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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1901 | 2026-02-26 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Jun-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
|
综述 | 本文综述了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性,包括其机制、在疾病进展中的作用以及潜在的治疗前景 | 系统总结了内皮细胞向间充质、造血、成骨及免疫细胞样等多种表型转化的机制,并探讨了利用单细胞测序等新兴技术揭示其异质性的最新进展,以及通过内皮重编程等策略进行靶向治疗的新方向 | 本文是一篇综述,主要基于现有文献进行总结和分析,未报告新的原始实验数据或进行直接的机制验证 | 阐明内皮细胞的异质性和表型可塑性在心血管生理和疾病中的作用机制,并探索基于此的靶向治疗策略 | 内皮细胞及其在心血管系统中的表型转化 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1902 | 2026-02-26 |
A tumor necrosis factor-α-responsive cryptic promoter drives overexpression of the human endogenous retrovirus ERVK-7
2025-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108568
PMID:40316021
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研究论文 | 本研究揭示了内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中通过肿瘤坏死因子-α响应的隐蔽启动子驱动的过表达机制 | 发现了ERVK-7的两个新型转录本(ERVK-7.long和ERVK-7.short),并阐明了它们由不同上游启动子驱动、受炎症信号通路差异调控的机制 | 研究主要聚焦于肺腺癌,对其他癌症类型中ERVK-7的调控机制探讨有限 | 探究内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中的表达调控机制及其临床意义 | 人类内源性逆转录病毒ERVK-7及其在肺腺癌中的转录调控 | 表观遗传学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序、表观遗传图谱分析 | NA | RNA-seq数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1903 | 2026-02-26 |
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110206
PMID:40345585
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研究论文 | 本研究探讨NOTCH2信号在小鼠骨骺软骨细胞中对转录组和细胞群体的影响,特别是在炎症反应和骨关节炎发病机制中的作用 | 通过NOTCH2功能获得性突变和条件性模型,结合bulk RNA-Seq和scRNA-Seq分析,揭示了NOTCH2如何增强炎症通路并破坏关节滑膜成纤维细胞的转录组特性 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类骨关节炎的复杂性,且样本来源和实验条件存在一定限制 | 探究NOTCH2信号如何调控骨骺软骨细胞的转录组和细胞群体,以理解其在骨关节炎发病机制中的作用 | 小鼠骨骺软骨细胞,包括NOTCH2功能获得性突变模型和条件性表达NICD2的模型 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq (scRNA-Seq) | NA | RNA序列数据 | 来自NOTCH2功能获得性突变小鼠和R26-NICD2小鼠的原代骨骺细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1904 | 2026-02-26 |
A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data
2025-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.91
PMID:41675510
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综述 | 本文系统回顾并评估了超过10种流行的单细胞RNA测序和ATAC测序数据整合方法 | 强调在生物学相关粒度上进行数据整合的重要性,并考虑不同模态间的固有差异以平衡生物学发现与噪声去除 | 讨论了这些整合方法的数据偏好、局限性、应用挑战及未来方向 | 比较和评估单细胞多模态数据整合方法,以解决细胞间对应关系识别这一挑战性任务 | 单细胞RNA测序数据和ATAC测序数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1905 | 2026-02-26 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.07.642107
PMID:40161587
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析肝癌样本,揭示了肿瘤细胞村庄及其与微环境的共依赖性对肿瘤异质性和患者预后的影响 | 开发了一种基于深度学习的空间动态网络策略,首次将肿瘤细胞状态组织成村庄概念,并展示了其与微环境的特异性分子共依赖性 | 研究样本量有限(50个肿瘤生物样本),且主要聚焦于肝癌,可能不适用于其他癌症类型 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像,单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像,RNA测序数据 | 超过200万个细胞,来自50个肿瘤生物样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1906 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1693937
