单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 19161 - 19180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19161 | 2024-08-05 |
Molecular and Cellular Characterization of the TH Pathway in the Sea Urchin Strongylocentrotus purpuratus
2023-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12020272
PMID:36672206
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研究论文 | 本文对海胆中的甲状腺激素（TH）通路进行了分子和细胞特征分析 | 首次在海胆中识别出多种与甲状腺激素相关的同源基因，并探讨其在发育过程中的表达 | 对海胆中甲状腺激素合成和作用的研究仍然有限，有待进一步探讨 | 研究海胆中甲状腺激素通路的分子与细胞特征 | 研究海胆发育过程中与甲状腺激素相关的细胞类型及其表达 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 海胆胚胎，样本规模未明确提出 |
| 19162 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Identifies the Renal Cell Type Tropism of Human BK Polyomavirus
2023-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24021330
PMID:36674845
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了BK多瘤病毒在肾脏中的细胞类型趋向性，主要影响近端小管细胞、集合管细胞和肾小球内皮细胞 | 首次在单细胞分辨率下深入研究了BK多瘤病毒在肾脏中的细胞类型趋向性，并提出了新的抗病毒治疗靶点 | NA | 旨在更好地理解BK多瘤病毒在肾脏细胞类型中的趋向性，以开发新的治疗策略 | BK多瘤病毒在肾脏中的细胞类型趋向性 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19163 | 2024-08-05 |
Multiomics Analysis Reveals Cuproptosis-Related Signature for Evaluating Prognosis and Immunotherapy Efficacy in Colorectal Cancer
2023-Jan-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15020387
PMID:36672336
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研究论文 | 本研究揭示了与cuproptosis相关的标志物，用于评估结直肠癌的预后和免疫疗法的有效性 | 首次构建了一个包含五个基因的cuproptosis相关预后模型，并阐明了其在结直肠癌中的应用 | 尚未全面理解cuproptosis在肿瘤微环境重塑和抗肿瘤治疗中的具体作用 | 研究cuproptosis在结直肠癌中的角色及其与免疫疗法的关联 | 结直肠癌患者中的cuproptosis相关分子特征与模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 涉及未具体说明的结直肠癌患者样本 |
| 19164 | 2024-08-08 |
Using Single-Cell RNA Sequencing and MicroRNA Targeting Data to Improve Colorectal Cancer Survival Prediction
2023-01-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12020228
PMID:36672162
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和microRNA靶向数据，通过miRNA-基因相互作用指标和正则化Cox模型，提高了结直肠癌生存预测的准确性 | 本文提出的方法通过结合miRNA指标和Cox模型，显著改善了结直肠癌生存预测和患者风险分层 | NA | 提高结直肠癌生存预测的准确性 | 结直肠癌的生存预测 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox模型 | 基因数据 | NA |
| 19165 | 2024-08-05 |
In Silico Drug Repurposing in Multiple Sclerosis Using scRNA-Seq Data
2023-Jan-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24020985
PMID:36674506
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研究论文 | 这篇文章探讨了使用单细胞RNA测序数据进行多发性硬化症的药物重定位 | 提出了一种基于活化或抑制基因和通路选择潜在药物的新方法 | 研究仅使用了六名患者的公开单细胞RNA数据，样本量较小 | 研究多发性硬化症的机制并发现潜在治疗靶点 | 研究对象为多发性硬化症患者的单细胞RNA外周血单核细胞和脑脊液细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA数据 | 六名患者的单细胞RNA PBMC和CSF数据 |
| 19166 | 2024-08-05 |
Prospective study and validation of early warning marker discovery based on integrating multi-omics analysis in severe burn patients with sepsis
2023, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkac050
PMID:36659877
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，识别出严重烧伤合并脓毒症患者的早期预警标志物。 | 首次通过多组学研究系统性地确定了七个易感基因、四个miRNA和两个蛋白作为早期预警标志物。 | 本研究样本量较小，仅限于特定中心的患者，可能影响结果的普遍适用性。 | 旨在揭示严重烧伤合并脓毒症的病理生理变化和预防目标。 | 60名严重烧伤的脓毒症患者及小鼠模型。 | 数字病理学 | 烧伤相关脓毒症 | 多组学分析，包括基因组学、微RNA组学、蛋白质组学和单细胞转录组学。 | 小鼠模型 | 基因组数据，miRNA数据，蛋白质数据 | 60名严重烧伤患者和相应的小鼠模型 |
| 19167 | 2024-08-08 |
Dynamic gene screening enabled identification of a 10-gene panel for early detection and progression assessment of gastric cancer
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.12.036
PMID:36659923
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研究论文 | 本文通过动态基因筛选方法，基于高吞吐量数据分析，从胃癌前病变和早期胃癌患者中识别出一个包含10个基因的诊断面板，用于早期检测和进展评估 | 本文首次通过动态基因筛选方法识别出一个10基因面板，用于胃癌的早期检测和进展评估，并探索了这些基因在细胞中的定位 | NA | 旨在识别用于胃癌早期检测和进展评估的诊断生物标志物 | 胃癌前病变和早期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | lasso回归模型 | lasso回归模型 | 基因表达数据 | 超过40,000个细胞 |
