单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
19061 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals a mechanosensitive injury signaling pathway in early diabetic nephropathy
2023-01-10, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究揭示了早期糖尿病肾病中的机械敏感性损伤信号通路 提出机械敏感性转录通路MRTF-SRF在肾小管细胞中激活作为糖尿病肾小管病的新靶标 该研究仅在小鼠模型中进行,尚需在人类样本中进一步验证 阐明糖尿病肾病初期的细胞和分子基础 早期糖尿病肾病的小鼠肾脏细胞 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA RNA 2型糖尿病小鼠的多个肾脏细胞样本
19062 2024-08-05
Construction of Peptide Library in Mammalian Cells by dsDNA-Based Strategy
2023-Jan-10, ACS omega IF:3.7Q2
研究论文 本研究利用双链DNA构建哺乳动物细胞中的肽库 该研究使用终端NNK退化密码子的双链DNA实现AND门遗传电路并生成肽库,这是一个创新的方法 本研究的局限性未详细描述 研究旨在开发一种新的构建哺乳动物细胞肽库的策略 研究对象为哺乳动物细胞中的肽库 数字病理学 NA PCR反应和细胞转染 NA 高通量测序数据 NA
19063 2024-08-08
Multicytokine-producing CD4+ T cells characterize the livers of patients with NASH
2023-01-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过结合单细胞RNA测序和多参数流式细胞术,首次构建了以非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者肝脏浸润CD4+ T细胞为重点的细胞图谱 首次展示了NASH患者中多细胞因子产生的CD4+ T细胞群体,并发现具有Th17极化状态的CD4+ T细胞在晚期纤维化患者中富集 研究刚刚开始探索CD4+ T细胞在NASH中的肠道-肝脏轴作用,尚未深入研究 旨在揭示CD4+ T细胞在NAFLD向NASH进展及纤维化发展中的作用 NAFLD和NASH患者的肝脏浸润CD4+ T细胞 NA 非酒精性脂肪性肝炎 单细胞RNA测序和多参数流式细胞术 NA 细胞图谱 NA
19064 2024-08-08
Multi-omics characterization of a scoring system to quantify hypoxia patterns in patients with head and neck squamous cell carcinoma
2023-01-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,构建了一个评分系统来量化头颈鳞状细胞癌患者的缺氧模式 首次通过整合批量和单细胞RNA测序数据,定义了缺氧与头颈鳞状细胞癌之间的关系,并识别了HLA-DPA1/CD4轴作为CD4+T常规细胞和pDC细胞之间的独特相互作用 NA 研究缺氧模式在头颈鳞状细胞癌中的精确作用及其与肿瘤免疫景观和细胞通信协调的关系 头颈鳞状细胞癌患者的缺氧模式 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 RNA测序 NA RNA NA
19065 2024-08-08
Putting bacteria on the cancer map
2023-01-10, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 研究使用空间分析和单细胞RNA测序技术描绘了癌症中微生物群的空间结构 首次详细描述了肿瘤相关微生物在微环境中的聚集及其可能的免疫和上皮致癌作用 NA 探索癌症中微生物群的空间组织及其对肿瘤发展的影响 癌症中的微生物群 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 空间数据 NA
19066 2024-08-08
Role of MR1-driven signals and amphiregulin on the recruitment and repair function of MAIT cells during skin wound healing
2023-01-10, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在皮肤伤口愈合中的作用及其机制 首次揭示了MAIT细胞在皮肤伤口愈合中的修复功能及其分子机制 研究主要基于人源化小鼠模型,可能与人类实际情况存在差异 探究MAIT细胞在皮肤伤口愈合中的作用机制 MAIT细胞及其在皮肤伤口愈合中的功能 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 使用人源化小鼠模型进行实验
19067 2024-08-08
Decoding anterior-posterior axis emergence among mouse, monkey, and human embryos
2023-01-09, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组分析和伪时间预测,研究了小鼠、猴子和人类胚胎中前-后轴形成的机制 首次展示了DVE和AVE在小鼠胚胎中的独立起源,并揭示了它们在植入前发育过程中的阶段特异性转录模式 研究主要集中在小鼠、猴子和人类胚胎,其他物种的相关研究较少 探究前-后轴形成的机制及其在不同物种中的差异 小鼠、猴子和人类胚胎中的DVE和AVE 发育生物学 NA 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 涉及小鼠、猴子和人类胚胎的多个样本
19068 2024-08-05