PMID:41334557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,构建了体外冲击波疗法治疗糖尿病伤口组织的细胞图谱,揭示了该疗法促进组织修复的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了体外冲击波疗法对糖尿病伤口组织的细胞动态和转录重编程影响,并阐明了其通过调节巨噬细胞、成纤维细胞和内皮细胞状态以及增强免疫细胞通讯网络来促进修复的机制 | 研究主要基于转录组层面的分析,缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入探索;样本量相对有限,且为观察性研究,因果关系需进一步验证 | 探究体外冲击波疗法促进糖尿病伤口愈合的细胞和分子机制 | 糖尿病伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约39,475个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1907 | 2026-02-26 |
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680437
PMID:41488614
|
研究论文 | 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组,首次构建了健康小型犬外周血白细胞的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了新的免疫亚群和检查点程序 | 首次使用更新的canFam4基因组进行犬类单细胞RNA测序分析,识别出51个不同的免疫亚群,包括在基于canFam3.1的研究中未被充分代表的多个新亚型,并系统揭示了免疫检查点分子在犬类免疫稳态中的调控机制 | 研究仅纳入6只健康小型犬,样本量较小,且未涵盖不同品种、年龄或健康状况的犬只,可能限制了结果的普遍性 | 构建健康犬外周血白细胞的高分辨率单细胞转录组图谱,深入解析犬类免疫系统的异质性和免疫检查点调控机制 | 6只健康小型犬的外周血白细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6只健康小型犬,共30,040个高质量转录本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1908 | 2026-01-23 |
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1773404
PMID:41567218
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correction | 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1909 | 2026-02-26 |
Interfacial delivery of carbon monoxide via smart titanium implant coating for enhanced soft tissue integration with switchable antibacterial and immunomodulatory properties
2024-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.06.010
PMID:38978805
|
研究论文 | 本研究开发了一种智能钛植入物涂层,通过近红外光控释放一氧化碳,以增强软组织整合,并具有可切换的抗菌和免疫调节功能 | 创新点在于构建了一种可控释放一氧化碳的双功能涂层,能在近红外照射下主动加速一氧化碳生成以抗菌,无照射时则缓慢释放一氧化碳诱导巨噬细胞极化,从而调节免疫微环境 | 研究仅在大鼠植入模型中进行验证,未涉及更大型动物或人体试验,且涂层长期稳定性和安全性需进一步评估 | 研究目标是增强钛植入物周围的软组织整合,以提高植入物的长期成功率 | 研究对象为钛植入物表面涂层及其在大鼠模型中的软组织整合效果 | 生物医学工程 | 植入物相关感染和炎症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 大鼠植入模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1910 | 2026-02-26 |
Senescence-targeted MicroRNA/Organoid composite hydrogel repair cartilage defect and prevention joint degeneration via improved chondrocyte homeostasis
2024-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.05.036
PMID:38855061
|
研究论文 | 本研究探索了骨关节炎软骨缺损患者的细胞衰老标志物,并构建了一种靶向衰老的miR-24微球/SMSC类器官复合水凝胶用于软骨修复 | 首次发现miR-24在骨关节炎软骨缺损中作为衰老标志物,并构建了靶向衰老的复合水凝胶,通过调节软骨细胞稳态来修复软骨缺损和预防关节退变 | 研究主要基于大鼠模型,尚未在人体中进行临床试验,长期安全性和疗效需进一步验证 | 探索骨关节炎软骨缺损患者的衰老标志物,并开发一种新型的靶向衰老的复合水凝胶用于软骨修复 | 骨关节炎软骨缺损患者的临床软骨样本、SMSC类器官、大鼠模型 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 高通量microRNA测序、单细胞RNA-seq、免疫荧光染色、SA-β-Gal染色、荧光原位杂交、qRT-PCR、荧光素酶报告基因检测 | NA | microRNA表达谱、单细胞RNA-seq数据、图像数据 | 临床软骨样本(具体数量未明确)、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量microRNA测序 | NA | NA |
| 1911 | 2026-02-26 |
Getting to the root of root-microbe interactions
2024 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504241278783
PMID:39234658
|
评论 | 本文总结了关于吸收性和运输性细根中微生物群落差异的最新研究,并探讨了根-微生物相互作用在生态系统功能中的重要性 | 强调了细根功能分类(吸收性与运输性)对微生物群落特征的影响,并提议应用前沿单细胞测序技术进行未来研究 | 作为评论文章,主要基于现有研究总结和推测,缺乏新的实验数据验证 | 探讨细根功能分类如何影响微生物群落,并推动根-微生物相互作用研究的未来发展 | 细根(直径小于2毫米)及其相关的微生物群落 | 微生物生态学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1912 | 2026-02-26 |
Single-cell integrative analysis reveals consensus cancer cell states and clinical relevance in breast cancer