| 19168 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of multiple cancer types reveals differences in endothelial cells between tumors and normal tissues
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.12.049
PMID:36659929
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研究论文 | 本文通过整合六种癌症类型的单细胞RNA测序数据，构建了一个多癌种内皮细胞图谱，以解码肿瘤内皮细胞的特征 | 发现了一种主要存在于肿瘤组织中的新型内皮细胞亚群——tip-like内皮细胞，并确定了前列腺特异性膜抗原（PSMA）作为其特异性标记物 | NA | 识别肿瘤内皮细胞特异性靶点，以应用于多种癌症类型 | 多种癌症类型的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 六种癌症类型的数据 |
| 19169 | 2024-08-08 |
Assessment of Fibrinogen-like 2 (FGL2) in Human Chronic Kidney Disease through Transcriptomics Data Analysis
2022-12-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010089
PMID:36671474
|
研究论文 | 本研究通过转录组数据分析评估了纤维蛋白原样蛋白2（FGL2）在人类慢性肾脏疾病（CKD）中的表达及其与疾病结果的关联 | 首次在人类CKD中评估FGL2的表达，并探讨了其与肾脏纤维化和疾病进展的关系 | 研究主要基于转录组数据和免疫组织化学分析，可能需要进一步的体内实验验证 | 评估FGL2在人类CKD中的表达及其与疾病结果的关联 | FGL2在CKD患者肾脏中的表达及其与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个独立的CKD队列（NEPTUNE和Innsbruck CKD队列）以及13个人类CKD转录组数据集 |
| 19170 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Molecular Characterization of the Immune Microenvironment in Acute Pancreatitis
2022-12-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010078
PMID:36671463
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研究论文 | 本研究首次整合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-Seq）数据，揭示了急性胰腺炎（AP）中免疫微环境的分子特征 | 首次使用scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq数据展示AP中免疫细胞浸润的特征，并探索不同细胞类型的特定分子标记 | NA | 揭示急性胰腺炎中免疫微环境的分子特征和细胞间相互作用网络 | 急性胰腺炎中的免疫细胞浸润和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），批量RNA测序（Bulk RNA-Seq） | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19171 | 2024-08-08 |
GAGAM v1.2: An Improvement on Peak Labeling and Genomic Annotated Gene Activity Matrix Construction
2022-12-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14010115
PMID:36672856
|
研究论文 | 本文介绍了GAGAM v1.2，一个改进版的基因组注释基因活性矩阵，旨在通过功能注释将峰值与基因关联，提高单细胞ATAC-seq数据的可解释性和信息量。 | 提出了一种改进的基因组注释基因活性矩阵（GAGAM）概念，通过标记峰值并将其与基因通过全基因组功能注释关联，使得不同数据集可比较，并能关联基因的可访问性和表达。 | NA | 改进基因活性矩阵的概念，使其能更好地处理和解释单细胞ATAC-seq数据，并能与单细胞RNA测序数据进行比较。 | 单细胞ATAC-seq数据的可解释性和信息量，以及与单细胞RNA测序数据的比较。 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 基因活性矩阵（GAM） | 基因组数据 | 数千个细胞 |
| 19172 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of H5N1-HA-Stimulated Alpaca PBMCs
2022-12-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010060
PMID:36671445
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了H5N1病毒HA抗原刺激下的羊驼外周血单个核细胞的免疫反应 | 首次在单细胞水平上研究了羊驼外周血单个核细胞对H5N1病毒HA抗原的特异性免疫动态 | NA | 旨在了解羊驼对抗病毒的免疫系统，并促进在骆驼科动物中开发更有效的疫苗和抗体 | 羊驼外周血单个核细胞在H5N1病毒HA抗原刺激下的免疫反应 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞测序技术（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 一个羊驼的外周血单个核细胞 |
| 19173 | 2024-08-08 |
Application of Single-Cell RNA Sequencing in Ovarian Development
2022-12-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010047
PMID:36671432
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在卵巢发育中的应用 | scRNA-seq技术在分析复杂组织中的单个细胞、分类细胞类型、表征单细胞、描绘细胞发育轨迹以及研究细胞间相互作用方面具有显著优势 | NA | 提高对卵巢细胞特征和发育的理解，从而识别卵巢相关疾病的新治疗靶点 | 卵巢中的不同细胞亚群及其发育过程和细胞间通信 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 19174 | 2024-08-08 |
Development and validation of a prognostic model and gene co-expression networks for breast carcinoma based on scRNA-seq and bulk-seq data
2022-Dec, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-5684
PMID:36660733