Single-cell transcriptomics of peripheral blood in the aging mouse
2023-01-06, Aging
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序研究老龄小鼠外周血的组成和转录组改变 识别了与年龄相关的细胞类型组成和转录特征变化,包括老年外周血中特有的活化T细胞群体 该研究仅限于老龄小鼠的外周血,不一定适用于其他物种或组织 探索小鼠外周血中与衰老相关的免疫细胞变化 小鼠的外周血单细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞数据 14,588个单细胞
19069 2024-08-05
Strategy of Patient-Specific Therapeutics in Cardiovascular Disease Through Single-Cell RNA Sequencing
2023-Jan, Korean circulation journal IF:3.0Q2
综述 本文总结了单细胞RNA测序技术及其在心血管疾病中的应用 探讨了单细胞测序技术在精准医学中的临床应用 未具体提及技术的局限性 研究单细胞RNA测序在心血管疾病中的应用 分析心脏和血管的单细胞转录组 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
19070 2024-08-05
Transcriptomic Analysis of Human Podocytes In Vitro: Effects of Differentiation and APOL1 Genotype
2023-Jan, Kidney international reports IF:5.7Q1
研究论文 本研究分析了人类足细胞的转录组,以探讨分化和APOL1基因型的影响 该研究首次综合分析了人类尿源性足细胞的转录组特征,揭示APOL1高风险变体对足细胞功能的影响 研究仅使用了有限的细胞系,可能无法全面反映所有足细胞的转录特征 理解APOL1高风险变体对足细胞病理的作用机制 人类尿源性足细胞样上皮细胞(HUPEC)及其转录组 数字病理学 肾小管间质病 转录组分析 NA RNA 4个细胞系(2个APOL1高风险,2个低风险)
19071 2024-08-05
Initiative of clinical single-cell biomedicine in clinical and translational medicine
2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 临床单细胞生物医学是一个新兴学科,旨在整合单细胞分子和临床表型以揭示新的疾病特异性诊断和疗法 提出了临床单细胞生物医学(cscBioMed)的倡议,促进单细胞生物学和医学的发现与发展 NA 希望通过建立临床单细胞动态监测和早期预测系统来改善人类健康 总括单细胞RNA测序、空间转录组学以及基于单细胞的生物标志物和靶点 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因组数据 NA
19072 2024-08-08
Perspectives on single-nucleus RNA sequencing in different cell types and tissues
2023-Jan, Journal of pathology and translational medicine IF:1.7Q3
综述 本文综述了单核RNA测序(snRNA-seq)在不同细胞类型和组织中的实验和分析步骤,以及其方法和特征。 snRNA-seq作为一种替代或补充方法,适用于难以分离的细胞类型,有助于理解细胞多样性和疾病状态的改变。 snRNA-seq存在一些局限性,如细胞分离的困难,这可能影响其使用和数据解释的准确性。 旨在提供snRNA-seq的全面概述,以增加其应用并改善生物学数据的解释。 研究对象包括不同细胞类型和组织中的单核RNA测序技术。 基因组学 NA 单核RNA测序(snRNA-seq) NA RNA序列数据 NA
19073 2024-08-08
Single-cell and spatial sequencing application in pathology
2023-Jan, Journal of pathology and translational medicine IF:1.7Q3
综述 本文综述了空间转录组测序的当前方法,包括其技术背景、组织准备和分析流程,并探讨了其在病理诊断中的应用潜力 结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与空间测序,提供同时包含组织学和单细胞信息的分子基础 NA 探讨空间转录组测序在病理诊断中的应用及其对疾病理解的提升 空间转录组测序技术及其在病理学中的应用 数字病理学 NA 空间转录组测序 NA 转录组数据 NA
19074 2024-08-08
Catecholamine induces Kupffer cell apoptosis via growth differentiation factor 15 in alcohol-associated liver disease
2023-01, Experimental & molecular medicine
研究论文 本文研究了在酒精相关性肝病中,儿茶酚胺通过生长分化因子15诱导库普弗细胞凋亡的机制 发现了儿茶酚胺/GDF15轴在库普弗细胞凋亡中的新保护机制,并揭示了肠道与肝脏之间的独特神经代谢免疫轴 NA 探讨儿茶酚胺在慢性酒精暴露下对炎症库普弗细胞的调节作用 库普弗细胞在酒精相关性肝病中的凋亡机制 NA 酒精相关性肝病 单细胞RNA测序 NA RNA 慢性乙醇喂养的小鼠及早期酒精相关性肝病患者
19075 2024-08-08
TREM2hi resident macrophages protect the septic heart by maintaining cardiomyocyte homeostasis