2024-03-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03127-0
PMID:38472225
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研究论文 | 本研究通过整合分析乳腺癌单细胞RNA测序数据,揭示了七种跨患者重复出现的共识癌细胞状态,并系统阐明了其生物学功能、亚型特异性分布、潜在起源细胞及相互关系 | 首次通过整合分析识别出乳腺癌中七种跨患者重复出现的共识癌细胞状态,并揭示了其与肿瘤微环境的相互作用及对生存预后的影响 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全捕捉到蛋白质水平或空间维度的异质性 | 探究乳腺癌中恶性细胞的共同状态及其临床相关性 | 乳腺癌恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个独立数据集中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1913 | 2026-02-25 |
IL-33 promotes rheumatoid arthritis progression by enhancing pro-inflammatory macrophage development in the synovial microenvironment
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20258645
PMID:41615676
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研究论文 | 本研究探讨了IL-33在类风湿关节炎滑膜微环境中促进促炎巨噬细胞分化的关键作用及其机制 | 揭示了IL-33/ST2信号通路通过MAPK/NF-κB途径促进单核细胞向促炎巨噬细胞分化,并形成IL-33和TNF分泌的恶性循环,为理解RA滑膜持续炎症提供了新机制 | NA | 探索IL-33在类风湿关节炎滑膜微环境中的作用,特别是其在促进促炎巨噬细胞分化中的关键功能,以期为治疗抵抗型RA患者提供新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者的血清、滑膜液及滑膜组织 | NA | 类风湿关节炎 | 多重免疫组化分析,单细胞RNA测序,KEGG富集分析,细胞实验 | NA | 蛋白质浓度数据,基因表达数据,图像数据 | 匹配的RA患者(活动期组和缓解期组)的血清和滑膜液样本,以及活动期RA患者的滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1914 | 2026-02-25 |
Disulfidptosis in osteoarthritis: Role of SLC2A3 downregulation and potential therapeutic implications
2026-Mar, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2026.113058
PMID:41628840
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研究论文 | 本研究分析了骨关节炎中二硫键死亡相关基因的表达,识别了潜在生物标志物和治疗先导化合物 | 首次在骨关节炎中系统研究二硫键死亡相关基因,并利用机器学习模型和单细胞分析识别关键基因SLC2A3,通过计算预测和分子对接发现talaroflavone作为潜在治疗化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,需要进一步体内外实验确认SLC2A3的功能机制和talaroflavone的治疗效果 | 探究二硫键死亡在骨关节炎发展中的作用,识别相关生物标志物和潜在治疗靶点 | 骨关节炎组织样本、软骨细胞亚型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组织化学 | 机器学习模型, GraphDTA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的六个骨关节炎相关数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1915 | 2026-02-25 |
Determining Composition and Distribution of Nicotinic Acetylcholine Receptors in Mouse Ventral Tegmental Area Brain Region With Single-Cell Sequencing Approach
2026-Feb-24, Nicotine & tobacco research : official journal of the Society for Research on Nicotine and Tobacco
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/ntr/ntaf075
PMID:40177951
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序方法揭示了小鼠腹侧被盖区(VTA)中尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)亚基在单细胞水平上的组成和分布 | 首次在单神经元水平上确定了VTA区域nAChR亚基的组合概率和分布,并预测了不同神经元中nAChR亚基的潜在组合 | 研究仅基于小鼠模型,结果可能无法直接外推到人类;样本量相对较小(6只小鼠) | 探究尼古丁乙酰胆碱受体(nAChRs)在小鼠腹侧被盖区(VTA)的单细胞水平组成和分布 | C57BL/6小鼠的腹侧被盖区(VTA)细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞核测序 | Metacell, scFEA, hdWGCNA | 单细胞测序数据 | 6只C57BL/6小鼠的53,855个VTA细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1916 | 2026-02-25 |
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2026-Feb-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf259
PMID:41270048
|