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研究论文 | 本文开发并验证了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序数据的前列腺癌预后模型和基因共表达网络 | 利用scRNA-seq技术研究复杂肿瘤微环境中的细胞变化，构建了单细胞分辨率的基因共表达网络，并开发了一个可靠的预测模型 | NA | 研究前列腺癌进展中的转录组学和基因共表达网络，并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 前列腺癌的恶性上皮细胞和基因共表达网络 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO-Cox | 基因表达数据 | 58个样本的scRNA-seq数据，超过300个已发表的转录组学数据集和31个CRISPR筛选数据集 |
| 19175 | 2024-08-08 |
Construction of a three commitment points for S phase entry cell cycle model and immune-related ceRNA network to explore novel therapeutic options for psoriasis
2022-09-15, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022630
PMID:36654055
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研究论文 | 本文构建了S期进入细胞周期的三个承诺点（CP1-3）模型和免疫相关的ceRNA网络，以探索银屑病的新治疗方案 | 首次探索了ceRNA调控机制在银屑病中角质形成细胞与免疫系统相互作用中的作用，并基于ceRNA网络筛选潜在的治疗药物 | NA | 探索银屑病中角质形成细胞增殖和分化的机制及ceRNA网络在其中的作用，并寻找新的治疗药物 | 银屑病中的角质形成细胞和免疫系统 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，分子对接 | NA | 基因表达数据 | 基于银屑病皮肤活检的单细胞RNA测序数据 |
| 19176 | 2024-08-08 |
A novel cuproptosis-related lncRNA prognostic signature for predicting treatment and immune environment of head and neck squamous cell carcinoma
2022-08-19, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022564
PMID:36653989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）肿瘤微环境中铜死亡相关基因的表达，并构建了一个基于铜死亡相关长链非编码RNA（lncRNA）的预后模型 | 首次探索了铜死亡在HNSCC中的应用，并构建了一个新的铜死亡相关lncRNA预后模型 | NA | 研究铜死亡在头颈鳞状细胞癌治疗和免疫环境预测中的作用 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同风险评分的HNSCC患者 |
| 19177 | 2024-08-08 |
A pan-cancer and single-cell sequencing analysis of CD161, a promising onco-immunological biomarker in tumor microenvironment and immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040289
PMID:36660546
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研究论文 | 本研究通过泛癌和单细胞测序分析，探讨了CD161作为肿瘤微环境和免疫治疗中的有前景的肿瘤免疫生物标志物的角色。 | 首次通过单细胞测序分析了CD161在多种肿瘤类型中的表达模式，并揭示了其在肿瘤进展和T细胞免疫中的关键作用。 | 研究主要集中在CD161的表达和功能分析，未涉及其在临床治疗中的具体应用效果。 | 探讨CD161在肿瘤微环境和免疫治疗中的作用，评估其作为肿瘤免疫治疗靶点的潜力。 | CD161在多种癌症中的表达、突变图谱、CNVs和SNVs变异、通路富集、药物敏感性以及与T细胞和巨噬细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 涉及多种肿瘤类型的癌细胞和T细胞 |
| 19178 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq unveils critical regulators of human FOXP3+ regulatory T cell stability
2020-Jul-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2020.01.002
PMID:36659163
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了人类调节T细胞在白细胞介素-6（IL-6）刺激下的反应及其与细胞抑制功能的关系 | 发现了CYP1A1作为调节T细胞抑制能力和稳定性的关键调控因子，这一发现为生物疗法的临床应用提供了新的潜在靶点 | NA | 探讨炎症条件下调节T细胞的异质性和抑制活性 | 人类FOXP3+调节T细胞在IL-6刺激下的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 19179 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals widespread monoallelic gene expression in individual rice mesophyll cells
2017-Oct-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2017.09.011
PMID:36659292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了水稻叶肉细胞中广泛存在的单等位基因表达现象 | 开发了一种单细胞RNA测序协议，首次在个体植物细胞水平上研究了单等位基因表达的普遍性及其潜在机制 | 研究仅限于水稻的特定品种和杂交后代，可能限制了结果的普遍性 | 探究植物细胞中单等位基因表达的普遍性和机制 | 水稻的叶肉细胞及其杂交后代 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括indica（93-11）和japonica（Nipponbare）纯系及其F1互交杂交后代 |
| 19180 | 2024-08-08 |
MR-seq: measuring a single cell's transcriptome repeatedly by RNA-seq
2017-Mar-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2017.01.029
PMID:36659282
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research paper | 本文介绍了一种名为MR-seq的新型单细胞RNA-seq技术，该技术通过重复测量单个细胞的转录组，能够统计评估技术变异并识别两个单细胞之间的差异表达基因。 | MR-seq技术提高了阳性预测值，并能应用于早期小鼠胚胎，识别出数百个候选的胚胎内异质性基因。 | NA | 开发和验证一种新的单细胞RNA-seq技术，用于检测少量细胞间的差异表达基因。 | 单细胞转录组和小鼠早期胚胎。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 每个单细胞测量两次 |