
PMID:40713972
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研究论文 | 本研究通过整合分析方法揭示了湿性年龄相关性黄斑变性中CXCR4+单核细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴促进病理性血管生成的新机制 | 首次发现MMP2+内皮细胞具有血管生成和干细胞样双重特性,并鉴定CXCR4+单核细胞为病理性血管生成的关键介质,确立RUNX3为促血管生成单核细胞分化的主要调控因子 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征,机制研究主要依赖实验模型 | 阐明湿性年龄相关性黄斑变性中趋化因子信号在血管生成中的作用并鉴定关键单核细胞亚群 | 湿性年龄相关性黄斑变性相关的血管生成和炎症过程 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | bulk RNA测序, 单细胞转录组学, 多重免疫组织化学, 体内模型 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1914 | 2025-10-06 |
Multimodal profiling of oral squamous cell carcinoma identifies genomic alterations and expression programs associated with betel quid chewing
2025-Oct, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101218
PMID:40784158
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研究论文 | 通过多组学方法研究槟榔咀嚼与口腔鳞状细胞癌的基因组改变和表达程序关联 | 首次通过整合外显子组测序、单细胞转录组和空间转录组学系统揭示槟榔相关口腔癌的独特基因组特征和肿瘤微环境变化 | 研究样本仅包含男性患者,缺乏女性患者数据;样本量相对有限 | 阐明槟榔咀嚼导致口腔鳞状细胞癌的详细分子机制 | 261例男性口腔鳞状细胞癌患者(129例习惯性槟榔咀嚼者,132例非槟榔使用者) | 癌症基因组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 外显子组测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间表达数据 | 261例肿瘤-正常组织配对样本 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1915 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals that RNA pseudouridylation-related gene NHP2 promotes the progression of uveal melanoma and validated in vivo and in vitro
2025-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110578
PMID:40812391
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现RNA假尿苷化相关基因NHP2促进葡萄膜黑色素瘤进展,并在体内外实验中验证其功能 | 首次揭示RNA假尿苷化相关基因NHP2在葡萄膜黑色素瘤中的关键作用及其分子机制 | NA | 探究RNA假尿苷化相关基因在葡萄膜黑色素瘤进展中的作用机制 | 葡萄膜黑色素瘤组织和细胞系 | 单细胞测序 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组化,Western blotting,基因敲低,基因过表达,CCK-8,集落形成,Edu,划痕愈合,Transwell,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1916 | 2025-10-06 |
Antioxidant functionalized double-net/TA dynamic hydrogel promotes cartilage regeneration through stabilization of chondrocyte phenotype
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102203
PMID:40893359
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研究论文 | 本研究开发了一种具有抗氧化功能的双网络/单宁酸动态水凝胶,通过稳定软骨细胞表型促进软骨再生 | 首次揭示软骨细胞在扩增过程中代谢模式从糖酵解向氧化磷酸化的转变,并基于此设计具有抗氧化功能的DN-TA水凝胶系统 | 研究主要基于小鼠皮下植入模型,临床转化效果需要进一步验证 | 探索代谢调控对软骨细胞表型稳定性的影响,开发促进软骨再生的组织工程策略 | 软骨细胞 | 组织工程 | 软骨缺损 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | P3代软骨细胞 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1917 | 2025-10-06 |
MIG-6 Plays a Critical Role as a PGR Mediator in Maintaining Epithelial and Stromal Cells for Uterine Receptivity
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501455R
PMID:40905903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了MIG-6作为孕酮受体关键介质在维持子宫容受性中的细胞特异性作用机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示MIG-6缺陷对子宫内膜上皮和基质细胞基因表达的特异性影响,并发现LRP2在子宫内膜异位症不孕患者中的表达异常 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究MIG-6缺陷如何破坏子宫细胞群体特异性功能从而导致子宫内膜容受性异常 | 子宫特异性Mig-6基因敲除小鼠的子宫内膜细胞 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mig-6基因敲除小鼠和对照小鼠的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1918 | 2025-10-06 |
Vascular Normalization Augments the Antitumor Efficacy of Combined HDAC Inhibitor with Immunotherapy in Solid Tumors
2025-Sep-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1033
PMID:40452600
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶抑制剂联合抗血管生成治疗可增强免疫疗法在实体瘤中的抗肿瘤疗效 | 首次发现HDAC抑制剂通过增强CD8+T细胞染色质可及性提升其抗肿瘤能力,但同时会诱导巨噬细胞产生VEGFA导致血管异常化,提出三联疗法克服此限制 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证 | 探索优化实体瘤免疫治疗的联合用药策略 | 实体瘤患者样本和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1919 | 2025-10-06 |
A multiomic analysis of Waldenström macroglobulinemia defines distinct disease subtypes
2025-Sep-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028164
PMID:40332467
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研究论文 | 通过对华氏巨球蛋白血症进行单细胞多组学分析,定义了两种不同的疾病亚型 | 首次通过单细胞多组学技术识别出华氏巨球蛋白血症的两种分子亚型,并揭示了其不同的分化能力和分子特征 | 研究样本数量有限,需要更大规模的研究验证亚型分类的普适性 | 解析华氏巨球蛋白血症的分子异质性并定义疾病亚型 | MYD88突变的华氏巨球蛋白血症患者 | 单细胞多组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,全基因组测序,批量RNA测序 | 伪时间轨迹分析,层次聚类 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,基因组数据 | 一系列MYD88突变WM患者及第二组验证患者 | NA | 单细胞多组学,单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,全基因组测序,批量RNA测序 | NA | NA |
1920 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Sep-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70351
PMID:40904198
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术揭示了小麦发育种子中基因表达的空间组织模式 | 首次在小麦种子发育关键期实现亚细胞分辨率的空间转录组分析,发现胚乳中四个同心圆状基因表达区域,并识别出亚基因组偏向表达的关键基因 | 研究仅针对14 DPA(花后天数)的小麦种子,未覆盖整个种子发育过程 | 探索小麦发育种子中基因表达的空间组织模式及其功能意义 | 小麦(Triticum aestivum)发育中的种子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过4,000,000个空间分辨的转录本 | STOmics | 空间转录组学 | STOmics空间转录组平台 | STOmics空间转录组平台 |