2023-01, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本文研究了脓毒症诱导的心肌病(SICM)中,一种名为CD163RETNLA(Mac1)的心脏驻留巨噬细胞亚群通过维持心肌细胞稳态来保护心脏的作用 首次鉴定并描述了Mac1亚群在SICM中的作用,并展示了TREM2 Mac1细胞在清除受损线粒体和预防SICM中的潜在治疗价值 NA 探讨脓毒症诱导的心肌病中免疫细胞亚群的作用,特别是Mac1亚群的功能 心脏驻留巨噬细胞亚群Mac1及其在脓毒症诱导的心肌病中的作用 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
19076 2024-08-08
Single-cell transcriptome analysis reveals functional changes in tumour-infiltrating B lymphocytes after chemotherapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2023-01, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了食管鳞状细胞癌(ESCC)中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞(TIL-Bs)的功能变化。 首次详细描述了化疗前后TIL-Bs的功能异质性,并发现化疗后TIL-Bs的某些功能如共刺激和CD40信号传导得到增强。 研究样本量有限,且仅限于食管鳞状细胞癌,可能限制了结果的普遍性。 旨在研究食管鳞状细胞癌中化疗前后肿瘤浸润B淋巴细胞的功能异质性。 食管鳞状细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其在化疗前后的功能变化。 数字病理学 食管癌 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 共分析了23个样本,涉及81,246个细胞。
19077 2024-08-08
Integrative multi-omic analysis of radiation-induced skin injury reveals the alteration of fatty acid metabolism in early response of ionizing radiation
2022-Dec, Journal of dermatological science IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过综合多组学分析,探讨了电离辐射诱导的皮肤损伤早期反应中的分子事件及其机制 首次揭示了电离辐射早期反应中皮肤脂肪酸代谢的改变,并详细研究了ACADVL在脂肪酸代谢中的重要作用 NA 研究电离辐射对皮肤组织的早期分子反应及其机制 小鼠、大鼠的皮肤组织以及人类角质形成细胞和皮肤成纤维细胞 代谢组学 辐射损伤 液相色谱-质谱联用(LC-MS)、mRNA测序(mRNA-Seq)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 代谢物、基因表达数据 涉及小鼠、大鼠、猴子以及人类样本
19078 2024-08-08
Single-cell transcriptomics and network pharmacology reveal therapeutic targets of Jianpi Yiqi Bugan Yishen decoction in immune cell subsets of children with myasthenia gravis
2022-Dec, Translational pediatrics IF:1.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和网络药理学方法,揭示了健脾益气补肝益肾汤在治疗儿童重症肌无力中的作用机制及其活性成分和潜在治疗靶点 本研究首次结合单细胞转录组学和网络药理学方法,探讨了健脾益气补肝益肾汤在儿童重症肌无力治疗中的作用机制和潜在靶点 NA 探索健脾益气补肝益肾汤治疗儿童重症肌无力的作用机制,并评估其活性成分和潜在治疗靶点 儿童重症肌无力的免疫细胞亚群及健脾益气补肝益肾汤的作用机制 数字病理学 神经肌肉疾病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 20只Lewis大鼠
19079 2024-08-08
Correlation between oncogene integrator complex subunit 7 and a poor prognosis in lung adenocarcinoma
2022-Dec, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
research paper 研究整合子复合体亚单位7(INTS7)在肺腺癌(LUAD)中的临床意义及其对细胞行为的影响 首次探讨了INTS7在肺腺癌中的表达与患者预后的关系,并验证了INTS7作为治疗靶点和预后标志物的潜力 研究主要基于公开数据集和细胞实验,未来需要更多临床样本验证 探讨INTS7在肺腺癌中的临床意义及其对细胞行为的影响 肺腺癌组织、细胞系及患者预后 digital pathology lung cancer 单细胞测序 NA RNA 包括33种癌症类型的数据集及肺腺癌细胞系
19080 2024-08-08
Tumor-infiltrating lymphocyte: features and prognosis of lymphocytes infiltration on colorectal cancer
2022-06, Bioengineered IF:4.2Q2
研究论文 本研究旨在探讨结直肠癌中肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的特征及其对预后的影响 首次综合多个队列数据库,详细描述了TILs在结直肠癌中的特征、比例及预后价值 NA 研究TILs在结直肠癌中的特征及其对预后的影响 结直肠癌中的肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理学 结直肠癌 scRNA-seq NA 基因表达数据 涉及四个基因表达综合系列(GSE)的结直肠癌队列
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