研究论文 | 本研究探讨了BMAL1不足如何通过下调REV-ERBα诱导血管平滑肌细胞凋亡,从而增加胸主动脉瘤和夹层的风险 | 揭示了BMAL1/REV-ERBα轴在调控血管平滑肌细胞凋亡和胸主动脉瘤与夹层形成中的新机制,并发现BMAL1激活剂ISX-9和REV-ERBα激动剂SR9009具有预防和治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性未在临床环境中评估 | 探究BMAL1失调是否通过加重血管平滑肌细胞凋亡参与胸主动脉瘤和夹层的发病机制 | 胸主动脉瘤和夹层患者、BAPN诱导的小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组学分析、空间转录组学、分子检测、组织学实验、体外实验 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、组织学图像、体外实验数据 | TAAD患者和BAPN诱导的TAAD小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 1917 | 2026-02-25 |
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2026-Feb-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf264
PMID:41329636
|
研究论文 | 本研究揭示了Ets1调控的内皮分泌因子在致密心肌发育中的关键作用,并提出了针对心室致密化不全的新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了心室致密化不全中异常的心肌细胞和内皮细胞状态,并明确了Ets1在内膜和冠状动脉内皮中通过不同分子机制调控致密心肌生长的具体通路 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类疾病中的直接适用性仍需进一步验证;治疗性因子在体内的长期效果和安全性尚未评估 | 探究致密心肌变薄的机制,并鉴定治疗性的内皮分泌因子 | 小鼠心脏内皮细胞(心内膜和冠状动脉内皮)及致密心肌 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1918 | 2026-02-25 |
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2026-Feb-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf268
PMID:41389000
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研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)如何通过表观遗传印记增强单核细胞对SARS-CoV-2的炎症反应,导致COVID-19患者免疫反应失调 | 揭示了ASCVD患者单核细胞通过表观遗传印记(如干扰素信号通路增强)在COVID-19中引发过度炎症反应的分子机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和体外实验,临床队列验证虽支持结论,但因果机制仍需进一步体内研究确认 | 探究ASCVD患者COVID-19疾病严重性增加的免疫学基础 | ASCVD合并中度COVID-19患者的免疫细胞(特别是单核细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,转座酶可及染色质测序(ATAC-seq),体外感染实验,多重细胞因子检测,酶联免疫吸附试验,批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,细胞因子数据,批量转录组数据 | 德国全国性队列(NAPKON)中的ASCVD合并COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1919 | 2026-02-25 |
Macrophage-Specific E3 Ubiquitin Ligase TRIM31 Reduces Atherosclerotic Plaque Formation by Targeting LOX-1
2026-Feb-24, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞特异性E3泛素连接酶TRIM31通过靶向LOX-1促进其降解,从而减少动脉粥样硬化斑块形成 | 首次发现TRIM31作为巨噬细胞中可诱导的保护因子,通过K48连接泛素化LOX-1的赖氨酸12位点促进其降解,从而抑制泡沫细胞形成和炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类巨噬细胞的验证样本量较小(每组5-6个),且体内功能重要性实验仅在基因敲除小鼠中进行 | 探究TRIM31在巨噬细胞脂质代谢和炎症中的作用及其在动脉粥样硬化中的保护机制 | 小鼠巨噬细胞、人类巨噬细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱分析、位点定向诱变 | 基因敲除小鼠模型(Trim31fl/flLyz2cre、Lox-1-/-)、过表达小鼠模型(Trim31Lyz2-KI) | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 | 小鼠每组8只,细胞实验每组5-6个 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1920 | 2026-02-25 |
Environmental PET-microplastic exposure and risk of non-alcoholic fatty liver disease: An integrated computational toxicology and multi-omics study
2026-Feb-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05115-0
PMID:41731169
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研究论文 | 本研究采用计算毒理学与多组学方法,探讨了环境PET微塑料暴露与非酒精性脂肪肝病风险之间的潜在分子机制 | 首次采用整合网络毒理学、多组学数据和机器学习的方法,系统性地揭示了PET纳米塑料暴露与NAFLD发病机制之间的关联,并识别了核心候选基因 | 目前公共数据库中同时包含微塑料暴露测量和转录组谱的临床队列稀缺,研究主要依赖于计算毒理学框架和生物信息学分析 | 阐明PET微塑料暴露与非酒精性脂肪肝病之间的机制关系 | PET纳米塑料、非酒精性脂肪肝病相关分子靶点 | 计算毒理学、生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | 网络毒理学、多组学分析、机器学习、单细胞转录组分析、分子对接、分子动力学模拟 | 集成机器学习框架(包含11种不同算法)、SHAP分析 | 多源数据库数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |